|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | GeneName = Os03g0404800|
| |
| − | Description = 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001056861.1 GI:115453450 GeneID:4333070|
| |
| − | Length = 10077 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0404800, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| |
| − | AP = Chromosome 3:17187314..17197390|
| |
| − | CDS = 17187411..17187696,17192907..17192996,17194156..17194289,17195230..17195388,17196561..17196683<br>,17197091..17197099|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008396:17187314..17197390
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008396:17187314..17197390
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaagcttttcaaggggtggaagttgtttttcacacagctgctgcagaccctgacatcaacgacttccaactacattacaaggtcaatgttgaagggacaaagaatgttattgatgcttgtgtaacgtgcaaggttaaaaggctgatatacaccagttccagtggtgttgtatttgacggagttcatggcctttttgatgtagatgaatcaatgccatacccaaacaagtttcctgatgcatatgcacaaagcaaggcagaagcagagaagttagtgagaaattccaacggcatatgtgaacttctaacttgttccatacgtcctggtagcatttttggccctggtgacaccattgtaccacatttactttcccactggagaacgatgtttattatcggcgatggaatgaattgtgatgattttgtatatgttgaaaatgtggtacatggccacatttgtgctgagaaaactctctcgactaaagagggttcaaagataagtggaggcaagaatgtgtga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>METAPAANGCSGGRRLQEEEPAARWCAVTGGRGFMARHLVAALL RSGEWRVRITDLAPAITLDPVEEKGLLGEALRDGHAVYDSVNVCDITQLTKAFQGVEV VFHTAAADPDINDFQLHYKVNVEGTKNVIDACVTCKVKRLIYTSSSGVVFDGVHGLFD VDESMPYPNKFPDAYAQSKAEAEKLVRNSNGICELLTCSIRPGSIFGPGDTIVPHLLS HWRTMFIIGDGMNCDDFVYVENVVHGHICAEKTLSTKEGSKISGGKNV</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>98..383#5594..5683#6843..6976#7917..8075#9248..9370#9778..9786#gcagcacactaatcgatcaccgcactatacacaatacgaccattagctattactagctagctatatatccctcccttgtttctttcgagcaagagcgatggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaaggttaattaattcgatcttcttaccgtatacgtacgcttttttcgaaccgctaaacgacaccgtttgtatgaaaattttctatataaaaggttattttaaaaatgaaacaaatctagttttaaagttttcaataattacttcctacatctcatcatatttgcgaatggtattgaggccaagacaagaaaaaaaatctttccttttaaattaaacctcatcgatcaaaacgttatgttagcatgtatgtggatatgcaacgatatcatttttactcctgcagtgataaacgaactgacatgcaaccatagtatttacttgtatataaataaacaaatagacatataatcatgatatttactctacagaaataaacgaattgacacctcttatataatgattattatgagatgagcaaaatgtaatgaatgaagtaatactcagttaatcatatgctaataaaatttctcgttttacgtgtggctaatcggccatttcaaaaagcactttaggacggggtcttagacaacaacgctgtatttaattgctctctctatattgagaaatacgagctgcttattatgtaaaaaaaggaaatacaagaagttttgaaaatatcagtatcggttttttagccggtggtaacaaagtaagtaacaattatgcttgtgcttggaggtataattgccggttataacaccatcagttacaatatgtatagtactatatcactgctattttgtggtttatgaactgggttgcaaaattcgaattctttgacggaaaaaaaatcgtattatacgaataatctactagtaaataatacgatgtgtcaagcaacttttacctcaacctcgatatgcgagaaacttgcttaccgctaaccatctcagagatagcacacagatatgcttcttcccctagaccctttttccgaagcttttggcaaatattttccctacataaaggagtgttggcaaaagtgggtcacggtgtagtgcaatgagtcaacgtttgattgttactaaaatggagtataattatccatatatatactttcaaacaaaaatccgcataagaagagaataattaagttgattgggcctctctgatctgtcacgtgagctaatgctccaatgacaagccaaccacttaaaatcaaatcaaatcaaatatgtgactggtacaatataacagttccaccaagaaaaatcaatggtgatcgatacacttagctagtacaaaatgacatgatgttttctaaataggccatttttcaagatttcactaattaatactcaattaatcatatctaataacgtttctaattttacatgtggctaatcagtcaattccaaacgtggcccttcgacagcaactatgtattcaattgctctctccatcgagaaatacgagctatgctttcattaaagaaaaagcgaatacaagacatgcttgaagaaagtagttcatccgtccttaaaaaaataaaccctaaaccctaaaccctaaaccctaaaccaaaaaccctaaaccctaaacagatctatgccctaaaccctagttctatctagataccctagttctatctagattcatagtcccatcatagatttgtttttatatataggactgagggagtacacgtcatgaatttcgactaataattaattattaaggcatcaacatataatgtctatacgcttttgcttttctttttgttatgttaatttatttggttgatataatataatgtcaaagaaaacaatgaccatatggccgtgacagcatcacagttggttacaaaaatggctatggataacaaatcatcggtactacagaactactccctcattcccaatgtttgacgccgttaacttttttaaacatctttgaccgttcgtcttattaaaaaaattttgtgaaatgtgtaaaactaaatgtatacataaaagtatatttaacaataaatcaaatggtaggaaaagaattaataattacttaaattttttgaataagacgaacgatcaaatatttttaaaaaaagtcaacggcgtcaaacactttagaattgagggagtaggtaccagagacagttcaaactactagcagtaaccggtttttttagccggtggttagtggtaagcaagcttcgcagagatagcatgcagatgcttctcggaaatgctactgagctagcgatcgccctcgctcgcccagagcgatcaattcccccccccccccccgcctcctcctcctccctccacctggtttccttttttggtaccgtattacttttctattttagtaaatttatgcacctcaagtttacacatctaaagtttagagaccaaaagtttataagtcaaaagtttatatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatattttttatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaagtttagagacctaaagtttatatatccgacgattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattcaaatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatatttttcatatatagtatttctatacatctaaagtttataaacctaaagtttatagacctaaagtttatatacccgattcaaatttgaatttgaatttaaataattcaaatattttatatatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaaatttatagatccaaagtttataagtcaaaagtttacatacccgattcaaatttgaatttgaattcaatttttttatacataaatttttccaactttttgtttttttaaaatttttttgtggtgtactgtaataggaagagaagaaggtgaggaggaaggggagaagtgggaggagtgcctataggagcggggggcccgggaccgatcgctgggcgccccccccccccaccccatgcttcttattaactagaccctttttccaaagcttttggcaaatatttaggcattcaatatgagccaaaataaaaaggttatcaattataaagttacaggattttcatataaaattttctccgtccaaattcatgtgtgtcatgtatactataatctttaaatttgcaatgatgagttagcgaaactacacttattaattaccattccggatttgtaatttgaacctgactgataacacaaactggattaattaatgggattaatggttactccctccggtttcattttaattgacgttttagacaatgacatggtctacaaaatatatatttgaccttatttttctattataatatacacaataaataaatgcatgtttacttttattatagtgctttgaaagacaaatctatatacgttgttctagtttttttaaactaaatatttttaaagttattgatggtcaaattataaaagtttgacctcaatcttatgcaaaacgtcaattattatagaaccgaggaagtatgttacatcatggaggatggaggaaacatagcactaggaccataataattaagtctatgaaattcgcgcgggcaacaatccctgtgtaacgtcacaattatcaatataaaaaacggctaagctccaagtaaagtatactttttttcaacaatactttcaaacaaaatcctctgacttgctttttgatttaaattcctagtatagggctaacagtaggcgcataaacaacagaataattattctgtgacatgaggtaatgctcttatgataagccaaccactcaaaatcacaatcaaacaaaatactccatcctcccaaaaaaaaagttacacctattacttttgtcaccaaaactaaagaagaaattaacttatcttgcatgaaacaaagatcaaagagtgtatgcacgcatgcaatacattaatattaagataactcctcatgtttcgatgaaacaattacttacctctccatttaattcttacatgcatagaaacaacaaataaaaacaacttatttgaaagaactcaaataggaaatatgtctaactcttgtaaatggagagagagtatgtgactgatacatcatacagtttcaccaagaaaaaacaatgcagattaagatccaaatactatctcggtttccgttagcatattttttaaattgctaaacggtatatattttgtgcgaaaaatttttatatagaagttgcttaaaaatataaaaaaacattttctaaatttgtaataaataaaacttaattaatcacgtactattttctcgttttacattttctacttaatcctcgtattcgcctatttcaatcgtggcattagtaggaaaagacacgatcatttctaaatggatccttatcacacacaaaattcttttggaagtatacctttttttcaccggtattactagaaagaagtagcgtaagtactaccgttaccaccatgaagcaaggtgcaaattctcggcgagttaacacggtgagtgctcgaactcgtgacatgttcgtgatgtcatcacaagttcacgtgaactcgcatccctacgaagtgaactcatgcgattaattaattaatttgcatcattagtaattaattaattgagcgttatttcttaaattagcgttagtaatcaattagtagtaacatttaattcggcgtgaggccattgttaatttagcattaggaagccagtttgcaaaccaattagcgaactcacacacgcggttaggtgaaaaaaaatatatttcaattttttttctatgacacactatacccacttcattgtcaaataattgacacaagttattcaagttcaatctttcacctcttctcttgcgagaaaaaaaatatatatacttgaaaatatgtcatattatctatacaaaataggaccatacaatttatgatatacttatattatcgattgaactttcatttatcgtaatataatcatttaaaattatttataatcaaactttctttatcgtaatataatcatttaaaattatttataatcaaagtaagatgatcgtgataaaccgtgtcaaccccgaacaccaaacatattagtccattgatatctaattttttcctaatctatgatttatctctataaacaatttttttttataactgcaagtatagaattttcaatctgtcatccatgccatgcagcttttcaaggggtggaagttgtttttcacacagctgctgcagaccctgacatcaacgacttccaactacattacaaggtcaatgttgaaggtatgaaaaatcattgatgaatcatttatggagaagcccctttatacatgatgggcatatgatctcattacttacatgactcagaaatagtcatcaatattattatttataaaaaaagtgcaataaagaactgtttcatcaaagcatcatcacatgatattaaggtacctctcggtggactcgtatcctctcgccaataaaaaaaaccttgtagagatattttttaatactatagggccatttttaaaatgttttatgaggcattcttcaaaatggctcgtaaatgtattttggtgaattgtctctagaaaccaaaccaagagagattttataagttatcactatgccttgtggcatttatgtaacagcatacttttacgtctataagaatgaataagcactttctagaggcattaaattatgccacaactgtagcaaattaatttaaaaaaacaaaaaaaatattactaaaatattgtttatacctctatttttacaaacaggttaaaagaacaccggtatgtaaaagaatttttggggtgtctacaaaaggcccacctatgaaagttaatttttacacgcgagcttattaagaggtttatctgcgaaaatagagttattttcgtaggagaacctgtctagaggcccatatacacgcgaaaagatcacattggtcgtccacacgtcatctctctcaatttctctactccctctccatgtctccttaaattttgctggcatatgtgaaaataaagttatttttctaggagaacttgttaagaggcccatatcgaaaagatcacatcgatcggccacacgtcatctctctccttaatttctctcctcccactccatgtctcctcatttatatcagtctctctgctccttgggagctgtgcgacctcggcagagacaacgacgctgtgggaccatcgcggcgacaacaacactgtgaagcttcgaattttagaattcttttttcacgggtgcactgcccgcttgttttgtccaacgagcatgaaagtagacataaacattcttgaatcttcggtaacatgattgttattaattcaaaaatgtacaccttatttggatttgattagtctcaatttttgtcttttttttgtttttaaaagagtcattttgtgttattacgcagggacaaagaatgttattgatgcttgtgtaacgtgcaaggttaaaaggctgatatacaccagttccagtggtgttgtatttgacggagttcatggcctttttgatgtagatgaatcaatgccatacccaaacaaggttctactatgtgactgaatgcaattttttctttattttggttgctcatgctactagatgctcaagtagtcacaaaatttcttgtacaattatgaatctcatttctttgttgtacccattggtacacgaactaaaaaaaattaatgcccccatgttgtgaaatgttttccttaatcaaatcgatgctaacaaaaaagtttggctgtgtatttttagttacctctctctaaccttcagcctatttttagttagctaaatgatgaatatttgttactccctccatcccaaaatataaggcacaaccattttattcccatgtttcataatataaggtatgcatgcatgcatgcctgcatacattaactagcacatcttggtcctttaaatttagtttgttttaaatcctcttccatcaagcaccacattcacattgtttgcatgtatggatatgattcaaccaaggaggtgattaaattctttcttggtctttgcgttaggaatggttgaaacttatatttgggatggatgtagtaccttctatgtatgtaccttgattgcaccaataattaattattatgtgttccaagcaacaaagaaaagaatgactgtgttgtatgttggtatcaacaaatatattatggtgatgatcactacttgtaggttgaagagggtagtttgtatacttagaacaagggctagatctacaacatagaacatttctacgactatttgaataccaaagtataattgcaaaaaaagtatatatagtactatgtttcaacacatttacatagggatacagggagagatctttttacttttaactactagcctaatttttttagatagttacttaattaagccatatttatttatttcagtatgtataaaattcacacttgattttttgtgtttttaactatgtgtttattaatgttagtttcctgatgcatatgcacaaagcaaggcagaagcagagaagttagtgagaaattccaacggcatatgtgaacttctaacttgttccatacgtcctggtagcatttttggccctggtgacaccattgtaccacatttactttcccactggagaacgatggtatgtagccgtctagtacatatcgtgttaatttctctcatacttcgaaatactaaacaaaatggttctaaaaatagattaatgatactacttttgattgggcacacctcaagtaattagcatatacaatatttgaaatattgatctcatggaagtccccaaattctgcatgtgcatcattgtttgcttctgtaggaaattatatacatataggtagttcacgagacatatgtgcaccttaagtaaataaacatgtacataatttatttagtcatacagaccataactgtggtacattattatttttactcagttatcaagcatatggtttgtgtgtgatatgaagattatgaactagttaattaaccctttgtaagaaactaaccaaataatcggcgttgcaaaaaatatatagtaaacaaatgataacataaattgtaaattctctgcaacaacgtcatataaatttctctacatccataagcactatgaaactcaaaatttttcagtaaatcaacagactaccatccatacaattcatgtttcattaatatgaagccacagataaagaatcatgttatgagtcgcatgcacatacatataaagcaagaaaccgatgacgcttcacgcatggcattcttcagaaatatatgcatatatatgcagtttacacatctctaccgcacacgattgccactccgttgtgtgtttttcacttttgcatctattgtgttatgcgacatggaggctggggccatgaatcccccctaattaagtgtccaacccaattattcaggtagataaataaaatatgatcattgattacaacactatcggctaataaggtgccaactaatagcccatacttattgtatttcccccttaatctctccaactatcccatcatcactacttgcatgcatgtaaatttctctgatagtgtggatgcaaagatattaaggaactcctagctgttggaggttgggctagagcctcaatcatccccaacaatgcacccaccactggggtcaaggctaactaaaaattcgtgtggttatgtggactaacattaatacatgcatatctaagaacattgaatatttcatgttacattatttatatttctcctctacaataaatagaaagggcttgggttctatatcttcttgcagtttattatcggcgatggaatgaattgtgatgattttgtatatgttgaaaatgtggtacatggccacatttgtgctgagaaaactctctcgactaaagagggttcaaagataagtggaggcaaggtatatcactattattgaattgcactagtttcactgctgataaattttcatggtgcatttaactttctctaggcttacttcataactaatatggagcctatgaacttgtgggactttctttatatgcttttagaagaacttggatataaaaggtgatgcttcttcctagatatcatacatataacctaaagtatattcttagcttctaaaatatgcagtctccatacactctaattgatgtaatattgaagttggcaatataaattagaaggatagttgtctatggatgtattgatcatgcaaattgtttgattccttatgttttataaaagttggccactatatgaactaatggaaatattctttattccttataaatgtttgttaatgttggtgcatatctacagaatgtgtgaattcattttgcttcgaccatatctaagacctcatacatggagcaagttctattgctattgaagatgtaaaatttatttgacatggatgataaccaatggtcgatggcaatgatgtctacacatataagtttgatgtattttttttacaaatggctaagtattgtaatcttgttgggaacaatattgattcttattggagaatgggcttccacttgttgcagtcaacataattgtaatatatatctgtgagatttttattgctatatctctttatgcaaaaacattaagtct</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001056861.1 RefSeq:Os03g0404800]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
