|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 2]] |
| − | GeneName = Os02g0438200|
| |
| − | Description = Cyclin, T/K family protein|
| |
| − | Version = NM_001053275.1 GI:115445920 GeneID:4329229|
| |
| − | Length = 11209 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os02g0438200, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 2|Chromosome 2]]|
| |
| − | AP = Chromosome 2:14785774..14796982|
| |
| − | CDS = 14793448..14793629,14793799..14793880,14794812..14794946,14795026..14795201,14795297..14795448<br>,14795535..14796700|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008395:14785774..14796982
| |
| − | source=RiceChromosome02
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008395:14785774..14796982
| |
| − | source=RiceChromosome02
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggatggggaatcccagacgagtaaattatcatgtgagcacatgtactcttggtacttcaccagggaagaactggagaaattttccccatctaggaaagatggtattactgagataatggagtcagaaattcggcagttgtactgttcattcattcgggatgttggcattagactgaaactaccacagatgactatagcaacagcaataatgttctgccatcgcttctatctgtaccagtcccttgccaaaaacggatggcagacgattgcaacagtgtgcatatttctggcttcaaaagttgaagatacaccttgtcctctggaccaagtaattagagtggcctatggaacaatgtacaggagggacccagctacagctcgaagaatccaccagaaggatgtatttgagaagcagaaagcactaattttgaccggggagagattagtccttacaactgttcggtttgatttcaacatccaacatccttacagaccactacttgatgctatggaaaaacttgggatctctcagaaggaagtgaaacaagtagcttggaactttgtaaatgattggcttaaaacaacactgtgcctacagtataagccccaatacatagctgctggttcgctctacctggctgctaagtttcagaacgtcaagcttcctgtgcatggagggcatgtttggtggcaccaatttgatgttgccccaaaacctttggaagctgtccttcagcaaatgagggagatggttcacatgaaagcaaagctgtttgctcatcccagtccggctaagcaaaaggaagttctttttgaaggaatgctgctcatatcaaatagcccagattctgtgttgactcaatctagcttgtcagtaagcagctcgagtcctgaaattggagaccccaatgaccacctgcaggtggattcaagtcaagacatagtgcatattgaggatcgtagcaagtcatatcctgaaaggaatttatcgaatcttactgctgatatgaataatcccggtaaaacacacaataaagaaagcttggatcaggccttaaaaatcaaacatggtggactgatctcatgtaatcagcagataccattagatgcaattgcaaagattgatagcagcactgctaaatgcgtggaacagaatattggcatttgttgcagctcaagtaacacattcaatggcaaaatcttgaacccgttctcaataagtcagcgaagtggtgataaaacaaagttatgctcagagggtggatcatcgcttacagatgtggacagcaaaagcactcaatctgtcgaaccgcccactacaatttgtaaccataccagtgacagtctcaatgtggacagtttgtgctctgatcagagactggctaattccactgcaggtaccacggagaaggcatcatttgtattgcctgtccagataaaggttgatcatttgtgtgtggagcgtaaaaaggtagatgtggcacggataaaggatttgttgatgaagaggaagagacgaagagaaagacaagggcggtgcattccttcagttgacctaagtgaagaagcctggattgagagagaacttgagtctggtatagtttttaaaaaagttgaccatgttgttgcatcgtatgatttaagtgatgaaggctggattgagagagaactggaatctggaattgttattggacaaaaaaatgaccagcctgtatctttagatggtttgactgaagatgattggattgagagagagcttgagtctgggattatagttgaaccaggaccagctggtaagaagctaaagtcaaagcttctttcagagggtcatgagataatgaatagcaggtgggaaataaatggcaaatcaatgcaaaatcaagtcacatag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MDGESQTSKLSCEHMYSWYFTREELEKFSPSRKDGITEIMESEI RQLYCSFIRDVGIRLKLPQMTIATAIMFCHRFYLYQSLAKNGWQTIATVCIFLASKVE DTPCPLDQVIRVAYGTMYRRDPATARRIHQKDVFEKQKALILTGERLVLTTVRFDFNI QHPYRPLLDAMEKLGISQKEVKQVAWNFVNDWLKTTLCLQYKPQYIAAGSLYLAAKFQ NVKLPVHGGHVWWHQFDVAPKPLEAVLQQMREMVHMKAKLFAHPSPAKQKEVLFEGML LISNSPDSVLTQSSLSVSSSSPEIGDPNDHLQVDSSQDIVHIEDRSKSYPERNLSNLT ADMNNPGKTHNKESLDQALKIKHGGLISCNQQIPLDAIAKIDSSTAKCVEQNIGICCS SSNTFNGKILNPFSISQRSGDKTKLCSEGGSSLTDVDSKSTQSVEPPTTICNHTSDSL NVDSLCSDQRLANSTAGTTEKASFVLPVQIKVDHLCVERKKVDVARIKDLLMKRKRRR ERQGRCIPSVDLSEEAWIERELESGIVFKKVDHVVASYDLSDEGWIERELESGIVIGQ KNDQPVSLDGLTEDDWIERELESGIIVEPGPAGKKLKSKLLSEGHEIMNSRWEINGKS MQNQVT</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7675..7856#8026..8107#9039..9173#9253..9428#9524..9675#9762..10927#aaaagtctaattctcctccctgctacagtgtcgtcttcaagcttggacagaagcccgagctgccgtcctgtgctctagccgacgccgcttcctccaccaaatccgccgcatcccgtgctccgtttgcaaaattagttgaggggaaatattcctcttatcctcctctatcctttcccccaagaatcggactttatcacgaagaaatcaacgcggaatcgaattcgttttcgagtttatctctccaactaaccctcggattttccggcttcgattcctctcggttggagtccgatctcttcaatccaagcctataaatagcatcccctagtcgtcctctttcgtttgccccatgtcccgagctctctcgtgccccgtagtgccgccgccgcgccacccaaaccgccgccgtcgccggccggcgaacagccgcctcgcgccgtcgttttagccgccgccgccgcctcctcacgtcgccgtcgggtgcgcgtggaagaggggaagctcggccgccccttcgccgtcaccaccggtcaccggagagccgccgccgccgcacaagctcgtcgccggtcgtcgttcgtcgcattggttagtaccggtgagatcgcgttgttctcctctacgcgtaggtaccctccaaaagtccggccgagtcttctagcgccggcgaggtcgtcgctgatgtcgagtcgacattgatgatgtcagcgatgacgtcattaatcccttttcttagttttctctattagatgaaaatcgattaaacttcggaaattaataactaaatcatcgtacctcggattcgagtggttcaagttgctaaatttttctaaaatcaagatctacatgttaaaaatatccacatgtactggttatgcttgtttttgtactattttgttgattttgttctttcgttttagtttccgacgttccggaggagagcgttttcgttgaggaaggttcggaagtgtttgcggaagctcaaggcaagtcacaaagatcccaaacaaccctttgagcatgttgaacccgtttaaagctattgtttgatttcaacttatgcattattttcgaatgtcatcgggtggtgagcctttcacaattaattaatggccgaagatggctttattttcctatgggttataatttgattagctagaaccttatatattggtttgggttcagctaaatgctatatatatataattgcttagccatgcttagaaacattagcacatgattgggataactaatgttacactatcacttatggttatatttaatggtagctcacgatggtcaatcgtgattggttaattaattattgccaattaaaatttgtcaatggtgggttgtgagcacatggttgtgaaggtcgtgctcatggcaattaaggaccgattcgcgagctactgttgtaaaacattaaccgtgccaaccacaagccagcataggcaacggctttaccttttgtatagcatgattcattgcggggcaccagactgagaagcggcgagaagtccgtgggggtcgctggggagtccatgcctctggttgtatttatagagggggtgattatgatccaggtatggtgcactgtggtgagttgtgttgtgcagagggtattgtcatagcctctattcgggtactttccagtatcgcgacgcatggtagacatgatgttgaggctgtgtcttgtaggtacagtggtacacctctggccagagtaaaactattcgaatagccgtgcccgcggttatgggcgagttgagcaatgtttttcgtgattagtctcacacatctcacaataattattgatgctataattggtaataatttgcttagctcctggtttggagttagatttgtacagccggggttggttgttcaggtttggttgggcctgtacagcattggggtgctgttcagtgttgattaaaattgatgattaattactctattgttttactactcttaaatctttgctaaatgctgcttttacaaatgagcctatattatgccatcctttggtatccttgtgcacttgcatatttgctgtgtggcttgttgagtatgtcatatgcttattcttgcaataatcaatcaacctcaattgaagaaaagggatccagaaggagaagacgtttggcttataccccagttgagctgcctgtgggaatggagctgaagtcatcgctagaccgttatttccgctgctgttttcttttcttttgtaagtatgtaacgttattattatgatggatttgtatattaaattgtcagtttgtgtacctcggctgattcctggacgagggttttatgcacaaataagttcggaaattactagtgaatttccggacgtggcaacgaccacgagtgggcctgccgctgctctactcgccgcttgccagagatgagcccgaggatgccgtcgatgctccacgtcgcgatggccccgacgttgctccacttggtgcttgccggagacgagactgccccgcccacactgtcggccttgatccacgtaggagaaagccaaccttgttttgcgccgtcggagttcaattcgctgatgccggagttcggtcccgccgccgaagctccaccgccaccgagcttggttgcatcattggaacttgatttgccgctggaggggaggggatggatggggaacgggagagggtagacggagatgggtggcgccgacggagatggagaggagagtaggcgatgaagctgggggcgatgttggtgaggcggcgaagatggagaggcgtcggcgtcttcgttgggacttgggaggggatgaggattaaatgcaattgggagcgagagaacggggtgagggggaggaaaaagtaagggatggctgacaagtgggtcagtgggcaggcatgattatgtgtgtagatcttttttttttgttgcagggtctgaaatataaaaaattggatggtttgttaatacaaaatataggaagggctgacatagaagaatttaagggctgagatgaaaaaaagttgttaggtggagcctccattgtggagctagtgtccatataggaacctcatcctatgtggcatagcgaggcatgattttgagtagattgtactgctattgtccttagggaatccacaatgtgagccacttctagagtgctgtagaggaactcagctcggaatggaggatacccctggatgggctcctcaaaatctgaaacaacttaatagagacactccaacccacaataggtatcacagcctacaaagccccatatttatttttactatcctacccctaatctctctctctcttgccccctcctttttttcgccaccgcactcgcctctccctctcgccgccgcctccaactcaggcccagcgcaccgctgcggtggccgacggcaagcggcgagaggcgggtggcatcctccctggccttctccgtcacgccatcgtcgccacccaccccagctctctctctctccggtggcggccgcaagggcgacgagtaggaccaccctcgccgccggagctttgtcgacgagggcgacgaggagagccgcctactccgccgcgaacccgttgcctccgccggggatccgccgttgccgccgctcgccgcgcgctctctctctctcgtcgctgctatttccggccgtagctcgagatcccgccgctccctctgccgatggctaagacgagcccggcagacggctgccgcacggtggccgactccgcccaccgcctctctctctcccgctagcagaggctgaggagacggcgcacctcggcggtgcccgaggaggagctcggctcagcggggtaggccgtctcgcgatgagaacggaggagaggagagagagggggagaggggtggaaggggaatatggtggtggagagacagtcgcctgaggcgtctgtcgccgcagcgcgtgcctctagcccgttccctagccgaaaaggaggaggcgcgtctcccaagcaggggtcgcgcgccatcaccagggcatggctcgaacggaaaagcgaacggccgtcgctggggcgggttgaagacacattgtagatggccttattcacccagtgaatagctaggagtaatttagaattatatatttgagaccaaaatatgatagcagaattagcggcgaggtccgaccttggaagtgagctgtttacacggtacagaccagtgacaccggatagtaggggaggcagtttgagacgttggatgcatttcaagggtggattttggggcactggacgcaagtcaatagtatccgagtgcagtacggcgtaggtggcctccgagtcgtcgcgcccggcctagggaaattgatctcccccgcatccccgtcccctcggcctcgactgcccacccgccgcctgcgccgatctccatctcgcgagggcgagtagcagcctgctgcttctgccgcatcctcgcaggccggtgagcaccctgctcgcgtcatcctctttttaatcccttatcttctctcctagatctggaagcttttctctccgccttagttccacaaacaatagatttgggggttcaactgaaccccatcatgcccccggttaggtcaaagattctgtctttggcgaattgggaggtgaattcatgggtgagccgacgagcttcgtcgtgatttcctattcaatttggggatcttctcgctgtttgacgtattggccgtatggcatatgcagaagtcgatgtgaattcattgcttctccaccttttacaacgatatcttgtgggctagattttttgtcgggctgggactagcttgtgtgtattcttgattttgtcttcaaagatgttatcctaaaggggtggacaaactgctttgcttttgtcgagaaatttggtcagtttattaactgggagttggttgaaattacacccaaagtctgccaacttttagtgagcgcagtttgtagaatctattatttacttggtcaagaagattgtgcctatacataaatagttactgctagttgagaaatcttttctacattcagttaagcttggatttggatgagatattacaatcttctgccaacaaaagacatagttttcagcatgttgtttttgttgtaaccagaatttctatactgtgaagattgtatgtacaacagaaaatttctcttatgccgcaaagctgcatgccatactcttatttgccacatgatttgttggctttgtaaaaatgccacaaagttcagttgtatactcgtttatctgccacactttaccattttaacccaccaaatgtgcaattttcccttcttctgcaccctctttctctcttctatgagtttgtgaatggagcttggccgcacgggctggtgcccactgtgtttggcccaacagaaaattatatcttaaaaatgtatgtctctctatgggcttttacacccaggcctaggacctaggtccgccactgcggccgggagcagggcgcgtggaactggctttcaggaggaaagccgtgcgcggagtaggtgggctgcacagagccagttgctgagggcaggacgcatattgttgtgctgctggcggccagaggcggaggtaatgctaaggttgaagctggctactggagctagggtgtcatagctcatgccgagctcaggtgcacggagatggcgtgcgcgttggacatgcaggagtggggcgtcggacgtgcaggagtgggctggctgccaggtctggctcaaactttggccggacagagctaggtctgtccttgctggacacagagaagaagggtggggataggacaaaaatggagaaggagaagaaggtgggcattaatttggaatttcacactgtattgtggtaaaagaatgaattggtactcaattttgtggcattttagtaaaggcttcaaacttttgttcaaaatgagagttttcgcatccaactttgtggcataagagcattattctctttgtataatggaataccgttaacttgtctcaggtgcaattgttattaagcagaacccaagggccgtgtaccacatccttgaaattgtgtattgtctgcttctaaccggaaaggcaatacatgcgaaaactttcaatgggtaatgtgtagttgcacattgatatatgggaaaaacatgcagtggatattaaacatgggaaaactatcgcataaatttctaaaatatctcacatacaggaaggttatattagacaaccatataaaatttcaggacatatgaaattgataaacagtgaggaaaaaaagagtattctttatttgtgtttttttctttgctatttgtaaacttaatatctcacaaacaaagttgagttttatcttgaattttgtatgcccatctaatttcatatagctatcattgagttctttttttcaaataaaactctttttgagaacttatattctgtggtttacatgtttccgacctagttaaacatttcaccatgtatttacactggatatctcggaaatctcacatcgtactcctatatccacattgtctcatgtatagttgtcgatagatcccatccatacaatgctccacattgcatggcaacagatcagaatgtctgatgtttgcacttcagagaacacaaacaacaatttaattggcacataagagggcacaaacaacaatgaactgaaatgaacagacaaatcagtaattgcaagatgtttgcatagaaatcttgaaatgcaactgataagtgattatggttacaaattggaccatgcaagtaggctttagaatttctaagctctgctcagtgctattttccttttattagtgcattgaggcggatcaaactcatctacatttttggtaaggttttggaatttagactttggaattcaaactcatcagcacacattgatttcctctggagtatagacgcttcaatgccggatatcgtcttccattaggagtacatgttcaaaagattcaatctcgtggaattcacatgtctgtacaggttctgaacaaaagagttttaaatggaaggaaatgtaatgaatataactgcacacagcattttgatgaatataaatcagtatccgtgactcttgattagttatggataaaattgaaataggtcatcttatggatttcttttaaagtaaaatcatcagatgattagcattttaatgatgatgacatggcttaatatgatggctcatgttatactcaaaaatataggggagagattttctgggatggaatacattagtatcttgttataccatgtatgttaatttgattaaaaaatatcatcttcatcaatataatttattttcctttgtggctatgagaaacttttttaacatttctgttaatttcgttctctgccaattgagggaaagggaggtaaaaatgttcacagtagcatggtgaatgcaactgtagcaagctatcaaaggaatagatcatgtaaaacatgcacaatttagctataatctgtacatattggcttaaatttacattcataatgttcgttgctcagtatgtggattcatattgtagatatttttattatatacataaatttcatggttctgcaggctgttcagcacaagcaattcggaagttctgtctgaaactacactgaagattttggagggtccttaagcaggttttttcaaacatactgatggatggggaatcccagacgagtaaattatcatgtgagcacatgtactcttggtacttcaccagggaagaactggagaaattttccccatctaggaaagatggtattactgagataatggagtcagaaattcggcagttgtactgttcattcattcgggatgttggcattagactgaaactgtatgtgccaatttccttgttgagtgtaccttttaatgtcagtatagctcacttttcaaacttatatgttggttttacggctagtttgtgcccttagttagcacacaataatttcttttattctggaagtttgctaagcttgttacctattttaacatttttctttcagaccacagatgactatagcaacagcaataatgttctgccatcgcttctatctgtaccagtcccttgccaaaaacggatggcaggtaaggagcttttttttttaatttatctcttttgttgtggtgggttggtgtcttttagaaaaagcatttttctgaaagaatgttttagaaaagcaattggatacaatcttctctttaaaaaatatttactggcaaaggttctcaaggaacatatataacccttgcatattttttatacttgatcagttcatatactctttgcaacttgtgcttaactttccgatctattatcggttgtacaataaatatgaagctgcataataacactaacatttaatcttgtattgcttattaagtgcatggcgatgttacagtgccattaggtgatttagaaattcaattccaaagggatctacttgtgccaatcagtaatcctatattgtaattccttacttttttactgtgctgtaaagttttgatatagtctgatttatggttgatttgcttgggatgtttggaagatacaatagtattgagatgtattgtacaatacaatagaacatcctttttgaggacaagtctgttcagcattcctgttgaagttacactattgccattagccaacaggaatacagcttacaatcctgttattagaagctaaaatactataactgaccatctaataagtataaatcctccagtaagttttatagatttgattcgcctcaccacattcactgtattcctgtcatgcggttatttaattgagaaacacattcttgtctctgcaattaatctggagttgtgctcgttatctgcacttgcagatgttacttgctgacatgtttcttcattgctcaagaaaagaaaaaaaaagctgtgcatgtgatgcaagctgtctataactaaatactattacaagtaattggtgtttattttatttgcttattgtcattccagagccaatagctttacttgttttttattgcagacgattgcaacagtgtgcatatttctggcttcaaaagttgaagatacaccttgtcctctggaccaagtaattagagtggcctatggaacaatgtacaggagggacccagctacagctcgaagaatccaccagaaggtatagttggatcattaattgagttttcagtatatatgtaccatccagttaatggttgacaagtagtatctatcaacaggatgtatttgagaagcagaaagcactaattttgaccggggagagattagtccttacaactgttcggtttgatttcaacatccaacatccttacagaccactacttgatgctatggaaaaacttgggatctctcagaaggaagtgaaacaagtagcttggaactttgtaaatgattggtatgagatgtgacatatcactttgtgacattattgttttgatgcttcattcattcaactgatcaatctggatgtattcattctgttgctcgtaggcttaaaacaacactgtgcctacagtataagccccaatacatagctgctggttcgctctacctggctgctaagtttcagaacgtcaagcttcctgtgcatggagggcatgtttggtggcaccaatttgatgttgccccaaaacctttggaaggtatgtagactactaagctgaaacataatagtaccttgtgtattcttggtatttacagtaagagactaagagttacactgctatagctgtccttcagcaaatgagggagatggttcacatgaaagcaaagctgtttgctcatcccagtccggctaagcaaaaggaagttctttttgaaggaatgctgctcatatcaaatagcccagattctgtgttgactcaatctagcttgtcagtaagcagctcgagtcctgaaattggagaccccaatgaccacctgcaggtggattcaagtcaagacatagtgcatattgaggatcgtagcaagtcatatcctgaaaggaatttatcgaatcttactgctgatatgaataatcccggtaaaacacacaataaagaaagcttggatcaggccttaaaaatcaaacatggtggactgatctcatgtaatcagcagataccattagatgcaattgcaaagattgatagcagcactgctaaatgcgtggaacagaatattggcatttgttgcagctcaagtaacacattcaatggcaaaatcttgaacccgttctcaataagtcagcgaagtggtgataaaacaaagttatgctcagagggtggatcatcgcttacagatgtggacagcaaaagcactcaatctgtcgaaccgcccactacaatttgtaaccataccagtgacagtctcaatgtggacagtttgtgctctgatcagagactggctaattccactgcaggtaccacggagaaggcatcatttgtattgcctgtccagataaaggttgatcatttgtgtgtggagcgtaaaaaggtagatgtggcacggataaaggatttgttgatgaagaggaagagacgaagagaaagacaagggcggtgcattccttcagttgacctaagtgaagaagcctggattgagagagaacttgagtctggtatagtttttaaaaaagttgaccatgttgttgcatcgtatgatttaagtgatgaaggctggattgagagagaactggaatctggaattgttattggacaaaaaaatgaccagcctgtatctttagatggtttgactgaagatgattggattgagagagagcttgagtctgggattatagttgaaccaggaccagctggtaagaagctaaagtcaaagcttctttcagagggtcatgagataatgaatagcaggtgggaaataaatggcaaatcaatgcaaaatcaagtcacatagaatatgagatatccatacagataggagcaccattgtttactcgtgttctttatttgattgaattaactatacacctcgtgtacttgaaatgctaggggtgtgcatgggaaagatttttgttctttgtataactagtaacagtgggaattcacaatttcaatctttaggttgtaggtgcaactgtacaataattaagtgtaaatgtacaatccgtccttgttagcagctaatccttcattgtaaactgtacctgtcatcaaaacgaaaataatgttctggtgt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001053275.1 RefSeq:Os02g0438200]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 2]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 2]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
