Difference between revisions of "Os11g0573000"
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GeneName = Os11g0573000| | GeneName = Os11g0573000| | ||
Revision as of 21:21, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0573000 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein |
| Version |
NM_001189689.1 GI:297728508 GeneID:9270404 |
| Length |
13777 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0573000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:23343089..23356865 |
| Sequence Coding Region |
23353032..23353106,23353683..23353792,23355707..23355805,23356036..23356151,23356242..23356350 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:23343089..23356865 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gaggttgctgtccgcaaaatggttgattattggacatatgattcaaaaaaagaaacaggttacgttggcctgaagaaccaaggagctacctgttacatgaactctctactacagacactataccatataccatacttcaggaaggctgtgtatcatatgccaaccaccgaaaatgatatgccatctgggagtattccgttggcattgcagagccttttctacaagctccagtatagtgacaatagtgtagccaccaaagagctgaccaaatcttttggatgggacacatatgattccttcatgcaacatgatgtacaagagctcaacagagttctctgtgagaaacttgaagataagatgaagagaactgtcgtagagggaacgattgaaaagttattcgaaggtcaccacatcaattatatagagtgtataaatgttgactataaatccaacaggaaggagtccttttatgaccttcaacttgatgttaaaggttgtcgtgatgtgtatgcatcgtttgataaatatgttgaagttgagcgcctcgaaggtgataataagtatcatgcagagaatcatggtttacaggatgcgaaaaagggtgttctgttccttgatttccccccagttttgcaacttcaactgaagcgttttgagtacgactatatgagagataccatggttaagattaatgaccgctatgaattccctttgcaacttgatttggatagagatgatggaaaatatcttgctccagatgcagatagaagtataagaaacctttatgctcttcacagtgttcttgttcatagtggaggagtacatggcggtcactactatgccttcattcgaccaacgctatcagatcaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>EVAVRKMVDYWTYDSKKETGYVGLKNQGATCYMNSLLQTLYHIP YFRKAVYHMPTTENDMPSGSIPLALQSLFYKLQYSDNSVATKELTKSFGWDTYDSFMQ HDVQELNRVLCEKLEDKMKRTVVEGTIEKLFEGHHINYIECINVDYKSNRKESFYDLQ LDVKGCRDVYASFDKYVEVERLEGDNKYHAENHGLQDAKKGVLFLDFPPVLQLQLKRF EYDYMRDTMVKINDRYEFPLQLDLDRDDGKYLAPDADRSIRNLYALHSVLVHSGGVHG GHYYAFIRPTLSDQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3760..3834#3074..3183#1061..1159#715..830#516..624#228..446#2..145#tgaggttgctgtccgcaaaatggttgattattggacatatgattcaaaaaaagaaacaggttacgttggcctgaagaaccaaggagctacctgttacatgaactctctactacagacactataccatataccatacttcaggaaggtgtgagatcatgcatcataattcagagcattctagactattgtttccagaactaattgactaacttcattattttacccaggctgtgtatcatatgccaaccaccgaaaatgatatgccatctgggagtattccgttggcattgcagagccttttctacaagctccagtatagtgacaatagtgtagccaccaaagagctgaccaaatcttttggatgggacacatatgattccttcatgcaacatgatgtacaagagctcaacagagttctctgtgagaaacttgaagataagatgaaggtgacaaatctggtatagagctgtatatatgctgcatgttggctgctattaactttgctttcttcctagagaactgtcgtagagggaacgattgaaaagttattcgaaggtcaccacatcaattatatagagtgtataaatgttgactataaatccaacaggaaggagtccttttatggtaggttttgtcctggtaccagattgtgggttcacattagatgtgtttcattatttattgtcaagttaatgctgtattatggccatgcagaccttcaacttgatgttaaaggttgtcgtgatgtgtatgcatcgtttgataaatatgttgaagttgagcgcctcgaaggtgataataagtatcatgcagagaatcatggtttacaggtacccacatgttcttctcagttctcactttaagctttgaaactgaagctagagttggttgtttcataaaggtttgatataacttgtggacttttatgtatctatgaagataaagggaatctgcatcccatatactataacagcttgctccatctatattttataaatgaagcccatttttattggttttggtgccaattcttgactatgtttttttgatattgtctcaggatgcgaaaaagggtgttctgttccttgatttccccccagttttgcaacttcaactgaagcgttttgagtacgactatatgagagataccatggttaaggttgggactgccataaccttgccatttatattctccatccatttacctctattatttatgttgtcatgtgaatgcaagacctgctgtgcaaaatgacacccttggaggcttgattttatttttacatttggagaacatacaacgcaattgggaaaaaaatgaaatacttagaaattatgaaaatgactaatgattgctgtaaacatgttaacaacttaacatcttcatttaaaactatttatggttaacgtagtatgctattatgctatactatactacctccgtcccatattacttgtcgctttgagttttcctttataatgtttgatcatttgtcttattcaaaaaattttggaattattatttatttcctttgtgatttgctttattatcaaaagtactttaagtatgacttatccttttttatatttgcactaattttttcaaataaaacgaatggtcaaatgttgcaaggaaaaagttaaagcgacaactattatgggacggaggtagtattatatatgtatgttctctcgagcctaattgatcttaacttgaccaaccttgagtgtgtggctgtgtgcacaatgatttgagcttgaccttggtgttggttgctctcaaaactcaaatagattgcccatcccaaagttatatgacaagttgacaacccaacatgcagatactctgtggatctgatgagttgttcgctttcttgatgcatgatcttaattcctaaaaggcataagtacaccaatgcaaatagttttttaacttggcgagatccaattccaaatgctgtgcatctcctgttataaatctggagagtcatggtgtcacatattggtattgcccaccaaaagcttgcctgttttgtttcttatttattatccaaattgattgggccatcttttatgataattgcttgtgcacaggaccaccataattcatggttgtactctcactttgagacttttgacatgcatcccttatcctatatatctataaagtttatccccactaagtgtagttaatgctatttctctcctctcattaagccacatcacctcaattctttctagctcttagatgattgatctatggtccaaattatgttcctccttttcttctcttacgaagtcttatcaccctagttttatctttgaatgattaatctatattatctcccttacctcattgagccacatcaccttagttttgctgttggatgattaatctatatataatttaaattgttataaaccatgtcatcttaaattgtttgtagctttttcttcaatggtcggtcaaagatgaaaattatgtaaagtattataaaattatattgtctagctatgccacatattatctactattattatacaaaactcccacagcaacgcgtggggtttcatcttgtatggcagacatctattccagtgtcacatactaattctcaataagggatgagaaaatattttgggcttgaatagtaaagaaaagtttccttttgctttttggtttaggaattttaacagttactttagagctgcaatatgttttcttccaacatgactggtagtttcataataataaggtgagacatcttaggtgattatcttatgttccattttgtttccctgtaacttctgtctcatctgcttttccttggttagacagttaacactgagccatcatttccttcaattttccctgccataaatgatttcaaaagacagctaacgcaacattaattcaagaaacattaagtggatcaaacgtttggatcacttcttgagaattgagaagcatgtagccgactagcctctttaatatctctgctgttcaaatactttaaaggtttacgttccggttctgagcttgggatttctgctattatgcctatctgtgcagattaatgaccgctatgaattccctttgcaacttgatttggatagagatgatggaaaatatcttgctccagatgcagatagaagtataagaaacctttatgctcttcacaggtagtgttttttatgagtatgtcattcacaacttactttaatggctttaagatcaattaatttctccatcacacgtcctaatagttcattatggtagttagggaaaccaaagtatcagtgggttcgttagtaataatacctgtttcttttatctacatgctatgtatgagcatgggggtagactactagctgctgtctgtctgtggacaaaaaacttggaggaagaattggttgatagtataaaatgggctgatataatgcgctatacaagtatatacctgcacgaatcttcatgcataatgactgagtcaattcctgagaattccacatcacttgccattctcttagcagtcattgtattccatattggttttagagttatggaataacagggttttatgtatcttagaaaattcagttttggtgagacctgggatcaagcaaataccatttgttatttttgtgtaatggtttcttaggtaccattttcagtgtaacagtggtgctccaataggtgccttttttcctcctttccacatctttttctcactatgtttcactgctgcttttattcagtgttcttgttcatagtggaggagtacatggcggtcactactatgccttcattcgaccaacgctatcagatcaatggttggtttttctttgactttttttttgtctctagtactacaacaatacaaaattattcaactatttgccatttaccagataatattattaccctgttcctatgcatggccacttgatgacagctgaatagatgtgttctccgagacaactccctggcactctattcgacaactgaaactatcttgttaggacctgtatctattggattgcagcatttccgaggcagatttccaaaaaaatattagagtgtttgtttctacacaagagaatatcatatctcaactagagttagccaatgttagtgggacgtttttacacactaacaaatttacataagttctcttaactggacagaaggccctcatgtcaagttcaacatgttactttttcataatatagttggttataggattctgtgttggttctaataagcacctgactagcatggacttcaataacttctttcaagctgatggtcatcagttatcacttatcaaaagaagtatgtggtgtgagattacaggaggaaaatcatatgccttatgcacttttattgtaagtggatgccagtctagggagtaaccacgctgcaacaatataggtaacttgcatatagaccagctgaataccatatattaggcatcaaatgagttgccaataaatcttcttaggtttagtgctacctcatgcaaatttctgttgaagaacctggaaacaagtgcaatatcctcgcattataattaattctacaatgattatgccttttgtcgaactatgctgttgaattttacatcctagcaaacagttcccaattcattatagatttttgaaaatgttatcctgtctaccaggtataaatttgatgatgagcgtgtaactaaagaagatactaagaaggcccttgaagagcaatacgggggtgaggaagaggtgtgttctacctgataattgatattgaatgatatgagatattgaactacatatgtttgttttcctgtttccgtaattttaatctcttttgggctgaacagttgcctcaaataaatcctggtttcaacaacgctccatttaaattcacaaagtat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