|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | GeneName = Os01g0848200|
| |
| − | Description = Similar to Delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthetase (P5CS) [Includes: Glutamate 5-kinase (EC 2.7.2.11) (Gamma-glutamyl kinase) (GK)|
| |
| − | Version = NM_001051337.1 GI:115441044 GeneID:4324853|
| |
| − | Length = 9810 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0848200, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| |
| − | AP = Chromosome 1:38186881..38196690|
| |
| − | CDS = 38187014..38187130,38187800..38187871,38187971..38188074,38188155..38188257,38188345..38188506<br>,38188631..38188908,38192016..38192166,38192383..38192547,38192665..38192742<br>,38192872..38192961,38193048..38193134,38193224..38193310,38193382..38193478<br>,38193621..38193724,38194023..38194098,38194542..38194692,38194834..38194902<br>,38194996..38195062,38195213..38195283,38195497..38195575|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008394:38186881..38196690
| |
| − | source=RiceChromosome01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008394:38186881..38196690
| |
| − | source=RiceChromosome01
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggggagaggagggatcggcggcgcggggctggtggcggcggtcgcgaaggcggacgtggagaacaccgactccacccgcggcttcgtcaaggacgtgaagcgcatcatcatcaaggtcggcaccgctgttgtgactgggccgaatggccggttggctatgggcaggctcggtgctctgtgtgaacaggtgaagcagctaaattttgaggggtacgaggtgattctggtcacctctggtgctgttggtgttgggaggcagaggctcaagtaccggaagctcgtcaatagcagtttcgctgatctgcagaacccacagatggacatggacgggaaggcctgcgctgccgtcggtcagagtgtgctgatggcgatctatgacacgttatttagccagcttgacgtaacatcatctcagcttcttgttacggatcgtgattttatggatccaagttttgggaaccagctccgcgagactgttaattctctgttagatctcaaggttataccagtatttaatgagaatgacgccatcagtaccaggaggcaaccatacgaggattcatctggcatattctgggataacgatagtttggccagactgttagcgcaagaacttaaagctgatctccttatcatgctcagtgatgtggaggggctctatagcggtccacctagcgatccacaatcgaagattatccacacatacgtccatgaacaacatgggaagttaattagctttggggagaaatctcgtgtgggaagaggtggaatgcaagctaaagtagcagctgcttttactgcttcatcaaaaggaatacctgttgtaattgccagtggatttgcaatcgatagcattattaaggtcatgcgaggagagaaaatcggtacgcttttccatagggaagcaaaccagtggggttgttccaaggaagcaacagcgcgtgagatggccgttgctgcaagagattgctccagacatctacagaaattgtcgtctgaggagcgtaagaagattttgctagacatcgccgatgctctagaagcaaatgaagatctaattacatccgagaaccaagctgatctggatttggcgcaagatattggttacgataaatcattggttgctcggatgaccataaagccaggaaagataaaaagcctcgcaggatcaattcgtgaaatcgctgatatggaggaccctatttcccatacactgaaaagaacagaggttgctaaagatcttgtttttgagaaaacatattgcccattgggtgttctcctaattatttttgagtcccgtcctgatgccttggtacagattgcatctttagcaatccgaagtggaaatggtcttctcttgaaaggaggaaaagaagctatgagatcaaacacaatactgcataaggtcataactggtgcaattccagatgttgttggtaaaaaacttattggcctagtgaaaaacaaagatgaaattgctgatttgctcaagcttgatgatgtgattgatcttgtaataccaagaggtagcaataagctcgtttcccagatcaaagcagcaaccaagattcctgttcttggtcatgctgacggtatctgccatgtttatattgacaaatcagctgacatggacatggcaaaacgtattgtattggacgcaaaggttgattatccagcagcgtgtaatgccatggaaacgttacttgttcataaagatctgaacaggacagaaggccttgacgatttattggtggagcttgaaaaggaaggggtagttatctatggcgggcctgttgcacatgacactttgaaactaccaaaggtagattcatttcatcatgagtataactcaatggcatgcaccctcgaatttgttgatgatgtgcagtcagcaattgaccatataaatcgctatggaagtgcacacacagattgcattatcactactgatggaaaggcagcagagacttttctacagcaagttgatagtgctgcggtattccataatgcaagcacacggttctgtgatggggctcgctttggtctaggtgctgaggttggcataagcacagggcgcatacatgctcgggggcctgttggcgttgatggactcctaacaactcgatgcattttacgaggaagtggacaagtagtgaacggcgacaagggagttgtttacacccacagggagctccctttgcagtga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MGRGGIGGAGLVAAVAKADVENTDSTRGFVKDVKRIIIKVGTAV VTGPNGRLAMGRLGALCEQVKQLNFEGYEVILVTSGAVGVGRQRLKYRKLVNSSFADL QNPQMDMDGKACAAVGQSVLMAIYDTLFSQLDVTSSQLLVTDRDFMDPSFGNQLRETV NSLLDLKVIPVFNENDAISTRRQPYEDSSGIFWDNDSLARLLAQELKADLLIMLSDVE GLYSGPPSDPQSKIIHTYVHEQHGKLISFGEKSRVGRGGMQAKVAAAFTASSKGIPVV IASGFAIDSIIKVMRGEKIGTLFHREANQWGCSKEATAREMAVAARDCSRHLQKLSSE ERKKILLDIADALEANEDLITSENQADLDLAQDIGYDKSLVARMTIKPGKIKSLAGSI REIADMEDPISHTLKRTEVAKDLVFEKTYCPLGVLLIIFESRPDALVQIASLAIRSGN GLLLKGGKEAMRSNTILHKVITGAIPDVVGKKLIGLVKNKDEIADLLKLDDVIDLVIP RGSNKLVSQIKAATKIPVLGHADGICHVYIDKSADMDMAKRIVLDAKVDYPAACNAME TLLVHKDLNRTEGLDDLLVELEKEGVVIYGGPVAHDTLKLPKVDSFHHEYNSMACTLE FVDDVQSAIDHINRYGSAHTDCIITTDGKAAETFLQQVDSAAVFHNASTRFCDGARFG LGAEVGISTGRIHARGPVGVDGLLTTRCILRGSGQVVNGDKGVVYTHRELPLQ</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>134..250#920..991#1091..1194#1275..1377#1465..1626#1751..2028#5136..5286#5503..5667#5785..5862#5992..6081#6168..6254#6344..6430#6502..6598#6741..6844#7143..7218#7662..7812#7954..8022#8116..8182#8333..8403#8617..8695#ctccgcccctccccgtatctctcgcgtttctggtctaagttccacgccacttgttgccgcattccttctccctccctgcaaatccaatccaatccaatcccaccccaagctcgcggaggaggaggaggaggagatggggagaggagggatcggcggcgcggggctggtggcggcggtcgcgaaggcggacgtggagaacaccgactccacccgcggcttcgtcaaggacgtgaagcgcatcatcatcaaggtgagtgaacgagggcgacgtgatgcgcgggttgacgatcccgtcagcggcgtccggcatgcgactgtgtcctcccttcctgtgaaacctgccgttctgccgttgttgttgtttgttgtttcctttttttttcagtgacgatagtttgtttgcgcgatctgtgatcggtgaaactcgaggctctctcgatctgatttgcgaaggatcggagaacctgacaaaaaaaatggccttacaaactgcaatagatttatttcattttttgtttttgggagctgcagcatgcgttccaaaggagtggttctaatctattcttgtgtgctgttcatgttcgtacttacgtttgatagattcatacaacgcgtgaccataagaagaacagcagtagtaggtaatttttagtgaatttttatgagctccattatgacagcatatgctgtcacccgtgatttgtcctttttttctattttttttaatttaaaatcactatggctatatttttatgtttaactctttaccattcatacgttttttaggtttaactatttaccataaatatgtttttaggtttaactatttaccactcattaattagtaccattctctaatgaaggatattattttttttccctctaaatatatgttctgttggctggcttaattcgacaggtcggcaccgctgttgtgactgggccgaatggccggttggctatgggcaggctcggtgctctgtgtgaacaggtaaactttccccccaaatttttttaccagaggttaatgctctgaccaaccgagcttgtgctaatcagtgtcagttaaccggtgtgataaatttcccaggtgaagcagctaaattttgaggggtacgaggtgattctggtcacctctggtgctgttggtgttgggaggcagaggctcaagtaccggaagctcgtcaatagcaggttgcagagagttaattggctctgaacagtaaacagtgttctgctgtagcattcatttctgatctctctcttgcttgcagtttcgctgatctgcagaacccacagatggacatggacgggaaggcctgcgctgccgtcggtcagagtgtgctgatggcgatctatgacacgttatttagccaggttggcgtgccattcctgatggatttttgtgtaaaaaatatgatttttttgcatatattttgacacgttaaacttccttcgctgcagcttgacgtaacatcatctcagcttcttgttacggatcgtgattttatggatccaagttttgggaaccagctccgcgagactgttaattctctgttagatctcaaggttataccagtatttaatgagaatgacgccatcagtaccaggaggcaaccatacgaggtgtgtttcctaatgtgatttgtgtgcactgggagcttcactgatatatacgtattccaaattccattaacaacaaacactaaccttttacactttactgattgtaatgatcaaccgtgtgtaggattcatctggcatattctgggataacgatagtttggccagactgttagcgcaagaacttaaagctgatctccttatcatgctcagtgatgtggaggggctctatagcggtccacctagcgatccacaatcgaagattatccacacatacgtccatgaacaacatgggaagttaattagctttggggagaaatctcgtgtgggaagaggtggaatgcaagctaaagtagcagctgcttttactgcttcatcaaaaggaatacctgttgtaattgccaggtgagtaaagcttgttttcttctatcgttgcatgaattgtagcacaaatgttaaccaataaatatatgtctaaaagataatatactgcaactgcaacaacgatttatattatttttcagtgtataagaactatatgttctacttatgatggttagttacactgtcacgtggtgttgtatttgtacacaagtgtttacacattgactaagacggtaatattttgatattttggaagcactttcctgataataatagttgagaatggagagcagctgcatgcctgcatcacaattttgttttagaaaactcgtggactgctttagttgctactattaaccacctgtacgaggctctggtagagacagtattcaatagtatcaaagtgctgcatcttaattcctacatttggtgtgttattatgaaactagctgggtagcccgcgcaattgcgcggctagcacctaaataaaatcatataattttttagtatgattttacttaaaatttattaaatagctatctcatgtcttaagagtttgaaagattaaaccttatcatccccgtgtttctaattatatatattttttaaaagtcacaccagttgctaccccttatgacatctccttctttatttgcttgctcgatataccactatttctattcattctccttgaaacctttaaaaattagatcttatagtttttagagtttattgtcatgttgggtttcgtttttataatttctagacgtcccgtcaaacgttgccattatactcctctatggcccgtctactgtctcttttctttattgtcattgagattttaaaaatcgaacataattatcgtttcggttcatttttactttctagaaatcccgccaaaccatcagcggcttttccattgtacttctctacggctcgcccgctgagtcccttctttattgtcattgagattttaaaatcgaacatgattatcattgtttttttttaccttttcgaagttcggaacctttaaaaattgaaccttgtagtttttagagtttattgtcttgttgggttttattttttataatttttagaagtctcgtcaaacaatgccactatgctcctttatggcccgtccgccgcctactctttctttattatcattgtgattctaaaaattaagcacaactatcgttgcaattcattttttattttctagaagtcacgtcaaacatcaccggctctaaaactatactactatacaccccgcccactgcttctttttattgtcattgagattttaaaaattgaatatgattatcaatggggttttttttttactttctagtagtcccggcaatcacattgctcgtttgcttcacggcctgcctatcgtccctccttttaatcgttattaggattctatttggtgttttattaacagtttttatatgtcgtatcaaccgccaccactctactcctttataggcctcttacttaatttatctcgtcatgtgttttagatggtctttctttaaatagtctttatttttatcacaaattttagttatttataaattgtattcctaattgaaatcttatttttctttttctaatttcagaatttattttttttcaaattttaattaatatcgtattgtgttattttagtatttttattttttattttcaatttcagttgtttcaaaattgtattcctacttgaactctcttttagtttttctaattttgaatattattttattttttattctgaattttaattaatctcgtattgggtttttatatggattcttatttcaatattgcttatttttaattccaaatttaagctaattttaaattgtattcctactttaactcttctttttttttgctaatttcggattttatttttttattcctaattttaattaatctcgtaattgggttcttatgtggactctttttttaatattccttattttaattccgattttcagctattttaaaattgtattcctacttggactatccttttattttctaattttgttttattttatttttatttttattttgaattttgattattgggttcttatatggaaacttctttcaatattgcttatttttaatttcgaatttcagctattttaaaattgtatttctacttgggtctctttttttctttctaattttggattttattttatttttattttgaattttgattaatcttgtattgggttcttatatggaaacttctttcaatattgcttatttttaattccgaatttcagctatttttagattgtatttctacttggactctccttttctttttttttctttttctccgattaatgtgggaatttctagcctctacagcgaacgtggttccttctttcaaagctgtaatttattataaattaaattttagttgttaaaaataatatcattggatattcatttaaatttaattttatatgattatgattttgttgctacaatgaaaaatttaaagttaaagtttagtttttaagaccgtactaaatttgaacacgccttagcgagttggacggagagatgtatctctaccaatgcataagttttctggtctattttctctttttttcatccataggtaaaaaaaatcacattttaattctaattatactggctccaaaatatatatgcacgcactgtgtttgaatcctaatcacctgatttgttgattgatccttagtgtccatctaggataagaaaagaatcaaagcaggagtacgtccacctatttggacttgtattctagtacttgatcagtgtcgtccgtttgatctagcagttgttttctattcagacttctattatcaaagttaatctacaccatcaaattctagtcccagtataatctaacggtctagatttttcttttttctccgattaacgtgggaatttctagcccccacagcgaacgtggtgcctcctttcaaagctgttttaataatataatagatttcaagttgtcagtaagacagtaagtaggaaagcttgtgtgtattttcccaacagcagtcttgtgattcaactctgctttctaactatttttattatccatgaagtggatttgcaatcgatagcattattaaggtcatgcgaggagagaaaatcggtacgcttttccatagggaagcaaaccagtggggttgttccaaggaagcaacagcgcgtgagatggccgttgctgcaagagattgctccagacatctacaggtattctttcctttcacttccttttgtgaaggaatcaggcaatgcaattttcaagctataacttcaaaaaacaatcaaataattgcgtgttttcttcatgtcatattaaattattacaaaggcatgtcgtcgtctttaagtagtataaatatcaatattgtttattttcttgctgcctttgctaactacttgtgttgcatgtggtcacctaaacagaaattgtcgtctgaggagcgtaagaagattttgctagacatcgccgatgctctagaagcaaatgaagatctaattacatccgagaaccaagctgatctggatttggcgcaagatattggttacgataaatcattggttgctcggatgaccataaagccaggaaaggtaggccagatacatgtgccatcttctgagcggtgtcatctttaagttcattatttgttgaagtgattcttggctgttgtatgaaatgtcctcactatatttaatatctattcgaagataaaaagcctcgcaggatcaattcgtgaaatcgctgatatggaggaccctatttcccatacactgaaaagaacagaggtgaatgcatataccctattctaaaatccaaacacgatgtgataagtactacaatcaatcaatgtgataagtactacaatcaatcatagcttcatgtgatttgtaaccaatgaaggacttgttttgtaggttgctaaagatcttgtttttgagaaaacatattgcccattgggtgttctcctaattatttttgagtcccgtcctgatgccttggtacaggtaaaatgatttttttagttggaaagaaactgtatcagttaactacaaagcaacgttatttatcatattaacataacattgtacagattgcatctttagcaatccgaagtggaaatggtcttctcttgaaaggaggaaaagaagctatgagatcaaacacaatactgcataaggtattatgtacttaactaactgatttagtagtaatgattaatgaagcaatagtaggcttcagtaataccaacatgctgtcttttattaggtcataactggtgcaattccagatgttgttggtaaaaaacttattggcctagtgaaaaacaaagatgaaattgctgatttgctcaaggtgagtatgtaaagtgattctttgggtgataaatttaagaatttaatctaaaccagaagtactctgtgcagcttgatgatgtgattgatcttgtaataccaagaggtagcaataagctcgtttcccagatcaaagcagcaaccaagattcctgttcttggtcatgctggtaagcttgtttttgttattgaattcttgtcactaaatattactagtatgataatggttatttattttgcataaactaagcataatacatttcctttttttattatgatatacattgaatgaatgttttttttcttctacagacggtatctgccatgtttatattgacaaatcagctgacatggacatggcaaaacgtattgtattggacgcaaaggttgattatccagcagcgtgtaatgccatggtacttctctaatttacaaatttattagcgtgtgcccatatggtgatacctctctatttattgtacttttttttaaaaaaatgtatattacgaattgtatgtgtgttctacatcgttgctggccactcatgctaacttacaagtattgttgtcgaacttctggctaaaagcaatagttcactgtggaagatgccattctattcaagtctaactttctatatttgtccacttaatttatttcttggaaaattttatcatttgagcacagatatctaaatattttttatattctgtgcaggaaacgttacttgttcataaagatctgaacaggacagaaggccttgacgatttattggtggagcttgaaaaggaaggtaaaatccacacccttgtagttgaagtattgcagccatttgtatcttgacatgtgttctgcaaaaagtgctacttcctccgtttcacaatgtaagtcattctagcatttcccacattcatattgatgttaatgaatctagacatatatatccatctagattcattaatattaatatgaatgaggaaaatactataatgacttacattgtgaaacggagggagtattttattttattatgagaaatgatgaacagttatgtagctcaacatcaaagatttgatgttcttaattactttcaatgcttctcaagggagcatattacagattttacttattatgttgcagtcaatccaaaattgctttgcaacacgagttcttgtgcaaatcagcaaaaggggatcagaagagcactaatggattttaattgatgtcatgttgcaggggtagttatctatggcgggcctgttgcacatgacactttgaaactaccaaaggtagattcatttcatcatgagtataactcaatggcatgcaccctcgaatttgttgatgatgtgcagtcagcaattgaccatataaatcgctatggaaggtatgcagtttttctccatactatatcctcatcactttttttttttggaagtatgcagtttttctccttactatatccccatcatttcttttttttttttttgaactaaacttgattgtgttaaatatatgttcatttcagtgcacacacagattgcattatcactactgatggaaaggcagcagagacttttctacagcaagttgataggtgtttaactaatttcctttgcacaactattatgtttgccgcttttagtacataccttaattaatggagttattcttctataaattgcaacagtgctgcggtattccataatgcaagcacacggttctgtgatggggctcgctttggtctaggtgctgaggtatgtcctttaaatttgtatcactttataacttggacattttcgttaactagttatcaaaaaaaaatagttatcgaaaatatatgttgttactattgaatggtcagcgtttcattcagtcccctattttctttcctttatcaaatataggttggcataagcacagggcgcatacatgctcgggggcctgttggcgttgatggactcctaacaactcgatggtagggttatcatgccatattgtcttcatgtccaaacattaaggacaatactattgtgcaagatgttttctgcatctagcattttatcatcatacaatattttttcagctaaatgttattatcatactaaacagatggaaaaaatcagtagttttgtatttactactagtatcttcatgtaatatgtgtgcattggtttttcgttatatatagcattttacgaggaagtggacaagtagtgaacggcgacaagggagttgtttacacccacagggagctccctttgcagtgaggtaggtagtgttcttttattttgaaagatggcatactactgattactaaccttcaacatctctggtttcaggtgaagtggcttgtgaaggagctgttgtagagcaattttttgcagacgctcaccgtgctcctccttgagagctgcttctcttcatgacatgcaatgggagcacgaaagcatgtcaaagcaggaagtaatgaagggcgaagtaggtcagaaacttatagtactatgtactatggtgttgctacgtagttgtgtggtattccttattattcattgtaccatgaataatttatgccaatgtcgtagtagctacatgtaactatattggctttcatggacacgtctatggtactagatgtaaaactgctagatggctttagatgaacatctcagatttattttccatagaatgcacatatgaaagtacctgagcgtggcgacgctggtgctttccatgataaagatctggctggtgtagggcggtctgctgctgaagccggagacatgcacatcgcagaagcctaatcatcagactggagcctcaactgaaccatcccgtatctgatctgtttagataaagacagttatattagaaatcgccaataagtctcggacgaaaattcccagcatttcacaacttaagaagttcagaattctagcagctattcgtaatgcatcccattgcagtattgcataacaaattacagagatgaatatcaatctcccagctcagggcctctaaccatgacagatggtagatactctcgtatcagtgtcaacattaggtggggatattacaatattacatccatgtctggtatccacagtaccatcaccattccaaatgtgtcaggataccgttactactactgatgtgttaaacagggatccatcacaaatgtatcaaaattgtctggcagagattccaattctctccaaacaaacaactcagcaatcttttgaggtacctcctgaaagactgagtcatgatggctagtctaatcaatatgttaggctatacaacaattcctacgtcttcagtggttattctgtataaatcagtaaagctcccaaaaaacattaatagagtccgcagcatcttcacc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001051337.1 RefSeq:Os01g0848200]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
