Difference between revisions of "BGIOSGA000565"
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Revision as of 18:05, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA000565 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000565, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_04276 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000565-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000565-PA |
| Length |
7542 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:38777946..38785487 |
| Sequence Coding Region |
38785482..38785487,38784556..38784630,38784426..38784484,38783616..38783631,38782921..38783034 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:38777946..38785487 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:38777946..38785487 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATAGTTTCCTTGGCGAAGTGGTGGGGGATTCCTGCTGTCGACGGCATCTCGGCGGTGAAGTGTCGATCTGCAGTTTCGGATTGGATCTGCGTATTTGATTCAGTTTTTGTTGTGGAGATTTGTTTTTGGCTTATAAGAACTGTATTTGATTTGATGCCTCGTGTTGGTAAAAGAAAAAAGGCTGCCAAGGCTGTTGTTATTTCCTATGATGAATCTCATTATGATGATTCTGAATCTTCTGAGAATTTTTTTGATGGTGTTTCTAAGTATACTGATTCTTCTTCTGATGATAACATGGAAAAGCTTTTGTTGAAAATATTCAAGAAACATATTGCTAAAAAAATGAAAAAGAAGTTTATCAGTAGTTCAAGTGATGTTTTTCGGAAGCATAAGGCTAAGAAAGCGAAAGGAGTTGTTAAGAGTGATGGTTCATTTTCAAGGTTTTCTACCAAGTATTTTCGTCGGGTTGTTTCATCGTTGTCTCCACATCAGATGTTTGTTATTGAAAAATATGGTTTCAAGAATCTTCTGTTGTTTGATAGCGGTGGTGTTCCCAAAAAAATTGCTGCTTGGATTTCTAGTAAGGTTGATCTAAAAACATCTGAAATCATCTTGAAAGATAGAGTGATTCCTATTACAGTTGAGTCTTTTAGAGATATCCTTGGACTCCCTTTTGGTGGCTTAAGTTTTGGGAAAGGTTATGATGAAGGAAAGAATTTCATCCTTTCAAAGTTTGGAATCAGTTCTCTGCCTTCTGTTTCGTATCTTGATACTGTTGATTTTGGTGAAAGAAATGTGCCAATTGGTTTTCCTCGAATGTCTGTTTGGAAAGAAGGAATGATAAAGAGAAAACAATCAACTTATAATGCTACTGCTATGGAGTCTGATCATGCTGAAGTCCATAATAGTACTGATCATATTGATGTTGGAGATGTTCACGTGCTTGATGCTAATGCACATAAGCAGTTTGCTTCCGGAGCTGTTCAGAATGAACAACAAACTTCTCCTTGTTGTAATCATGATGTTGACAGCTATGTTCCTTTGGAGAATGACTTACCAGATAATATTCCTGTTGCTGGTAATTTTGATAATGCTGGTGATTTCAATTGTGCTTCTGGTTATCTTCCTTCAATGAATACTGGAAATGCTTCGACTTCTGTTGTTGATGATGGCATTGCTGAGAGCTTTGGTGATGGTCAAGCATTAGTTACACCTGATGTTGGTTATGCTAAAAACTTTAAGAACTCTTCAGATGAAAGATTTAGTGGTTGCCCCAATTCAATGGATCTGAAAATGTGGATCGTACTGTTGGCTGGTATTTCATTTCACTCTGTTGAAGACACTCCAGAAGAGTTAATTCAAATCAAACATAACCGTGAGGGAACTGCTAGGACTCCTAACAGTGGAATCATCAAAAAGAGGAACTCTCCTGATTTAATCATTGTTGGTGAATCTAAATTTCATGATCGTTGCAATAATATGACTGCTCAAAGTGATCTGATTTATAATGCAAGCATTCTGCCTACTAGTACTGCTCATCATGCGAGTTCGTCAGGTGGAAAAATTCCCCCACATGGCCCTAGAAGAGTTCTTGCTCCTGCAAAGTACACTAGTGATCCATTTGTTCAATTGCATCGCCATTTTCCAATTTCTGATGTTGAAAATCGATACTACATTGTTGTTTGTCGTCTTGCAGATAGTTCGAAATGGCACAGTTATGATGCAGTAAATATCGACAATGTCAAAGCTAATTTTTACACTTTTGGACATTCTTTGAAGAAAAGTGGTCATGAACAACTAGTGGTTGACCCAAGTTTTGCTGATGCTGAAAAAGTTCAAAAATCTTTTGAAGGTGCTGCAAAGGCTAGGAGATTGGATTTGTGTGATATGCTTTTTTTCCCTATTCACTACCAACAGCATTGGTTCTTATTCATTGTTGATGTCAAAGATAGAATGTTTGTTTTTCTAGACTCTAAACATGAGGAACATTCTGAATTTTATGAAAACCTGAAGACTTTTGTAGTTGACAATTTTCAGAACTTGTGGAATAAGTTTGTTGGTAGTTCTTTGGATTTTAGTGTTTTCAAGACTGTTTTTCCTCCTGTCCCTCGTCAAGATTATGAGTCTGATTCTGGAGTATTTGTTATGAAGTTTATGGAAATTTGGTCTCCAAGGATTCTTCTTCCTAATGAGTTCTCAAAGCAAAACATCAACAATATCCGAGTGAAATATGTTAACCAGATCTTTTTTCATGCAAAGAACAAAATGCTTCATACTGAAATTGAAGATGTTGTTCTTAATTGGTTTAATCCTGAGAAATTTGCTCGTCAATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIVSLAKWWGIPAVDGISAVKCRSAVSDWICVFDSVFVVEICFWLIRTVFDLMPRVGKRKKAAKAVVISYDESHYDDSESSENFFDGVSKYTDSSSDDNMEKLLLKIFKKHIAKKMKKKFISSSSDVFRKHKAKKAKGVVKSDGSFSRFSTKYFRRVVSSLSPHQMFVIEKYGFKNLLLFDSGGVPKKIAAWISSKVDLKTSEIILKDRVIPITVESFRDILGLPFGGLSFGKGYDEGKNFILSKFGISSLPSVSYLDTVDFGERNVPIGFPRMSVWKEGMIKRKQSTYNATAMESDHAEVHNSTDHIDVGDVHVLDANAHKQFASGAVQNEQQTSPCCNHDVDSYVPLENDLPDNIPVAGNFDNAGDFNCASGYLPSMNTGNASTSVVDDGIAESFGDGQALVTPDVGYAKNFKNSSDERFSGCPNSMDLKMWIVLLAGISFHSVEDTPEELIQIKHNREGTARTPNSGIIKKRNSPDLIIVGESKFHDRCNNMTAQSDLIYNASILPTSTAHHASSSGGKIPPHGPRRVLAPAKYTSDPFVQLHRHFPISDVENRYYIVVCRLADSSKWHSYDAVNIDNVKANFYTFGHSLKKSGHEQLVVDPSFADAEKVQKSFEGAAKARRLDLCDMLFFPIHYQQHWFLFIVDVKDRMFVFLDSKHEEHSEFYENLKTFVVDNFQNLWNKFVGSSLDFSVFKTVFPPVPRQDYESDSGVFVMKFMEIWSPRILLPNEFSKQNINNIRVKYVNQIFFHAKNKMLHTEIEDVVLNWFNPEKFARQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..6#858..932#1004..1062#1857..1872#2454..2567#2674..2736#2814..2876#2976..3338#3701..3792#4249..4271#4376..4452#4531..4603#4704..4759#4853..4921#5184..5232#5327..5398#5538..5581#5798..5908#6017..6309#6390..6465#6655..6753#6840..6971#7057..7157#7241..7430#7522..7542#ATGATAGTACATAGCCCAAACTATAAGCCATGCCGTATTACTTAAGGCAATGTTAAACTCAAGTCCGAGTCTGTTTACATAATTAATACGGGATTGCTATCTGTCTTGTGACAGATTTTGGAGTCCCATATCATGCAGATTTGTGAACGTTGGATTGTGTCAAGATTCGTGCCTTTGTCTAATGTGGATAGACTTTTTTGTTGTTTCGTGGGCTAGTGCAGTTTGAGTTGGATTCTTGTTTGGGCTGGATCCCGTTTGGGTTTTGGTTTGGGCTTTATGTGGGTCCCACTATACTGTTCATTTTTACTGTAGATTTCGAATTGCGCGCCTCCGACACAGAGAGAAAATTTCGGACAGAGGAGAGAGAGAGGCAAAAAACGCAACTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCGTTGACTCCACCTCGGCGACGGGTTGGCGATTCCGACCGTCGTCGGCGTTTCGCCGGTGAAGTTTGGTTTCCTTGCTCCGGTGAGTTTGTGCTTTGGTGTGTGCGTTCCCCTGCTTGTGCTTTCGCTTTTTGCTCGGTTGAATCGTCTTCTTTGGTTTTTGTTTGAGTTATGTTTGATTTCTCCTTTGTATTTTGTGTAGGTTTCCTTGGCGAAGTGGTGGGGGATTCCTGCTGTCGACGGCATCTCGGCGGTGAAGTGTCGATCTGCACTTTCAGTGAGGTTTTTGTGCTTCTGCTTTGTTGTTTCAAGTTTTGGTTTAATCCTCTCCTTTGTTTTGGTGTGCAGGATTGGATCTGCTTTAGTTTGCTTTTTGCTTGGTTGAATCTTCTCCTTTGGTTTTTGTTTGAGTTATGTTTGATTTTTCCTTTGTATTTTGTGTAGGTTTCCTTGGCGAAGTGGTGGGGGATTCCTGCTGTCGACGGCATCTCGGCGGTGAAGTGTCGATCTGCAGTTTCGGTAAGGCTTTTTTGCTTCTGCTTTGTTGTTTCAAGTTTTGGTTTAATCCTCTCCTTTGTTTTGGTGTGCAGGATTGGATCTGCGTATTTGATTCAGTTTTTGTTGTGGAGATTTGTTTTTGGCTTATAAGGTGAGTTGTTTTCACTGATTTGAATTTTATTTTGGTGGAGATTTGTGTTCTATTCATGTGGATTTGATATGTTGTTCGTAGATTTGGTTAGTTATGGGGAGTTCCTATACATCATTTGATTTTGACCTGGTGACAAATGAAGCAGTGATGATTTGTTTGGATTATGTGATGAGTATTTTTAGTAGTGATCTTAGTTTTTGTTCTCTGAAATATTTCAGTCTAGTAAGGGCCTTGTGCTTCAAATTATAGTGTATAAGCAGGTTGATGCTCTGATCTAGCTTTGGGAATCTATGAGAGCAGAAAGCTATGCTATGAAGTAACTGAATATTTTTGGTTATTGCCCTGTTACAGATATGTTTATCATGTTAAATTATTTTATTGTGGTATAGTTCTGTTGTTTTGTAAATTTTGGTATATGTTATTTTTAGCATTTGAAACTTGCAGCATGTGCAGAAGTTTGCATGTTTGTGTGGCTGAGTGTTGATATACAGATTTGAAGGATGCTTGAGTGTGCCCTGCTTTTGTGATATTTTGTTTGACTGTGTAGGTCTATCATTTAAAAAAAATCTGATTGTATTTTAGCTATTTGTAGTTTTAAGAATTTTGGTAGTTTTATTAAGTAGGTACCATACTTGTTTTTAAATGGACCTTTTGTCAAGGGTGTGGGGTGGTATTTGCAGTTGCTGTTTGATTTGCGGTAGGTGTCCTGTGAGTTTAATTTGTTCCTTTAGCAAAAAGTATGCCTACACATGAAGCATTATGCATTATTAATGTTTTTTATATATATTCTGTAGAACTGTATTTGATTTGGTGGGAAGTATTTATTTATAGTTCTGAATGTTCACTGATGTAATATGATTGCATTTTAGTGATGTAATAGTTTAAACCACTTGATACGCAGAATTTTGTAGTCATTTATTGTTTTTTTTTGTTTTTGCCAGATGATGATACATATGATTTGAATTAAGCAAATCAAAGTTCTGCATGTCATTAGGCAAGAAAATTATTCATTCTAAGTGAAAAGAATGATTAAATTTCTTGTTTGATGATGTGCAGAGCTTTGAGGTGTTTTTTAAATATCTGATGGCATTTTATTTTTTATTGTATATTTCTTGGAAGTATGAATGATAATTAATATCTTAATCTGATTCAGATGGTTAATTTTGTTTAATGCAAAAAAGCACACAAAGACCTTTGGACTTGGTGAATCATTTTTTTTATTTGATGCAAATATAGTGTTTTTGATATTTTGTATGTCAAGCATGATGCAAGTGTTCTGTGTTGATATTATGTACAACTATAAATGAATTGGTTGGTATTATTATTTATAGTGTTGAATGTTTAGTGATGTGGATTCAATTTATCTTTTGTTTTTGTTTTATAATATGTAGATGCCTCGTGTTGGTAAAAGAAAAAAGGCTGCCAAGGCTGTTGTTATTTCCTATGATGAATCTCATTATGATGATTCTGAATCTTCTGAGAATTTTTTTGATGGTGTTTCTAAGGTTTTGTGATAAATGCTCTTTTTCATTATGTGCTTTTTTATTTTTTGTATGTTCCATTTCATTTATGTATTTATGCCACATATTTATTTTTCTGCTTTGTTAACAGTATACTGATTCTTCTTCTGATGATAACATGGAAAAGCTTTTGTTGAAAATATTCAAGAAACATGTAATTTTTTTGTGATTTAATTATTATTATCTTTTCATTATGTTTATCACTCAAATATTTTTTAATTTTTCTTGTAGATTGCTAAAAAAATGAAAAAGAAGTTTATCAGTAGTTCAAGTGATGTTTTTCGGAAGCATAAGGTACCTAAATTTTAGTTTATTTTTTCCTTTTGTGTTTTAATTTTAGGGTTATTAATAAGTTTTTGAAATTAATGTACCTTGTTTTTAAAATTTTGATAGGCTAAGAAAGCGAAAGGAGTTGTTAAGAGTGATGGTTCATTTTCAAGGTTTTCTACCAAGTATTTTCGTCGGGTTGTTTCATCGTTGTCTCCACATCAGATGTTTGTTATTGAAAAATATGGTTTCAAGAATCTTCTGTTGTTTGATAGCGGTGGTGTTCCCAAAAAAATTGCTGCTTGGATTTCTAGTAAGGTTGATCTAAAAACATCTGAAATCATCTTGAAAGATAGAGTGATTCCTATTACAGTTGAGTCTTTTAGAGATATCCTTGGACTCCCTTTTGGTGGCTTAAGTTTTGGGAAAGGTTATGATGAAGGAAAGAATTTCATCCTTTCAAAGTTTGGAATCAGTTCTCTGCCTTCTGTTAGATATTTTGGGGATTTGCTGATTGAGCAGAAATAGTTGTCTGATGATGAAGTGATAATATCATTTTTGATTGTTGCGTTGGCTTGTTTCATCTGCCCAAACTCTTCATTGTATCCTAGTGTGAAGTACTTGACAATTTTTGAAGATTTGAATATTTTGTCATCTTATGATTGGTGCAAGTTTGTTTATGACTGGTGCATGAATCGCATCAAGAAATTCCAAAAGTCAAAGAACTTGGGTGGTTGTTTGTACTATTGGGCTGTAAGTTTTCTTTGTATTCTTTTTATTCATTTTTGTTACTTTTAATTTTTTGATGTTATCTTGTATAATAATCTTTGAAATTTTATTTTTTTTATTAGGTTTCGTATCTTGATACTGTTGATTTTGGTGAAAGAAATGTGCCAATTGGTTTTCCTCGAATGTCTGTTTGGAAAGAAGGAATGATAAAGAGGTATTCTGACTTTGAGAAGATAGATGATGATACTTTTGGACTGAGGCCACCAAGAGTTATTTGTTCTACATCTAACTCACATGTATTTTGTTTTTATTTTTGTATTAGGTATTTATTATTTTCTGTGTTTAATGTTTGCAATTTATCTGTTTAGTAGTTAAATCAACTTATATCACCTTCATGTTTGATTTTTAGCCTGCAGCTGCACTTGATGAAGCATTTTTAGCCTGCAGCTGCACTTGGAGAAGCACTACCTAATTATGCAGCTGCTCAATTATGTTATTGGAGAAGCATTACCTAATTATCTCAAGGACATGATTTGTACGATGCTAAAAGATCATTGTCAGTCTATTCAAGTTCACAATAGCCAATCTTTGCAAGATTTTGTGATTAGTTTGCTAAAGTTGTTACATGACGAACGTGTTGGTAGTCCTATCCAATCTGATGAAAATGCAGAAAACAATCAACTTATAATGCTAGTAAGTTTTATTTGTACTTGTATTTTCTGTTTTGCCTTTTTTTTGCACTTTATTTGTTCTTCTTAATAAAAATGTTCTTTAATTCAATACCTTGCTCTATATAGCTGCTATGGAGTCTGATCATGCTGAAGTCCATAATAGTACTGATCATATTGATGTTGGAGATGTTCACGTGCTTGATGTAAGAATGCAGATTTGTCATTGTTTGTATTTGTATTTTATCATTAGTAAAATTTAATGCTATTTTATTTTCTATTAGGCTAATGCACATAAGCAGTTTGCTTCCGGAGCTGTTCAGAATGAACAACAAACTTCTCCTTGTTGTAATCATGGTAAGTATTATTTTTAAATTTGATAATTTTATGTTTTATTTATTTTATCTGAGTATGTTTTATTTTTATTAACCTTTGTGCTAACAAAACAAATTTTCAGATGTTGACAGCTATGT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