|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 11]] |
| − | GeneName = Os11g0545300|
| |
| − | Description = Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein|
| |
| − | Version = NM_001074590.1 GI:115485828 GeneID:4350688|
| |
| − | Length = 11021 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os11g0545300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 11|Chromosome 11]]|
| |
| − | AP = Chromosome 11:21932287..21943307|
| |
| − | CDS = 21940220..21940249,21940326..21940486,21940593..21940689,21940765..21940956,21941043..21941104<br>,21941173..21941319,21941647..21942460|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008404:21932287..21943307
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008404:21932287..21943307
| |
| − | source=RiceChromosome11
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtttggtggaaaattccgtcgcagtaaagtttgttccaaatgtggaatgctttctaattctgaagaagattttactttgctaatgtttaatatacctcatcgtgaacaagttgttgctgcaacattagaagattgtcttgatcacattgtggaagaaaacgtacatgattcattatcccgttgtgaaagctgtatgaatgaccagaagtcaaccagtaagtgtacatttcatgaaactagagatgttgttattgtgttgcaaagatttgaaccacttacacttgggggttatcgaaagattggagaactaattaactttcctacggagctggacatttcaccatatatgagtggtgttgtaactgacaagcatatatatgaactgtttggaattatagttcatgaaggcggtgttatagggggtcactatagaagttacgtgaaaacaaactgttggtatgaagtcagtgatagagatgtgaaaagagtaaatgaaaattttgtcctaggggcacaagcatatatcctgttctacaacaggaaagaagaggccaaatcattcgatgaggttttagcttttgctgctacagctatgtcttcatctgatgccgtgcctacatcaacttcaaaagattacactgaaagaacattatcacctgaagtatcgtctgctgctctgtcatgttggattgatgctgcacgggtccttgagcccaagagttactcagaccaggatatcctagaaaaatatatcatttgtatggaccgtgacagttcagatgtatctgagaggataaggaatgccatgcggaattgtaatgagtccagacaggagtatcattttaatctccctacaacggatggacctttttatgatgacaacttggggcagtactgtcttcttcggggagctagatttcgaaccattagtacaagcagtaatgtagaagcgaagagagatagggctgttagaatgcacttccttctttctgaaatcttaaaactcctacagctgaaaaaagtgattgacgttggagctattggctatctggagaaatttaagtttgggaattattccaggagtgctcttttacggcgaattaatgatgcatgtatgctcttggggactaacagattatcccttaatatctcagttatgtcaagaggatctatcattgggccagtgctgttcaaagttggagaagatgtgatgattgatgcaagcttaagggctgtacagattccacacgacattcacttggtggaccatattaagttgaaaaaaccagtcagctttgttcttgttgttgaaaaactatcaatatttaacatgcttgtcaatcttaactttcatgtcacacacaattgcataatcatcactggatgtggaaaacctgatatggcaacaagaggtgcagtttttaaacttaattattgcttgccagtcaaagtttatatccttgctgatcttgacttggatgggctccagatatacttataa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MFGGKFRRSKVCSKCGMLSNSEEDFTLLMFNIPHREQVVAATLE DCLDHIVEENVHDSLSRCESCMNDQKSTSKCTFHETRDVVIVLQRFEPLTLGGYRKIG ELINFPTELDISPYMSGVVTDKHIYELFGIIVHEGGVIGGHYRSYVKTNCWYEVSDRD VKRVNENFVLGAQAYILFYNRKEEAKSFDEVLAFAATAMSSSDAVPTSTSKDYTERTL SPEVSSAALSCWIDAARVLEPKSYSDQDILEKYIICMDRDSSDVSERIRNAMRNCNES RQEYHFNLPTTDGPFYDDNLGQYCLLRGARFRTISTSSNVEAKRDRAVRMHFLLSEIL KLLQLKKVIDVGAIGYLEKFKFGNYSRSALLRRINDACMLLGTNRLSLNISVMSRGSI IGPVLFKVGEDVMIDASLRAVQIPHDIHLVDHIKLKKPVSFVLVVEKLSIFNMLVNLN