Difference between revisions of "Os09g0456900"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
 
Line 20: Line 20:
  
 
==Structured Information==
 
==Structured Information==
−
{{JaponicaGene|
+
[[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 9]]
−
GeneName = Os09g0456900|
 
−
Description = Nucleic acid-binding, OB-fold domain containing protein|
 
−
Version = NM_001188941.1 GI:297727012 GeneID:9271302|
 
−
Length = 10051 bp|
 
−
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os09g0456900, complete gene.|
 
−
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
−
 
 
−
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
 
−
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
 
−
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
 
−
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
 
−
|
 
−
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 9|Chromosome 9]]|
 
−
AP = Chromosome 9:17888437..17898487|
 
−
CDS = 17890650..17890810,17890899..17891172,17891249..17891392,17898094..17898135|
 
−
GCID = <gbrowseImage1>
 
−
name=NC_008402:17888437..17898487
 
−
source=RiceChromosome09
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage1>|
 
−
GSID = <gbrowseImage2>
 
−
name=NC_008402:17888437..17898487
 
−
source=RiceChromosome09
 
−
preset=GeneLocation
 
−
</gbrowseImage2>|
 
−
CDNA = <cdnaseq>atgcgtagcttctttcggtgttgggtctccggtaccaccaagatggtaaccacgctaatcagtaagcttgagcctggtcttggcaacccaactattcgtcttcgtgtatcaaggttctgggaattccgcgaccaaaatgatgaaaatattctgtatcatcttggcctggttctggttgatggcacgggggccagcattgcagctcagattatgcctccattggatgagctctttgcccctgcaatcactgaaggcaaagtgtatgacctcacgttctatcgtgtaaggcagtgtaccagccagtataggccagttggcaatatgcagtcgattgccctcacaaagtggtctacactggaagagtgtactgatgtgccagagaatttccctaactatgtttactctctaacgccatatgaccagctaaggggacgagtgaacaggaaggactctttcacagatgccattggaatcattactgagataacatcagtgacacctatccaaacgcgcaccaaggatggtgaaagtctgaagaggagcatctacattcgcgatgccgagttagcccttcttctctgttttttaatatgcaaaaagatatttacttcagttctctaa</cdnaseq>|
 
−
AA = <aaseq>MRSFFRCWVSGTTKMVTTLISKLEPGLGNPTIRLRVSRFWEFRD                    QNDENILYHLGLVLVDGTGASIAAQIMPPLDELFAPAITEGKVYDLTFYRVRQCTSQY                    RPVGNMQSIALTKWSTLEECTDVPENFPNYVYSLTPYDQLRGRVNRKDSFTDAIGIIT                    EITSVTPIQTRTKDGESLKRSIYIRDAELALLLCFLICKKIFTSVL</aaseq>|
 
