Difference between revisions of "BGIOSGA001487"
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Revision as of 18:11, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001487 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001487, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02286 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001487-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001487-PA |
| Length |
18714 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:21813844..21832557 |
| Sequence Coding Region |
21832326..21832557,21831295..21831395,21831030..21831110,21830549..21830646,21830386..21830470 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:21813844..21832557 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:21813844..21832557 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGTCGACGTCCACGGAGGTGGTAGTGCCGGCGGGTGCGGGTGCGGGGGCGGGGGCGGGGAGGTGGAGGCGGGATGCGCTGGCGCACACGCTGGGGTCGCGGAGGCTGCCCGAGGGCGTGGCGGACGCCGGGGAGAGGGTGCCCGACGCCGTCGCGCCGGGGGTCATGCCCTTCATCCGCGCCGCCGACGAGGTCGAGCAGGATAGCCCGCGCGTCGCCTTCCTCTGTCGCCGATATGCGTACAACAAAGTCCAAAGAATGGATCCATCATCAGTCCAACGTGGAGTTCGACAGTTCAAAACATACATGTCAGTTAAGCTAGATCAGATATTAGATAAGTCTTCTATAAAGAACAATTACGATGTAGATAATCTTGCTAGTCATTTACAACCTTACAAATGGGAGCAGGACGACACCCAAGTTATGGGCAATGATGCAAAGGAAATTCAACGATTTTATAAGAGTTATTGTGCTGAGCTGAGTAGGATATCAGAAAAGAGAAACTTTGAGGAAGTGGCTAGACGTTACCAAGTGGCATCTGCTCTTTATGAAGTGTTAAGAGATGTGACAAACAACAAAGTTGATTCTGAGGTGATGAAGATTGCGAAAGTGATTGAGGAGAAGAGTGTTCATTTCAAGAACTACAAGTACAACATTATTCCCCTGAACTTTCCAGGTTCATCTGAGGCAATTGTGGAACTCCATGAGATAAAAGGTGCTATTGATGCGCTAAATAGCATCGATGGCCTTCCAATGCCACACATGTCTTCTATGCACACGGATGGGAATAAATCCATACGAGATTTACTTGACTGGCTTTCACTAGCATTTGGATTTCAGAAATCAAATGTGGAAAATCAAAGAGAAAACTTGGTTTTGCTGCTCGCAAATATTGGCACAAGGACTGCTGGGCAAGACCATCCTCTGGTTGACACTGTGAATAAATTATGGAAAAAGATACTTCAGAACTACCAATCATGGTGTAGCTATTTGCATGTTAGTTCAAGTATCATGAACGTTGAGACAGTCACACAAAATAAACAACAATTAATGCTCCTTCACATTGGGTTGTATCTTCTTATCTGGGGTGAGGCCTCAAATGTTCGTTTTATGCCTGAGTGCCTGTGCTACATATTTCACCATATGGCAAGACAGTTGCACAAAATGATCGAAGAAAATAATTTTCAATCACCACCAGGATTTGAAGAAGAGGGATCATTTCTGAAAACTGCCATTGAACCTATCTACAAGGTTTTGCAGAAATCTGTGAGTTTTCGTTTTCTTCCACGCAGGTCAGAGAAATGTTTTGCAAGGCTTAACTGGCCATGGGACCTTACAGCAGACTTCTTTTATCAAGGGCGCACTACATCAACAAAGCCCAAAACAAATTTTGTTGAAGTCCGCACATTTCTACACATATTTAGAAGTTTTAATCGAATGTGGATGTTTTTCATACTAGCTTTTCAGGCGATGCTAATAGTATCATGGAGTTCGTCTGGATCTCTTTCTGCGCTTGCTGATGCAACTGTTTTCAGAAGTGTTTTAAGTGTCTTTATAACAGCTGCTCTACTCAACTTCATTAAAGTAACTCTGGACATAGTGCTTACTTTCCAAGCATGGGGGAATATGGACTGGATACAAATAGTCAGATATCTATTAAAATTCTTCGTGGCCATTGCTTGGATAATAATTCTTCCATTAGCATATTCTAGTTCCATCAGATACCCATCTGGTGCTGGAAAACTCCTGAATAGTTGGAATATCATGGAACGCTCAAACTGGCGTGTAATTGGTCTTATTATGTGGTGGATTCAGATATCCCCAATTATTGGTCCAACAAAGTTCCTTCTTAACCAAGGAGTTGGGAACTATGAGTGGCATGAAATCTTCCCTTTCCTGCCACACAACCTTGGTGTCGTCATTACTATATGGGCCCCAATCGTCATGGTGTACTTCATGGATATACAAATATGGTATGCTATTTTTTCAACTGCATTTGGGGGTGTTTCAGGTGCCCTTAGTCATGTTGGTGAGATACGTACCCTTGGCATGTTAAGAGCCAGATTCAAATCAATGCCAGAAGCTTTCAATAAAAGCCATGCAACAGCGCATAGAGAGTATATGTTCCATTTAAAATGCAGCAGCCTTCATGGTAGGATGGAGAAGGCACACTGCTTTGAATCTCTCAACCAGGGATCGGATCCCATTGACACACCCTTTACTGGTTTTTTGACAAAAGAATGCTGTGGGTTAACCCTCAACTTTTATTTTGATAGAGAAAGGGACATACTGATGGCTCCGTCATTTTCAAGTAGTTTTTCTGTTACTCCATGGCCTCCTTTCCTTGTTGCCAGTAAGAGATGCTCATGGTCTCAGGAATATACCAGAATCGTCGATGCCATTGATAAAACAGTGCTTGATAGTGTGGAAAATAATACACTTTTGGAAGATTTTCATATGGCAGAGATTGGCAAAGTCAGCAACACGCTGGCAAAATTATTGCATCTACTGAGCAATGAATCTACTGATGGTACTGCTGAGAGAAAAATCATTAATGCTCTGCAAGATTTTATGGAAATTACTACACGGGATTTCATGAAAGATGGACAGGGTATTTTGAAAGATGAGAATGAGAGAAAGCAGAGGTTCACACATTTAGACATGGATATGATAAAGGAATCGTTTTGGAAGGAGAAGTTTGTCCGGTTGCACTTATTGTTGACTATGAAGGATTCCGCAATGGATGTACCAACAAATTTGGATGCTCGGCGTAGGATCACCTTCTTTGCAAACTCGCTGTTCATGAAAATGCCAAAAGCACCTCAAGTTCATGATATGATTTCATTTAGTGTTTTGACTCCATATTATAATGAGGAAGTGCTCTATTCTTCTCATGAACTGAATAAGAAGAATGAAGATGGCATTTCAATTTTGTTCTATCTACAAAAGATTTATCCAGATGAATGGAAGAACTTTCTAGAACGCATTGGAGTTGACCCAGAAAATGAAGAGGCAGTAAAAGGGTACATGGATGATGTCCGTATCTGGGCATCTTACCGTGGTCAAACACTTGCCAGAACTGTGAGAGGAATGATGTACTACAGACGAGCTCTTGAACTACAATGCTATGAGGATATGACAAATGCTCAAGCTGATTTAGACGGAGAGGAATCTGCAAGGTCCAAGGCCATTGCTGATATAAAATTCACTTATGTTGTTTCCTGTCAACTCTATGGCATGCATAAGGCATCAAAGGATTCCCGTGAAAAAGGTCTTTATGAAAACATCTTAAATCTCATGTTAACGTATCCAGCATTGCGTATTGCTTACATTGATGAGAAAGAAGTGCCATTACCAAATGGTAAAATGGAGAAACAATATTACTCAGTTCTTGTGAAAGGCAATGATGAGGAAATTTACCGGATAAGGCTCCCAGGTAAACCAACAGATATTGGCGAGGGAAAGCCTAATAATCAAAATCACGCTATAATCTTCACTAGAGGAGAAGCGCTTCAAGCAATTGACATGAACCAGGATAATTACCTTGAGGAAGCATTTAAAATGAGAAATCTACTGGAAGAGTTCCTTATTAAACACGGAAAGTCTGAACCAACAATATTGGGTGTTCGCGAACATATCTTTACTGGGAGTGTTTCATCCCTTGCGTGGTTTATGTCAAACCAAGAGACTAGTTTCGTTACCATTGGACAACGTGTTCTTGCGAACACTCTCAAGGTACGATTCCATTATGGTCACCCTGATGTTTTCGATAGAATCTTTCACCTCACAAGGGGTGGCATAAGCAAGGCATCAAAGGTTATCAACCTTAGCGAGGATATCTTTGCAGGATTCAATTCAACCCTGCGGCAAGGAAATGTTACTCATCATGAATATATACAGCTGGGTAAAGGACGTGATGTTGGAATGAATCAAATATCCAACTTTGAGGCCAAGGTGGCAAACGGAAATGGTGAACAAACACTCTGTCGAGATATTTATCGACTAGGGCACAGATTTGATTTCTACAGGATGTTGTCTCTATACTTCACTACAGTTGGTTTCTACTTCAATAGTATGGTGTATGCACTATCATGGCTGGTTATAGCTATAGTTCTTGTATCACTTAAGGTCGTCTCAATGGGGAGAGAGAAGTTTATTACCAATTTTCAACTTGTATTCCGTATCCTCAAGGGCATTGTCTTTATTGTCCTCATCAGCTTGGTGGTCATCTTATTTGTTGTTTTCAATCTGACTGTCTCTGATGTTGGTGCCAGTATTTTGGCATTCATCCCTACTGGCTGGTTTATTCTTCAGATTGCACAGCTCTGTGGACCATTGTTCCGGAGATTGGTGACGGAGCCGCTCTGTGCCCTGTTCTGTTCATGTTGCACCGGGGGCACCACATGCAAGGGGCGTTGCTGCGCCAGGTTTAGGCTGAGGAGCCGGGATGTGCTCCGCAAGATCGGGCCATGGGACTCCATCCAGGAGATGGCGAGGATGTACGAGTACACCATGGGGATCCTCATCTTCTTCCCCATCGCCGTCCTGTCGTGGTTCCCCTTCGTCTCCGAGTTCCAGACTCGGCTGCTCTTCAACCAAGCCTTCAGCCGGGGGCTGCAGATCTCCAGGATCCTCGCCGGCCAGAATGGTAGCGGCTCAAAGAGGGACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAASTSTEVVVPAGAGAGAGAGRWRRDALAHTLGSRRLPEGVADAGERVPDAVAPGVMPFIRAADEVEQDSPRVAFLCRRYAYNKVQRMDPSSVQRGVRQFKTYMSVKLDQILDKSSIKNNYDVDNLASHLQPYKWEQDDTQVMGNDAKEIQRFYKSYCAELSRISEKRNFEEVARRYQVASALYEVLRDVTNNKVDSEVMKIAKVIEEKSVHFKNYKYNIIPLNFPGSSEAIVELHEIKGAIDALNSIDGLPMPHMSSMHTDGNKSIRDLLDWLSLAFGFQKSNVENQRENLVLLLANIGTRTAGQDHPLVDTVNKLWKKILQNYQSWCSYLHVSSSIMNVETVTQNKQQLMLLHIGLYLLIWGEASNVRFMPECLCYIFHHMARQLHKMIEENNFQSPPGFEEEGSFLKTAIEPIYKVLQKSVSFRFLPRRSEKCFARLNWPWDLTADFFYQGRTTSTKPKTNFVEVRTFLHIFRSFNRMWMFFILAFQAMLIVSWSSSGSLSALADATVFRSVLSVFITAALLNFIKVTLDIVLTFQAWGNMDWIQIVRYLLKFFVAIAWIIILPLAYSSSIRYPSGAGKLLNSWNIMERSNWRVIGLIMWWIQISPIIGPTKFLLNQGVGNYEWHEIFPFLPHNLGVVITIWAPIVMVYFMDIQIWYAIFSTAFGGVSGALSHVGEIRTLGMLRARFKSMPEAFNKSHATAHREYMFHLKCSSLHGRMEKAHCFESLNQGSDPIDTPFTGFLTKECCGLTLNFYFDRERDILMAPSFSSSFSVTPWPPFLVASKRCSWSQEYTRIVDAIDKTVLDSVENNTLLEDFHMAEIGKVSNTLAKLLHLLSNESTDGTAERKIINALQDFMEITTRDFMKDGQGILKDENERKQRFTHLDMDMIKESFWKEKFVRLHLLLTMKDSAMDVPTNLDARRRITFFANSLFMKMPKAPQVHDMISFSVLTPYYNEEVLYSSHELNKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLERIGVDPENEEAVKGYMDDVRIWASYRGQTLARTVRGMMYYRRALELQCYEDMTNAQADLDGEESARSKAIADIKFTYVVSCQLYGMHKASKDSREKGLYENILNLMLTYPALRIAYIDEKEVPLPNGKMEKQYYSVLVKGNDEEIYRIRLPGKPTDIGEGKPNNQNHAIIFTRGEALQAIDMNQDNYLEEAFKMRNLLEEFLIKHGKSEPTILGVREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRVLANTLKVRFHYGHPDVFDRIFHLTRGGISKASKVINLSEDIFAGFNSTLRQGNVTHHEYIQLGKGRDVGMNQISNFEAKVANGNGEQTLCRDIYRLGHRFDFYRMLSLYFTTVGFYFNSMVYALSWLVIAIVLVSLKVVSMGREKFITNFQLVFRILKGIVFIVLISLVVILFVVFNLTVSDVGASILAFIPTGWFILQIAQLCGPLFRRLVTEPLCALFCSCCTGGTTCKGRCCARFRLRSRDVLRKIGPWDSIQEMARMYEYTMGILIFFPIAVLSWFPFVSEFQTRLLFNQAFSRGLQISRILAGQNGSGSKRD</aaseq> |
| Gene Sequence |
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