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<ref name="ref2">Takahashi Y, Teshima K M, Yokoi S, et al. Variations in Hd1 proteins, Hd3a promoters, and Ehd1 expression levels contribute to diversity of flowering time in cultivated rice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009, 106(11): 4555-4560.</ref> | <ref name="ref2">Takahashi Y, Teshima K M, Yokoi S, et al. Variations in Hd1 proteins, Hd3a promoters, and Ehd1 expression levels contribute to diversity of flowering time in cultivated rice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009, 106(11): 4555-4560.</ref> | ||
<ref name="ref3">Lee S Y, Jang S H, Jun S H, et al. Functional analysis of MADS-box genes expressed preferentially in vegetative tissues[C]//Advances in rice genetics, Los Baños, Laguna, Philippines, 22-27 October 2000. World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, 2003: 414-416.</ref> | <ref name="ref3">Lee S Y, Jang S H, Jun S H, et al. Functional analysis of MADS-box genes expressed preferentially in vegetative tissues[C]//Advances in rice genetics, Los Baños, Laguna, Philippines, 22-27 October 2000. World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, 2003: 414-416.</ref> | ||
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Annotated Information
OsMADS51, also konwn as OsMADF65, is type I MADS-box gene in short-day promotion pathway in rice. OsMADS51 encode a protein which is composed 164 amino acids and contains an SRF-like MADS domain..Cite error: Closing </ref> missing for <ref> tag
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- ↑ Cite error: Invalid
<ref>tag; no text was provided for refs namedref1 - ↑ Takahashi Y, Teshima K M, Yokoi S, et al. Variations in Hd1 proteins, Hd3a promoters, and Ehd1 expression levels contribute to diversity of flowering time in cultivated rice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009, 106(11): 4555-4560.
- ↑ Lee S Y, Jang S H, Jun S H, et al. Functional analysis of MADS-box genes expressed preferentially in vegetative tissues[C]//Advances in rice genetics, Los Baños, Laguna, Philippines, 22-27 October 2000. World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, 2003: 414-416.
Structured Information
| Gene Name |
Os01g0922800 |
|---|---|
| Description |
Similar to MADS-box protein PTM5 |
| Version |
NM_001051770.1 GI:115441910 GeneID:4327247 |
| Length |
19989 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0922800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:42139221..42159209 |
| Sequence Coding Region |
42139357..42139541,42157107..42157188,42157601..42157647,42157735..42157831,42158706..42158789 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:42139221..42159209 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:42139221..42159209 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcggagggggagagtgcagctgaggcggatcgaggacaaggcgagccggcaggtgcggttctccaagaggagggcggggctgttcaagaaggcgttcgagctcgccctgctctgcgacgtggaggtggcgctcctcgtcttctcccccgtcggcaagctctacgagtactcctcctccagcattgaaggtacctatgatcgctatcagcaattcgctggagccaggagagacctgaacgaaggaagtacaagcatcaacagtgatgaaaatgcaagtatacactccaggcttagggacataacggcctggtctctccaaaacaatgctgacgagtcggatgctaatcagctagagaaactggagaaactgctgacaaatgctttgagggatacgaaatcaaagaagatgttggcaaaacaaaatggtgaagggagtaggagcagagcaaactccagtggctctagggggcaggaggaaggaagtgcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARRGRVQLRRIEDKASRQVRFSKRRAGLFKKAFELALLCDVEV ALLVFSPVGKLYEYSSSSIEGTYDRYQQFAGARRDLNEGSTSINSDENASIHSRLRDI TAWSLQNNADESDANQLEKLEKLLTNALRDTKSKKMLAKQNGEGSRSRANSSGSRGQE EGSA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>137..321#17887..17968#18381..18427#18515..18611#19486..19569#cgatcccctcctcctcctcccccacttctccccaccaccacaccaccacacacacgcacgcacgcacgcacgcctccgttttcccccaccgacgagaggcggagagggaggggagctagggtttttcggggcggggatggcgcggagggggagagtgcagctgaggcggatcgaggacaaggcgagccggcaggtgcggttctccaagaggagggcggggctgttcaagaaggcgttcgagctcgccctgctctgcgacgtggaggtggcgctcctcgtcttctcccccgtcggcaagctctacgagtactcctcctccaggttcgctctctgattccatccccctccctccccccgcctcctcctgttgttagtttgttagttacgatcaaaacccagccgcggccgaatcgagaccccccgccgcggcaggatctgccgattggttccgatcccatttcgttctgctatcccggatcgatcgatgattctccctgctatactgtatcgtaatgggtaagcctagtgcacgccatgtgctcgagactatctcgcagaggcccccccccacccccccaaccccccaccgccacctaccggcgttgcgctgcatgacagccctgtgatttctgattagtaggatcttgttctcttagcctgtacagtagcagcagccagcagcttgtatctagtatatgaagctttgacaccttgtactgttccgcgcttcgtctccccgacggcgtgggccgcgttgtttttcctcccctggtgtgcttttacacgtgtttcgcatgaggagacaccagccttcgtagaggcggaggcgcgcagcaatacgcgcatcaccctgagagccaccgcagtgtacggcctacggcgagtgaggagtttatcattttctcccaacttttttttcggcatcttgttttttttttctctgagagggagtgatgaaggagtacagttgtgtgtgttttctttaatttatttcagcgacagggacgaagtcggcttgctctgtagcgaccggcctattctcataaatagtcttttgttatggtattgagtggcatatgttaaataatattatttgatacaactgcttaaagatttttttgtaatggcttatttcttgtattttagtgtacacatcgaacaggactattcttagtgatatagtagtgggataacatatttatctaattaacctttattaatgatatactataaagaacattgataatatatttatatatgtcaagcaacttgattgaaaaacaagcacatcactcacaaagttagcccaattgtgcacaatagtccatttcataccatgatgctaaaaatcgcgcgctctgattgtttgagcgacaacccagaataattcataggtataatattttatatatatattaagtggtttaaaaaccaagattgaaaaatagacctcaataaaaaaaatgccccctaaaatcaactctcaaggagaaccgcgtttggctttggccgataatccacgaacaaatgatgaaatcacatattccatatattcgcattcacttatgaacaaatggcaacttttcttatttcttggtaatgtacgccctacacattttccaacccacatttttctagttttgcaccccctccaccaccaatatggtacaactacagctccaaaatttagctccaggagttaggtctggagtggagttgcctaaatccagttccacaactctagtttattttgtgcgagcttcacccagcttcactcccaattttaatggagctgtaattgtttggctgagctccagctccaagagaagtggagctagagctggagctgtgccaaacaggcccttagcttgtccaaatggtctagattcttatttcagattctacgagtcagaaggtgcataatcaataatcaatgaactggaagccagaagttggataacgtaagcttcagctagatactcaccaattgctttttaggatctgtagctttcttaaatagggcatttcctatctttaatactccatatgtcccaaaatataacgacttttagcctttagaatttgttccaaaatattacaacttctccaccaacattctcttctcaaccaatcacaaccctccaccattcaatttctccacctacattcatttctcaaccaatcacaatcttccaccatttaattctacttattttcttaataaccgtgaccaactctaaaactcattatatcctgtccgtcccaaaataagtttatttttcacgcatctcacgcgtaccaatatctaagaaaaaaaactagaatacattcacttcatcaaattccaatgcagttgttcctcactttatctactcctaatgtattttccccctacttttacaaactctgttgcaataattgctaaaatatgaacttattttgggataaatgggaggggctaaaaatgatcttattctgggacggatggagtagatgcttcttgtagcatatgtttttgaatttaactaccatcaagttccaccacaacatatagaagtatcttgtagtaaccgttattttgctattttgctaatgaaatagactagaggcattttagcttgccttgcacacgagtgacaagtaaactagaacggaaggagaattttattccccctcaatctgaccaaatcgatccaaagccataccagtgtatgattttccttactaaatgtgaggttgatctttcactaacaatgaataaactcctctaaattttgaactaggatgggacaatagacccaaattaacataaaactaggaaatcaatgcggcgatgtttaagtaatgaccatgattgtagacaacaaaataacacaaaattgataaaataactcgtacatgtatgtcatagattatttaatatttgttgggtcgtccccttcatgtgttaaatcatctaggaatttgtcctaacatttgggataaaaaatttcgctaataaatctattgaacatctaatgtacgacaaaagtctctatgacaacccactattagaaattggggcatatagatctccagcaaaccttaacattttattcaagggtttgtccttgaatacatccaggcaaaatgttgaggatttcaatcaaagttcgggccattggatttatttgacgcgtatcttaatggttaacatgtgccctacctcttcttaccttttcttgttatctcactattgaagttgtccatggttactaatactcaaagcctagaggctatacacgcactacctcctgctattccatatcacattctaaccacaatgtctacggttattacttattagctatgtttgcaatgcttcgggcttgcattcaactaagatagcaaaaaaaagtgttaaagtgttaaaaaatccccacaattcccggcacacgagggggtgggggttaaaaatccccttgaatataatttgactaggtatctcttctttgttggcttagaagatttagttgtgtttagtacttcatgaagttatggctatcactacaacttggtcaagtttgatttcttatctagtttgttgccatactaattaaagtgttgcattttgaaatgcacccaaagaagtgaattatgcacacatactagaatcattaacaatcgtttttaaacttgttttatgaatactaatatgtattttatacgcacgtaagacacacataatatgctgaccatatatgtgataaattatgaatgatcttatatcttttatactcccttcgtttaaaactagagggtgtattatgattttacacaatctccaactttgaacattaatttcttttgctataaattatcaactacaaaaacaatatcatatgagagtattttttaaatttgaatctaatgatactacatgtgtagcattaacaacatatttttgtttaattatcagtcaaaattttaaaatggtgattttacagaaaacaacgatgtcatatatatattagagcggatggagtatgttacaaacaaactaactagcatcattactacaaagcttgtccaaggttgaacaaaatcatctcaaaagctctaaccatcatatcattccctcaaaaggcacaaatcattccttgctagactgcttcctatgagtaaattacatcgagcagtaatgtttatcagttatctctatgcacaacctaataatacatcatgcgagtccacaacctttttgcctcctgccaatctatagtattacataattattagaacatagcatatgccattgtttttaaaattcttcctaaatattttaacaaatcaattctaaatatgttagaacatctattataatgtttcaacaatgcacatagtttcatctggtttccttatgcctctccgtagtcggatcattgatttgtcttacgacattaacaatgtgaagtgcaaaggtgctcccagggagaaaacaagtccacataatctagcgtttatgaaagagatgtttatctagttagtaaccaataattctgatattggttttcccatgggtgtgatggatattcattgcaacttacaggcaaataatattgtgcattttcttatttcgaaaagatatcgtacggatgaaagtacatgcatacacttttacacaatattatacaaaattaggtttgcttttcttatcttcagtcttataatataaacatgcaagcatatacaaaatattatctcaaaaatttataatcaacttatgtcaaacatgcaagcaaggatgttgacaagctttaaagtttctttttaaaaaggtcacacttatctgaaatgatcccaattatctcattagtttggatactatattactcctaaggcatgccaaatttataattaacctgacgggttaattttttacatta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