|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]] |
| − | GeneName = Os08g0116700|
| |
| − | Description = Conserved hypothetical protein|
| |
| − | Version = NM_001067390.1 GI:115474516 GeneID:4344518|
| |
| − | Length = 10413 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0116700, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
| |
| − | AP = Chromosome 8:923215..933627|
| |
| − | CDS = 924971..925177,925273..925449,926075..926176,926262..926325,927206..927355<br>,928479..928558,928658..928723,929887..930094,930849..930922<br>,931888..931956,932045..932088,932421..932514,932601..932713<br>,932822..932899,933339..933432|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008401:923215..933627
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008401:923215..933627
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgttcgaggatttggtgagcaaggtgctcccggccctcctcggccgctacgtcagcttccagaaggaccagctcaccattaacatctggaatcaggaaataatattggtagatgtagagctgattctggaagccttcgactacctgcagttgccattcgcattgaagaaaggacggattggcaaactaagcgtcaggattccatggaaaacacttgggtggggtgccataattattgccatagaagacgtgtttatctgtgcatgtccacgggaggactctgagtggagttcagattctctggataagagagagttagatggaaaattggctaaacttaaagctattgagcttgctaagatttccagaagaattacagataaccaaacggggcaatcacttttatcctacatattagcaaagatactggacaacatccaagtttctatacgaaatgttcatatcacctatgctgataactacaaagatcagggaaatttcatgtttggtttggaattctccagtctctcgatacaaacggatccgaagaaacaaagttttgccatgtctttgatggtcatgtcaagacaagatgaagtaaacaagacagtagagatatccaatgttggcatttactgtcatcacttggatgaacagcagggttcatgtgatactggtggtcttactgaaactaatttcagtttcagtcatgaattggcccatccaagagatgcttatcttctaaatccatttaacgtgactatatttgtgcttgctaacaaagctggaaagcttgatggtgcacctcggtataacataactgtagagctaactgctctgatcctatcgattgatgaaatccagattcaacaaatcttgaatctttgtgattacttctccatctgtgctttgcgaacaaagtatggccgttatcgtccctctcaaagttctttatctaagagacataaaggttggcagaggatgtggtggcactatgctcagagatccgttttagcagatgttcgcagagaactgaggaaaacttcatggaattacttggggcaacgactggactgccgtcggaaatatgtcaatttttacagaatgaaattggagcttttgcagaaaggacagcttgttagtgaagacattctacaagagctggaaaatatggacagagaaggcgatatagatgatatacttaactacagaactattgcagagcagaaattacaggaagcattggtgaaatctaccaaagataatttttctagtccaggaagtcctcgaattgatgatcagtcagctggggcaggccaaggatggttaaagtggctttctcgtggaatgcttggtgctggtggaacagctgataccagctcatttgctgatgtttcagatgacattattaaggatatatacgagggaacggaattccatcctatttcttctgctgaaaatcatttgacaaaagaaaaccactattctttatttgttaggttatctttttctgagatccttgtaagcatcacctccaggcaagtgttgcatacctatatcaccggtacttccacgttatactgttgcagacattccattaccaattataataaattttag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MFEDLVSKVLPALLGRYVSFQKDQLTINIWNQEIILVDVELILE AFDYLQLPFALKKGRIGKLSVRIPWKTLGWGAIIIAIEDVFICACPREDSEWSSDSLD KRELDGKLAKLKAIELAKISRRITDNQTGQSLLSYILAKILDNIQVSIRNVHITYADN YKDQGNFMFGLEFSSLSIQTDPKKQSFAMSLMVMSRQDEVNKTVEISNVGIYCHHLDE QQGSCDTGGLTETNFSFSHELAHPRDAYLLNPFNVTIFVLANKAGKLDGAPRYNITVE