|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 2]] |
| − | GeneName = Os02g0530850|
| |
| − | Description = Hypothetical protein|
| |
| − | Version = NM_001186073.1 GI:297721278 GeneID:9268239|
| |
| − | Length = 7474 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os02g0530850, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 2|Chromosome 2]]|
| |
| − | AP = Chromosome 2:20388330..20395803|
| |
| − | CDS = 20388330..20388652,20389600..20389888,20390016..20390114,20390196..20390288,20390384..20390608<br>,20390697..20390929,20391007..20391069,20391152..20391262,20391336..20391401<br>,20391470..20391580,20391661..20391735,20391876..20392134,20392427..20392927<br>,20393018..20393105,20393197..20393455,20395161..20395803|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008395:20388330..20395803
| |
| − | source=RiceChromosome02
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008395:20388330..20395803
| |
| − | source=RiceChromosome02
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggctccaagcaaggcatggatgggccttgtggatgatcggctaaatcacgagtacttagagggtgtagagaagttcatagattatgcattcagtaaattagatggtgtccaggttatacgttgcccatgcatcaagtgctgcaatacatattctttgcctcgtcacatagtgtcttctcacctgaaagcgtatggaatactgaggagctacacattttggtaccatcatggtgaagtcttagcagaacaagagaatgacatagaagttgatgagtatgattcacaggaatttaatggggaaggatataatggaatgcaagacctgatggaaaatttatttcctcagtgcaacacccctggtggagacgaagcgacacatgaatctactgatcagggacctgaagaggagccaaacactgatgcggccaagttctatgctttgcttgacaaatacaaccaaccactgtatgaagggtccagaacctctaaattatctgccttagttaatttgcttcatgttaagaatttggggaaatggagtaataagtccttcaccgcattgttggaattgctgcgcaaggactttctacctcatgactctacactgccaaattcttattatgaagcaaaaaaaactattcagggttcaattgctgagggatacattgcagatgagtttatgacattaagctctaggtacttggatgatgtcgagacaaaacacaatcgtccaggaagaatacatgacacatctattggtaacaaatttaatttatcaatcttctcctgtgctggaaggcccattggttctcgtaaaactcgagatcttgatatgcttgaatcagaacaagctcatatttatattctgcggaattgcgatgaagtccaagaatatatcagtgagtactgcaacagtacagagggttcttcaatggtacaatttacctcaacatggaacaaaaaattcatcaactggtttaaagagaagatatatcagcagcaccagcatgataagagtgaggtcatggaagaccttttgtcattgtcgcgtggtccgctgaagaatataacatgctttactggatatgacatgaatgggttcagatatcgcacagaaagacgggacagccgcaggtgtacacaaaacagtggtgtgatggttcttggtgatgatgtggaatattatggagttttgacagaaatacttgagattcagtacttaggtggaaggagggtgccgttatttcgctgcaactgggttgatgtatttaataaagaccgtggaatacggatagataaatatgggcttactagtgttaacctacagcggttgcttcaaacagacgagccatttgttttagctagtcaagctgctcaagtattttttgtgaaagacaatcagatcaaaggttggcacttgattgagaaaatgcaaccacgtgacacttaccaagtaccagcaggagaatcagatgacgaaagcactgaagttgttgtgatgatttctggaaggtatggaagaaatagagtgtctgcactacaaaacaacaactcgaagttcattagtcctggactacttcagcaacaagttgcaagacggacagcaccttcaacagctgatgatttatttgggtcaccagagaacatggtgtcagctacagctattgtgcaagaaggaaagagcaagcctgtctatgtaaggcagagcaatctaaagtaccagaaacacactgctgtgccacaacctggagaggaggatgattcagacgaagagtcaatagacacatggcttcggagagctagggaatataacaattccaaaaacatgggcgatgcaaatgatgataccaccgaagaggatggcgtacataatagtaatcaagctgctaaaagaagacttcgtccgcaaactaattcacgtgctccaagtgatggttctcaatcagttaagcgcagtagctgtggcaaaaacaaatgtgaggactgcatcgtctcaaggaatattagtaatagcaataatggatcccatgcttcggatgatgcacataacagtatccttgctgcaaagagaagacgttctactcaacctaatttgcaagatacagaacaagatactgagcaagatgtaattgaacgagtccaggtgcagagtttgaatggtaccttacaaaatggtactaaaatggttcagcacaagggccatggcaagaacaaatgtaaggaagttgccaaactcaaggagaaccaaaaaattaaagttgagttttacaacaatcgtgctctttcgaatagtttgtcacgtcatctgggtagaattgttcgtgatcggaacattactccggtcaaagtgaagaaatggtcagacattagtaacacagagcaggaacacatatttgcctcgattacagacaagtttgaaaatgaagatccagatattaaaattgatgtatacaaagatgagataatggaacatgccaagtctctttggattaactggcgtggagatttgcatcgacattttgtgaaaccggcaaaaactatgcagcaggctacaaaaaataagccaaaggattttgacccatctgattggcaatggcttgtccaggagcatttttatagcaaagattttattgcaatgagccttagaaactctcggaacagagcaggcttaaaaatgcctcatcgcactggaagcaaacccttcaaagagataatctacaatatgggaggaaaggaaaacagaccaccaactttggatgagttattctttgagactcgcaagaagggagacactttggtggatgttgaatcttctaggatgcatgcagaacttgtggatgtagttagctcagatcctaatctctccaatgttgaagttatggataaatgttacaacggtaataagcggcgtgatcatttaattggatttggtggtggtgtcaaagcaagagatgtacgaggcccagcacttagcaaagctgaattgcatgctagacttcgagcaacagagagggaaaacaaaatgcttcgagaagaaaatagtcaggttgttgagtctgtaaatcaaatgcagaatgaatgggctgagatgaggagagactattatgctaacttccttcacttgcttgaagactatggctcgtcatcttccagtacaccacgcgacgtgtttgccatcggtggaactagcacgtatgaacaggctaacgcagaggcggagaaccagacggccacgccagcccaacatttcggcaccgttaatgcaatattgagagaagcaccctatgaccccgtgcttaacgatgacctcgcacgatggacggaacgactacgggaatcggtggccaatctcagtaacgcattcgaggaagctactaccagagcacaaccggaacgaccaacagctggcggtgccgacggtgaaccaccggagtag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MAPSKAWMGLVDDRLNHEYLEGVEKFIDYAFSKLDGVQVIRCPC IKCCNTYSLPRHIVSSHLKAYGILRSYTFWYHHGEVLAEQENDIEVDEYDSQEFNGEG YNGMQDLMENLFPQCNTPGGDEATHESTDQGPEEEPNTDAAKFYALLDKYNQPLYEGS RTSKLSALVNLLHVKNLGKWSNKSFTALLELLRKDFLPHDSTLPNSYYEAKKTIQGSI AEGYIADEFMTLSSRYLDDVETKHNRPGRIHDTSIGNKFNLSIFSCAGRPIGSRKTRD LDMLESEQAHIYILRNCDEVQEYISEYCNSTEGSSMVQFTSTWNKKFINWFKEKIYQQ HQHDKSEVMEDLLSLSRGPLKNITCFTGYDMNGFRYRTERRDSRRCTQNSGVMVLGDD VEYYGVLTEILEIQYLGGRRVPLFRCNWVDVFNKDRGIRIDKYGLTSVNLQRLLQTDE PFVLASQAAQVFFVKDNQIKGWHLIEKMQPRDTYQVPAGESDDESTEVVVMISGRYGR NRVSALQNNNSKFISPGLLQQQVARRTAPSTADDLFGSPENMVSATAIVQEGKSKPVY VRQSNLKYQKHTAVPQPGEEDDSDEESIDTWLRRAREYNNSKNMGDANDDTTEEDGVH NSNQAAKRRLRPQTNSRAPSDGSQSVKRSSCGKNKCEDCIVSRNISNSNNGSHASDDA HNSILAAKRRRSTQPNLQDTEQDTEQDVIERVQVQSLNGTLQNGTKMVQHKGHGKNKC KEVAKLKENQKIKVEFYNNRALSNSLSRHLGRIVRDRNITPVKVKKWSDISNTEQEHI FASITDKFENEDPDIKIDVYKDEIMEHAKSLWINWRGDLHRHFVKPAKTMQQATKNKP KDFDPSDWQWLVQEHFYSKDFIAMSLRNSRNRAGLKMPHRTGSKPFKEIIYNMGGKEN