Difference between revisions of "BGIOSGA001102"
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Revision as of 18:08, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001102 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001102, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0006H05.18-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001102-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001102-PA |
| Length |
11772 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:29666351..29678122 |
| Sequence Coding Region |
29677991..29678122,29677752..29677836,29676791..29676830,29676454..29676702,29675271..29675370 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:29666351..29678122 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:29666351..29678122 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTCCGCCTCAGGGCGTTCCGGCCGACGAGCGACAAGGTGGTGAAGATCCAGCTCCACCCCACGCACCCCTGGCTCGTCACCGCCGACGCCAACGACCGCGTCTCCGTCTGGGACTGGGAGCACCGCCAGGTGATCTACGAGCTGAAGGCGGGTGGCGTGGACGAGCGGCGGTTGGTTGGAGTTAAGCTTGAGAAGCTCGCCGAGGGAGACACTGATTCAAAAGGAAAGCCCACTGAAGCCATCCGAGGTGGAAGTGTAAAGCAGGTTAGCTTTTATGATGATGATGTTCGCTTTTGGCAACATTGGCGCAATTGCTCTGCTGCTGCTGAGGCTCCAACTGCGGTCAATCAACAATCGTCCGCTTTCAGTGCACCTGCACCATCTACAAGAGGAAGACATTTTGTTGTGATTTGTTGTGAGAACAAAGTAATATTTTTAGATTTGGTGACTATGCGTGGCCGTGATGTTCCTAAGCAAGAGCTTGACAACAAGTCGCTTCTATGTATGGAATTCCTCTCCAGGTCATCTTCTAGTGACGCTCCTCTGGTTGCATTTGGATCTTCTGATGGAGTGATAAGAGTTCTTTCAATGCTGACATGGAAGCTTGTGCGAAGGTATACAGGTGGACACAAAGGAGCAATATCTTGCTTAATGACATTCATGTCTGCAGCAGGCGAGGTACATCTAGTTTCTGGTGGTAGTGATGGTCTACTTATATTATGGAGCGCTGACCATATCCATGACTCTCGTGAACTTGTCCCTAAGATTAGTTTGAAGGCTCATGATGGAGGTGTAGTTGCAGTTGAACTTTCACGGGTAATGGGAAGTGCTCCACAACTCATTACAATAGGGGCTGACAAAACTTTAGCCATATGGGATACTGTTACATTTAAGGAAATAAGACGCATTAAACCAGTACCTAAACTTGCTTGCCATAGTGTTGCATCGTGGTGTCATCCTCGTGCACCAAACCTTGATATTCTGACTTGTGTCAAGGACTCCCATATATGGGCCATAGAACATCCAACCTATTCTGCTTTAACAAGACCACTCTGTGAACTGTCCTCTCTTGTTCCTCCACAAGTCCTTACACAACATAAGAAATTGAGGGTTTACTGCATGGTGGCACACCCCTTACAACCACATCTTGTTGCTACTGGAACTAATATTGGTATTATTTTAAGCGAGTTCGATCCAAGAGCACTTCCAGCTGTTGCTCCTCTACCAACACCAGCAGAAAGCAAGGAACACTCTGCTGTTTACATTGTTGAAAGAGAACTTAAGCTGCTGAATTTCCAATTGTCAAACACAGCAAATCCCTCCCTTGGAAATGCTGGTGTCACATCTGAAACGGGAAGGTCAAGGAATGACCCTTTAGAACAGCTGGTAGTAAAGCAGACCAAGAAGCATATCAGCACGCCAGCTCCTCATGATTCATATTCGATTCTTTCAGTTAGCAGCTCTGGAAAGTATGTTGCAGTTATATGGCCAGACATCCCTTCATTTGCTGTATACAAAGCAAGTGATTGGTCAGTCGTTGATTCTGGTACAGGGAAACTCTTTGCTTGGGACACCTGTCGTGACAGATATGCTTTGGTAGAGAGTGCCTTGCCTCCAAGGATGCCACTTATTGTGAAGGGCGGTTCTTCTAAAAAAGCAAAGGAGGCAGCTGCCGTTGCAGCTCAAGCTGCAGCTGCAGCAGCTAGTGCTGCTTCTGCAGCCACAGTACAAGTGCGCATCTTATTAGATGATGGAACAGCACATGTTTTGCAGCGATCCATTGATGGCCGCAGTGAACCGGTAATTGGATTGCATGGTGGTGCTTTGCTTGGTGTCACATACCGTACATCTCGTAGAATCAGTCCTGTGACAGCAACAGCTATATCAACTGTTCAATCTATGCCCTTATCAGGTTTTGGAGGAAGTGGATCATCATTTGCTTCAGATGATCCATTTTCCTCCAAAGAAGGGCCTCCTCAAAATTTCCAGTTATACAGCTGGGAGACCTACCAACCTGTTAGCGGCCTACTTGCACAGCCTGAGTGGACCGTGTGGGACCAAACCGTTGAGTATTGTGCATTCGCTTATCAGCAGTATATTGTAATTTCTTCCTTGCGGCCCCAATTTAGATATCTTGGAGATGTTTCGATTCCCTTCGCTACAGGTGCCGTTTGGCATCGTAGGCAGTTGTTTGTGGCTACGCCCACCACCATCGAGTGTGTCTTTGTTGATGCGGGTGTGGCTGCCATTGACATTGAAACAAAAAAGAGGAAAGAAGAAATGAAAGCAAGAGAAGCTCAGAGTCGGGCGGCTGCAGAGCATGGAGATTTGGCTCTTATTACAGTTGAAGGCCCCAAGACTACCACTTCTGAGAAAATAGCTTTAAGACCTCCAATGTTGCAGGTTGTTCGGTTAGCCTCCTTTCAGTATGCTCCATCTATACCCCCATTTATAGTGCCAAAGCAATCAAAGTTAGATGGAGAAGATTCAGTGTTTCAGAAAGAATTGGATGATAGAAGATATGCTGAAGTTGCTGTTGCTGGAGGAGGGGTATCTGTTGCAGTAACCCGCTTCCCTCCTGAGCAGAAAAGACCTATTGGACCCCTTGTTGTGGTTGGTGTCAGAGATGGAGTTCTATGGCTCGTTGACAGGTATATGTGTGCACATGCCTTATCTCTAAGCCATCCTGGTATCAGATGTCGGTGCCTTGCAGCATATGGAGATCCAGTTAGTGCCGTGAAATGGGCCACTAGACTTGGTCGGGAGCATCATGATGACCTGGCTCAGTTTATGCTGGGAATGGGCTATGCTACTGAAGCACTTCATTTACCTGGAATATCAAAGAGGTTAGAGTTTGATCTCGCAATGCAAAGTAATGACTTGAAAAGAGCACTTGCATGCTTGTTGACAATGAGCAACAGCCGAGATGTGGGACAAGAAACTACTGCTACTGATGTTACACAGATTCTTAATTTAGCAGTAGCTAAGCAAGCTAAGCAAGAAAGTCTGGCAGATGCCGTGCAAGGGATAGTGAAGTTTGTCAAGGAATTTTTTGACCTTATCGATGCTGCAGATGCCACTGGACAGGCTGACATTGCTCGTGAAGTTCTAAAGAGATTGGCTGCTGCAGCTTCTGTAAAGGGTGCTCTGCATGGGCAAATGCTACGAGGTCTGGCACTCCGTCTTGCGAACCATGGAGAGCTTACCAGGCTGTCGGGTTTGGTAACTAATTTGATCATAGCTGGCCATGGGCGCGAAGCAGCATTTGCAGCTGCAGTTCTTGGAGATAACGCCCTCATGGAAAAAGCATGGCAAGACACAGGAATGTTGGCCGAGGCTGTTTTGCATTCTCAAGCCCATGGTCGTCCATCATTAAGGAACTTAGTCATAGCATGGAACAAGATGCTACAGAAGGAGCTGGATCACACACCCACTGTAAAAACTGATGCTGCCGCAGCGTTTTTGGCCTCTCTTGAGGATCCGAAGCTTACCAGTTTGGGAGAAACAGAGAAAAAGCCACCCATTGAAATACTTCCTCCTGGGATGCCGCCTCTGTCTGCACCTCCCATTGTAATTAAGAAGTCTGGTGCGAAACCTGGCCTGCCAAATGCAGCGCAGGCCCCGACCGCAGCTATTGGTGCTCCCATGGCTCAAGACACTCCTATGGTTCAAGGCACCCCAATGGTGCAGGGCACTCCCATGGCTGAAGGCACTACTGGAGCTCAGGCAGCTCCTACTGCTCAAGGTGCTCCAGCTCAAACACAGAACCCGGAAGAAGCAAAACCATCAGAGAGTACAGCAGCTCCTGACAATGCAGAGAAAACAGCAACGCCTGACAATGCCGAACGGATGGCAGCCCCTGGCAACGTGGAAGCTACTACAGAACCAGCAGCAGCCCCTGGTAATGTGGAAGGTACAGCAGCGGCGGCAACGGACGCAACAAGTAATGCTGATGCTACTTCTGGTGCTCCAGCTCCGGCAGCTGATTCTAATGGCGCCGATCCACCTGCTGTTACTCCTGGTCAAGTTACAAATGGTGCACCTTCTACCGAGACACCGGAGACAGCAGATAAGCCATCTTCAACTGAGCCATCACCAGCACCACCTATACCAAATGTGCCTGCTGTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLRLRAFRPTSDKVVKIQLHPTHPWLVTADANDRVSVWDWEHRQVIYELKAGGVDERRLVGVKLEKLAEGDTDSKGKPTEAIRGGSVKQVSFYDDDVRFWQHWRNCSAAAEAPTAVNQQSSAFSAPAPSTRGRHFVVICCENKVIFLDLVTMRGRDVPKQELDNKSLLCMEFLSRSSSSDAPLVAFGSSDGVIRVLSMLTWKLVRRYTGGHKGAISCLMTFMSAAGEVHLVSGGSDGLLILWSADHIHDSRELVPKISLKAHDGGVVAVELSRVMGSAPQLITIGADKTLAIWDTVTFKEIRRIKPVPKLACHSVASWCHPRAPNLDILTCVKDSHIWAIEHPTYSALTRPLCELSSLVPPQVLTQHKKLRVYCMVAHPLQPHLVATGTNIGIILSEFDPRALPAVAPLPTPAESKEHSAVYIVERELKLLNFQLSNTANPSLGNAGVTSETGRSRNDPLEQLVVKQTKKHISTPAPHDSYSILSVSSSGKYVAVIWPDIPSFAVYKASDWSVVDSGTGKLFAWDTCRDRYALVESALPPRMPLIVKGGSSKKAKEAAAVAAQAAAAAASAASAATVQVRILLDDGTAHVLQRSIDGRSEPVIGLHGGALLGVTYRTSRRISPVTATAISTVQSMPLSGFGGSGSSFASDDPFSSKEGPPQNFQLYSWETYQPVSGLLAQPEWTVWDQTVEYCAFAYQQYIVISSLRPQFRYLGDVSIPFATGAVWHRRQLFVATPTTIECVFVDAGVAAIDIETKKRKEEMKAREAQSRAAAEHGDLALITVEGPKTTTSEKIALRPPMLQVVRLASFQYAPSIPPFIVPKQSKLDGEDSVFQKELDDRRYAEVAVAGGGVSVAVTRFPPEQKRPIGPLVVVGVRDGVLWLVDRYMCAHALSLSHPGIRCRCLAAYGDPVSAVKWATRLGREHHDDLAQFMLGMGYATEALHLPGISKRLEFDLAMQSNDLKRALACLLTMSNSRDVGQETTATDVTQILNLAVAKQAKQESLADAVQGIVKFVKEFFDLIDAADATGQADIAREVLKRLAAAASVKGALHGQMLRGLALRLANHGELTRLSGLVTNLIIAGHGREAAFAAAVLGDNALMEKAWQDTGMLAEAVLHSQAHGRPSLRNLVIAWNKMLQKELDHTPTVKTDAAAAFLASLEDPKLTSLGETEKKPPIEILPPGMPPLSAPPIVIKKSGAKPGLPNAAQAPTAAIGAPMAQDTPMVQGTPMVQGTPMAEGTTGAQAAPTAQGAPAQTQNPEEAKPSESTAAPDNAEKTATPDNAERMAAPGNVEATTEPAAAPGNVEGTAAAATDATSNADATSGAPAPAADSNGADPPAVTPGQVTNGAPSTETPETADKPSSTEPSPAPPIPNVPAV</aaseq> |
| Gene Sequence |
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