Difference between revisions of "BGIOSGA001442"
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Revision as of 18:10, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001442 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001442, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02368 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001442-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001442-PA |
| Length |
11938 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22864537..22876474 |
| Sequence Coding Region |
22876075..22876474,22875855..22875929,22875183..22875217,22875015..22875093,22874823..22874912 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:22864537..22876474 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:22864537..22876474 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCGGTCCACCGCCGCCGCCGCCGATGTGATCGATCTCTCCAGCGACGACGACGACGAGGTGCCCGTCCCCAGCACCAGCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCGCGCCGCGTCGCGCCCTCCACGTCCCCTCGCGACGTCACGCCGTACGCGCTCGTCGATGTGAAGCCCGCGCTGCTGTACCCGCTCCAGCCACCGGGCGTCGTCGTCGGTGGCAGCGGCGCGCTCGTGCCCGTGAAGGAGGAGCTCCCGTTGCTGACGCCGGTGCCCCTGCTGGCCGCGGGCTATTCCCCGTCCACCCCCTCCACCAAGGTCGCCCTCCCGGCGCCGCGCCTCTGCCGCCAGTTCTGGAAGTCGGGCGACTACGTCGTCGCCCAGCGCAACCCCGACGCCGATGCACCCGGTGGGCGGAACCGACTTCGGATTAATCCCAGGTTCCTGCACTCGAATGCTACTTCCCACAAGTGGGCTTTTGGTGCCATTGCCGAGCTTCTTGATAATGCAATTGACGAGGTTAACACTGGGGCAACATTTGTTCGTGTTAATGAATTTACAAACCCACGAGATGGGAGTTCCTCATTGTTAATTCAAGATGATGGAGGGGGAATGGATCCAGAGGCACTGAGACGCTGCATGAGCTTTGGATTTTCAGATAAGCAGTCCGATGCTTTAATCGGGCAATATGGAAATGGATTCAAAACTAGCACAATGAGGCTTGGAGCAGATGTGATTGTTTTTACACAAAACCAAAATAACTGGGTGCCAACAAGAAGTATCGGTCTTCTTTCATACACATTTTTGATGGAAACTGGCTGCGATGATGTTTTGGTTCCAACAGTTGATTATCAGTATGATATATCAACAGCTTCATATACTCAGATGCTGCGTCATGATCAGAAGCTCTTCTCTTCAAATTTAGCGATCCTCTTGAAATGGTCCCCTTTTGCTAGTGAAGCTGAGTTGCTCAAACAATTTGATGATATCGGAGAGCATGGAACAAAAATAATTGTATTCAACCTCTGGTTCAATGATGATGGGGATATGGAGCTTGATTTCAACTCCGATAAGAAGGCATACACATCTGTCTTGTACCTTCACATTCCTGATAATTTCAGAATAGTCTTGCGTGGACATGATGTGGAATCACATAATGTAATAAATGATTTGATGTATCCTGAATGCGTGTTGTATAAACCACAAATTGCTGGGCTTGCAGAGCTATCTGCAATAACCACCATTGGATTTGTCAAAGGCGCCCCAGAAATTGATGTACAAGGCTTTAATGTGTACCACAAGAATCGTTTAATAGCGCCATTTTGGAAAGTTGCGAACAACTCATATGGCAAAGGGCGAGGAGTTGTGGGCATTCTAGAGGCAAACTTCATCAAACCTACCCATGACAAGCAAGATTTTGAAAAGTCGGTCCTTTATCAAAGGCTGGAGAGCCGCTTGAAAGAAATGACATATGAATACTGGGACCTGCATTGCCATCGTATTGGTTATGACAACAAAAAATTACCTAAATCTTCCCGTGCACTTAATCGTGCTAATCAGATGAATGCTGGCAGTTCCCCGCCAATTGTTCCACGTCAGCTATTGGCTGCTGATATTCCGACAAGCAGCTGTGCTGTCCCTACATTTATGGCCCCTGCATTAAGGCAAAAACAGATGGGATTGAAGAGAAATATTGATGCCCTTGGATCCAAGACAGACAGTGCTGACCAAGATGGATCTCACTTGGACGTTTCTCAACGGAGAAGGTTTAACGAATACAGGACTTTGACACTAGAGAATGACAAGTTGCGTGGCGAATGCTTGCAATACGAGGAGTCAGCAAAACAACTTGCTCTGAAGGAACAAAAGCTCCGATCTCAAATTGCTTTGGAAAGAAAGAAATATGAGGAATTATTACAAGAGCTCAGGTCGTTGGATGTGAAGACAGAGAAATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRSTAAAADVIDLSSDDDDEVPVPSTSAAAAAAARRVAPSTSPRDVTPYALVDVKPALLYPLQPPGVVVGGSGALVPVKEELPLLTPVPLLAAGYSPSTPSTKVALPAPRLCRQFWKSGDYVVAQRNPDADAPGGRNRLRINPRFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAIDEVNTGATFVRVNEFTNPRDGSSSLLIQDDGGGMDPEALRRCMSFGFSDKQSDALIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFTQNQNNWVPTRSIGLLSYTFLMETGCDDVLVPTVDYQYDISTASYTQMLRHDQKLFSSNLAILLKWSPFASEAELLKQFDDIGEHGTKIIVFNLWFNDDGDMELDFNSDKKAYTSVLYLHIPDNFRIVLRGHDVESHNVINDLMYPECVLYKPQIAGLAELSAITTIGFVKGAPEIDVQGFNVYHKNRLIAPFWKVANNSYGKGRGVVGILEANFIKPTHDKQDFEKSVLYQRLESRLKEMTYEYWDLHCHRIGYDNKKLPKSSRALNRANQMNAGSSPPIVPRQLLAADIPTSSCAVPTFMAPALRQKQMGLKRNIDALGSKTDSADQDGSHLDVSQRRRFNEYRTLTLENDKLRGECLQYEESAKQLALKEQKLRSQIALERKKYEELLQELRSLDVKTEK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..400#546..620#1258..1292#1382..1460#1563..1652#1741..1816#2307..2385#2483..2617#3931..4029#4583..4729#5714..5806#6847..6898#6992..7103#8331..8521#8624..8691#9375..9451#10574..10616#11843..11938#ATGCGGTCCACCGCCGCCGCCGCCGATGTGATCGATCTCTCCAGCGACGACGACGACGAGGTGCCCGTCCCCAGCACCAGCGCCGCCGCAGCCGCAGCCGCGCGCCGCGTCGCGCCCTCCACGTCCCCTCGCGACGTCACGCCGTACGCGCTCGTCGATGTGAAGCCCGCGCTGCTGTACCCGCTCCAGCCACCGGGCGTCGTCGTCGGTGGCAGCGGCGCGCTCGTGCCCGTGAAGGAGGAGCTCCCGTTGCTGACGCCGGTGCCCCTGCTGGCCGCGGGCTATTCCCCGTCCACCCCCTCCACCAAGGTCGCCCTCCCGGCGCCGCGCCTCTGCCGCCAGTTCTGGAAGTCGGGCGACTACGTCGTCGCCCAGCGCAACCCCGACGCCGATGCACCCGGTAAGCTAAGGCTAGCTAAGCACCTAGGGTTCTCCCATTTCGCTTCGCTTCTTAGCTTTCCGTTTGGATTTTGGTGGAGGCAAATTTGACGGTTTGAAGAGGCTGACTGATATGGGGTTGCGATTCGGTGCTGGTGTATGTGCAGGTGGGCGGAACCGACTTCGGATTAATCCCAGGTTCCTGCACTCGAATGCTACTTCCCACAAGTGGGCTTTTGGTGGTATGAGAATTGACAAATCTTATTAGTGGAAACAACTCCATTTTAGGCAATGACTTGATTCTAATACCTTTAATTCGTTCATTCGTTCGCATAATTGCAACCAAGTTTCTACTAACGGTATTTCCTTTAGTAAGAAGTTGTGATGTGTAGTGTGTATTTAGTTGCATTGGATCATATTTCTTGTTTGCCGAACAGCACCAATCAATTTCTAGTTGTAAACATGTAATTTGGCTAAAGTAAATAAAACTTTTTCTTCTTAAGGAAGTATTAACTTCAGTATAAACAAATTGAATATTGTACATGTTTTGATTATTTTTGAGGATTTAAAATCGTCTTTGCCATGTAAAACGCTGTGAAGCCCGTCTTTGCTGGCACGGCTCTACTTTTTGAGCTCAGGATCTGGTACCATAACAAACAAGTGGACTACTCTATATGCGGCCGTTATATACCTACTTATATTATTGTGTATCTATAAAAATGTGTTAGCGTTTTTATAACCTAACCCGTCATGCAGGTATTTGCGGTTCCATTATATTATTCTCTTAAAGTAATCAATCATATTAGGACATTGCATTGCATTATATGGCACTATTTTCCCACTGATTTATGTTCAGTATTATGCTTATCATTTTTTCAGCCATTGCCGAGCTTCTTGATAATGCAATTGACGAGGTAATTAACAAGCGCACCCAGTTCCAAACTTCCAATGGCTAAAATATATTGATATTATGTATGATTTATTATCCCACTATCTCTATCAGGTTAACACTGGGGCAACATTTGTTCGTGTTAATGAATTTACAAACCCACGAGATGGGAGTTCCTCATTGTTAATTCAAGGTTGGCAGATTCAGTAATATAAATATATGCAGATCCTCTAAGTTCATAGAAAATCTTAATTGGATAAGTGAGAAAGACCTGTGTTTTTTTCACATGTGCTAGATGATGGAGGGGGAATGGATCCAGAGGCACTGAGACGCTGCATGAGCTTTGGATTTTCAGATAAGCAGTCCGATGCTTTAATCGGGCAATGTATAGCCTTGTGTACTTTTTCTGCAGTTCTTTGGAAAATTGATATCTAGAACCCTTCTTTTGGATTTACTGCTGTTTGTTGTATCAGATGGAAATGGATTCAAAACTAGCACAATGAGGCTTGGAGCAGATGTGATTGTTTTTACACAAAACCAAAATAACTGGTATACCTCCTTTTCTAATTCTGGAAGTTTGGTTGTTCAATGTTACACCAGAAAAAGCATTCTGTGATGTCACCATGGTATTTTGTAATGTAATAAACTCTGAGGGACTACCTGGAAATCTAACAACACAGCTTAGGGATAGAAGAGAAGCAAAATCAAACAGCAGTTATGACTTATAAGTGCTTAAACATTATGTCAAAAGAAATAAGTGGCCATACAACCTTTTGCAACGTTTTCATTCTGTGGGTTCTAGAAGAAATTGTTTGCATACAGTTGCTTTAACTTTTCTTATTGTGTATCTGGAAACAACTGTAAGTGAAAACTAATAGGAGAATTATGCATTTTATATGTTACTTTCTGCATGCTGCTGGCCAGTCAAACATTTATCATCCGATCCCACTAAGCCTTTTTGCCCAGTCTGGTTTATTATGTAAAATTTCTGTCCACCCTGGTTCATATATCTATTTAATTATCTTTTTTGTGTCTGTAGGGTGCCAACAAGAAGTATCGGTCTTCTTTCATACACATTTTTGATGGAAACTGGCTGCGATGATGTTTTGGTTCCAACAGTAGGTTCACAAATGCTTTGACATTTTAAAAATGAGTGATCATTGGTCAATATGTGTAGTTTTATTTCACCCTTGTGACACCCTCTTTCTCATGCAGGTTGATTATCAGTATGATATATCAACAGCTTCATATACTCAGATGCTGCGTCATGATCAGAAGCTCTTCTCTTCAAATTTAGCGATCCTCTTGAAATGGTCCCCTTTTGCTAGTGAAGCTGAGTTGCTCAAACAAGTATGTTACTAAAGTTTCATTACTTTGTTACATAATGTCATATACTGATATTTATATAAATAATGTGTTGAAGAAGTTATGGAAGGAGAGAATTCCTTGTATTCCCTTGAAATTACAGCCAATTCCTTCCATACCCCTGAGTTTTGGTCATTTCATTATATACCCCTGAATTTTGGTTTTGATCCCTCCCATATCCATTCTGTCAATTGACCATTAGTTGTCCATTTAATGGCAGTGGAAAAGCCCGTTTTATGCTTGGACACAGAAAGAATGTAGAAATTTGTGAAGTGTATTTTGGAAATATAGAAGTTTGTTGTGTGACTATAATATCATAACTTTGCTGTATGTTGTTGTGTTTCACAAATTTATTTCAATATATATATATATATATATATAGTTTTTAAAAATATGTGTAGCATTTTTTTTTAAAATGTACAAAACAGTGATACTGGTCTTGCATTTCTTGTACATAATGTCAATAATAGACGCTAAATCTATTATATATAGCATAAAAATTAGCTGTACATATACTCTTTTTAGAAAGACAAATATTAAATTTTCTTAGTCGTTATCTAAAAAGTAAACTTTGCTGTGAATAATAGTTGTCACAACAAACTTATAGTTTTGTACATCAAACTCCAACACTTCGAACAATATGCTCCACGAATTTATACATTTCTTCTTTCCTAAGGGCAAAATGGACTTCTTCATAGCTATTAATCGGTCAACTGATGTAATGGGTATGGAAGGGATCAAAATCAAAATTCAGAGGTATAGAAGAGAGTGAGAAAGGGCATGGAAGGAAAGGGCTGGAATTTCAGGGGCACGCAAAAAATTCTCTTATGGAAGATACATCGATACATCAGGCTGATACAAAAGAGGATGTATATTTTAGTGCATGCAGGAAACTCCATATGTTGAGTTTCCTGTATAGTAGTCTTTAGCCCCTAAATGACTTATAAAAAAGATTTTGCTAATTCTTTAAGTCATTGGAAGTTTTGGTAAATAAAATATTGAAATGGTTGAAGATCATTTTTTCAATGCAATATACATACACCAGAACTGAAACACGGTATGAATTTATGTTATACTGAAAATTATGAGTATTATTTGTGGCAAAAGATTTATTGATGCATTACGGGTCATTTCTTTAAAATTGAACCAAACACTTCTCTTTGTTCATATCAATTCCTTTTCCCCTTCTATAGCATATATTATATATATTTTGGTAGATTTCCATTGTTTAAAACAATCTTATCATCCTAATTGAGATTTTTTTTCAAGTTTGTTCAAGTGATTTTTACTTGATACAGTTTGATGATATCGGAGAGCATGGAACAAAAATAATTGTATTCAACCTCTGGTTCAATGATGATGGGGATATGGAGCTTGATTTCAACTCCGATAAGAAGGTAAGTAATGCTGGCATATTTTAGGGCTCTATTGGGCGCTGTCCAATGATATGTGTTTAGGAGCTTCTATGCTTCAGTATGTGGGAATTTGAAAAGTTGTAATGCACAAATAAATGGTGAGTTCCACTCATTGCGTGTTTCAAGTCGTGCAAAACTTATCGAAGGGGGTGAAGTATGGAAGCACTTCCCCAACCCCCACCCCACCCCCACCAAATCACATGGCACATTTGTGGGCACGTTTCAGATACACCATCCTCCTTCCAACTTTCTCATATAGTTATATGACTGGTTTATACATAAGCTGTATGTATTACGCTAAGTTGTAATTGATCAATTCGTATTTAATATTTTAGGATATCCTCATTACTGGGGCACACCAGGAAGGTGAATACCAACAAGGCAGATAAGGTCGCAACACAGAACTACGTTTCAACTCGACTCCGTTATTCTCTTAGAGTTAAGTATTGATCCCCATTTACTAGTTTGCTAAAATCAGTTTTACTATTTCATTGTGCTGATATGTTTATTTTTGTTTCTATCTGAATTTGAACAGGCATACACATCTGTCTTGTACCTTCACATTCCTGATAATTTCAGAATAGTCTTGCGTGGACATGATGTGGAATCACATAATGTAATAAATGATTTGATGTATCCTGAATGCGTGTTGTATAAACCACAAATTGCTGGGCTTGCAGAGGTACGTGCAACTCACATTTGTGAAGCAATACTATGCATTTTCACCCATTTTGATCAATGGG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