|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 6]] |
| − | GeneName = Os06g0171600|
| |
| − | Description = Tetratricopeptide-like helical domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001063470.1 GI:115466671 GeneID:4340267|
| |
| − | Length = 7649 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os06g0171600, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 6|Chromosome 6]]|
| |
| − | AP = Chromosome 6:3587218..3594866|
| |
| − | CDS = 3587399..3587537,3587931..3588040,3588131..3588196,3588302..3588419,3588508..3588563<br>,3588656..3588775,3588946..3589044,3589452..3589499,3590362..3590427<br>,3591421..3591480,3592070..3592171,3592968..3592976|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008399:3587218..3594866
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008399:3587218..3594866
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtacaagggtggtattctgtggtttcataacttgaccgagtttccacatggttcttcgggccttgtttttcctaccctagttgcaggtctccattacttaaatattcagattgcctttcatggaacccataccaagcattatccaggtatttttggcgtactggcaaagtactacagggtataccttgaaatcctgactatccctttgtttcttattgggtatgtgattcctcagggtagcctggtctactggactacaaatggtttaattactgtagctcagcaattgtccctcaaaaatgacgctgtcaagaaggtgttgggattgcctgatactagagctcaccagaagtttcctcgtgtgggtcataagatgatgcaggaacggcctcttgaagatgctcacatgcacactaatttgacatcaacaaataatgaaaccgccaataacattatggaaggaaaagtatctgcgtccagttcacctgaggaactacttgaacaagcattacaacatttggaaactggaaaccaggatcaagctattccactgatcagaacagcaatagagaaagactctagtctttatgtagcactgattggtatgggacagacattgttctcaaacaggttgtttcctgaagccacagtgtgttttgaacatgctataccaaagattgaagagcaggatccacttcttgtgcttgcatgctacggtgcagggctttcacgtatgcggcagggtgatagcaaaatggcgatcgaaaacctccaaagattagcagagctcaaggaaccagaaaaacccattaacaaaaaatgctattaccaaggattggttgctctaggaagtatactaattaatgagggacggaaatctgaggctgtcaaattcgtgcaacgagcggttgcttatgatccaaattgtgagatatatctgaaagaatgtgatgacacaacagaagataagccgaaatctgcagaacactga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MYKGGILWFHNLTEFPHGSSGLVFPTLVAGLHYLNIQIAFHGTH TKHYPGIFGVLAKYYRVYLEILTIPLFLIGYVIPQGSLVYWTTNGLITVAQQLSLKND AVKKVLGLPDTRAHQKFPRVGHKMMQERPLEDAHMHTNLTSTNNETANNIMEGKVSAS SSPEELLEQALQHLETGNQDQAIPLIRTAIEKDSSLYVALIGMGQTLFSNRLFPEATV CFEHAIPKIEEQDPLLVLACYGAGLSRMRQGDSKMAIENLQRLAELKEPEKPINKKCY YQGLVALGSILINEGRKSEAVKFVQRAVAYDPNCEIYLKECDDTTEDKPKSAEH</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7330..7468#6827..6936#6671..6736#6448..6565#6304..6359#6092..6211#5823..5921#5368..5415#4440..4505#3387..3446#2696..2797#1891..1899#acgacaaaccacatggcgcttccgcttcgcctcctcggccgcctcgccggcggcggcggcggcggcggtcggcgcctcccgcggccgctggccgtgctccaccaccaccacctctccgcctcggatccaagccccaccacccgcgcgccgctgctcccgtcaccccctcgcttgccgccgctgctagtccctttcgctgccgtccccgcgcgaagcttctcctggtacccccgctcgccgccgccggccggccccgccgcggcggagaaggctcccgaggaggacgtgcgcgccgagggggaaggcgcgtacctgcacgacgcgggtggtgctgatttcggggaagtggtcgccaccagcgcggcgtcggcggatgcagccggagtagccgccgcaggagatggcggaagcgcgtcggggttcgctgtcagctcgctgattgacatcctcgacggatttcataacctcaccgggatcccatggtatgcgtccttcgctgtcgttactgctcttgctgcaattggttggaactctaggccccatttgaaatgtgggagctctccggtttagtaatgggggaaactgatatgtttgctgtaaatttcgtacattttaaatgagctcttcattggtttagttggtttgaatacctctgatgtagtgtgctttgtttttttttaaaaaaattctctcatatagtgtgttgtggtgaaagggaatcatactcaatctctagttctctacttagttctgtttctaccttttatctccaaatgacacgggtataccaattgtatatttgtattccgtgaagtcttgatcacaaatgttatatcaaagcaactaggttgttctgttccctccaaaaaaaaaactaggtggttctggtgttttgaatcactgtaccttgtttggtatttgcaagtgttgtgatttcgtacatcttgaattgagtattctggatcctttattgtaggtggataacaatttctctgtcaactgtggccatgagactgttgatacttccagtacttataacacaaattaagaaggctgctaaaattggcaaactattaccagaatgtaagttctaaatttgttttgcaaactgcaaactgtgctttctcatatcatagtaaaatcattacaatatactccctctgtcccaaaatataaaagattttggttggatgagacatattctgtccaaattcgtagtactataaatatgtcccatccaactaaaatcccttatattttggaacaaagggagtattgtctagcttatccctgtaacgtatatgattaaatggttcttttttctttgagaaatttatttctaaatttccaattgattcatctacgtttaccatatccaacaaaatactttatgaatactaaactcttccagctgtaatagtgattattctattctatgtcaaaatgcttattttaggtttgccagagccttcattttagtcatacagctgcccattgaactcatattctttacatttcttgcttgtgtttgtgtctgattccactcatatatgtccttttaaagtgcctcctccattcccacctcctctatcaggaaggagctttcgtgaccagttctctctctatcagaagaaaaggcgagaacttggttgcccttcctttctttggaactgggcctacttttcaatccaggtaatgattaaaaaaatgttaaaaggtcttctatccttgatattgtctaataatagctacgaatcttacattggcatcataatttgttttccgaattgttcattattgtttgttgtatacgcagttcccgtgctttatactgtggatgtcaacaataaggactatgtgtttgagcaatcaccctggactagataatgtatgtacaaggtattttttttattatattacacatttgtactagcagctatactttattatatgtagtgttcccccctgttttataaccattcatgagctacgctcatttttagtattgttttgatgctttaaattccattgccgaaggtcctttataatttcatatgctaaaaaaacatttctattaattaaaattatgatgcgtctttttagaattttaatagaataaaaactttgtaatatttttttggctatgcctttggcatgtttgccggatcaaatggaatacagttaacaaatgctgtcacacatgcattgggtcatttagccctgaaaaattaaaatgcgatgtggaattgcaaagaacgttatttgtactatattgtccaaggtgacttagactattctttcaaaagagctagagcacataatatctatttaagttgtgatacaaataggtactggtgacattgtgagtcagaagtacatttcaccatttttataaaagcagcaaatgagttgttttcatgtttaaataaaggaaaccttgtgaacagagcatggtaagtaaatggccattaaacttggtaaatttgttttttttttgttgccataagagaagtttaattttctttcccatttctatgaatcagatgcacaattgcaaatgttcaaggtttctggttcttaatacaatagatatattcacattcttatactgtctactccattttaatttatttattttattttgaccttcttcaggtttaaccttttgttttcattttttttgacaattatacagggtggtattctgtggtttcataacttgaccgagtttccacatggttcttcgggccttgtttttcctaccctagttgcaggtctccattacttaaatattcaggtattctccgtgcagtttttgtttcatatgtcgtgtttaatatttttttctttttctagtgtgaccttttatcatgtaagtctaatgcctaactaatagaagttataaaaggctgatgaagtaaagactatgcttgcttgcttctatttccttctcgtaggctttcattttgtcataattgatttgatgttgcatatatcatactgagtcgtgcaaacacccaaagctgatgatatccttctgcaaagttggtataaaccatcaagaccaaaaagaggttactgagaatagttgatatagctgcccaataggacaaaattcaaatttaaatctacaaatctgcaactgctctaataaatatagggatttccattttttgtacattaggggcttcaaataatgctgttgctgattttaatttctgattggttgctgacttcatctgtcttatggtggatggagcacaatgtagtttgagaaataagtctgaagtcccactatgaattgacctagagctacttagttttgatcatgttgatgaagctacatattttgatcatgttgatgactgtttggtttgttgtctcagattgcctttcatggaacccataccaagcattatccaggtatttttggcgtactggcaaaggtatgctcctaaaaccattgatataatgcacgtaagctgtagttgtcacaagttccccagtaaattactagcataggaaactggcttgttatcaagatcctgtcatagtaacatcggagattgaaaactcaatcagaaaatttcatggtattttacttgtttggtggaaaccagtggtggataaatgcatacagttgtgtggtttaattggtgaatataccaaaaatataccaagaggttttcttctgtagttagatcatacagtgtcgaaattctcagtgcacccattcactgtcaaacggcacaattgttataactgtacaatggatgttatattggcgtgtgcatgttggctttgcctctgtactggttcttcctagtgggtgctggtagtatgttgttgattaattgatttgggtggtgtttgttattaaatgttgtttggggttagaaattgtaggatgtgtaaatcagatacagagaaaggtaattttgatttaaactgaccagttaccatcaagtaacagagagaagcgattttattcataccaaccagttgaccacagtgtaattggccaggttttgaaactgatgagtactgggaaaaaaactgcaaatcggttattgcaaccctgtatgggctaacacgcttactggaaacctttgcacactgggaagaactgcatatcgatttttgcaacctgtactggcacatgctagttttgtatttgacaggtctttactttcttgtcaaattataagtgagaacaagttatgctgctatctctaaagattcttgagaggcattaggcatgaattatgtttggtagtttagtggtcctgaacttggtagctacaatagggcatcaacaatattttatttggtccaataatgttcatcaaaatactgtgaatttagttccacgacaattgttatattctagctgctgtttccttttctccttctgaatgtattgctatttttatttgcagtactacagggtataccttgaaatcctgactatccctttgtttcttattgggtatgtgattcctcaggtcagtttcttgcaaattgttttatttatttacagatgaatatcatggcatcatgcacatcagaatatcagattgataaatatgtgcaaggttcgactttctttatgctacgttttgatttagattgatgagattaaatcaaatttgcttaactattttcttggaggttgttaactgctgcaaattttgagtgtcagaatagtgattagtagcttcacttaatcctacttgctgtcagcctgtcacaagcaaaccgggaaaaatgtagcccatgggatgaattaagatattgcaatggtaccatgtgcaagcatgatattggattacttttcaaactaatataagcacgatatatgttatgttaaaatcataggtgcacgactattgtagcgcgcactactagccaccatacagcttgtcatggggggcaagctttgtcttgttgagatacaaataatgaaataagtttgctcaagataagattgagttgaagcaggagcatcaagtggttggtatcaatagttcgaagtgctgttatttatagacactgagtcactgtatcttgcttaagcaagaataaatttaagtcgtcttcaactggaccttggagccaattaagggtgtctgccttactgtcggtctccataccccatacccaactccattcattacaatttagattagtgtaatttgatttcaatacaattattcagttgaaggtgtttttatagaaagcatggttgtcatcatccataatttcaaacagactgaaagaacacaattctttgcaacttctgtttcattcagatcacaattcaggtaatagtgctgcatttcatttacttctatctttgattggcagggtagcctggtctactggactacaaatggtttaattactgtagctcaggtcagtacaatattttgtttttcctgatgtaaagaaggtcacttgttacttgttagtcaaaatgtaatatccagcatctgtgtttctagtggtcccatgccaaaatatctgtatgtatatgatagttcttttacatattttctagagaagtgtttagaattcaatagagtctttatttatttagaataaagaagataggttcagaccaggttcggcagagttctctctttgatttctgcaatttgctgttagtcgatatggacaagtttgacatgtgttgttacagttccagtggtcaacaaacaattaggttaggttctcatatactttagtttaaatgaacattgcgtgatgaaagttacactgtattttgcattgcatctaatttttcaatgatataaatgcagcaattgtccctcaaaaatgacgctgtcaagaaggtgttgggattgcctgatactagagctcaccagaagtttcctcgtgtgggtcataagatgatgcaggtagaggcatcggctgtatgtagccactgtcatcatgataatctaaatgtcgatttattagctcccgacccacttttgtcccagctagaccacattattgcattcaatcttcatgaacacacatgccatgcttctgaagtttgttttcttctttgtgataaaactttcaggaacggcctcttgaagatgctcacatgcacactaatttgacatcaacaaataatgaaaccgccaataacattatggaaggaaaagtatctgcgtccagttcacctgaggaactacttgaagtatgaatctctttttcgttatgaacgcatataatctacataatcttgccttggaatatttttcattatgtagtctcttgacttatttttagcaagcattacaacatttggaaactggaaaccaggatcaagctattccactgatcaggtatcagggtgacttggtgttaagctttcagttggctaatatcccatttgcatacagtggaagttaatggataattgtgtctccacagaacagcaatagagaaagactctagtctttatgtagcactgattggtatgggacagacattgttctcaaacaggttgtttcctgaagccacagtgtgttttgaacatgctataccaaaggtatgttgcaacattgtatattctttagtactcttgaagatggtttgaagccgtataccaggcaggtaggcactattgtaagacttcttgttctttgttgtgtagattgaagagcaggatccacttcttgtgcttgcatgctacggtgcagggctttcacgtatgcggcaggtagattaatactacatgatgctttggctttaaaagcattttgaatgatagtggacagtacaagcattttgtttcttctttctattttagggtgatagcaaaatggcgatcgaaaacctccaaagattagcagagctcaaggaaccagaaaaacccattaacaaaaaatgctattaccaaggattggttgctctaggaaggtaaacaatctttttcatgtcatttcatcaagagtgcgtattttcaagtttcatttgctgtgaaacaaagtgcaattgcttggtaattgttttcactattgtattgcatctcttgcgcctcttataaggatcatgaatctggctgcgcgtaactttttgtacctgataattgttttcgaaattgtactgcatctcttgtgcctcttataaggatcatgagtctggctgtgcgtaattttttacacattgtgctattggtctaaccttagagattatatgtatgtgttgtgttgtcatgctttcaactgcatgcagctaacttaattttgccaaatatctttttattcatattaattaatgaggtttattgaagtcgctgatatctctttgcagtatactaattaatgagggacggaaatctgaggctgtcaaattcgtgcaacgagcggttgcttatgatccaaattgtgagatatatctgaaagaatgtgatgacacaacagaagataagccgaaatctgcagaacactgaattgccacaactgaagatcagagtcaggcatcatggatgacgtgttccattcttcgttttttttttttttacaaacaatacaattttgtgcgatttgtacacatgtaacatgttccatcaaatctgtagaatgcactcacaagatttataccaatataatgccggaacgcacaatttgttc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001063470.1 RefSeq:Os06g0171600]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 6]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 6]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information