|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]] |
| − | GeneName = Os11g0147000|
| |
| − | Description = Similar to Long chain acyl-CoA synthetase 6 (EC 6.2.1.3)|
| |
| − | Version = NM_001072271.1 GI:115484154 GeneID:4349764|
| |
| − | Length = 9315 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0147000, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
| |
| − | AP = Chromosome 11:2113793..2123107|
| |
| − | CDS = 2114158..2114253,2114327..2114413,2114524..2114610,2114831..2114916,2114996..2115099<br>,2116554..2116640,2116728..2116851,2117527..2117645,2117733..2117862<br>,2118009..2118097,2118229..2118317,2119092..2119185,2119294..2119373<br>,2119470..2119559,2120302..2120388,2120488..2120532,2120954..2121030<br>,2121104..2121209,2121365..2121446,2121537..2121608,2122114..2122191<br>,2122262..2122322,2122844..2123003|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008404:2113793..2123107
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008404:2113793..2123107
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgcgaggcaacggcagggggcgggaggaggaggggaactccccaatgggccgccggttgcgggccgtctcggcccacctcctgccgccggcgtccaccaccaccaccaccggcggcgttgacctcgccgccaaccccaccgccggcgagtacgcgcacgtgcagggctacagtgctgtgctccctgagaagttgcagaccgggaagtggaatgtataccggaatgcgaagacacctcttaggttaatagatagattccctgatacccctgatattgcaacgcttcatgataatttcgtgtatgcagttgagacctttagggactgtagatacctgggcacaagaatctgcgctgatggaacagttggggactacaaatggatgacatatggagaagctagtacaaacaggactgcaataggttctggtcttatttatcatggaatacctgaaggtgcatgcattggtttgtattttataaacagacctgagtggatcatagttgatcatgcctgtgcagcatattcattcgtgtctgtgccactttatgacactcttggtccagatgcagttcagttcattgtcaaccatgcgacagtagaagctattttctgtgtgcctcaaacactaagcactctgttaagctttataactcaaatgccatgtgttcgccttatagtggtaattggtggagacaatgcaaatatgccatctaccccaacatctactggagtggaaattataatttactccagactactcaaccagggaaagatgagttctagaccttttcgtcctccaaaacctgaagatgttgccactatttgttacactagtggcacaaccggcacaccaaagggagttgttctttctcataggaacttaatcgcaaatgtagcaggatcaagtgtggtcattaagttttacccatctgatgtgtacatctcatatctacctttagctcacatctatgagagagttaaccagattgcactgcttcactatggagttgccattggattctaccaaggggataatttgaagctgatggatgatctggctgcactgagaccaacagtattttctagcgtaccccggctatataacagaatttatgctgcaattacaaatgctgtgaaggagtctggagggttgaaagaaagattttttcatgctgcatacaatgctaagaggcaagccattatgaatggacgaaatctgtccccaatgtgggacaaattggtatttaacaaaataaaagctaggcttggtggacgtgtgaggcttatgtcttcaggtgcttctccattgtcagcagatgtcatggaattcctaagagtatgcttcggttgtctcgtaattgaaggatatggaatgacagagacatcctgtgtcatcgctacaatggattgtgatgataggttaattggtcatgttggacctccaaatccatcttgtgagattaagctagtggatgtcccagaaatgaattacacctctgaggatcaaccatatcctcgtggagaaatttgtgttaggggaactacgatattttttggttactataaggatgaaatccaaacgagagaggtcattgatgaggacggttggttgcacactggagacataggtttgtggctgcctggagggcgtttaaaaattatagataggaaaaagaacattttcaagttagctcaaggagaatacatagctcccgagaagattgagaatgtctatgctaagtgcaagtttattgcgcagtgctttatatatggtgatagtttaaactcttctttggttgccgtagtagcagttgaaccagaggtgttgaaggcttgggctgcatcggaaggaatccagtacgaggatttaagacagctatgcgctgatacaagggcaagagctgctgtcctggctgacatggactctattggaaaggaggcacagctaagaggttttgaatttgccaaagctgttacccttgttgctgagcctttcacactagaaaatggtctcctcaccccaacattcaagatcaaaagaccgcaagctaaggcatactttgcaaaagaaatcgcagatatgtacgcacaactgcgtgaagcagaatcaacaaagtccaagttgtaa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MRGNGRGREEEGNSPMGRRLRAVSAHLLPPASTTTTTGGVDLAA NPTAGEYAHVQGYSAVLPEKLQTGKWNVYRNAKTPLRLIDRFPDTPDIATLHDNFVYA VETFRDCRYLGTRICADGTVGDYKWMTYGEASTNRTAIGSGLIYHGIPEGACIGLYFI NRPEWIIVDHACAAYSFVSVPLYDTLGPDAVQFIVNHATVEAIFCVPQTLSTLLSFIT QMPCVRLIVVIGGDNANMPSTPTSTGVEIIIYSRLLNQGKMSSRPFRPPKPEDVATIC YTSGTTGTPKGVVLSHRNLIANVAGSSVVIKFYPSDVYISYLPLAHIYERVNQIALLH YGVAIGFYQGDNLKLMDDLAALRPTVFSSVPRLYNRIYAAITNAVKESGGLKERFFHA AYNAKRQAIMNGRNLSPMWDKLVFNKIKARLGGRVRLMSSGASPLSADVMEFLRVCFG CLVIEGYGMTETSCVIATMDCDDRLIGHVGPPNPSCEIKLVDVPEMNYTSEDQPYPRG EICVRGTTIFFGYYKDEIQTREVIDEDGWLHTGDIGLWLPGGRLKIIDRKKNIFKLAQ GEYIAPEKIENVYAKCKFIAQCFIYGDSLNSSLVAVVAVEPEVLKAWAASEGIQYEDL RQLCADTRARAAVLADMDSIGKEAQLRGFEFAKAVTLVAEPFTLENGLLTPTFKIKRP QAKAYFAKEIADMYAQLREAESTKSKL</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>8855..8950#8695..8781#8498..8584#8192..8277#8009..8112#6468..6554#6257..6380#5463..5581#5246..5375#5011..5099#4791..4879#3923..4016#3735..3814#3549..3638#2720..2806#2576..2620#2078..2154#1899..2004#1662..1743#1500..1571#917..994#786..846#105..264#acgagtgacgacgagtagtcctccacccctacgcctcgccttctcctctcttcttttcccacgcaaacgccggagacagaggaggagacaagagtccaagaccaatgcgaggcaacggcagggggcgggaggaggaggggaactccccaatgggccgccggttgcgggccgtctcggcccacctcctgccgccggcgtccaccaccaccaccaccggcggcgttgacctcgccgccaaccccaccgccggcgagtacgcgcacggtatgtcgtatcttcagtcccgtgtggtgatgcccgcgattcggatctctttggggttggattcccagctggtcgagcagactagcacttttgcttttagataataatctaaaattgtttctgattcccaaacggtggtggtaatacgcgtcgcaacactgtgttcatcggatttagttatggtcgtgtggagaggtttcgcttttctgaatttgtgctgccgagtccgcgcatcagttccatacttccgttgcttagctcggtagtatccttctcgctattggattagagtaatcgcttctaaagctccctttatatatctaaaaaattaaaaatatttagagtattcgcttgtgtgctgaataaaggtaaaagggatgaggccttttcttcctttttttagtatgccggcacacgaaagttgtggacttgtggattccccaactactgcatgtttgatttatctttcttgacaaaacagcctttttttagtttgtaactcaatgtcatagcttctccagtgcagggctacagtgctgtgctccctgagaagttgcagaccgggaagtggaatgtataccggtaggttatttatatttttggctgcatttgcttatgttgcagctcacaattgctgtttccaatcttgcaggaatgcgaagacacctcttaggttaatagatagattccctgatacccctgatattgcaacgcttcatgataatttcgtgtaagaatcctcgaaatctcatttgagcatccggcttttatttcttaatattattctcaacttggcgaagtctcagttatttacaaaatgttatgctatgatttatcaaattcttgttttgaattgtcagcaaacatgtgagtgcacaaacatagagttaagcaaaatgaacgctagttctgttttccctaggatgaattgtatcaggaggattcttaggaaaatctgattacataaaaagaattattggcaagggaagctgttctttaagctattttattgaaaccttggagccggaaaatgtttgtatctataagggaaaagtgagttaacctttatctattgttagatccacagcctgaatgcagatggtttttatctgatggttttatgaaagctgataaatttagatctgttgcaggctacatgctttacaagaaaattattattcttcaaatttaagttctgtgctaagttctgaggcaatataccccaaattgcgcaggtatgcagttgagacctttagggactgtagatacctgggcacaagaatctgcgctgatggaacagttggggagtaaggattagttcctggatatatgtgttattattggcttttgtagctttgttcaaatcttttaaatgatatatgtatggaactttgcagctacaaatggatgacatatggagaagctagtacaaacaggactgcaataggttctggtcttatttatcatggaatacctgaagtgagtcataatggtcgcaacaagtaccgtccttctttttttaactagtagcaggcagatcttgtcacacatggacaatgatataacatttgtatttacacttagagagtcccttttttttttaacttgctttattttttttaactctgaaccagggtgcatgcattggtttgtattttataaacagacctgagtggatcatagttgatcatgcctgtgcagcatattcattcgtgtctgtgccactttatgacactcttggtatgcactattcaccaaatgatcatctatatccttatcattcatctagcaacaatatttatgtaatctgcaggtccagatgcagttcagttcattgtcaaccatgcgacagtagaagctattttctgtgtgcctcaaacactaagcactgtgagctttaaccccttatctcagccttgtatagttattagtttatacaatcattaaaatttgcacttttcatgtcactggtaccagccattaactactgaaggtggcaagtagctagttatttccaggaaatagatctgtgctttcaggtgctgatctcatcctgctatgaacacacaatgtcaaaagactgcacactgcataaactgcatgctcatcatactgtttgttcttaaccatatccacatacgcacatgatcaatgggctgagcgctgggccctgaccatgaaatatgtttatgtggattctgatccttgtttcaaacactacatcagtttgtacctttaatttaatcatgatatattctttggaatgaagtatttttatgtttgcttatgtatatgtctctatttattgcagctgttaagctttataactcaaatgccatgtgttcgccttatagtggtaagttcgaaccatttataattagtatgttcaatcgagcagtcatgattttttaagaatctttgttctgttttttttttcttaacttgttttgtataggtaattggtggagacaatgcaaatatgccatctaccccaacatctactggagtggaaattataatttactccagactactcaaccaggtgaatttgctacatgatccttcagtttttgaaaactatattgtactaccttcatctcaaaatataagaacttttggggttgaacaagggtattaaggaagtatgtggagttaaatggcagaaggttttgattgatcgaaaagaggaagtagatggataaattaaatgagggaagattgcgattggttgaaaaaagaacgtaggtggagaagttgctatattttgggacaaacttagaatgctaaaagttgctatatttttggatagagggagtatatgggatactagtcttaacacctcatatagttttagagatgtctgcaccagatgagtttactaacactatatattgttcattgtatttgttctattccacgcaaaaaatgtatttgttctccaatttcagtcaaccgaatcaaactgcataccagttgactgcactccgtcatgtatgttgctctgattaaatttagacttgttccaaatgatttatccatatcagacaaagttgatgtggcatctagtttccacttatatttgtgtgagcagtgtgcctacgttttcatttttctttcttatggacacacatagtatgtgcattctgtacatattgtctttttaagttttgcgtcaaatgcctgcatatctgtatccagtcatatacataatctttggtgttagattgaaggttgctagcacttttgctcactatttttccatcgcttttgaatcttcaactcagggaaagatgagttctagaccttttcgtcctccaaaacctgaagatgttgccactatttgttacactagtggcacaaccggcacaccaaaggtaaataacccatgtttctgattattctttgctccattcaaagggcctttctaattcgacctttcaatcttgtggcacttgatgtcatatttccagggagttgttctttctcataggaacttaatcgcaaatgtagcaggatcaagtgtggtcattaagttttacccatctgatgtgtgaggagtttacattaaatctagattcatatctttctgctataacttaataaatttatatcatctctaaatgtttttgatagtagtcatgttgatatctctccacaggtacatctcatatctacctttagctcacatctatgagagagttaaccagattgcactgcttcactatggagttgccattggattctaccaaggggtatgcagatccaaaaccattcaggatgttaatttggtagttctttgcatttgctgtttgtgtaaataatagaacatgtagaacaatggagtttctgacttagaaaaggtatatatcaataaccggggccaggtgcacatgaaataaaccacttggaaaagcaattggtaatgctagttctcctgtaactgtaagttacccctagacataggagcagaattggatcaggtagtgcaatatttctaactgttagataagaatcatccagagatcaattgaacacagcagatttcgacagtctaatgtcgtttatataacagttctgaagtctgaactttctactcttcttaatacaatttcggttggttgagtttcggccgacccggctaaaaaattgaacacaatagatgcattttatgctggacctttcacctacaagatatcatcccattatagtagttgttatggcatccttgtcttaaatggatccattttgttatctcatgttagtttactgcacctctatgttgctcaccataatcctttcctcaccatcgcacctatcatattgctaccctattgctggatttccttgcgcacaggaatcagctagatatagggttatatcaggtgtgtttgctgcttgtttgcaagcagcaaacgctttgtgcaacacttgacaaatatgcatcacttccttttatatcaaatgttcatcttactgcatgcataataatcttttaccgccaattctgaattctttgtcatttccaggataatttgaagctgatggatgatctggctgcactgagaccaacagtattttctagcgtaccccggctatataacagaatttatgctgcgtaatacaactataccattaacttagatactttcgtgtttggcatgactatttctagtcatatcttttgcacgaaatcaattttttcccttttcagtaattctaactggctagttgtttattactctgtagaattacaaatgctgtgaaggagtctggagggttgaaagaaagattttttcatgctgcatacaatgctaagaggcaagccattatgaatggtaagaacagtatgaagctcattgcaattaagtgtcttatgtagttttgcaatgacattcctaggcagctcctacatgttttctgtcatcccattttttatccaccacatgtatgaaatgttaattctacatttttgtgttattaggacgaaatctgtccccaatgtgggacaaattggtatttaacaaaataaaagctaggcttggtggacgtgtgaggcttatgtcttcaggtgcttctccattgtcagcagatgtcatggaattcctaagagtgtaagctggcttcatatatgctcctttgggacagcatgattttataacttggattaactaataaattttgtcttatttttttaacagatgcttcggttgtctcgtaattgaaggatatggaatgacagagacatcctgtgtcatcgctacaatggattgtgatgataggttaattggtcatgttggacctccaaatccatcttgtggtaagatctgtgtttggattttcaaggatgtaactagatttgcttggataaaaaacttgtccttttgttcacagtaatccctcactgttatggtctgccactgtagcattaagattataatatttcccaaaataattaattagattaataggatcagttatttaatatcctatacatttggctctaggtttaactaggaaattagagattgctttgttgggatgataaggatccaattgttgatggtcgagatactgtaaagtacacaatgcctattggtacacatttctatctagcatatgtagtccaccggtataagtgaccgttgcatccctattatcatcaaaaaataaagtaaacacaaagttaggtttaacttgattatagtctcttggcaatcaggataaacccagcaccaataagagtgatcttgtctttatccctgctgtcagatccttatcgtatctatgaattagtgttcatgacgcccatcaagtcaagtctgcttcatatagttgtagtgcatagtaacccatcactgatgtaaaacatgtgacatctcatatttacctttcttaaccccaaataagtctaggtttcatcttcaactaaaatattgtttttttttgcgtgctatcacactctcataatgtaaatcctgttgccatttttcagagattaagctagtggatgtcccagaaatgaattacacctctgaggatcaaccatatcctcgtggagaaatttgtgttaggggaactacgatattttttggttactataaggatgaaatccaaacgtaacgtatcttgctatgtatttctgtctcctatttaagttcaaatatattaaatgagtttcagaaattacatttgaaaacatgcaggagagaggtcattgatgaggacggttggttgcacactggagacataggtttgtggctgcctggagggcgtttaaaaattatagataggtaaaactgaattactaccgtttgtgtttcagccatttcctttggaattaaaatggccttgtgccttcgtcatataatatctattttgttccttgataattttgccatcgcatcctttcaatcattgctaaacagtctcatgagtttggtgaagataggaataggattgatctactatccagcaaagttctgacttccaaattaatttttttcctaggcagaagaaaatatcatgctacaagttcctgcgaaaataaattatgatgcatagaagttttattagtgatgttttcatgtactccttccatttgaaaatatagctcttattttgggtgggcaagaggactaaggcggtacaatactaagaagaggagttaaaatgaccatgctacccatacttaattaaataccttaggaataggagagtggatggttagtgtcatgtgtgatgcttcctatatgcaagagagagtatgtgataaagggggcaaaataaagaaaaggctcaataaattcacatgaaagccttctgtttttcaacaagattgaaaaaactttaggcctcataaaaggaaacagagggagtgcatctttttttcttgaatacatgagaaaacaggaacaaggaagggagcaacgcccaccctcatccaaaccaccaacaaaccttagcctttacatgaaaaacacacaaactaaaaaacaacctcacccaagcgacctattaggaaactccctaagaagccctgggcatgatccaacattcattggtcactgtttggataactgtagttacactgagattaatgctgttaaacacacaattttttctatgcttccaaatcttccaaagagagggtgtacatcttaggacttacttttagcttccttgcagtttcctaatgatatccagatcagtgattgctaaattaagttgttaaatattaatgcatacttgaaatcttcattcagcttctactattttcttctcaccattatattgtttgttatatgagatttgcatggttggtgatgaaactctaatatgtgaaagctcactgctattctaaattatagaatttgctgtattttgtagttctgtgaatacataccatatactaagatggtagggacttgataaggttaaaactagtgtgctaaaagactaaagtaaaagcaagatattaactcctcatctactgatcgaagagcaaaccttaactatcctctactgttattgtagcagacagctttcaattgcgaaatgttgtaatgcatggatgttttttgagaaataaccacaactctattctgaaatctttttgtctgtaattatttatcctctttccacacaattttttaggctatctattttaatttattcccctggaactctgtttcgtctgattacttttcttattaaattttaattgatgcaattttcttttctcaaggaaaaagaacattttcaagttagctcaaggagaatacatagctcccgagaagattgagaatgtctatgctaagtgcaagtttattgcgcagtgctttatatatggtaatattcatgatcttatattggttattacgtactaattatttaccatgtatattctaagccgttgatttgaatgcaggtgatagtttaaactcttctttggttgccgtagtagcagttgaaccagaggtgttgaaggcttgggctgcatcggaaggaatccaggtaaatgtgctgaccttttttttgaagtaaagagtacatactatacatttgtacagcccagtttctccaaatcagcagattaccttcttgtatgttattatatattttccagttcactacacaaacactgcctttatttattaaaaaacagaactacaaatagagctccttacatccgcattgcctgcttatgttatgatcttccctttctaacctacagtacgaggatttaagacagctatgcgctgatacaagggcaagagctgctgtcctggctgacatggactctattggaaaggaggcacaggtttaattttcacttcttagttcttaccttacatgctctcttaataagtaaaagttctgtatgatgtgtatgatccttatctatctctctgtgcttacttactgtaccagctaagaggttttgaatttgccaaagctgttacccttgttgctgagcctttcacactagaaaatggtctcctcaccccaacattcaaggtaggcccgttaattctgttgcaggagatctcgatacctaaggtgctaattctctatctcaatgatgttgcagatcaaaagaccgcaagctaaggcatactttgcaaaagaaatcgcagatatgtacgcacaactgcgtgaagcagaatcaacaaagtccaagttgtaattacccgagtaacaaacagaataaaggttcaaccaacacaggagatttagttcgccaattgtatattcaacaggatgaaataagcgccttctatttactggccaagcaaacaatgacagcagtatttcacgagcccttccatctgacgacgaaatgaaacttcaccgatcaacagcagggaacagttggatgtagaggccggtttcttaatccattatctaaaaaacagcagggaacagtgcttgatgcataattcatatttgtttcttatttgagtgaagtaatactactgtttagtgggatatggactactcatttgtttgggacagtatttggtgcggaattaatatttgtttgttgctagc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001072271.1 RefSeq:Os11g0147000]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 11]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 11]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information