Difference between revisions of "BGIOSGA001759"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001759

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001759, complete gene.

LocusTag

OsI_01684

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001759-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001759-PA

Length

9623

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:13871482..13881104

Sequence Coding Region

13880958..13881104,13880710..13880744,13880109..13880180,13878007..13880031,13877550..13877881
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Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGTCTGCTCGCCGGAGAAGGCGGGGGCGGCGTGCCCGGAGTGCCTGGAGCGTCGAATCCTTTCGGGCCTCCCGGGCTCCTGCTTCTCCTTCGTGCACGGCCTCCACGAGTCCCCTCTCCCCTTCGCCTCCGCCGCCGTCGTCCAGATTGCATCTGATGGTGCTGAGGAATGTAATGGGAGCCAGCAGAGCACTGGTTATTTTGTATTGGTGGGACTACATGGTGGCAAGGCACTTTTGGATATTCAAGAATGTGAGAATAATTCCTTGGAAAATGGAAGTCAGATAGATCTGCGGGGCAAGGAAAGCACAGATGCTGATGACAACCACAGGAAGCAATCAATCATAAACACAATTACTAAGTTAACTCCTACTCAATATCTTGCTAGAGCAGCCACTTCTGAAATTAGAGATCTTATCTCAAGTTACTTGAATTTGACAACAGAAGAGAGTGTGATGAATTCTTTAAATCTTTTGTCTGAAAATAAAATTGTTGGCTCAGGAGGCTTAGATTTTCTCAATTTTACTGGATTTTCAGAGTTCAATGATATACATCCTTCTGGCCATGTCAGACATCCCAACATCTTACCTGTTTTAGGCATTGTAGAAACATATGATTGTTGCTACATGTTACATCCAAAGTCTCCATATACCTTGGAAAATATCATGCACTACAGTCCAGAGGCATTGTGGTCAGATTGGCATATTAGATTTCTCATCTACCAGATAATATCTGCTTTGGTGTATCTTCATGATTTTGGAGTTCATCATGGTAATCTGAAACCTTCAGCCATCTTTATGTCAGATTCTTTATGGCCTTACCTGAGCATAAGTGATATATGTCCTGTAAAACAGAATTGTGGTTTTGCTGAGTTGAAGCGTCCAGCTCTTACCCTATGTTGTTTTGAGGAGGATTGTTCTTCAAGGGACATTTATTCTGGTTTCAATCTGTCATCATCCTTAGATTGGCAGTCTTACTCTAAGCGATGGTGGATGGGTGAATTGAGCAACTACGAATATATTCTTGTCTTAAATAAGTTAGCTGGTAGAAGATGGGGTGATCCAGCTTTTCACACAGTAATGCCTTGGGTAATAGATTTCACAGTGAGGCCTGACGAAAATTCTGATATTGGTTGGAGGGACCTCACCAAAAGTAAATGGCGGCTGGCAAAAGGTGATGAACAACTTGATTTTACTTATTCATCATCTGAGGTTCCACATCATGTTTCTGATGAGTGTCTCTCAGAGCTAGCAGTTTGCAGTTATAAAGCAAGGAGGCTACCAAAGAACATCTTGAGGTCTGCTGTGCGTTCTGTTTATGAGCCCAATGAATACCCATCTAACATGCAAAGGCTATACCAATGGACTCCTGATGAGTGCATTCCAGAATTCTATAGCGATCCTCGGATATTTGTCTCTCTTCATTCCGAAATGAGCAATTTGGCTTTACCTTCCTGGGTGACTTCTGCAGAGGAATTTATTTGTCTGCACAGGAATGCTTTAGAGAGTGACCGAGTCTCGCGACAACTGCATCATTGGATTGACATAACCTTTGGGTATAAACTTTCTGGGGAGTCATCTGTTGAAGCCAAGAATGTAATGTTGCCTCCTAGTGATCCAGCAAAGCCTAAATCAACTGGGCGGCGCCAACTTTTCACGAAACCGCATCCTAAGCGACTTACTAGCACACCTCACTCTACCTATCATAATAAAATGGAATCTTGTGCTAAATGCCAGGGGGGATCAAGTAGCATGACTACTGGTCTACTATTAAAGGACCACATTCCTCCAGCTATGTCATCACAAATTGATTATCTGGAAGAGTTTGAGCAAGCAAACGTGTTTATGAAGCTTGAAAATCATTTGTGTCCAATATATGATTATGCTAATGATTCTTCTTCTTGTTGCTCTTCAGTCAAATATAATAAGAGCCCTTGTTCAAATCAGTATATTGTGCCTCCAGAGAGTGTGCTATCAGTGGCGCCTGATTTTGATTTTTGTTCTTTTCTTGAATGCTTTGAATCCGATGATAGTTCTCCAACGGGTTATCAAGAGCTGTTGCGTTGGAAGCAAAAGTCTTGTTCAGTTAATGAGTATCATGCAAATGATATATTTTCTGTTGGGTGTATCTTGGCAGAAATCTATCTGCACGGACCACTTTTTGATGCTGATCTCCTATCTGCATATAAAGAAACTGGCGTACTGCCAGGAGCAATTCAAGAATTGCCTATCCATGTTGCTGTTCTTGTTGAGTCATGCATACAGAGGGAATGGAAAAGGAGGCCACTGGCAAAGCACCTTTTGGAATCACAATACTTTCCTCCATCCGTTCGATCTGCATACATGTTTCTTGCTCCACTTCAACTTATATGTACACCTAGGGATCGCCTTAAGTATGTTGCTAAGCTTGCAAGTGAAGGAACACTTAGAGCTATGGGGGAATGTGCTGCCGAAATGTGTGCACCCTACTGCCTACCTCTTGTTTCACCATCTTTGTCAGATATTGACACCGAATTCGCCTTGGCTCTGCTTAAAGAATTTGTGAAGTGCTTAAGTGTCCAAGCAACTAAGGATCTTATACTTCACATCATTCAGAAGATCTTACAGGCCGGTGGACTTCTCGGAGAGAGTTTTACTGTCAAGCAAATTCTTCCCTTACTTAGGAATGTTATACTCTCATGCATTGAATCCTCAAAGATCAATAAGCCTGAGCCACAACATAGTTGGAATTCTTTTTCCCTCATGGATGGTTTATCTGCATTGGAAGGCCTTGTATCAGTTCTACCTGTCAAAACAATTCTTAGAGAGCTTCTTCAGGTGGCTGCTAGTGCACTTGTTGATCTTTGTCAACAAATTGGACCAGAAAATACAGCTACATATGTGCTTCCACATCTAAAAGAGCTTTTTGCTGAACTAGCATTCTCTCATGAGTCTTCTGGTCTTAGTGTTCCTACAAAAGGGTTAAAGTTCTTCGATGGAAACAAAACAGAGCCAGCTAAAATGGAATCTAGGATGGATCTCGATTGGCAGCCTTCCACTGACCATTCTGGCAGTAGTGAAAACATGAAAGGTCAAAGGTTTCGGCCTGGGAACTATACCTCATCTGAGCCTGCTCCTACAAAGCTTGTTGCAGAGATTGGTAAAAATGGTCGGAATATGACAGTCTCCAATCAAGGATCTAGGCTTGAGCATGGGTCATCTAGTGACAATTTGTGTGCCTCAACTTCTGGAAATCAACCATGGTTTTGGTTCCCAAGTCCTGATCGTAATTGTTGGGCACCGGATTTTCTTGGACGTAGTGCTGGTATGAAGGATGAACTTCCATGGAAGATCAAAGCTTCAGTCCTTTACTCAGCTCGGGCCCACCCTGGGGCTTTGCGGTCATTAGCTGTTCATGATGATGAGTTTACAATTTTTACTGGTGGAGTTGGTCCTGGTTTTAAAGGAAGTATCCAGAAGTGGGAGTTACCAAATATGAACTGCAGCTCTGGATATTATGGGCATGAAGAGGTTGTCAATTCTATCTGCATCCTGTCAATTACGGGAAAAGTGGCATCTTGTGATGGCACTATTCATATATGGAATGCACAGACAGGAAAACTCATAGCAGTTCATACGGAGTCATCTATTAGCTTTCCTCAGCAAACTGCGTCTATTGAGCAGGCAAACATGCTTAATCAGGATGCCCTCTCAGGCGGAATATTGTCAAATGCATTTCGTGGTAGTTTATATACAACTATGCATTACATGGAATCCAAAGATAAACTTGTTGCTGGTATGGGAAATGGTTCAATCAGATTTATTGATATTTCTCAAGATCAGAAGCTGCATTTATGGAAGAGTGACTCAGATGAAATCTCTTTCTCATCGCTTGTATCAGCTATTTGCTCATGTGCCTCAGACAAGCTGAAGAAAGACAGCACTGCAGCTTCATCTTCCTGGATAGCAGCAGGTTTAAGCTCTGGTTACTGTCGATTGCTCGATGAACGTAGCGGAAATATTGTTGCAGTTTGGCGAGCACATGATGGTCACATTACAAAACTAGCAGCACCAGAGGATCACTTGATTGTATCAAGCTCCCTTGACAAGACTCTTCGAGTTTGGGACCTAAGAGGGAATCTATCAACCCAGTCAAACATTTACAGAAGTCACTCAGATGGTATCATTAACTTTTCTGCGTGGGGTCAGGATATGGTATCAGTTTCAAGAAACAAAATTGCACTAACTTCCCTTTCGAGGCCAACAAGTGAGATTGGACATCAGCAGCTCACATTTCAGAACCTCTATTCGTCTGATCGAGGAGTGAAATACAAAAACATGTCTGTTCTTTCGACTATTTCTGTGCTTCCTTTGTCAAGATTGTTTGTTGTTGGAACAGAAGATGGTTTTCTCAAAATCTGCCACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVCSPEKAGAACPECLERRILSGLPGSCFSFVHGLHESPLPFASAAVVQIASDGAEECNGSQQSTGYFVLVGLHGGKALLDIQECENNSLENGSQIDLRGKESTDADDNHRKQSIINTITKLTPTQYLARAATSEIRDLISSYLNLTTEESVMNSLNLLSENKIVGSGGLDFLNFTGFSEFNDIHPSGHVRHPNILPVLGIVETYDCCYMLHPKSPYTLENIMHYSPEALWSDWHIRFLIYQIISALVYLHDFGVHHGNLKPSAIFMSDSLWPYLSISDICPVKQNCGFAELKRPALTLCCFEEDCSSRDIYSGFNLSSSLDWQSYSKRWWMGELSNYEYILVLNKLAGRRWGDPAFHTVMPWVIDFTVRPDENSDIGWRDLTKSKWRLAKGDEQLDFTYSSSEVPHHVSDECLSELAVCSYKARRLPKNILRSAVRSVYEPNEYPSNMQRLYQWTPDECIPEFYSDPRIFVSLHSEMSNLALPSWVTSAEEFICLHRNALESDRVSRQLHHWIDITFGYKLSGESSVEAKNVMLPPSDPAKPKSTGRRQLFTKPHPKRLTSTPHSTYHNKMESCAKCQGGSSSMTTGLLLKDHIPPAMSSQIDYLEEFEQANVFMKLENHLCPIYDYANDSSSCCSSVKYNKSPCSNQYIVPPESVLSVAPDFDFCSFLECFESDDSSPTGYQELLRWKQKSCSVNEYHANDIFSVGCILAEIYLHGPLFDADLLSAYKETGVLPGAIQELPIHVAVLVESCIQREWKRRPLAKHLLESQYFPPSVRSAYMFLAPLQLICTPRDRLKYVAKLASEGTLRAMGECAAEMCAPYCLPLVSPSLSDIDTEFALALLKEFVKCLSVQATKDLILHIIQKILQAGGLLGESFTVKQILPLLRNVILSCIESSKINKPEPQHSWNSFSLMDGLSALEGLVSVLPVKTILRELLQVAASALVDLCQQIGPENTATYVLPHLKELFAELAFSHESSGLSVPTKGLKFFDGNKTEPAKMESRMDLDWQPSTDHSGSSENMKGQRFRPGNYTSSEPAPTKLVAEIGKNGRNMTVSNQGSRLEHGSSSDNLCASTSGNQPWFWFPSPDRNCWAPDFLGRSAGMKDELPWKIKASVLYSARAHPGALRSLAVHDDEFTIFTGGVGPGFKGSIQKWELPNMNCSSGYYGHEEVVNSICILSITGKVASCDGTIHIWNAQTGKLIAVHTESSISFPQQTASIEQANMLNQDALSGGILSNAFRGSLYTTMHYMESKDKLVAGMGNGSIRFIDISQDQKLHLWKSDSDEISFSSLVSAICSCASDKLKKDSTAASSSWIAAGLSSGYCRLLDERSGNIVAVWRAHDGHITKLAAPEDHLIVSSSLDKTLRVWDLRGNLSTQSNIYRSHSDGIINFSAWGQDMVSVSRNKIALTSLSRPTSEIGHQQLTFQNLYSSDRGVKYKNMSVLSTISVLPLSRLFVVGTEDGFLKICH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..147#361..395#925..996#1074..3098#3224..3555#4108..4313#5646..5852#6289..6774#7623..7909#8422..8665#8774..8847#9167..9302#9468..9623#ATGGTCTGCTCGCCGGAGAAGGCGGGGGCGGCGTGCCCGGAGTGCCTGGAGCGTCGAATCCTTTCGGGCCTCCCGGGCTCCTGCTTCTCCTTCGTGCACGGCCTCCACGAGTCCCCTCTCCCCTTCGCCTCCGCCGCCGTCGTCCAGGTCTTTCCGCCACCCTATTTATCTCTTCGTTTCTGTGTGCTTAGCCTAGGCGTTGCTCCACCCTTTGGAGCTTCATTTCATATTCCTGCGAGGCTGATCCTTCCATTGCCTCCGCATTGTTAGAAATCCTTCTCTTTGTTTTAGTGGTTGTAGCTTTTTGGTTGTAGTTCTGACATGATTGTATTTTTTTTTTCGCATCTCCTGATATTGCAGATTGCATCTGATGGTGCTGAGGAATGTAATGGGAGGTAGGGCTACAGATTCTTTGGTTACAGTTACTTTGCAAATTATCTAAAACAATTACCTTTTGTGTTGATGATATTTTCTGGTAAGATGGAAAATTTAGCTGTATATGCTATTACCTCTTTACAATATCACAACATTGTACATCAGTTAGATTGTTGATCATGCAAGTATAATGGAAACAATTGAGTAAATCACTAACTGAACTGTAGCTATTTTTAGCAGTGTTATTTCAGTGCTGCTGCAAAATTCCTTATTTTTCACTTGGGAGTATCATTAAAGCACATGCTGGGGCTTTTCTTTGGACGTTTTAACAAGGTTGGGCACAAGAAAGTTTGACATTGTTAATAAGCACACCATCTGCAAAAAACTCGAAAGCCGCTTGTACATCTATGCAGTTTTTGGCTATTAGAGCTAGTTGTATCTTGTATGCTGACTCACTGATCTACGTCCTTTGTTTTCTTAACTAACTGAATTGCCCTCTTCCTTTTGTTTCGTTCCATCCTTATTCAAGTGATGCTGTATATGTTGCAGCCAGCAGAGCACTGGTTATTTTGTATTGGTGGGACTACATGGTGGCAAGGCACTTTTGGATATTCAAGAATGGTAAAGTTTCTTTTTAGGTACTATCTTTTATGCCCAAAAGGCTCCCAAGTTCATCAACATTTAATATTATCCTGCAGTGAGAATAATTCCTTGGAAAATGGAAGTCAGATAGATCTGCGGGGCAAGGAAAGCACAGATGCTGATGACAACCACAGGAAGCAATCAATCATAAACACAATTACTAAGTTAACTCCTACTCAATATCTTGCTAGAGCAGCCACTTCTGAAATTAGAGATCTTATCTCAAGTTACTTGAATTTGACAACAGAAGAGAGTGTGATGAATTCTTTAAATCTTTTGTCTGAAAATAAAATTGTTGGCTCAGGAGGCTTAGATTTTCTCAATTTTACTGGATTTTCAGAGTTCAATGATATACATCCTTCTGGCCATGTCAGACATCCCAACATCTTACCTGTTTTAGGCATTGTAGAAACATATGATTGTTGCTACATGTTACATCCAAAGTCTCCATATACCTTGGAAAATATCATGCACTACAGTCCAGAGGCATTGTGGTCAGATTGGCATATTAGATTTCTCATCTACCAGATAATATCTGCTTTGGTGTATCTTCATGATTTTGGAGTTCATCATGGTAATCTGAAACCTTCAGCCATCTTTATGTCAGATTCTTTATGGCCTTACCTGAGCATAAGTGATATATGTCCTGTAAAACAGAATTGTGGTTTTGCTGAGTTGAAGCGTCCAGCTCTTACCCTATGTTGTTTTGAGGAGGATTGTTCTTCAAGGGACATTTATTCTGGTTTCAATCTGTCATCATCCTTAGATTGGCAGTCTTACTCTAAGCGATGGTGGATGGGTGAATTGAGCAACTACGAATATATTCTTGTCTTAAATAAGTTAGCTGGTAGAAGATGGGGTGATCCAGCTTTTCACACAGTAATGCCTTGGGTAATAGATTTCACAGTGAGGCCTGACGAAAATTCTGATATTGGTTGGAGGGACCTCACCAAAAGTAAATGGCGGCTGGCAAAAGGTGATGAACAACTTGATTTTACTTATTCATCATCTGAGGTTCCACATCATGTTTCTGATGAGTGTCTCTCAGAGCTAGCAGTTTGCAGTTATAAAGCAAGGAGGCTACCAAAGAACATCTTGAGGTCTGCTGTGCGTTCTGTTTATGAGCCCAATGAATACCCATCTAACATGCAAAGGCTATACCAATGGACTCCTGATGAGTGCATTCCAGAATTCTATAGCGATCCTCGGATATTTGTCTCTCTTCATTCCGAAATGAGCAATTTGGCTTTACCTTCCTGGGTGACTTCTGCAGAGGAATTTATTTGTCTGCACAGGAATGCTTTAGAGAGTGACCGAGTCTCGCGACAACTGCATCATTGGATTGACATAACCTTTGGGTATAAACTTTCTGGGGAGTCATCTGTTGAAGCCAAGAATGTAATGTTGCCTCCTAGTGATCCAGCAAAGCCTAAATCAACTGGGCGGCGCCAACTTTTCACGAAACCGCATCCTAAGCGACTTACTAGCACACCTCACTCTACCTATCATAATAAAATGGAATCTTGTGCTAAATGCCAGGGGGGATCAAGTAGCATGACTACTGGTCTACTATTAAAGGACCACATTCCTCCAGCTATGTCATCACAAATTGATTATCTGGAAGAGTTTGAGCAAGCAAACGTGTTTATGAAGCTTGAAAATCATTTGTGTCCAATATATGATTATGCTAATGATTCTTCTTCTTGTTGCTCTTCAGTCAAATATAATAAGAGCCCTTGTTCAAATCAGTATATTGTGCCTCCAGAGAGTGTGCTATCAGTGGCGCCTGATTTTGATTTTTGTTCTTTTCTTGAATGCTTTGAATCCGATGATAGTTCTCCAACGGGTTATCAAGAGCTGTTGCGTTGGAAGCAAAAGTCTTGTTCAGTTAATGAGTATCATGCAAATGATATATTTTCTGTTGGGTGTATCTTGGCAGAAATCTATCTGCACGGACCACTTTTTGATGCTGATCTCCTATCTGCATATAAAGAAACTGGCGTACTGCCAGGAGCAATTCAAGAATTGCCTATCCATGTTGCTGTTCTTGTTGAGTCATGCATACAGAGGGAATGGAAAAGGTATCACAAATTTGTCTGTTGTTTGTAATTTATAGTTTTGTATGTCATCATGACCTGTGTTTTTTCCCCTTGATTTTTTAAAAAGAAACTATTAGACCTTTTTATGAACTTGTGATATTTTGCAGGAGGCCACTGGCAAAGCACCTTTTGGAATCACAATACTTTCCTCCATCCGTTCGATCTGCATACATGTTTCTTGCTCCACTTCAACTTATATGTACACCTAGGGATCGCCTTAAGTATGTTGCTAAGCTTGCAAGTGAAGGAACACTTAGAGCTATGGGGGAATGTGCTGCCGAAATGTGTGCACCCTACTGCCTACCTCTTGTTTCACCATCTTTGTCAGATATTGACACCGAATTCGCCTTGGCTCTGCTTAAAGAATTTGTGAAGTGCTTAAGTGTCCAAGCAACTAAGGATCTTATACTTCACATCATTCAGAAGATCTTACAGGCCGGTTAAAATATCACTACGAAATATTCTCATGTAGCTTTCTTCCATTTCTGGGTCTTGATGTGTGCAATATAGTTTTTATTTATTCCAACAAGTCCTTTTTACTTGTTGTAGGCACCAGAATATTCACATCTGAAGGTTTCCTTGCTTCAAGATTCATTTGTGCGTGAGTTGTGGAAAAAATTGGGAAAACAAACTTATATTGAGAAGGTGCATCCTTTGGTGATCATGAACCTGTACAATTCACCTAACAAGATTACTGCCTCTGCTGCGTCTGTTGTTTTAATTGGTTCAAGTGAGGAACTAGGGATACCAATAACTTTTAATCAGGCAAGTCTTGTTACTACCTTTGCTTTTTTGTACCACCGTAATCCTATGTATTACTAATTTATTCTTCATTTTATCCAGACAGTTTTACCGATAATCCAGTGTTTTGGCAAAGGTTTATGTCCTGATGGAATTGACACATTGGTCAGGATAGGTAACCCAATTAACCCTTTTTCCTTGTGATGAAGCTGTTAGTTCTTTGAACAGTAGTTGACATTAGTCATTACAGGTGGACTTCTCGGAGAGAGTTTTACTGTCAAGCAAATTCTTCCCTTACTTAGGAATGTTATACTCTCATGCATTGAATCCTCAAAGATCAATAAGCCTGAGCCACAACATAGTTGGAATTCTTTTTCCCTCATGGATGGTTTATCTGCATTGGAAGGCCTTGTATCAGTTCTACCTGTCAAAACAATTCTTAGAGAGCTTCTTCAGGTATTTTGGTGGCAAACATAATTGAATTAATGACAATAAGGGGGGCAAAATGGATTGATTTTGGATTCTCTTGAATCACTACTAACTGAAGCAGTTAATTTTGAAACTGATCCAATTTCATACTCAGTTATCACTTGCTTGAGAACTATTTGATGATTAGGCGATACCAATTCTATAGTTAAAAACTTTTAATAAGGGCATAAGGTCTAATTGAAATCTACTACCTCTGTCCCATAAAAAAATGAATTTATAGGATATAAGGACAGATTAGGAGGATAGGCAGATAACCACAGTAACCTTATATAATAAAATAAACACAGTACATGCACACATTCCATATATAAACTTGATTAAAAGGATGTTGAGACAACGGGTTAGAGATGGGATGGAAAGAAGGGAGATTACAAGGAAACATATTTTGATGTAATCAGTTTGCTGGGTCCCACATTAGTAGAAATACAATTTTTATGGGACGTAGTACATTTTAATGCCCAAATGCAAAACCAGATATTGGACAACTCTCACTATCCATACCTTG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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA001759