FHVTHNCIIITGCGKPDMATRGAVFKLNYCLPVKVYILADLDLDGLQIYL</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7934..7963#8040..8200#8307..8403#8479..8670#8757..8818#8887..9033#9361..10174#atacgcgacacagaacacgggcttccctccatgaactcctcctcctttgtcgaagaatatcttccagcaggtgagacattggatctgtccctgtcaatagctacgagcaagatttatcgatgcagcgttggtcaggggcctctccgtctatctgttcctatggaacctgccggccgggggctgcttccatgggagagaaaaaaaatagtctggcggtggttcgttccatagaagcacggcggaagtagtctggctgcggttcgtcccattgaaccggatctgacctggtacgttactgttctttttttcagttttcgagtatgttttttaatgttaccacaacggccggcgatatccatggatctctttctgctgtcaatagcaatgggtgagatcgatgccgcagttacccgccacaggccagatcgatctaccggcgtcagtgatatcgccgtcgaacagttcccatgttcgagatcgagatgaactaacggcggtcgggcgagatcgatctaccggcgtcagtgatatcaccggcggacggggttctgatctccaaggggagtaaagtctgtcctgtctggtggtgttttttacgatattgtatagaacaacggcgacggcaatgatatcgatgaaaataatttgtcgccctgtttctattcttcagatagatcgtcgccatgatctctccaaggagggggtaagttactatttcttgttcagtcagttttccttaactccgttttctagcatttaattacctatagcggcagtttgcgtgcagtggcttcctacactgtacgattttgactggagattgtgctctgcatcttcaatacagattgggtggttagcatcgtcgaatccaggataaaaattgagggtaggctggactgaaagtcttaagtctaagttaacaatgctaatatgaggcatacaccattatcaagtcaaatgttacacttacatgattaaatagaaaaacatagttataaaagaagtaacttgacttaccagtaagttgctaattttcttagatcttagcaaagagttaagtgagaagcctcctggatatataaatgagcaaagttagtaatgcataaatggtagaagtaaacaaatattaactaaagaaagcaacatactgctaagttgttgcattttgttcacgaggcaaggatactttacaggatactttacaggttttcagggcttggaatcgcttcatgattacattatcattgatacttttaaatatctctattacaaatctaccaacaaatcaaatattaggaaatgtaaatgataaatcccctcacttgccacgagttagtactcactaacaagtagtaacaaataacaatgaagtaaagaacagtatagcttactcactctgtcacttagagactcactggaagcagccaagtagcaagccgagcagtagcaggcaagcaactccggcggcctgctgtgctgctctgcgcttgctgccgcggggccaccagccgtgcgcccgcgccgccgcgcgcaggccccttccccttgcagcttgcgccttgtcggctttgccgcttgcgctgtgcggctgtgccgctgccgcaatcgctcgtcgcccgcagctgccacgcggccgcaatcgcacgccgccgcagcgccacgaaaaatccccacagggcaaaggttagcagccacacggtccaaactccaaaaccctaagccaagacaaaacagacacaatgggccaagtgggcttttgctaaagtgataaatgggccattttacgcgtaccggtttagctacatgacttccatggctcctgttcttcttcctcgccgccagagacggagttcttcgcctcttctcttcttcctgccttctccagctgtttccatggaagagatgctatatacttaaattttttttgcaaaaattggagggtaggctagagcctgatggagcctacatgctagaatcgccactggttagcattgctataatctttctcataatagcacatatactttcacattttattattaaaaaatattagaaacagcaatatgattttaacagcattaggatactgcataacttgaccaatatgattttatatgtctgatatctgattgttaatgtaagtcctatgtccataaagcaaatatcatggatataaaccatggtaggtggaagatcaccattaaatactacataaggtcattatcttcgctatcattaaaaatttaaattattagtggcttctctttgctatctgtagtgatatccttatacctactaaagatgatatgtcatatcttatgttcatatacgggttataaaaagtgttcataacatagtggaacagttataaaatattttatatcgtattttataagttatgaacactttttcattgtcacgttagtatagggttggacaatccattctcatctgttgtagttataattttatacagcttagacaatctagcctttatacaacttattaacacgtgaattcaaagaattttcaattaaaatgaaaacatcgatgtattattaccctctagaattaatgtatcactcctagtaaatcctccaattaatttaagtaagaatatactctactctcaatattatttacctagatttaaaaaagttgtcctcattcatgaactattttccttaaatttaaaatatttttaaattataatacttacttttaatctaattttaaaatacttttaagagtaaattttactttggaccatctttattgaccgaaatttcacattgggctagggctaggctcatgttttcacttaacaccacgtatagttaccgttgtttgcactttggacctggttttatagttaccattacatgagttgttgtctaggtgcttagcattttacaagaaacaatgatatggaaatctttgccatgcaaatatgcttagcacaagaacaatgattgtaaatgttataggatatcctatcatcagattaatgggacttcattactactacatatgaacattcacaacccttatactatagagacaaaattggagaaatattgagtttaagaactatttttctacaaaagatattacatgttttataatacccaactgtagtgttagtacaaattattgaattctaagttttctaacacaaaaaagaaatgagatcagatctacagtcattatattatgtgtaatttgtgaaacttggtccaaagtgcaaatgatggtaactatatatgttaagtgaaaatataagtcttaactctagtccaatgtgaaaatttggtaaataaaggttgaccaaagtgaaatttactctatttttaaattatatactcctacataaacttatttctccactctatttattatagtgaattacgctttgggctacattttattacacaagttttactctggaccacgcttaaacctaccttctcactttgaaccaggtaagtttgtcattgttgcggtttggaccaccccgaatgatttttttcactacacaccaatgaccttaaacacattgcgatctcctccatgtatgtctacatggcgagaaaagttattcagggtagttcaaattgaaaagataggtaaaggtggtccaaagtgaaacttgggtaataaaaggtggcccaaagtgcaatttattctatttattttctagttccaaatttagatatctctaaattgtatttctatgtgcactcttttccttaatagtatttatttttaatctaattttcacatataaatttctttttctacgttgattcttgtctctattattatttttcagtttttaatccaaaatttggatttttccaaaattgtatttctacacgtactattatgtcaatatttactattatttgatccactgcgatgctattattttattatgatatattcttatgtagactcattagtcataatattatttaattttaatccaaatctaaaatatttcaaaattatacttctccatggaatcgcttatctatatatttattttttaattcaaattttagatatgtcaaaattgtattttgacctagactctcttaatattatttttatccaaattttaaatatttctgcatttccacacggactctactcccaatattaattattttttacgatattgtatagaataacggtgatggcaatgatatcgatgaaaataagttgtcgccatgcatccattcttcagatagatcgtcgccatgacctctccaatgaagggggtaagttgctatttcttgttcagtcagttttccttatttgtgttttctaacgtttagctatagtggcagtttgcgtgcaggggcttgggacatctttatgtaggattttggctgggtattgcgctctgcatcatccatgcatcgccgtcctaggtctagaacttataagaaagctgagatgaaatcggctatccctacatgagagggaagtccggttcggggtgtctacaattttccctccacgtcgaaagaacagaacatttggtaattttttatttgttttactcaatttgtcaagttatagtacatagtacttttgagaaacaatacatgtattttcatagatttcagtccattgtggagtcgttccttctaaggatatgaaggtagaatgtttcaaggtttattcacggtctattgcctgtttaatgtgcttgtatgctaatattgtgaatgccgttttttaaccctatttgaattttcttagtacatacaatcctttcttttatggctctaaattttcgaagtacatacaatgtttttttaccttttttaaatctgaattttgaaatgccattttatcaagaacagatatgttattctgacctcacattttttttgtttttagcgccttattttctatcaagaaattgcccaagtgaagattgtgagacctgattttcttagtatgtgatttggagagaaagacttgaaattcactttattgcatgaaaattttataggaaatgtctaaacttggtcttaatcaatacctcattgatggtggtgagcagcgaacatctgccaccacccaccaccacttaaccattaggacctgacacccaagaagaaaaggttgtatcctacaacaacaacaacaacaaaactgggcttgccttttttacttgttagatgagatgttcattatcgtagaagcttgttattggatctaaaaaagaatcattggtattttttttgtttatgttggctaaatttaaatggctgaatcattattattagaagaaagatatacaataattttgaactctgattttataagaattatctgtatgcatatttttttacttgtctccttggctattatgaaaatagatttaatattagaattaccctaaaattaagtactacataggcacagaactctcggtggcacacattggactaaatgagagttatgtgctgttttgccttttaccagtgctaagtgctatcaggctgcctgtgattctttgttatgtgctgtgattctttatactatgtatgcatatatgcacttgttctcctggtgatgctaaccgaataggactaagtataattcaaaccaagtcctattcggcccaaacggaaacggacgggagtttttacaatttttgtggaatcggacagattcgtttttttcgcccaaattttttttaccgcgtcgatcgaatcggatttgatttgtttttttaccgggtcgcatttttttaatcgcgtcacatataattccttttttttttcaatgggacagattcgttttttttcaccttttttttaccgcgtcaacggagttggtttcgtttttctttctcgcgattttttccagctttttttttggatcggacagattcattttttttctcccgttttttttttctacccgatatttttttcgcctagtgtttttgtcctttaacttataagtactacatatgaggaaccacatgttatttgatatgggaattggtggcagatttactgctccgttattttcttcttttaaagtggttgtatattttaaagttataatcgctacaaatggtgtgctctctattctattaggatttagtctaattttttttacctttgaatctttgtatctatatattagtcaccctgttacttggttaaacactttacataatacaacaaatgtgatttgggctttcttgtggaacaatcatgttgttttagtctgtatagaaaacatattcaaattatgttgttagattaaagggttttttttttccattctctcaccttctccctctcttctctccctcccaccctccaaatcctattcagatcttcctgggaactccacctctctctccctctctccctctccccctctcctctccctcacgccctccaaatctcttcctgggaactccacctctctctccctctcccactcttccccctcttctctccctcttttctctcttctctccctcttacaccgtccaaatccgaacagcagcaggaggaggaggtgctgcagtgagtggctggaggagatgctgcagtgagcggctggaggagatgctgcagtgaggaggaggaggagatgctgcagtgaggaggatgaggcggctgcagtgaaagaaaatacaccaggggacagatccaatcacttgaagtgaaagagaatacaccaggggatagatccaagcacttgaagtaagtactgatgaaatgtgtttgccattttttttggaaatgtgtttgtccaacaactaaatgttgaaaaatgtgcagattggtgtaaaatgttgaaaaaagatccaaataaagagtgagtgctttattattttttatttaaatattgtttaaggtgcataatcattccctaatgaatatcttttttttttctctaggacaattctgtcagtttcagttgctggtgcccaaaatggcagggaagctcaatggactgttgataggactgtgtacacttatgctaacttctatgatgattttaaagccaaggtttttgactttggtgataggctcaagatttcgtttatagaattagttcagcgtcaagaaaatgatctattgcttggatcttttgagaaagagttaagattaaaagtacttctagcggatgaacatgatgaggtatccataaacatttgcttaatcccacccatgttcggttgttaagctaaacgattatctaaatttgttaggagttaaatgactatctaaatttgttaggagctagcatggttgttaagttaaatggctctatctaaatttgttaggagctccaaagtgagaggtttgtcaagatgcaggggaagcatcaacctgttggtttaaaaaatgagaaaaataagcaagtattgttccttttttttccatcttttttgtcagtgtttgtttaagttccatgtccttaatgttttgtgtatagctgttttggtaatgtagtgctccaatgtttggcaatcacggaaccatttgtttcaagactctttggacaacaatttggagaagaatgtatgatttaatcacaatttttttagtaaaaaaaatatttgtttaagtactaaacgtgtagtgttttaggcctaggaaactgtcacgcttgcgacctgcgccgtgatctgaagaggataagaaaaactggtgcaccagccttctttcccactatctttaagcatattcgatcattaggtggtgattttgaggatggcttgggacgtcatcgtgactcttctgagttcttattgtaataacttaactcaacttttgttgttttagtttgcatttcagttatttttgtgtgttatagattatttttcttttccaggttattactacaaaagttatttgatggtacacatggatgtttaacagatatgtttggtggaaaattccgtcgcagtaaagtatgtttgttgttttagcaattttgacatgtgtttcactgattttacatatagcaatgttttaatgtatgtgcaggtttgttccaaatgtggaatgctttctaattctgaagaagattttactttgctaatgtttaatatacctcatcgtgaacaagttgttgctgcaacattagaagattgtcttgatcacattgtggaagaaaacgtacatgattcattatcccgttgtgaaaggtaaaatttccgatttgtgaatcttaatcgtgtatcatcatgtttatagtaagttcaagttgtttatagtaagttctttgtttataaaatattttcttttgtgtagctgtatgaatgaccagaagtcaaccagtaagtgtacatttcatgaaactagagatgttgttattgtgttgcaaagatttgaaccacttacacttggggtaagtaaatactgttatttgttgttatataatcacttaattgaccatctaacacctaataaatatgtctttaagggttatcgaaagattggagaactaattaactttcctacggagctggacatttcaccatatatgagtggtgttgtaactgacaagcatatatatgaactgtttggaattatagttcatgaaggcggtgttatagggggtcactatagaagttacgtgaaaacaaactgttggtatgaagtcagtgatagagatgtaagtttcataaccattttgtttaatgtgaatgacaatattgtaaactgattcacatgtcaaaatgacattgcttgtatttgcaggtgaaaagagtaaatgaaaattttgtcctaggggcacaagcatatatcctgttctacaacaggtatcgtagttcattttgacaatatgtgtgcctttatgtgagtttgaaaatctgaacttcattttcaggaaagaagaggccaaatcattcgatgaggttttagcttttgctgctacagctatgtcttcatctgatgccgtgcctacatcaacttcaaaagattacactgaaagaacattatcacctgaagtatcgtctgctgctctgtcatgttggtatgtttaagagctctttatttcgatgcaccttcctatttttaatgaataatgttgactttttaaatgaatgacgttgttaacttttctatactgtttgtcttgttgaaaaaaagttatgtgaatgtcaattactttcttgtgacttgttttatcttcaaataaactattatcttaacttatacttttacatatgtgtgcactaagtttttgaataagatgaaaggtcaaacatcatgcaaaaactcaacggagccataaaaagaaatgtagtagtatactgtgaataggagtatcatgaaatatctaatttattgttgtttctaggattgatgctgcacgggtccttgagcccaagagttactcagaccaggatatcctagaaaaatatatcatttgtatggaccgtgacagttcagatgtatctgagaggataaggaatgccatgcggaattgtaatgagtccagacaggagtatcattttaatctccctacaacggatggacctttttatgatgacaacttggggcagtactgtcttcttcggggagctagatttcgaaccattagtacaagcagtaatgtagaagcgaagagagatagggctgttagaatgcacttccttctttctgaaatcttaaaactcctacagctgaaaaaagtgattgacgttggagctattggctatctggagaaatttaagtttgggaattattccaggagtgctcttttacggcgaattaatgatgcatgtatgctcttggggactaacagattatcccttaatatctcagttatgtcaagaggatctatcattgggccagtgctgttcaaagttggagaagatgtgatgattgatgcaagcttaagggctgtacagattccacacgacattcacttggtggaccatattaagttgaaaaaaccagtcagctttgttcttgttgttgaaaaactatcaatatttaacatgcttgtcaatcttaactttcatgtcacacacaattgcataatcatcactggatgtggaaaacctgatatggcaacaagaggtgcagtttttaaacttaattattgcttgccagtcaaagtttatatccttgctgatcttgacttggatgggctccagatatacttataaacttggcagcaaagtaagggcttttgagaactttgtgttgcatctagagatcttatatggctgggtgctagaccagaagattctctacttttacaagaacccaatgaatttaccagagtgcagcagaaatctcttactgatcttcgtgattctcttcccaatatttcggacagagatcgtctaaacactgtgttggactggaactttacattgaatctgcatgacattcttgattatgagaatattgtagagtatttgactaatcgaatggcagagtttgaagatccttgatggagaaagatctgacctcagctgtttgcccataagtgaagctgaagatgggttgccaaacgtgtgtcgccatttatgccacttgtatattttgcacgattgcatcttgtttactgcaataggcgatactgtgccagtgtgccaccatctggatgatatcccctactgactgtagttctcattctgggtaattctaattctggtttttaagagtatgctgtaacgtaggagcaatacctctttgctgataagagtttaacagatcaggcaatttctgattaacttaaagactacgtgttttgattaaccgtcgcttaaaaagtgtgttagtatgacatttacttttgtttgtctttgaactgtgctgaatcctgggaagtccgatgggtgccacagctgtgatatggtcaaagatgagatctccgggcggtggtttcccggattgtagatttgtagcacagggagtattgctgattgtaatgcaaacttttggtcatatttacgtactttgcttggtgagattgacattacttacatggtgtgtttatttcacgct</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001074590.1 RefSeq:Os11g0545300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 11]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 11]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information