−
DNA = <dnaseqindica>7678..7838#7316..7589#7096..7239#353..394#gtctgcccagtggctggttgcgaccttccgctctgatggcgatggcaaggtgattgcccttgctcagcatggtgttgcattgtttttctaggattggcggtgttcctcatattcggtgtgttctttccagcaaatccctttcaggatccaggggcatctccatctagggatagtagagtttgacgccagctccggatcggctgttgcggaggaggtacagccccgttggctgcttctgttcatcggtgaggtttcatgccggctctaattttgttccattctgtaggagaacggccaccgcacgttggtctgctgctctctctcttcgtgcttggtccctggttcttgacggatgcgtagcttctttcggtgttgggtctccggtaccaccaaggtagtgttcttctctttatatcgcctagattgctgtgtgttgttctttgtgcttttattgccacctttattgcgtttggtttgtttgggaggggaccgttgctgtctggtcaatgttttatatgtcaacctttgttttttttccctttttcatagaggattctcgagtgtgaggtgctctgtacaggacatgtgaacgttggttccagaatatatatctgtgtttggccccacgcgacagtgtagctactttatagcatcttcctgttcttgctatcttagtatatatcttaccttccctcagcccctgtctcctcaacattttaagccctcttttccccctatttgaaagctgtctctacgattcgcagtgctctcggcgggatggtggcggttggcgtatcctacgtttctttgttgaacgctgttgcttcccattgccgtttaccttgggtgtcatacctttgggaggtagatggtgacggagtgctgttagcaggtgttgaacttagtcttcctgacgagcagttaggctgcggtacagtaagcaagttcttttgggttgctgcagtacagccgtcggccgtttcccatgaaatggttgcacagcaggctgttaggtttctccaagtcaagtatggtttcgctgtgcacaattataacttccacatgttgctttcatacagaaagatagccgcgtctgcggttgacgtagctataacagcggctgcacaccttgctaggttagaggcgcgctatggtcctacagatctgccttgtgagaatgtactaaagcagtgtaactctctatggttcacctttgttagggaggaccattttttctgcggtgcgcataggtcgtaggattgttcctctgtagtatcggggtagttaaagagtattcttaatggtgatcgttgttttttcgtactttaattattgccctctgtttctggtcctatatgtaaactgccaacttgatctattgatttggttttgttcagcttttgttcccatctttgcagctgcttactgttttcgccttttttaaaacctgctattatctatgttactcactgtgcatgttcaattgtgttctattttgtgatgcgctgtgcagagtggctccctgtatgtgtccccattttctttgcaatgtctggtaaagcaaaatcgtgtgtccaacgggcgcgtgagagtcgattaaggcgtcatgcttcattaggccagggtgtgttattcgcgccacacatttgtacatgttgtttttattatttagctcagctaactaagacagcaaattggcttccttaggatttctgcaagctccggtatttggttcagtaggttctgttcctttgcgcctcagctcagatgctgtgcacactggaccaagtagcatacatgcagatgtcgcgcaaggaagcgttccatcaggtccttcccagcaagccacatcccatcgttctaatgccaataggcaactgcccattgaaatcaacacaatcagtggaaacccaataggcaatgtgaaaagtaagtacatcactaatatagcctataagctgacttggttgcttcattcgagaaaagaacgaaccattgtttcgattcatttcttagtataactactttcccttagggaagaggacattactagacataccgcgaagtgctgctacgagcaatagggagagacgacatatgaagagatctgcccaccgaacagactactctctgatgaatgttcttgatggtattttcagatccaaaaaaaatacaaagaaaaaatttgtttcctactgcttatagcctcatttctattcgttgtataggcccaaaacctactcttgaggacatcttacctttgcctaaggattatattgcatccttaaaaggtttgtttttgttcatcctttagccagcgttcctttaatctatattccagtcttcccttatgctttaattctacagcgctataccctgaacgatcctactatggcgggccatcccatgaatgcccatactgtggagctgtattttcgttccaagagagggtcaaaaaagggaccgtgctgtcacagcgaaagatcatttacaacctgtgttgtagaagtggtaagattagccttccagagctgaaaaaaccacctgatttcctagccagactattaaaatttgatggtgatgcacgatcgaagcgatttataaggcagatccgatcatacaactctatgtttgcttttacttcgctaggagctaatgttgataagacgataaataataggtctgcaccttgtgtgtttaaaatcaatggggttgtacaccaccgtattggcagcctcttgccacgacatggtgctgcacctaaatttgctcagttgtatatatatgaccctgaaaatgagacatcaaatagaatgaatatatttgagagagattctaatgccgtggatgatccagacccagaaattgttatcgagctgacttctatgcttgacagccataatgatctggtcaaagcatttcgctttgctagagatcggttaaaagaccatggtgatgagaaaatttcccttagattgctggggtgtgatgcaagggatgaaattcagtacaatcttccaacgagtggtgagatcgcaggaatagttgtaggtgactattcaaacggtgagtatacgtacgatgtaatggtctaatcttctgatgccaggttacgacgtgtctcagctctacatccatcctatatggctcttcagtatccgctgcttttcccatatggggaggccggattccatttaggtatcaagtacactgacttccctagcatttctggtaattcacgacgctatgttacaatgctcgaatactaccgttaccgtctccattatcgattgaataaaccaaatccctttacctgttgtggacgtcttagtgattccatatgtgttgactcatactcgactgttgaagggtcaaggttgaagtatattgctgacaaccagcctgaacttcgctcagagtctgtccaagcgatatctgatgccattgatcatggtcttgaaactgggattctgtagggaagaagtatgtcttgcctaccagttttactggaggcaggcgatacatggtacaaaattaccaagatgcgatggcaatatgtcgtgtgtttggagtgcctgatttgtttgtgactttcacttgcaattcaaagtggcaagaaatatacgatgctttgctgtttgaactaggccaagtaccaagtgaccgctctgatatgattgtgagggtttttaacatgaaagtaaatgagtttatctcagacattagggaaggaaaaacatttggcccagtccttgctggtgggatactttcttcctgtgtttagtttgttgtacattcagttagttagttctaacattttatacttgccatgtagtgctctacacagtagaatttcagaagcgtggactccctcatatacattgccttatctggcttgctgcaggcagcactgaatttagcgctcctattgttgatggctttatatccgctgaaatacctgatgtttttactgatccattgggttatgctttggtcgatgagtttatgatccatggcccttgtggcaaccagaacaaatcatgcccgtgcatgaagaaaggggagtgttctaaacatttccctaagtcttttcaggatgagacaataatggatgattttggttttactatctacaaacgcagaaacaatggtcgatatgttcttaaaaatggagtgaaacttgataatcgatgggttgtgccttataatatggaactccttaaaaaataccaagcccatattaatgtcaaatggtgcaacaagtctaacatgattaaataccttttcaagtatgtcacaaaaggagctgatagatctaaagcatactttgaggtcaataataagccaactggtcaattatctgatagtaatggtgcagccaaagatgatacgttaaacaaaacaactaattctaatcacacacctcgaaatgaaatacaggagtacattgatgcacggtttctatctacctgcgagtctctttggcgtgcttttgaattcgatatccactatagagttccttcagtagagcgactaactgtgcatcttccaaatcaaaactttgttcgatacaaaaagggtgctgaactcaattcactcctaacaagccctgcggcccaaaaaacaatgttaacggaatagtttgaagctaataaaaaacatagcaacgcacgaacactgacatactgtgatttcccaaaggaatggacatgggacaccagctcacgtagttggcgtcctagaacaccatgtgaaaagataggtagaatgtactatgtgagcccaatcagtggagagctttactatttacgaatgctgttgatgattgtgaaaggtgctcagtcatatgttgatgttaggacatacgaaggcattgtttatgcgacatttagagaagcgtgtgaattaagaggtttactcgagagtgataacgagtggtatttgctctttgatgaggccataatatccgcatcatccacctagctaagacaactatttgttactgttgtaatgttttgctctgttggaaacgttcgatccctctttgacaaatattgggtgtatttcactaatgatatccagcgacgtcttagaacagctttgtcaaacccttcttatttggttcctcatgataggctactgtcgctattgatgaaagaaatgcaaaccactttttcaaatagcggcggtaacatagatgactatgatttaccgcgcccagcgatttactcagatgacatagtacggaatagaatgattgaggaagagcttgctcttgacagcgccatactggccactgaagctaattcaataattccaaaattgaacgctgatcagagaactattttcgatacagttatgaagcatgtgaatagctcaaaacctggttttttctttgtctatgggcatggtggcacagggaaaacatttttgtggaatgcattgatttcaaaaataaggtctgaaaaaaagattgttcttgctattgcctcctcgggggttgcttcccttctccttcctcggggacgcactgctcattcgaggtttaaaataccaattgacattgatgagaacagtatttgcactattaaaagaggtaccatgcttgctgagctcattcaaaagacatcacttattatatgggacgaggctccaatgactcatagaaaatgttttgaggctttagatcgaagtttgcgtgatctgctttccgagcacacaccttctaacagcagactaccattcggtggtaaggtggttgtacttggaggtgattttcgccaaatactaccagtgataagaaaaggctcgcgtgcttccatagttgatgcgtccataacaaatttgcctctctggcaccatgttactcttctgaagctgaacattaatatgagactccttcaaagtgacctttgtgaacagaaccgacaagaccttgaaacttttgctaattggatcctatgtcttggtgatggtaaggtacctgcaacaaaaaaaattgatgaaactgaagcaacatgggtcgatattcctgaagatttactaataaaaacatccggcgacaaaataaaggcaataatagatgaggttttcctagatttccccaacaagtacacagaccattcctatctagcatgccgtgctattgtttgccccaacaactgaacggttgatgaaataaatgattctgtcattcgtatgatacccactaagccaaaagaatatcttagttgtgatacaatttcaagatcatgtgaccatatgcctgactttgatatactatacccaactgaattcttaaactctattaatgtcaacaatttcccgtcacataaacttattttgaaaaaaggtgtcaccgttatgttgttgcgaaatttgaatcaatctatgggtctttgcaatggcacacggctattgattgtttctcttggccatcgattgttacaatgtgtgatattaactggatctaatattggtgagacagctttcatacctcggattgcgcttacaaccacgagttctaagtggccttttacacttcagagaagacaatttcctgtccgtatatgctatgcaatgacaattaacaaaagccagggacaaactctttcgcgtgttggggtttatttgaaaaaacctgtctccacacatgggcaactatatgttgctgcttctagatcaacttcaagagcaggccttagaatccttatagaggatgaggatgaggtctgtagttcaaagactaggaatatggtttatcaagaagtgttggatgcagctagattgatggtattattaaacaatttggctttatgtgcatcatactacagaccgaaagatatattaggacaaaccctaatatgttctctgttctaattgcaggaccttggcacctaagtaccaactatagcactattttttgccgtgctgttgtatactatcctttttcccgtttgctgtactatgcagcttttgtgtatgtagtgctgccttttcttgcatttatttttgtctgtctgttcactgcttccaatttttataacatcctaaataactgtatggcaagctaacaattgcttacggtattggcagatggtaaccacgctaatcagtaagcttgagcctggtcttggcaacccaactattcgtcttcgtgtatcaaggttctgggaattccgcgaccaaaatgatgaaaatattctgtatcatcttggcctggttctggttgatggcacggttagttctttagaatccttgctttgtaatctgtcatcacatttcgctttcttactcagtaccattttctaaacagggggccagcattgcagctcagattatgcctccattggatgagctctttgcccctgcaatcactgaaggcaaagtgtatgacctcacgttctatcgtgtaaggcagtgtaccagccagtataggccagttggcaatatgcagtcgattgccctcacaaagtggtctacactggaagagtgtactgatgtgccagagaatttccctaactatgtttactctctaacgccatatgaccagctaaggggacgagtgaacaggaaggactctttcacaggtactgtgattcagtcatatcctcatagattaccattctttttattgcattcttaatgtgtgttttattatgatctcttaaataatagatgccattggaatcattactgagataacatcagtgacacctatccaaacgcgcaccaaggatggtgaaagtctgaagaggagcatctacattcgcgatgccgagttagcccttcttctctgttttttaatatgcaaaaagatatttacttcagttctctaacatttctattaacagtgtatcagcaacaccaactaactaccaccaaatattactccccctttcaatatacatgctttccacatttatttttttgctaacatcacccaacaaccgctcacgatgccataaactctttatgtaatgatactatgtctgctgcatagcaatgtgacaataaatgttgcgctatggggagatcgagccacaacattccctgcagatgaggtgattgaagctggcaaaaaaaaatccacagatagtgatctttgttggcacgcttgtgaggggctttggtagtaagtccattaaacaccatacatgtgttctataatggctcttggaaaatgttctagggtgcttacatatgctctggatgcagggaatgtttctttgtcaggtaactctgcctgcaaatggtacataaaccttgacaaaccataggtgactgccttgaaaaacaggtttgttacatatactgtcttagcaaatcatatcctctgatctttcttttctatttccaattgagacatgaacttttttgttctatgcagcatccaaggaaactatgagccaataaaatatactgatctacccgccccatctcaggctgcaaacaatgcagaacagaagacggtcattgagattaaagacctacacccttttaagttcaaggtaaatcctcggtactataaatgctcattctaacatttcaatttatgttatacacagtgctaattaggatcctatttttatgaacagaagcatcagttcttagttactgtcgtcataaaaaaggttaacgtggatagctcctggtggtacactgcttgtgacacatgcaacaaaacagcaaaacgttttggaaatggatacaggtgtgcagatccaacatgcccaccagttgttttggcttcgcctaggtcagttgacataaactccactgttcaagctaatgaatacatgtagctatactaaaattaccattataatgcattttccagattcaagctcaatgtgatagcaggcgatgacacagctgattcttcattcattatctttgggcgtttggcacaacgcctcattggtcgttcagttgagacactgttgcagcagaatccaagtaacactggttgcataccaaaggagatcactgacctacttgagaaagaatttacctagaatgtcagcatcactgagaacactgcttctactggtactgttgcattccagatgaataggattcttggaggtgctaacaatcacacccttgccctgttacaatccccatctgcatctcaagcatcttctctcccagcttccatggctctatcaccaactccatcagttgggcttagtgatgcacagactggaccagctagcccatccactgctatatcaaaacacaaagacctggaaatagagtctgcttcaaagaccactacagaggttcaggatgaagaggaaatagaagatgaggttaggcttttccataaattccttttaaacacacatattcgaatttctaaaaactgaggttttttactatggagtaggatgtcgatcacctcagcctcacacagaaagctccttcttctagcactaaacaaagcacttctaagagctacaaaaaaaggtaaatgcttttttcccaagtattaatattccgcagtacacaaatgctaactgttctttttacaacctacccacaaaaaggcctaggccatctcctggcacaggtgctgcgaagaagctattcaaagacaatcctggcaacgatgctggtggcaggtattatgagttttgatgtttttgttatatactgatcaggagctataggtttacagtctatgtcttttatgcaacttcgcttatcctctttacatcgttgcagtgccatcaaccaagcctgatatgttatggaccaaacaagcttacttttggatgccacagttgctgcctacaccagacagctcttcagtgagaggagaagaaaatcagccgttctgtagtgcctttgcaaactgtcctattattatactggtgtcctgtgtttgacaccgtttccactagacttattcttttgcaaaaagacttaatgtgaactggcactgatcatgtaactaggattctgcattatcatagttatactatgataatcctgaatactggttgttatttcacggcgattaatttacctccgaattatcagtcgc</dnaseqindica>|
 
−
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001188941.1 RefSeq:Os09g0456900]|
 
−
}}
 
−
[[Category:Genes]]
 
−
[[Category:Japonica mRNA]]
 
−
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
−
[[Category:Japonica Genes]]
 
−
[[Category:Japonica Chromosome 9]]
 
−
[[Category:Chromosome 9]]
 

Latest revision as of 13:26, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information