Difference between revisions of "BGIOSGA000117"
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Revision as of 17:51, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA000117 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000117, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0062H02.12 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000117-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000117-PA |
| Length |
13842 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:45680545..45694386 |
| Sequence Coding Region |
45694201..45694386,45686757..45686855,45686606..45686668,45686464..45686526,45685043..45685163 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:45680545..45694386 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAAGCCCCCGGGCATCCGGCGCCGTTCCCCGAGTATACTTGCATTGCATGCAACCAAGACGGACGGCCTGATCGCGAAATCGCGCGAGGTCGTGTGCGGCGGCTGTCGTGCCGGTGTTGTCTCGCGCATTCTCAGCGTGGACGGCTTCTTGACGTGCAGCGGCTCGCAGCGGTTCCTGCGATCGATGCCTCGTGTCCAAACATCAAGGTTGGGTAAAAATCCCATTGAAGTTGATTCTGATGGAGGTGAAGATTTACATGTTGATTATGAAGTTGGTAATGATGTTGATGAAGGTCCTGAACATGGTGAAATTGATGGTTTATTCTCTGTTGTGCTCAGGAAAATGATTGTTCAAGAAGTGAAAAAGAATTTGGTTGACACTTCTTCTGTCAATTTTCACAATCCCATTGATAAGAAATCTAAAGTTCATTCGAAGACTGAGCCCTCATATAGCAGATTCTCAACAAAATATTTCTCAACAGTTCTATCTTCTTTATCTCCTGATCAGCAGCGTACTATTGGTGACTATGATAAAGTCATTGCAATTAATAAAGAATGTGTTCATTATATTTTGGGTCTGCCTATTGGTGGTATGGAGTTCCCAACTGATTGTGATGCTGGAAAGTCCTTTATTCTTTCAAAGTTTGGCAAGAGCGCTCTTCCATCTGTGAGATTCTTTGGTGATAAGTTCATCCGAAAGGAAACTCTCTCTGATGATGAAGTTATTACTTCATTTTTGATTGTTGCAATGGCTTGTTTTCTTTGTCCAAACTCTTCTTTGGTCCCTAGCACCAAGTATTTGACTGTGTTTGAGAATGTTGATGAGCTTCGGTCATATGATTGGTCAAAATTTGTGTACGAATGGATGATGACTTCCATCAAAAAGATCCAAAAGTTTAATACCTTGGGTGGATGCTGGTTTCTCTGGGCAGTGCTTTATCTGGATTATGTTGAGTTTGGTGACAAGAATATTCCTATTGGTTTTCCTAGAATTTCTCACTGGAAGAATAATATGATTACTTTGTATTCTGACCTTGACAAAGTTGATGAAGAAAACTTTGGCCTTAGGCCCATTAAGGATTTCAATGATACAACTTATTTCAAGGTTGTACCCCCTGAAAATAGAATTAATACATTCAGAGATAAATTGGAGTCTGCTATTGGTACTATGTTACCTGCTTTCATTAAGGAGAAAATTTGTTCAATGGTTGTTAGTCATTGTTCTGCCAATCACATTGTTGACAGTGAGTCTTGTGAAGATATTGCTATCAGCATTATGCTCTTGCTATGTGAACATGCTGGTTCTAGAGATGGTGGTGATCCTGATGAAAACTTAATTTTTGATAATATCAACCCTGGGTTTCAGCCTAACTATGCAATTGATGTTGAAAATGAAATCCCTTGTGATGCTCATAACAATGGAAGTACCAATAAATCTGTTGCTAGTAAAGCTAATGAAACAAGTTTTCGCCATACACCTTCTCATGATAAGGAATTGGGGGTAAATGATGATTCTGTTATTGTCTCTAAATCTGTTGTTAGATTTTCCCTTTCACCAAACTTTGAAAAAGATCAAGGCTTACTAACCCCTGAAGTTGGATATGCTAATAACTCCAATTCACGATTTGAACATTCTCGATCTGGTCCTACTGTATCTGCTGTAGCTGCTGTTAGGAATGTTGCAAATAAAATTAAATCAAGATTATCTCAACTCAACAATGATGACAAAAGAGGACCATTGTTCCCTGATTTAATTGATTCTTGTGAAGATGAAGCTGTTGGTTATGCTAAGTCACTTTCATGTCAAAAGGAATATCTTAACCCTCGATATGTCACTTCCTCTTCATCACAGCCTGGTATATCTTTTCACTGTCTTGACAATTCACCTATTCAAGTAATTGGTATAAATAATAATGAAGGAACAAGCAGAACTCATTGTATTCAGAATGTGAAGAAGAGGCGTTTTGATGATGTTACTAATTCTCCTGATGTGGAATATCTTGGTCATTCTATATTTCCTGATTGCTGCAAGGTATTGTGTACCCAAACTAATAATTTGTATAATGCCAAGAACATGTTGAAAAGTAACAACCTGGATTTGAGTTCTACCGGTGGAAAATTACCTCCCCATGGCCCTAGAAGAGTTTTAGTTCCTTCTCGGAAATTTTCAGATCCTTATGTTCTTTCTGTTAGACGCCAATTTCCAGTGTCAGATCAAGAAAAGAGACATTACAATGCAATATGCAAGTTGTCCGAGAGCTCTAAATGGCATAGTTATGATGCTGTAGACATTGATAATGTTAGAGCAAAATTCTCTTCTTTTGGGCAATCTCTCATGAAAGGTGGTATTGTATTGAGCTATGTTATCAATGTGTTTTGCCGTGTTTTGTTCAACAACAATCATCCTTCAAACTCCAAGAGACACTATTTCTTCTCTTCTATTGGTGAACTATTGTTAACTGATCTATCTTGTGCTGATTTGAGCAAGGTGAAAAGATCGTTTCTTGGAGCAGCTAGTGCTAGGAAGTTGCACCTTTCTGACATGCTATTTTTCCCCATCGAACACCTTGAACATTGGTTCCTTTTTGTTGTTGATATAAAGGACAGAATGTTGGTCCTCTTAGATTCTTTACATGAAAAAGGTGATCCCTATTTTGAAGACATTGAATGCTTACTGATCAATAATTTACAGACATTCTGGGATTCTTATGATGGCTCTTCAATTGATTTTACTACTTTGAAGAAAGTTTACCCTTGTGTTCCAAAACAGAGATCTTGCTTTGATTCTGGAATTTTTGTTATGAAGTGTATGGAATTGTGGTCATCAAGGGTTGTTCTACCAAATGAATTTTCTTCAGATGATATTGACAATATTCGGATGCTGTATGCAAATCAGTTATTCTTCCATCCAACGAATAAAATGCTGCAGACTGAAGTTGAAGAAGTTGTGCTCAATTGGTTTAATCCTGATCAATTTGCTGGTGAAGGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKPPGIRRRSPSILALHATKTDGLIAKSREVVCGGCRAGVVSRILSVDGFLTCSGSQRFLRSMPRVQTSRLGKNPIEVDSDGGEDLHVDYEVGNDVDEGPEHGEIDGLFSVVLRKMIVQEVKKNLVDTSSVNFHNPIDKKSKVHSKTEPSYSRFSTKYFSTVLSSLSPDQQRTIGDYDKVIAINKECVHYILGLPIGGMEFPTDCDAGKSFILSKFGKSALPSVRFFGDKFIRKETLSDDEVITSFLIVAMACFLCPNSSLVPSTKYLTVFENVDELRSYDWSKFVYEWMMTSIKKIQKFNTLGGCWFLWAVLYLDYVEFGDKNIPIGFPRISHWKNNMITLYSDLDKVDEENFGLRPIKDFNDTTYFKVVPPENRINTFRDKLESAIGTMLPAFIKEKICSMVVSHCSANHIVDSESCEDIAISIMLLLCEHAGSRDGGDPDENLIFDNINPGFQPNYAIDVENEIPCDAHNNGSTNKSVASKANETSFRHTPSHDKELGVNDDSVIVSKSVVRFSLSPNFEKDQGLLTPEVGYANNSNSRFEHSRSGPTVSAVAAVRNVANKIKSRLSQLNNDDKRGPLFPDLIDSCEDEAVGYAKSLSCQKEYLNPRYVTSSSSQPGISFHCLDNSPIQVIGINNNEGTSRTHCIQNVKKRRFDDVTNSPDVEYLGHSIFPDCCKVLCTQTNNLYNAKNMLKSNNLDLSSTGGKLPPHGPRRVLVPSRKFSDPYVLSVRRQFPVSDQEKRHYNAICKLSESSKWHSYDAVDIDNVRAKFSSFGQSLMKGGIVLSYVINVFCRVLFNNNHPSNSKRHYFFSSIGELLLTDLSCADLSKVKRSFLGAASARKLHLSDMLFFPIEHLEHWFLFVVDIKDRMLVLLDSLHEKGDPYFEDIECLLINNLQTFWDSYDGSSIDFTTLKKVYPCVPKQRSCFDSGIFVMKCMELWSSRVVLPNEFSSDDIDNIRMLYANQLFFHPTNKMLQTEVEEVVLNWFNPDQFAGEG</aaseq> |
| Gene Sequence |
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