RPPTLDELFFETRKKGDTLVDVESSRMHAELVDVVSSDPNLSNVEVMDKCYNGNKRRD HLIGFGGGVKARDVRGPALSKAELHARLRATERENKMLREENSQVVESVNQMQNEWAE MRRDYYANFLHLLEDYGSSSSSTPRDVFAIGGTSTYEQANAEAENQTATPAQHFGTVN AILREAPYDPVLNDDLARWTERLRESVANLSNAFEEATTRAQPERPTAGGADGEPPE</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7152..7474#5916..6204#5690..5788#5516..5608#5196..5420#4875..5107#4735..4797#4542..4652#4403..4468#4224..4334#4069..4143#3670..3928#2877..3377#2699..2786#2349..2607#1..643#atggctccaagcaaggcatggatgggccttgtggatgatcggctaaatcacgagtacttagagggtgtagagaagttcatagattatgcattcagtaaattagatggtgtccaggttatacgttgcccatgcatcaagtgctgcaatacatattctttgcctcgtcacatagtgtcttctcacctgaaagcgtatggaatactgaggagctacacattttggtaccatcatggtgaagtcttagcagaacaagagaatgacatagaagttgatgagtatgattcacaggaatttaatggggaaggatataatggaatgcaagacctgatggaaaatttatttcctcagtgcaacacccctggtggagacgaagcgacacatgaatctactgatcagggacctgaagaggagccaaacactgatgcggccaagttctatgctttgcttgacaaatacaaccaaccactgtatgaagggtccagaacctctaaattatctgccttagttaatttgcttcatgttaagaatttggggaaatggagtaataagtccttcaccgcattgttggaattgctgcgcaaggactttctacctcatgactctacactgccaaattcttattatgaagcaaaaaaaactattcgtgaactaggactaagttacataaaaattgatgcttgcaagaatgattgcatgctgtactggaaagaagatatagatgctgaatcctgcaaggtatgtggatcatctaggtggaaagaagaaaaacacacaggggaaattaagcactcttcagctgggaagaagattccacataaaactatgcggtactttcctataaaacctagattgcagaggttatttatgtgtaggaaaacggccgcatatgctaagtggcacaaagagtgtagggttgatgatggagttatgcgacatcctgctgattcaaaagcatggaaggagtttgataaaatccattcatcatttgcatctgaacctcggaatgtgaggctttgtcttgctagcgataggtttcagccgtttgctaacatgcgaacctcctattccatctggcctgtattccttgttcctcttaatttgcctccttggatgtgcatgaagcaacaaaatgtaatgttgtcaatgctactaccaggacctgatggtcctggggatgcaatcgatgtttatctgcaaccattgatagaggaactgatagaactttgggaagatggagttgacacatatgattcatcaaccaagacaaatttcaagctacgtgcacagctcttctttggacagtgcatgacttccctgcttatggaaatatatcaggccatagcacaaagggaaagttggcatgtccagtttgtcataaagaaacaaattcaatgtggcttaagaaaggtcggaagttttgctacatgggtcatcggcgctttcttcgcagaagccacagatggagaaatgacagaacttcttttgatggtacaaaagagagccgagaaccaccaaaggagttatccggagatgatgtgctcaagcaagtgcaggatttacagggaattatattgtcaaaggatatgagtaagaagacaaaagtatcacgcagtgataggggagataactggaagaaaaggagcattttttttgagttaccatattttaaaactctattgctacgtcataatcttgatgtgatgcatatagaaaaaaatatatgtgatagcattattggaacactaatgaatgtcaaagggaagaccaaggacaatattaatacccgtagtgacttaaaactcatgaacctgaggccagacttgcatccagtagatgatggaggaaaggtggttttgccacctacgccttacacgttatctccagaccaaaaaaaaaagcactgcttagtttttttaaagaattgaaagttcctgatggattttcttcaaatataagtcgttgcgttaatatgaaagagcggaaaatgtcaggattgaagagccatgactgtcatgttattttaaatcgtatactccctcttgctctgcgtggactgctccctgaaaatatttatgaaccacttgtggagctatcccagttctttaagaaattaaattcgaaggcattgtcagttgaacagcttgaagaaatggatgctcaaataccaataattctttgtaagcttgaaaaggaatttccaccatccttctttgatgtcatgatgcatttgcctgttcatttggctagagaagctctaattggtggaccaaccatctatcgatggatgtatttatttgagagacaaattcactgcctaaaatcactagttcagaatatggctcgcccagagggttcaattgctgagggatacattgcagatgagtttatgacattaagctctaggtacttggatgatgtcgagacaaaacacaatcgtccaggaagaatacatgacacatctattggtaacaaatttaatttatcaatcttctcctgtgctggaaggcccattggttctcgtaaaactcgagatcttgatatgcttgaatcagaacaagctcatatttatattctgcggaattgcgatgaagtccaagaatatatcaggtatcccttgataaaaatggcacttatttatgtcatgtttcttacgattcatttcacaagcttatgtaatttctaatttaaaatgttgcagtgagtactgcaacagtacagagggttcttcaatggtacaatttacctcaacatggaacaaaaaattcatcaactggtttaaagagaaggtaatatttatataattacatatatggaataaaccgtttcaaatatgtatatttgttgatgttattttttttaatctttttgccctgtagatatatcagcagcaccagcatgataagagtgaggtcatggaagaccttttgtcattgtcgcgtggtccgctgaagaatataacatgctttactggatatgacatgaatgggttcagatatcgcacagaaagacgggacagccgcaggtgtacacaaaacagtggtgtgatggttcttggtgatgatgtggaatattatggagttttgacagaaatacttgagattcagtacttaggtggaaggagggtgccgttatttcgctgcaactgggttgatgtatttaataaagaccgtggaatacggatagataaatatgggcttactagtgttaacctacagcggttgcttcaaacagacgagccatttgttttagctagtcaagctgctcaagtattttttgtgaaagacaatcagatcaaaggttggcacttgattgagaaaatgcaaccacgtgacacttaccaagtaccagcaggagaatcagatgacgaaagcactgaagttgagcaagatgatggcaatgaagaagacatactagatgattctccctcagcatcactaaaaagaaagagaaaaccatgatgatgcttgtccttacattccttgtttgcataaagatggaacattcgcagtccttctgtgttcttatctgacaattatattgatccataataatgataatttccttttatcatttcaaattttattgataaaacataaacattttattttatcttttgatcgctatcagataacaattgttaattattttaacactagtgtagccttgtaggttgttgtgatgatttctggaaggtatggaagaaatagagtgtctgcactacaaaacaacaactcgaagttcattagtcctggactacttcagcaacaagttgcaagacggacagcaccttcaacagctgatgatttatttgggtcaccagagaacatggtgtcagctacagctattgtgcaagaaggaaagagcaagcctgtctatgtaaggcagagcaatctaaagtaccagaaacacactgctgtgccacaacctggtaattatccttcatgaatgtatattcaaaattaaataatatttaccaagtaacaatagaattaatatgcttcttttctgataatattgaacaaatagctagctagtatgcttattaaaactaatttcttgttttcttaggagaggaggatgattcagacgaagagtcaatagacacatggcttcggagagctagggaatataacaattccaaaagttagaatattcccctctcaatatctactctacttatgccatatatatttttatatcaacagcattaacatgtattgtagacatgggcgatgcaaatgatgataccaccgaagaggatggcgtacataatagtaatcaagctgctaaaagaagacttcgtccgcaaactaattcacgtgctccaagtgatggtacgacaagaatttattttattttctacataaagtacttagtataatttgtttttcaattgttttaggttctcaatcagttaagcgcagtagctgtggcaaaaacaaatgtgaggactgcatcgtctcaaggagtaaactagtaacaaaatgaaatattgttaagttacttattttgtcctcgtatcaatttgttgtgtcatgtagatattagtaatagcaataatggatcccatgcttcggatgatgcacataacagtatccttgctgcaaagagaagacgttctactcaacctaatttgcaagatacagaacaaggtatattaaaacattcaatacaagtttttccattcaataaataaatttactataatagttgttttcttgacatatctgttagatactgagcaagatgtaattgaacgagtccaggtgcagagtttgaatggtaccttacaaaatggtatgcacgataattcaactatcatttgtttaattcatatctagagttcatatttttatgtttatctaatttgccaggtactaaaatggttcagcacaagggccatggcaagaacaaatgtaaggaagttgccaaactcaaggagaaccaaaaaattaaagttgagttttacaacaatcgtgctctttcgaatagtttgtcacgtcatctgggtagaattgttcgtgatcggaacattactccggtcaaagtgaagaaatggtcagacattagtaacacagagcaggaacacatatttgcctcgattacagtacgcatctgtcttcctatgaaatgttctctcttgttttcaataaaactatgcttgcactgaatcatttgtttttataattttgcaggacaagtttgaaaatgaagatccagatattaaaattgatgtatacaaagatgagataatggaacatgccaagtctctttggattaactggcgtggagatttgcatcgacattttgtgaaaccggcaaaaactatgcagcaggctacaaaaaataagccaaaggattttgacccatctgattggcaatggcttgtccaggagcatttttatagcaaagattttattgtaagtgatgatgtcccctctttttccagtatgttctatgcattttacttgacttatatttgcccaaaatgagtccgtttgttaactaaatacaggcaatgagccttagaaactctcggaacagagcaggcttaaaaatgcctcatcgcactggaagcaaacccttcaaagagataatctacaatatggtataaataaaagaattatgtacataatttttcattaaatcacacttgttttctactatatacatttctctgctcgaatagggaggaaaggaaaacagaccaccaactttggatgagttattctttgagactcgcaagaagggagacactttggtggatgttgaatcttctaggatgcatgtaagattcaggttttgtgcagaataactatcctgtgaacgcctcttagataatgcatagtttcattatggtttctagttggtattgacagtagcatttgtccaacactattattggttcatttcaggcagaacttgtggatgtagttagctcagatcctaatctctccaatgttgaagttatggataaatgttacaacggtaataagcggcgtgatcatttaattggatttggtggtggtgtcaaagcaagagatgtacgaggcccagcacttagcaaagctgaattgcatgctagacttcgagcaacagagagggaaaacaaaatgcttcgagaagaaaatagtcaggttgttgagtctgtaaatcaaatgcagaatgaatgggctgagatgaggagagactattatgctaactgtgaaaatagaagtgacactggctcacaaagacgtcatgagaggtaaattcatgcacctaaaatgactttcatatatgatatgtgaaatatagtactcattaacttgcgtatctaatatatatgtgctcatggcaggatccacagtgaaagagatgactatgatgcaaatgaagatggtacctgctgatgaagggttgattcctcgtaaaacatgaaggaatagtccattgcaattccaatttcagattgaaattttgttcaccataagttctagtgattgtttaattaggcatcatgttggtgctgtctgaataatttatctagttggatgcagtgaacattattattttgtatttgcaccgagtaaacacgtggctgctacaggacaactcaatgttatattcgttgtgctgttagacaaatgtgggaatcaatatattacaaggtgtggttgtttaaactgatccgtgagtgttattgatgtattgctaatggtaacacattatgccatcgtgaataattatatgatgcattatcatggtcactaaaaaaattaggaggctacagtttctcggtagtctataaaataacaatggtatagtttcacggtcgttaataaaaatagcgacgacggaaaagcacgatcgttaaaagaaaaatgaaaaacgatggcatattatcacggtcgttaatgagattaacgatggcaggatatcaccgtcgttaatgaaaacaacgatggcagaagaacaccgtcgttaataaaattaacgactggaaaaaaatcggtcggtcgttaatacttttaacgacaaagcctttaacgaccactgacgaccacacttctgtagtcgttaatgacctttaacgaccacatttggacttttaacgaccaaatttccggtcattaatagtcgtttctccagtagtgcccgcgaaccatcagtccttcacttgcttgaagactatggctcgtcatcttccagtacaccacgcgacgtgtttgccatcggtggaactagcacgtatgaacaggctaacgcagaggcggagaaccagacggccacgccagcccaacatttcggcaccgttaatgcaatattgagagaagcaccctatgaccccgtgcttaacgatgacctcgcacgatggacggaacgactacgggaatcggtggccaatctcagtaacgcattcgaggaagctactaccagagcacaaccggaacgaccaacagctggcggtgccgacggtgaaccaccggagtag</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001186073.1 RefSeq:Os02g0530850]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 2]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 2]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