LTALILSIDEIQIQQILNLCDYFSICALRTKYGRYRPSQSSLSKRHKGWQRMWWHYAQ RSVLADVRRELRKTSWNYLGQRLDCRRKYVNFYRMKLELLQKGQLVSEDILQELENMD REGDIDDILNYRTIAEQKLQEALVKSTKDNFSSPGSPRIDDQSAGAGQGWLKWLSRGM LGAGGTADTSSFADVSDDIIKDIYEGTEFHPISSAENHLTKENHYSLFVRLSFSEILV SITSRQVLHTYITGTSTLYCCRHSITNYNKF</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>8451..8657#8179..8355#7452..7553#7303..7366#6273..6422#5070..5149#4905..4970#3534..3741#2706..2779#1672..1740#1540..1583#1114..1207#915..1027#729..806#196..289#acagatacggcgcagatacgtacagggagggagctcccacacgaatcgcccctctccttccaccgccgccgcctcctcctcctcctcctccaagcaaactcccaaacccaactccgcctgccccccccctccctccaaacccatgggagcgcggcctctctagggtcctcctcctccgccgccgccgccgccgccatgttcgaggatttggtgagcaaggtgctcccggccctcctcggccgctacgtcagcttccagaaggaccagctcaccattaacatctggaatcgtaagtcctcgatcgatcccttcccttcccctccgcgctccacgcgccgacgaggacctctgcgctcccccctcccccgttccatcgcacttcgccccaatcacgccgccggtgccgcgacggcgatgtggttttcggattctatggctggctgcgtttagtgccgaaactgttctgtgtggcgattgcaatgtaataaatgtgaatgtgcaattaggacccagtttgatcgctctgtgatttttttttctccctgtgcgcgctgtgtccctttatgctttgtgactgtgatggatgctgattttgtttttttctttcactgatggctaactaattttcctagaattgatgatcacatatgtacgtcctttttttaaaaaaattattgtgctgtctctggcatggtggctaagagtctagttgtctccatgttcaacagaggaaataatattggtagatgtagagctgattctggaagccttcgactacctgcagttgccattcgcattgaagaaaggtatcgatcctgggctgtttttatggattccatcgcctttactttttgctagattgttgtgccctgtgtagttgtgaattctaatttttctgttctactacctgacaggacggattggcaaactaagcgtcaggattccatggaaaacacttgggtggggtgccataattattgccatagaagacgtgtttatctgtgcatgtccacgggaggactctgaggcatgttattgaatcttgtcatactttgttcaatttacttgtaatgatatgacatgttgacccagtaatggctgtttcttttccagtggagttcagattctctggataagagagagttagatggaaaattggctaaacttaaagctattgagcttgctaagatttccagaagaattacaggtcctgattccgtgttcttcgtgcattttgtttttttaagaaaattacgatgctttagtctctcatatttaaaccactgttatcaagcttattaacttcaacaacatgttgttagtggtcatttcgggattactgttgttttcattatttccaatggcatgcattttgtcctctcttgaatataccactctgctacattaacttgtaatatgtatgtaacatgtttctttacctagttttatcatattgtcaatggaactgtatgggattctcatgtccttttggagaaactaacaaccacctctgacaacttcatttgtttttatttctagataaccaaacggggcaatcacttttatcctacatattagcaaaggtaacaagcttgcagtttattttcaagcgactctaaacttggagatagtgctagaacattaattactgttcatttttactcttgtcagatactggacaacatccaagtttctatacgaaatgttcatatcacctatgctgataactacaaagatcaggtatatctgtttacatcatattctatgcagattgggtgtacagttctgtttcgcctgaggttcaagtttgtgtttgtttgtaacatggatactgtttatgttttccctacaattataggattttgtatgcacattgttactgagcaccagaagttttttcccagcagttattacttttcctactcaaattagatccatatctagggccttcatttatttttttgccagatgaaaaagaaaagctatgaagtattcaaagttagtgatcgctgggatatatctagtgcaactgcaaacacaaatctttggatgctgtcacttgagaccattgtatttaatttgtatttgttagatttaagttggtggaatgcctcttacatcattctcaaaccatatgaaaggtgcacttttagccttccccaaattgcttggggttaaaggctgatattgttgccgtatgaagggtgaacttccaaatggtcatccatgtacctccaagtttccataaatctagtccaaccaaataattttgtgtgtttagtgtgattgttttgctaaaaaaaaaatcaaattcaaataccatctagtagtctacattcaatgtttgaatgatagaatccaaagataggtttgcacgagatttcatttaatctgctacttccatagtcataatttttgcactttgtctttagcttggaagttataatatcttcactttatcagttttgtttacaacaaggagactatcttggaatagtcctgttcggaaattctaccatggtagcttcctaaattacattttcagtccaaaacattaatggtttgtgcagaagatgtggcaatagtgatgcaccctttcagcaagctcatttattttctagtttcacacatatgtttctttttttccccagttgttctgtcagttattctcaactctacttattttctttctgatacgtcaacagggaaatttcatgtttggtttggaattctccagtctctcgatacaaacggatccgaagaaacaaagttttgccatgtgagttagccattttttttaattctttgttcttgccaagctgccaaaaaatgaggaaacaagagggaaaaggaacaacatattgagagccaaagcttccagttccggttcagttcaatggattatttatatacaatttattcttatcttcattattttgccgctgaagataaggatattttgattaagaaaagtttacactagttcttcattattttgctactggagattagaggatttttttatcaggaaaaaaagttaaaactgatgcaattgctaaacactaaaggaaatgcttgccagccattgaagttcttagaagcgtcaactacaagtggggtcttagagataaccaacctaatatggaaacttgtttcagaaactgcactacaagattagcttggctcctgaaggaacccatacttctacaacaaattttatttccaaatgcctcaagaacttcccttgtcggttgtggatatagcttttggaactctctcttgttgtgtgaattatgatgtatcatgaaaccataaggaatttttagccttttgctgttaaacaatttcttgcacctttttggacaaacatttttaatggctatggaatatggacaatttgtatgccaatgttgcggtgtagagatacggtttgctaggcttgcagataatttggtagccaaacggttggttgcagatatgtgcttgtgttgtgtgcgtatgttaaagttcacatttttttttctgtgctttaggtctttgatggtcatgtcaagacaagatgaagtaaacaagacagtagagatatccaatgttggcatttactgtcatcacttggatgaacagcagggttcatgtgatactggtggtcttactgaaactaatttcagtttcagtcatgaattggcccatccaagagatgcttatcttctaaatccatttaacgtgactatatttgtgcttgtaagtgtatttattccacatgtttccttcaataattttactaaatttaaaacagtccaggttttctggctgaaattgtagaacctaggtgttatggttcgtgcatataaccctgacttttagggccttaaggtttcagaaaaccacaacctagacaaattccaactaattaaccatctttgctacaatattctccaaaataacacagtattagactttttgatcaactcaaacaacaaacaaacaattcatagatattttatgatggtataaagatagggtgaaatacatgtcctgcttctcgtgcccctttgggtcatttggaactatccttcaacaacgtccacatggatagctgagcctccattcagtatgcttcggagcatctcatggatctctcaggcaccgtggaaactgtccagagacttgagttactcagtagtgttattccattaatgtaatgtggcttaattttaatcccataaacccctgacttttctagtcagggattgtttggtgtccgagttttcgactcacatgtagtcaatacagttttgagataatgagttctagtggactggtcaaatatccttctgttcatctgttgagtcttaacataaagagttaatctgtatgcatatgtctcaatctattttttttgcaaggatgtgaaaccttatgtccctaaaatgtgggttatgcacgttaaatccacaagacacggtacctggtgtttctatgacttcgacagcaaaacctaagctttataaaatttagtctgtcattaatgatagtattctcaagcagccttccagtctcatcttttggcttatgcttatgcttataagccaaaatttgaattttcaaccttaaatttggagttgattttggagttttttcatcgtagtttatttttcagcctttacttttagatcgctaagaacatgtatataaaagttttatttataaattattttccgtttgcaaatatgccgttttgcttattccgtcaataagcgaaatgatggagtccttctttggccggccttcgaaagttttctaggttctttcatgataaccttgattgttttgtctttttttattaaaaaaattaatgatgaatgttgatcacttaatctaatggaacttcatctttataacaggctaacaaagctggaaagcttgatggtgcacctcggtataacataactgtagagctaactgctctggttcgttttgttctattattagcacagtgtaattatgttaaaatattctgggaatgaattgtttattgtctccttacattctccatcttatctttgtagatcctatcgattgatgaaatccagattcaacaaatcttgaatctttgtgattacttctccatctgtgctttgcgaacaaagtatgttgttctaatctaaatgactaaagctgccgtcctattaaaacatatattttaggttccatttactcttgttctgactttgtgatgagtgatgacaatatgatcctgctacccctgtctttttggggacaatctgtaggggagagtccaactgtaaatcaattaagagggattgaaatcatataaacaaagttataggagaaaagtgaaaataaatatcccccacagagagattcaaatgtagcattctttgaaaccgttaacccaacatctccaaagtaaaaagaagcttcccccttctaaatttattggggaacagctcacaaatgtgccactctttaaccaaatgttcaaataaccaagagtagttaattctttgaatgaaattacttattccatatggacaatattgtgaaaaggacagatgaaacaaatcccatgcacaatattgaccagatgacacacatcagagtgaacaaaaatgctggtctctttttttctttttatggatacatagaagatttttttggatcatattagtattggaaattaatgtttgggtacatcaatctaaatgctaagctgctctagctcaagaaagaaaaaaaacctatgattatctgagcatagtttcatttctttagaatccgtaggaaacttgtaccattcaacatgcacttgttcttacacccatccatatagatgtgtacttcatgtcctctctaaataattcatatgccattgaattgctgagaacactagtatttcatgatgccaccaattgctgagaggcggattctgaaacgcgggcccataggtgtttgccaatatgtcatgctctattagaaaattgactaaaatcaaaagtctttgtgcaaaagtgtgaagatggtaaaaatcatgatttagaaccttggcaaaagataatcccagaataatctgttttccatcatcaaaggatgggcaatcagcttgataagattagtagatgtttaagaacgcccctccacaaaaataatcctttcgtaattgggcattattgcaaactttttaaatttgctctgagcatctgctatacagtaagattaagccataaatgcttattcccatattttcacaggtatggccgttatcgtccctctcaaagttctttatctaagagacataaaggttggcagaggatgtggtggcactatgctcagagatccgttttagcagatgttcgcagagaactgaggaaaacttcatggaattacttggggcaacgactgtgagctttttgaaaactctttccttttcaacttgatttgtaagatgtcaaatgaacataaaattgtagttgaatgggtaaagataaccaattatcctatatgggtgattttcatacatataaaatggaatacatttttggtaaatattcagatcttggaaactaattgaaatttattcctcagggaaatgactaaactaattggccgtatggttttcccttttgtgtcaaagtttaggttgttggtagcagcaaatgcaataagatttctattaatatatgctcctgttttccttttttctttctaaaccagcttcagggagctcagggtctcagaactaatgaggcatggaccctatctatgacaagtagagatagctacttgaacattttattgttttttactagatggtggtagcaattgctgacttggttggcctttcacccctagttacaagtcatcctcatattttgccacatacatgggtttagtcctccaacgcctgttagaagttactagttagaactcacttcgacctggtcatgtcttggtcatttcttttcaggtcaaataggaagaatgcaaatcttccacctctggaaggcacctacagcttaacagctgtttaatcttccttgccaacccatcgtgcgaaacctggtttcttgtcataccgctcttggtttttaactctaaaactttatgattatcaaatttcattatcttaaaatttctgtaaccactaagagttaatactttcagtttgatgattcacgagtatgtttgcttttgtctatctgaaccaaatgtccatctatcatattctgttgtgtatgaaaataccactcttcacatatgcctccttgatgtgtttaacagggactgccgtcggaaatatgtcaatttttacagaatgaaattggagcttttgcagaaaggacaggtgtaattctctcgacatagaacatgtttcatctttttcatatgtgtttttggagcacacattgacataagtctgttattttcagcttgttagtgaagacattctacaagagctggaaaatatggacagagaaggcgatatagatgatatacttaactacagaactattgcagagcagaaattacaggtacttggtttcttttatgtgaggaataatgtgaatatgagacttaattttgtcaaaaaacacatttactgttgaagctgaaactatcttgatggcttgaccttaatcaatctcatatctaacatccatatctcataatttctcacttgcccaatattcttaatctggattgatggtatattggccttggcaacttagtttaactagtagtatatatctccaaggcttggatatgctaccatggtttttttgtttcctcctggtgtatgtctatacacacatcagattctcactctgcagtaattctaggatcaattttgcgttaagccacctctgttaggctctccaatgtgggattaaacagggatatcatattattttcctttttggtagaaagtgacctgggagtgatcgaccaatacgagcaatgcatctggactgtagctttgattgcattttcttcccattttcattataagaacaattaatgaacctgggcgtgatctacagttgtttttggcctcttatgtagaacttgcatatattagattcatgttttagaatgcatatcaatcttttagtttttcagcattagctttgccaatatctcattgattatttacaggaagcattggtgaaatctaccaaagataatttttctagtccaggaagtcctcgaattgatgatcagtcagctggggcaggccaaggatggttaaagtggctttctcgtggaatgcttggtgctggtggaacagctgataccagctcatttgctgatgtttcagatgacattattaaggtactctgtggttctagaattactgtatataaggccattgcaattgatttataggtacaagaaatgacataacatcttacttttaaatctctcaggatatatacgagggaacggaattccatcctatttcttctgctgaaaatcatttgacaaaagaaaaccactattctttatttgttaggttatctttttctgagatccttgtaagcatcacctccaggcaagtgttgcatacctatatcaccggtacttccacgttatactgttgcagacattccattaccaattataataaattttaggtcagcgctgctaatttgctaaatattgcagaagcaacaagctaagtagttagtttttgggccacatttagtaaagtaatttctattatgaatttgaaatgcagttgcttacctagctgagtaaaacaagagtagcccaaaagggccctgtgtgatgagcgctccctgagctcattttgttgtaaacaatcacaataacagcttcaaccttcatgaaacaattaaatgttagtatttattagattctgtttggatggtggtaactcctgataaactgctgtccatcctaacgacttaaccccccatgtaccatactcacaagcaccaagaacaccatttttccttgaacttaactaaaacttttagagtctacagaagttcttatctctgtagtttcttgaaagtctttccttgttatacttgctgttttgtcagatgggtgtctattggtgtggtgggcttgtggcagttaaaaaacctgtagctcctacttcctatagtttggttatttgctactgatgatcaagagttttatttcctatttgttatgcaatgaaccttatatgacaatgggccgatggtccaaagtatttataacagagctacagacaaaaatacgcataaataccctatgctagaagataaatgcagagctatatgcatatgtgtgacactgtttacttggtttcatttatctggggaaacatttattgttggttaacttcgcaaaatgttttatggtttaggaaaattggcatgaaacttgtagatgcaatgttcactgggcttggtgttgaatgtaaaatatgggatgattcaacaactatccttgcctgtcttgattcacttgagatcatcaacccattaaatgaaaataaagtcttgctggctgaaaaggtacacttacataaatcatcaggaacattttgttccttttgtgaactgcttgtcttttaaaatataatctattttagtgtagcactggtgatggtctggggacacctgttatcagtgttcaagttgactgtcctaagtcaaaccatagcccagaagctttgacacgggtacttaatttccatccaaagagagttacagaagtcactacatatggcttaaagattttaattgctgatttgtatatttttgtccattccctttttaggttgttgtccaggaattcagtgccatatatgaaccagtgttcatctataatctcatgcacatctatgatttgttttcctccttccagtttcagcatgatagggtgagtgttctattgtacacccatgttctattgcttgggaggataaacataaacatattgatgcattatgcatattatgtgcttccccctgcactaacgttatctcattttgtaatgagtaaattgcattcacagtgcatcaacttgtcaggtgggtgcaatttggtgcaataacttgaaaaatgagcgttctagtgcaacaacttggcatgtatgtgcaatttaatatgagaactttatcagtgatcgtataaattcaacaacttgcaaggtaggtacggttttgatacaataaattaaaaggttatgcaacaacttaattatttggagcattttttttatataaattcaatttttaagtactacttttgacaatatactagcacggatgtgtataagtatgtttatatttttatgctaataactgataactgaaagccaattaaattggatgtagaaattattatatttcgattgatatttgagaagatg</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001067390.1 RefSeq:Os08g0116700]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 8]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 8]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information