|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 8]] |
| − | GeneName = Os08g0201700|
| |
| − | Description = Protein kinase-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001067750.1 GI:115475236 GeneID:4344906|
| |
| − | Length = 9655 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os08g0201700, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 8|Chromosome 8]]|
| |
| − | AP = Chromosome 8:5883638..5893292|
| |
| − | CDS = 5883638..5883808,5885069..5885140,5885539..5885621,5887005..5887076,5887154..5887225<br>,5887439..5887513,5887790..5887864,5888970..5889014,5889114..5889178<br>,5889266..5889550,5889581..5889645,5889782..5889983,5890082..5890252<br>,5890584..5890702,5892046..5892256,5892354..5892585,5892672..5892822<br>,5892894..5893292|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008401:5883638..5893292
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008401:5883638..5893292
| |
| − | source=RiceChromosome08
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtccaccttgttagcccaccttgttcggcgggaaggattcggtgaactggcagttcaccttgttcaacagctgcttgagctcttcaggctcggccgcatggggagggaggccctcaattgccagccgaacgatgtgtctcattttggtgcttcgggcatgaatggcacggaatctagatcaaaattacttgactggatatttaccgacattcattgggaatatgacttacctgagggaactaccgtggactcagcgccattaactttggcgctaagctataacgtttcagcgccaacgatgttggcgctaagctctaatccaaggtatattgatagctgtggtttaagcggggacctaccattaaccctttccaagcttaagaacctgagagcattacgagcatcagataatgatttcactgggaaaataccggattatattggaaacttgtcaaatttggaagtactgaagctccaaggaaacaaaattgaaggccccattcctgcaagtctttcaaagcttgtcaagttgaatagtagtttaaccctgcgaaactgcaacatatctgacaagctgacttcagtggacttctcaaattttaagaacctcacggacttgaatttggtgtggaacaactttatgatagatagctctaacagcagtattttgccttcagggctagaatgtctccagcaagatactccatgtttccttggtcaaccagagtattcctcttttgcggtagattgcggtggttccagatccgttaaaagcgacgataagttcatttatgaatctgacggtgccaatctacaaggtgcatcatactacgttacaaggccagtgagatggggtgttagcaatactgggaaattctacatgggtgaacctaatagaagttacattatatacacttcaaatcagtttaacaaaacacttgatagtgaactattccagacagctagaacgtcaccctcttctctgagatactatggcattgggctcaagaatgagatcttcccagatggacagatctggcaaagcatgggaaggaggattttcgatatatacattcagggagagcgcaaagaacaggactttgatataaagaaatatgcaaatgaaaaatcaaatactcctgttgaaaggcaatactttactgacgttacaaacaatttcatggagattcatctcttctgggctggaaaaggcacttgttgcattcctaccctagggttctatgggccatctatctcagcattaagtgtctctttttcgggggatcctggtctaaacataaacaacacgactaacggtgagaatacaagcagcggtagaagaggtttggttgttggagttgtagtcagtgctgttattgtaggacttctagcagttacaggaacttttgtttggacacagaaacgtaaaaggttagaggtcgagatggaagagctcctcagcatagtgggaacgcctaatgtatttagttatggagaaataaaatcagctactgacaactttagtactcaaaacattctcggaagaggagggtacggacttgtttacaagggtaagctacttgatgggagaatggtagccgtgaagcagttatctgcaacatctcatcaagggaaaagggagttcatgacagaaattgcaacaatatctgcagttcaacatcgaaaccttgtgaagttgcatggttgttgcattgagagtgatgccccacttttggtctatgaatatatggaaaacgggagccttgatcgagcaatcctaggcaaggcaagcttgaaactagactggagaacccgctttgagatatgcgtaggcatagcaagaggcctagcatatcttcacgaggagtctagcacacgaatagtgcacagggacatcaaaaccagcaatgtcttacttgatgctaacctcaatcccaagatctctgactttgggcttgctaggcattataatgacagcatgactcatgttagcacaggagttgcaggcacgctaggttatctcgcacctgagtatgccatgatgggccatctcacggagaaagctgatgtttttgcatttggaatcgtggcaatggaaatcattgcaggaaggccaaactttgatgatagcgtcgaggatgataagaaatacctacttggatgggcatggtgtttgcatgagaacaagcagccacttgaaatattagacccaaaactcacagaattcaaccaggaagaggtcatgcgagtcatcaacgtcattcttctttgcacaatgggcttgcctcatcaacgcccaccgatgtcgaaagtcgtgtccattcttacagaagatatcgagacggttgaagtggaagcaaatgcgaggcctagctatatccctcagtcgcagatcaggagtgagaatgatggcttcatagcaggctacttctcaggatcatcgatacagcaatcttcaggtacccaaggcagcatgccatcaagctcaagcagcaaacccaaatttcacagggacacctcccctttagcactgtcgccttgttctagctgtgagattgattag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MSTLLAHLVRREGFGELAVHLVQQLLELFRLGRMGREALNCQPN DVSHFGASGMNGTESRSKLLDWIFTDIHWEYDLPEGTTVDSAPLTLALSYNVSAPTML ALSSNPRYIDSCGLSGDLPLTLSKLKNLRALRASDNDFTGKIPDYIGNLSNLEVLKLQ GNKIEGPIPASLSKLVKLNSSLTLRNCNISDKLTSVDFSNFKNLTDLNLVWNNFMIDS SNSSILPSGLECLQQDTPCFLGQPEYSSFAVDCGGSRSVKSDDKFIYESDGANLQGAS YYVTRPVRWGVSNTGKFYMGEPNRSYIIYTSNQFNKTLDSELFQTARTSPSSLRYYGI GLKNEIFPDGQIWQSMGRRIFDIYIQGERKEQDFDIKKYANEKSNTPVERQYFTDVTN NFMEIHLFWAGKGTCCIPTLGFYGPSISALSVSFSGDPGLNINNTTNGENTSSGRRGL VVGVVVSAVIVGLLAVTGTFVWTQKRKRLEVEMEELLSIVGTPNVFSYGEIKSATDNF STQNILGRGGYGLVYKGKLLDGRMVAVKQLSATSHQGKREFMTEIATISAVQHRNLVK LHGCCIESDAPLLVYEYMENGSLDRAILGKASLKLDWRTRFEICVGIARGLAYLHEES STRIVHRDIKTSNVLLDANLNPKISDFGLARHYNDSMTHVSTGVAGTLGYLAPEYAMM GHLTEKADVFAFGIVAMEIIAGRPNFDDSVEDDKKYLLGWAWCLHENKQPLEILDPKL TEFNQEEVMRVINVILLCTMGLPHQRPPMSKVVSILTEDIETVEVEANARPSYIPQSQ IRSENDGFIAGYFSGSSIQQSSGTQGSMPSSSSSKPKFHRDTSPLALSPCSSCEID</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>1..171#1432..1503#1902..1984#3368..3439#3517..3588#3802..3876#4153..4227#5333..5377#5477..5541#5629..5913#5944..6008#6145..6346#6445..6615#6947..7065#8409..8619#8717..8948#9035..9185#9257..9655#atgtccaccttgttagcccaccttgttcggcgggaaggattcggtgaactggcagttcaccttgttcaacagctgcttgagctcttcaggctcggccgcatggggagggaggccctcaattgccagccgaacgatgtgtctcattttggtgcttcgggcatgaatggcacggtgccagcgacggaaggccctcaagaatagatttgacatgagcatctcagaatagtatttgacatgagcatctaaggctctgttcgttatgtggagataggagagattgagtctcgttttccgcacgcacgcttttcaaactactaaacggtgcattttttgcaaaaaaaatttctataggaaagttgctttaaaaaaaatcatattaatccatttttaaaatttaaaatagttaatactcaattaattatgagctaatggctcacctcgttttgcgtatcttcccaatctcctcaatctctttctcctcaaacacacctcatcagttgtgcctgctaatcgtgcatgatatttgtcaaaactaacaaaccagacttactgttctgcatttattcttacaggaaagtatttgcactaaatgttgttgggaagattccagaggaactacaagatctaacttacctgacatacttgtacgagttatttcctcctctactgaagttaaaaaagacactgatattaatacatgataaatgctgcagctccttgtaaataattgctctatgcacgcaactggaaacaaaaataagaaagaagtgaatactgttgaatttcatgcgcatggacgtacgtttttcggttccacttgtacacttagggcacccacaatagttatctataggctctctacaagagatccatgtcagtatattttcctacttggaagagattaaatgaagagagagcaaatctatctactaacctgaagatagtctatagagaaaaacgaggcaatggattagagagctatagatacccatgtagacataccattaaagtggtttactattaatctaatctatcgctgagatgtacatgtttcattactttaccattgcgggtgctcttatttattataatggagagaacagagcattcagacttggtgtacagattttgttaattagtttcaattctttaagtagatatgctggttacaagaggtgcaaaaattctaagcatatatgtcactttatttgttaatctcagtagatacgttgtttcgacagctcgaaaatgtagtctaactcgaccgtgctctgaatattggtgccagtgcaacggataattttgtaaagagcatactacatagggttcttctgtactgcttacatgaagtggttatcacagtccaacttaactacgttctgaatatttgtatcttattaattaattactgcttacatgatgtgctttcaggaatctagatcaaaattacttgactggatatttaccgacattcattgggaatatgacttacctgagggaactgtaagaattacaattcaaatatatgattggaagtatttcaacttaaagagttatcattgttacatgatgtcttgtgtagcacataacttacgttattctcttttcaaaaaactgcaaagatatgtggcgtttaatgcgttaagtggagttttaccaagggagctttggaacctcaagaatcttatatcattgtaagaactgggaaactaacatcttcagttactgtgtgaacaaatacagcaggataaaaatttacagagctgtttcatctgttattatttttgttattctcattatctcacaagctcgttgggtttagaccctttttttaacaaattgatccttttcaaaaacttatttcgaaactagtccatgcaaaaaacttcaaccaaaaatagaccgtggactcagcgccattaactttggcgctaagctataacgtttcagcgccaacgatgttggcgctaagctctaatccaaggtgacgtgaggacgctgagtcatcattgctcagcgccaaataacttggcgctgaggtcccaacgatttaaattaatatggaggcatatctagcaaagtcctactgatagcataatggtagtggaggtctactctaaccttaaggagcagggtttgattcccatcccacctatttttgtttctttttagtttttcctttttcttctctctctcactctttgttttttctttttctctctctctctttattaatatgttttttcttttttttccctctctcactctttgttttttctttttctctctctcactctttattaatatgttttttctttttttttctctcgttttctttttctatctttatttagttttccctttttcttctctctctcactctttattaatatatgttttttattttttctctcattttctttttctatctttatttattttttccttttttttctcgtaatactatcttcaaaatatatgtttaatatgcaactttttttgaatttgaaaaaaatatattgaagtggtatactatatggcaaatgagaacttaaactgaaatttcaaataaaattcaaaataaattaaattataaaatttgaaaggagcatatacttcttttatattggcactcaaaatcaaattcaaaataaaacaaatttacacacggaacattcatttttgtaaacaataagtgagtaggcaagagaaaaaaacccaaaaatacaaaagaaagcagaaggggagggatacaaggatacgatcctggcacctttgggcacacaaccttccgcaatcaaccactaggctatcacaattttgcttctacatgttgtttgcgctactatttaaaccgttgagacctcagcgccaagttatttggcgctgagctatgatgactcaacgaaataacgccatctcggattagagcgaggttggcgctaaaacgttatagcttagcgccaaggtcaatggcgctgagtcaacgacctatttttggttgaagttttttgcagagactaatttcaaaataagtttttaaaaaggatcaatttgttaaaaaaacgggtgtttagaaattagtcagacaattaaaagtacttctctgcataaatcaagcaccttgatttttcatttaatttcccaattgcatactttttttctctgaaccccctttttttgtgtgtgtttcaggagccttagcatgactaagtttgttggcgtacttcctgacgaaattcaatacttaactgaacttgaacgactgttatgtcttgtttcttcatgtctcactttttcttccaacaacatgcatgtgcatcataattgataagctgaacgtatcactactcgtccaattatgcaggtatattgatagctgtggtttaagcggggacctaccattaaccctttccaagcttaagaacctgagagcattgtaaattctgattacactttatatttaagaaagtgttcgataccatcagtgcattaactttgtttctacacgtccagacgagcatcagataatgatttcactgggaaaataccggattatattggaaacttgtcaaatttggaagtactgtaagttgcaacttgattttttctttgggtggggtacgcaagaatatcatgtaaaaatatgaccacttatgttctcaatgttcatttagccgtttttatgtataaaaagaataaaataaacgttctgcctaaatgtgtcacatactcgcatttaattgcgtaatgaactacagttttatacgttttaaaatgaatatatatgtggccatgcaggaagctccaaggaaacaaaattgaaggccccattcctgcaagtctttcaaagcttgtcaagttgaatagtagtttgtatgctcttcctgtaaccctagctactttgggactttgggagacacctgttgtgtgcttgttgcagttaattaatgccattttttgaattgttatcttttatattgaaaaggtggataggtgatttaacaggagaggtgtcttccttggattttgtgtctaacatgacatccttgaatgctctgtacgatggcatttgcatgctcttaatttaattagtccatattttggcatttgtggaatatcctgaagttttttttctttcacttcttacagaaccctgcgaaactgcaacatatctgacaagctgacttcagtggacttctcaaattttaagaacctcacggacttgtaagcattcattttaacaaaaaaaaaaagaacttactccatccgtcctaaaaaaagacaaaccatgggtttgcgtgtccaactttgactgtccgtcttatatgaaatttttttataattcgtatttttattgttgttagatgataaaacatgattaatactttgtgcgtgacttgtctttttaatttttttaataattttttcaaataagacgaacggtcaaacattgggcatagaaaccagggttatgtttttttggacggagggagtaactgtttaccattatatgacagccatacttcattaacttctcaaaaatgctgtacaactcagttacgtatgtacggtaagcattctttggtggaatgttaaatttaaaacctatttgatgagttggtgttgaactgcttgtatgtgagagctagtaaagtgcatgttatggtgttgaactgtttgctctttaattaattatgtcttctctggcgaggcagggatttaagttttaacagcatcacaggcatggttcctccaacaattatgaaccttccaatgctcgttttcctgtaaggaatcatgtatagaatatattgttttgaaatttatctcaaactaatagtttcgaatttcccaaactaaagtttataggaaccagatttcttgggagcaataaccttaatgggagcctgcccaacactaccataagcccttcacttactactatgtaagtagtttgttctattttattcagttgttttttaccaattaatttggccagcatcctgacagtatgtagatgcactatgcggatttatttaattagttagttgatggtgtgtcttgtcctttatttatttttatcaacatatttcttcaaatttcttttgcagagatttgtcatataacatgctttctggaagatttcctgcttgggttagcacaaaaaatttaaacgtgtagggttctatatcctaatacctatttaattagaaggcagaataaattcatgcatatctactgtattttcaatctggatatcaatattgcaatttcggtgccaaaacatcacatcttctgatctaacctatgtgctttatacttctcttaggaatttggtgtggaacaactttatgatagatagctctaacagcaggttcgatttttccccttcacctagattccccttgtctctattacaaacagaaagttgtaaacatctaattatgccatgaattatatattgtgcttgtagtattttgccttcagggctagaatgtctccagcaagatactccatgtttccttggtcaaccagagtgtgagctcttgtctcctgatccatatcaatacctgctttgggcaacaccaagttctatatcgcttatatgattctgttatattgtagattcctcttttgcggtagattgcggtggttccagatccgttaaaagcgacgataagttcatttatgaatctgacggtgccaatctacaaggtgcatcatactacgttacaaggccagtgagatggggtgttagcaatactgggaaattctacatgggtgaacctaatagaagttacattatatacacttcaaatcagtttaacaaaacacttgatagtgaactattccagacagctagaacgtcaccctcttctctgagatactatggcattgggctcaagaatggtaagtacattgttgcactaaaatttgcagagatcttcccagatggacagatctggcaaagcatgggaaggaggattttcgatatatacattcaggtgactaattcgtcactgtgatagtgataataacaagagtagtttccatcctgtatcatctgctaaattgattcaaatatgtttcattaattttttgaatacaagaatcttaattttttttacctgcttggtgcagggagagcgcaaagaacaggactttgatataaagaaatatgcaaatgaaaaatcaaatactcctgttgaaaggcaatactttactgacgttacaaacaatttcatggagattcatctcttctgggctggaaaaggcacttgttgcattcctaccctagggttctatgggccatctatctcagcattaagtgtctctttttcgggtactgatgcttatcttgctaaaagcataattatttctaggagatcatcttagaacaataatccattttctattatctaaactcttactgcattgaaggggatcctggtctaaacataaacaacacgactaacggtgagaatacaagcagcggtagaagaggtttggttgttggagttgtagtcagtgctgttattgtaggacttctagcagttacaggaacttttgtttggacacagaaacgtaaaaggttagaggtcgagatggaaggtaatgcatgctgaaaaactgttgtgataatcttacaaataaatactccctctgtattttaatgtatgacgccgttgactttttaaccaacgtttgactactcgtcttattcaaaatttttatacaaatataaaaatacttatgtcatacttaaagaatatttgatgataaatcaagtcacaataaaataaattataattacataaaatttttgaataagacgaaagatcaaacgtttgttaaaaagtcaacggcgtcatacattaaaatacggaggaagtaactgttaagtgcttcccttctgctataatgtgattctgtgaacttgcagagctcctcagcatagtgggaacgcctaatgtatttagttatggagaaataaaatcagctactgacaactttagtactcaaaacattctcggaagaggagggtacggacttgtttacaaggtaagttagatgcctttcctcaaaacttggaaacctatgcactttactagttgagcatatgctggatgtggttccccaaaccaagacatggttgcaaaatctccctttctatgttgtaattggtagagttaatccatagaggacttttacgatacattgtactgcaagtatatactaacagtatataaaagggtatgtttgatatttggtaaaaaatctggaaagggctttttagccatttgaagttcagaatttgtttcaatcaggagtaccctgtcgatctcgtcgtgtggtcgtagtgctcttccataatacgaagaagacgcacgtggaggcgtcgcgattccttccccactcggcttctcccgcgtccccggcaccatgcctcccaggctcccaccctagccgccggctttctcctccgtatccaacctctgccttctccaaaccatggcagcgaggttggccacgtcaagcccgctgcctcatcccacctcccacctccgacctcttgctcccactgttaaggtctaacatgcagaaccatgatccataaaattgatagatgaatctgtacgttggatctgttatactctacctggtgtatatactgtgtccaccaaacctatgttagttggtgacgaaaaattatcctattgctggtgctgacttctgcaaatgaattcttctgttggtgatgaaaaatgctgctgctcaatctctgccatgggcacagtaatcttatccttgcttttcaatatggcatgtgaagttcattaattcctctggctaaaataccatcttactagtacattgcggtggcgcggggtgcgtgtggcatgtgggcgcggtggtcgatcgccgtgatgaaggaaggcgaaagatttcgctcgagcgggatccgtcaaaggaaaacaaaaaataaaaataaaaataccccttattaaaagacaaatatacctttttttaatttatattacaagctaattgagtggaagatcaaattaatctgaaccattagattatttatactggtagtatatactactagtatattgtaccgtaaaaatcctctaatccatatggtttgattgggaatattttacaacatagctggcctttcttttgtgggattttgtttgtaaacattagcaaattactgtataatagtatcattctacaatctacattctgttctatatattttcagctttctccatactctcactgtttgtctcaaagcagctaatcactattaataatttgctaggtgtattacagttatgttttatttgctttccgaattcatgattggtagtagtatttgtatattatgtatgaagggtaagctacttgatgggagaatggtagccgtgaagcagttatctgcaacatctcatcaagggaaaagggagttcatgacagaaattgcaacaatatctgcagttcaacatcgaaaccttgtgaagttgcatggttgttgcattgagagtgatgccccacttttggtctatgaatatatggaaaacgggagccttgatcgagcaatcctaggtattgtttttcttttctggacctcctaaactagacacagctttgatgaaatttgcaccaaacttccaaggtgcataaaacttttgtatgtgtgcaggcaaggcaagcttgaaactagactggagaacccgctttgagatatgcgtaggcatagcaagaggcctagcatatcttcacgaggagtctagcacacgaatagtgcacagggacatcaaaaccagcaatgtcttacttgatgctaacctcaatcccaagatctctgactttgggcttgctaggcattataatgacagcatgactcatgttagcacaggagttgcaggcacgctgtaagaacatttctttgcatatatttctatgtcgtattcatgacagaagatcaatcgaccaacattatcgtgttcttactttttagaggttatctcgcacctgagtatgccatgatgggccatctcacggagaaagctgatgtttttgcatttggaatcgtggcaatggaaatcattgcaggaaggccaaactttgatgatagcgtcgaggatgataagaaatacctacttggatgggtatgtatgttaatactttctcaaacttacacatcaaatttatttaactaactaactaaatcaactcacaggcatggtgtttgcatgagaacaagcagccacttgaaatattagacccaaaactcacagaattcaaccaggaagaggtcatgcgagtcatcaacgtcattcttctttgcacaatgggcttgcctcatcaacgcccaccgatgtcgaaagtcgtgtccattcttacagaagatatcgagacggttgaagtggaagcaaatgcgaggcctagctatatccctcagtcgcagatcaggagtgagaatgatggcttcatagcaggctacttctcaggatcatcgatacagcaatcttcaggtacccaaggcagcatgccatcaagctcaagcagcaaacccaaatttcacagggacacctcccctttagcactgtcgccttgttctagctgtgagattgattag</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001067750.1 RefSeq:Os08g0201700]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 8]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 8]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information