Difference between revisions of "BGIOSGA001202"
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Revision as of 18:09, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001202 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001202, complete gene. |
| LocusTag |
P0686E09.27-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001202-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001202-PA |
| Length |
11050 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:27580529..27591578 |
| Sequence Coding Region |
27591528..27591578,27590473..27590551,27590292..27590374,27590052..27590201,27589539..27589654 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:27580529..27591578 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:27580529..27591578 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCTCCTCGCTCCCGGCCAAGGAGGCCAACCTCTTCAAAGTCATCGTCAAATCCTATGAGACAAAGCAATATAAGAAGGGCCTGAAGGCAGCAGATTCCATTTTAAAGAAGTTCCCTGAGCATGGCGAAACCTTATCAATGAAAGGTTTGACGCTAAATTGCATGGATCGGAAATCTGAAGCATATGAACTTGTTCGCCGTGGATTGAAGAATGATCTGAAGAGTCATGTGTGCTGGCATGTCTATGGCTTGCTTTATCGATCAGACAGAGAATACAGAGAAGCCATAAAATGTTACAGAAATGCTCTGAGGATTGATCCAGATAACATAGAAATTCTACGTGACCTGTCACTTCTCCAGGCACAAATGAGGGACTTGTCTGGCTTTGTTGAGACTAGGCAACAACTTTTAACACTGAAGCCAAATCACCGCATGAACTGGATTGGTTTTGCTGTAGCTCACCATTTAAGTTCCAATTCTTCCAAGGCAATAGAAGTATTGGAGGCATATGAGGGGACACTGGAAGATGATTATCCCCCAGAGAATGAGCGATATGAACACAGTGAAATGCTTCTGTATAAGATTTCATTGTTCGAGGAATGTGGGATGCTGGACAGAGCTCTTGAGGAGATGCAGAAGAAGGAGAGCAAAATTGTTGACAAGCTATCGTTCAAAGAACAAATGGCCTGCATTTTGTTGAAACTTGGCCGCTTTGAGGAGGCTGAGAAAACATATAGGTCCCTGCTTTTCATGAATCCTGATAACTACAAGTATTTCATAGCTGTTCAAAAGTGCCTTGGTCTATACTCAGAGAATGGTCAGTATTCCACTGATGATGTTGACCGATTATGCGAATTGTATAGCTCACTTAAAGAAGAATATGGTTGGTCATCTGCTGTTAAGCGCATACCCCTTGATTTCCTGGAAGGAGAGAAATTTCAGGAGGCAGCAGATAATTATGTCAGACCCCTATTAACCAAGGGAGTACCATCACTATTTTCTGATCTTAGCCCATTGTACGAGCAACCTGGCAAGGCAAACATATTGGAGGAATTGTTTCTTAAGCTAGAACGTTCAATTAGGACTTCAGGATGCTTCCCAGGAAGTTCGCATACGGAACCTCCATCCACACTCCTGTGGACTCTGTTTTTGATCTCTCAGCACTATGACAGAAGAGGCCAGTATGATATTGCTCTAGATAAAATTGATGAGGCTATTTCACACACGCCAACTGTAATTGATTTATACTCAATAAAGGGGAAGATATTGCAGCATGCTGGCAATTTCTCAGCGGCTGCAGCATTGGCGGATGAAGCTAGGTCAATGGATCTCGCTGATCGTTATTTAAACAGCGAGTGTGTTATGCAGATGCTCCAAGCTGACCAGGTTGGTCTAGCTGAAAAGACAGCTGTTTTGTTTACTAAGGACGGCGATCAGCACAATAATCTCCATGACATGCAGTGCATGTGGTATGAGCTTGCTTCTGGTGAGAGTTACTATCGTCAAGGTGATCTCGGCAGGGCTCTCAAAAATTTCTTGGCTGTTGAGAAGCATTATGCTGACATGACTGAAGATCAATTTGACTTCCATTCGTATTGCTTACGGAAAATGACACTAAGGGCATATGTTTCTATGCTGAAGTTTCAAGATCGCTTGCATGCTCATGAATATTTCCACAAGGCTGCAGCAGGAGCTATCAGGTGTTATATGAAATTGCATGATTCACCATCAAAATCATCCACTGAGGAGAATGATGAAATGTCGAAATTGCCACCTGCTCAGAGGAAGAAACTGAGACAAAAACAGAAAAAGGCAGAAGCTCGTGCCAAAAGGGAGGCTGAAGAGAAACAGGAGGATGAGACAACTTCATCTCACACTTCAAAATCTGGGAAGAAACAAAACGCAAGACCAGTTGATTTAGATCCACATGGTGAAAAGTTAGTGCAGATTGAAAACCCACTTGCTGAAGGAACAAAGTATTTGAAGCTTCTGCAGAATAACTCATCAGACTCGTTGGAAACTCATACACTTTCATTTGAACTCAACATGAGAAAACAAAAGATTTTACTTGCTTTTCAGGCAGTCAAGCAGCTCATTAAGTTGGATGAAAATAGCCCTGACAGTCATCGTTGTTTGATAAGGTTTTTCCACAAGATAAACAATCTTCCCTCTCCAGGGACAGATTCTGAAAAGCTAATTTGGAATGTTTTGGAAGCTGAGCGTCCAGATTTAAGGCAGTTGCATGGGAAGTCTCTTGTTGAAGTAAATAGAAGTTTCCTTGAAAAGCACAGTGCTTCTTTGACGCACAGAGCAGCAGCAGCTGAAATGATGTACCTCTTGGAACCAGATAAGAAGCTTGAGGCAATCAAATTAATTGAAGATTCAGTAAACAGCACAGCATCAGGAAACAGTGTGCTTGGTCCTGTGAATGAATGGAAAATTCAAGACTGTATTGATGTTCACAAATTGCTGGAGACAATCTTTGGTGACCAGGATGTGGCAAACAGTTGGAAGGCACGATGCGCTGAATATTTCCCATACTCAACCTACTTTGAAGGCATTAAGAGTGCTAGTGCTGCCTATTGTTCTGTTGCCAATAGTCTTGAGGATTCATCAGAAAATGGAATTGTAGCAAATGCGCAAATGAAATCAGCAGACGGAGAAACATGCACTTTGAATGGAACTGTGCATATTGTGGATGAACTGAGCAATCTAAGCATTAGGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSSLPAKEANLFKVIVKSYETKQYKKGLKAADSILKKFPEHGETLSMKGLTLNCMDRKSEAYELVRRGLKNDLKSHVCWHVYGLLYRSDREYREAIKCYRNALRIDPDNIEILRDLSLLQAQMRDLSGFVETRQQLLTLKPNHRMNWIGFAVAHHLSSNSSKAIEVLEAYEGTLEDDYPPENERYEHSEMLLYKISLFEECGMLDRALEEMQKKESKIVDKLSFKEQMACILLKLGRFEEAEKTYRSLLFMNPDNYKYFIAVQKCLGLYSENGQYSTDDVDRLCELYSSLKEEYGWSSAVKRIPLDFLEGEKFQEAADNYVRPLLTKGVPSLFSDLSPLYEQPGKANILEELFLKLERSIRTSGCFPGSSHTEPPSTLLWTLFLISQHYDRRGQYDIALDKIDEAISHTPTVIDLYSIKGKILQHAGNFSAAAALADEARSMDLADRYLNSECVMQMLQADQVGLAEKTAVLFTKDGDQHNNLHDMQCMWYELASGESYYRQGDLGRALKNFLAVEKHYADMTEDQFDFHSYCLRKMTLRAYVSMLKFQDRLHAHEYFHKAAAGAIRCYMKLHDSPSKSSTEENDEMSKLPPAQRKKLRQKQKKAEARAKREAEEKQEDETTSSHTSKSGKKQNARPVDLDPHGEKLVQIENPLAEGTKYLKLLQNNSSDSLETHTLSFELNMRKQKILLAFQAVKQLIKLDENSPDSHRCLIRFFHKINNLPSPGTDSEKLIWNVLEAERPDLRQLHGKSLVEVNRSFLEKHSASLTHRAAAAEMMYLLEPDKKLEAIKLIEDSVNSTASGNSVLGPVNEWKIQDCIDVHKLLETIFGDQDVANSWKARCAEYFPYSTYFEGIKSASAAYCSVANSLEDSSENGIVANAQMKSADGETCTLNGTVHIVDELSNLSIR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..51#1028..1106#1205..1287#1378..1527#1925..2040#2479..2584#3046..3117#3201..3316#4580..4712#4929..5006#5172..5225#5311..5381#5924..5978#6098..6193#6560..6688#6854..6936#7019..7249#7338..7470#7542..7655#7802..7933#8814..8870#9649..9746#9814..9872#9965..10076#10159..10259#10830..11050#ATGGGCTCCTCGCTCCCGGCCAAGGAGGCCAACCTCTTCAAAGTCATCGTCGTAAGCATCCCCCGCCGCCGCTCCTCCTCCTCCTCCTTTTCCTCCCCTCGCGCCTCTCCTCTCCTCTCGTCTCGAATCGATCCGTTCCCCTCCCCCGTTGCGGCGCTCCGCCCGATTCGGCTTTCTGGACATGGGCGGGCTGGCGATTGGGAGGTGCGCCGCCCTGCGGTGGGGGGTTCCACTGCCTGGTGACTCCCCCAGGATCGGTGTGGTTTTGTGCTGTCACGACTGTGAAGCTTTGCTTTGGTTCGGCGATGGTGTGAGATTGGTATTTTGGTGGTAAGCCTGGAGCCACGGGAGCAGTGGTTTTTTTTACCCGTGGTGTGGAAAGTGCTTGAGTTGGGCCGTTAGCTTAGCTTCGCTGTGCTTGCTCGAGTCTGGTGAAGTTGCTGGTGCTAAAACCCGATGATTGGGATTTGGAGTTCTATCGGAGTAATTGTAGCTGAGGGATTTCTGTTTCATGTTGCATCTAATGCGATGTCAGGTCCTTTTTGTTAAGTATCATCTACCATGCTATGGAGTGCACTATTGACTCTGCATTATATTGCTGGGCTGGGATGTGGAGATTGACTTGATGTGGCTATTGGGACTTAAAATCTCAATATTGGCCACTAGTATAGTATGGTAATACACAGACTGAATGCAGTTTGTTCTAGTGTATGTGGTTGGAGCTTTTGTGATAGTATGACTAAGATGCATGTATGGTCTCTGACATTTTATAGGAGCCTGGAACTATCCTTCATCACTTTGCAGATTTGAGATTGTTTTTGGATGATTGTTTGCATTTATCAATATGCAGTCTTGAACATTCACATTAGTCTCAACTCTCGTGATGTCCTGCACTTACATTTGATGCTCGTGAAAGATTGGTTCATCATATGCTCTGTTTAATAACAGTGTGTATTTGTGTCATTCTGTTAAATTGGTTATCATTTCACGTGCTGCATTCATGATGTTTTCATGTTTGCACATACAGAAATCCTATGAGACAAAGCAATATAAGAAGGGCCTGAAGGCAGCAGATTCCATTTTAAAGAAGTTCCCTGAGCATGGCGGTATGCAGAAAGATATATTTAAGTTCCTTTCGTGTTACTTTACTTCCTGCAATATATATGTTAGTCACATTCACACATTGTGTCTTATTCCCCTGTAGAAACCTTATCAATGAAAGGTTTGACGCTAAATTGCATGGATCGGAAATCTGAAGCATATGAACTTGTTCGCCGTGGATTGAAGGTATGTATGAGTGATACGGTTTTGAGTATTTTTTTGTCTAAATCTTACAATTGTACGAGAAATGGAACTGATTTTACTTGATATATGCAGAATGATCTGAAGAGTCATGTGTGCTGGCATGTCTATGGCTTGCTTTATCGATCAGACAGAGAATACAGAGAAGCCATAAAATGTTACAGAAATGCTCTGAGGATTGATCCAGATAACATAGAAATTCTACGTGACCTGTCACTTCTCCAGGTTGGTGGGACATGAATATTATTTTCCCCTGTCCTATCTTTAAGCTAGTTTTTATTTTTAAAACATTGACCTCCACACAGACTTGTCCAACCTAATACGTTGCTGTGTTTAATCTTACCTATTGCTCACGTAATTTTTCCTGTATTTTTTTTATTCATGCTTTGGTCCATAAGTGTTTGCCCTTATTTGGATTTCAAGTAGTTGCACTTGGCTGAATTTCAAGCACCTATTTGGATTTTAAACATTTGATATTGCAAGAGTTTTACTACCAGAAGATTGAACATCGAGGAACATAACCAATTATTGTTCTTTTTTGTTACTAGCATCATTTTCCAGTGTGCTACAAGCAGAAAGTGTTTTGTTTATTCTAATAAATGATTCTATCTTTATTCCACAGGCACAAATGAGGGACTTGTCTGGCTTTGTTGAGACTAGGCAACAACTTTTAACACTGAAGCCAAATCACCGCATGAACTGGATTGGTTTTGCTGTAGCTCACCATTTAAGTTCCAAGTATGCTAACTTATTTTCTGTTAGATATTGTCATTAAAATATATTTTTTGAGTACTTGACTTGCTCAGACTATCTTATCAAATCTGAGGCCTGTCATGAGACACAACTTGTCCACAGTGAACAACGGTGTTGCAGTACTGACTACTGACTACTTAGTGTCAAATATGGGCTGATCTATGATTTCAGTGTTGCACTGGCTATTAAACTGACTTTGCAATATTATGGTGGAACTTCTTTGCACAACTGTCGTATGCCTTTGGCATATCGGTGTTAGTTTCTATTTGTATTTTATTTCTTATGTATTACATGCAGGGTTAACTTGTCTGTTTATTCATTACCTGCTTGGTACCGCACTTGTGGGATTAAAATAGTCATTTATAGTATAAAAACAATTCCATTTAATGTATTTGTCATTTTGTTTCCATCACATATTTGTAGTTCTTCCAAGGCAATAGAAGTATTGGAGGCATATGAGGGGACACTGGAAGATGATTATCCCCCAGAGAATGAGCGATATGAACACAGTGAAATGCTTCTGTATAAGGTGCCTGTCAAAATTCTCTTGTATTTCTGGGATATGATTGCGGTAGCAATGCTGTACTTATACACATTCACACTTTCATGAACAACGAATTATCAGGACATATATGATATCTGTCTGGATTATATGCGTTGGTCATACTGTAATTTGTGTAGCGTTGTATTTTGTATTTTGATGCTGGTTTTGCAGAATGCTGTCTGTAAATACGAAGTGTTCGAATGATGATTTATATTCACTCTCTGGTTCATATTAGTTGAAAACTTGCTGCCGGCCATCTCTTCTTCAAACAATCTAACTTTCTGAATGAAATTGATTCTTTACTTATGTTCTGATTTTATGCCATCACTTTTATTTATGTATTAAGTTCTTTTCATGCTCTGGAAACTAGAAAGTAGAAAGAATTTGCGTTATTTTAATACTCACTTCATCTTTACTTGTTATGTAATGTTATTGCTGTTCCACAGATTTCATTGTTCGAGGAATGTGGGATGCTGGACAGAGCTCTTGAGGAGATGCAGAAGAAGGAGAGCAAAATTGTAAGTCTTATCTTTCTCAATCATGTAAAGAGGAAAAATATTACTCAGAAAGATGGGCGCACATAATTATTTTTTTCTTCTAGGTTGACAAGCTATCGTTCAAAGAACAAATGGCCTGCATTTTGTTGAAACTTGGCCGCTTTGAGGAGGCTGAGAAAACATATAGGTCCCTGCTTTTCATGAATCCTGATAACTACAAGTGAGGCACCTGTGCTGCTTTTTTTTTTCCCTCATTTAAATTTCTTTGCGTCTTCTGGTAAACTCTGAAAATAGTGTGTATGGGTTTTGAATTTCAACATGGACTTATTCTAATATGCTGTTTACATTCCATTTTTATTCCAATTAATACCTTATTTTTAGATTATTGTTATTTTTAAATCTTTAATTTTGTAATTATGCATGCTTTAGGATCTTCTGTAAAATACTCTCTCCCAGTTTATGAGTTATATGATAATCTAGCTCTATTTTATAAATAAGTGTTGGTCAATTTGGCTAATTCAACCAATTTTATCAGTACTTGCATTTGGTAGTTAATCGTGACAACAATCTGGTCTGCAACCACATGAACTATACATGAGGCAGAAATCATATGTTATCATGACTGATTCTGACCCTTCAGTCCTTAACGTATTTAATGTTCATGTTGCAAAACTTTGCATGGAATTGATTTAAGTTATTTCTTGTGTTTGTGCTCTCTTTGCTTGATATATGTATATCACATGCTCTTCATAGGAGGACAGGGGAGCTATGCCATTTATATTTCTGTAACATGATGGTGCAAATTTAGCCTGTGGGAGGGTTCTTAGTTCTAGTTGGTACGTGGTGGGTGGTGGGTTTAAACCCAATAGTCCCATATAAACAATGGGAAAATCATGCTTACCAACTTGGCTTGCCCTTTTAAGATAAGTGAGGATGAGAGCCTCTGGTTTTGCAGAATTTACCTGGTATGCAACATGGTATCAGAAATATGTGGCCTGATATGAACCAATTTTCTGTCTGCTAAGACTTGTACAATGGAAGAAGTGGCAAAGAAGGGAGGTGCTTAGTATACCATGTCAGCAAAGCATCCATCTAAGAGTCCAAACTTTCAGTGCAAGTACCTTACAGGTGCTTATATGGTTTCGCAAACTCAAGGTCACAACAATAGGCATCCATGTGCCTGCTCTTATTGGTTGGCTTAGTCCCACTAGATAGTTGCATATAAAACTTGCGGAACCATCCATGCCAACTGGGCTCATCCTTTAGGTGGAGTGACGCTGTAAGGCTAAGTGTTAGGATAAGTTTGATGCATCTTTGGTGCTACAATCTTCCTCTATGACTTAATATCAACTCAGTTTTGGAATTCCCTTGTATTCAGGGGAAATATTATAGATACTTGCGTCTATAGCACTCTTCTGACTTACATTGTACCCCTTCTTGTTAATACTCTAGGGATTAATTTATTTTCACTGGTTTTAATCAGGTATTTCATAGCTGTTCAAAAGTGCCTTGGTCTATACTCAGAGAATGGTCAGTATTCCACTGATGATGTTGACCGATTATGCGAATTGTATAGCTCACTTAAAGAAGAATATGGTTGGTCA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