Difference between revisions of "BGIOSGA001893"
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Revision as of 18:13, 20 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001893 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001893, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0278200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001893-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001893-PA |
| Length |
15769 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:10733058..10748826 |
| Sequence Coding Region |
10748673..10748826,10747725..10747753,10746484..10746570,10746101..10746166,10744684..10744798 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:10733058..10748826 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:10733058..10748826 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAGACCCACCCCGACCTCCCAAGCGCACGCCTCCGATCCTCTCGCCTTAGACCTAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGAAAGTGAGCCCTCCCCCCGACGCGCACACACACCCCCTCCCGATTCCGGTGGGCGCGCGCGGGGGAGACAACCAAGATAACTCTACCCAGGCTGAGTTGTGGCTGCTTGTCTGTCGAATTACAAAATTTGGATGGTTTGATGATGATAAATTCAGAGATATTGTCAAGGAGGCAGCTGATTTCTTATCTCTTGCATCCCAGGATCATTATTTCATAGGATTGAAGATACTATATCATCTTGTAGGAGAAATGAACCAGGCAAACGCTATGCCTTTGACACTTCACAGAAAAATTGCTTGTTCGTTCAAGGACCAGTTTCTTCTACAGATCTTCCAAATTTCTTTAACCTCATTACACCAACTGAAGAGTGAAGTACCTGATGACTTTAGGCGTGATCCCCTCTCGCTTGCATTAAGGTGCTTGTCATTTGACTTTGTTGGTTGTCCTGTGGATGAAAGCTCTGAGGAATTTGGTACAGTGCAGCTTCCTGCATCTTGGAGGCCTCTCCTTCAAGATCCTTCTACTGTTCAGATCTTCTTCGATTACTATAAAGTCAACGATACATGTGTTTCAAAAGAGGCTTTGGAATGTCTTGTGAGACTTGCTTCTGTCAGGCGCAGTATTTTTGTTGAGGACCCTTCAAGGACCCAGTTTCTTTCTCATCTGATGTCAGGCACAAAGGAGATACTCCAAACTGGCCAAGGTCTTGCTGATCATGGAAATTACCACGAGTTCTGCCGTCTTCTTGGACGGTTCAAAGTGAATTTCCAGTTGTCAGAGCTTCTGAGTATTGAGTTTTATGGTGAATGGATTGGTTTAGTAGCAGAATTCACAACTAAATCCTTGTTGTCATGGCAGTGGGCCAGCAATAGTGTCTACTATCTTTTGAGCCTTTGGTCAAGGCTGGTGACATCTGTTCCTTACTTGAAAAGTGACACACCAAGTATGCTTGATGAGACTGTTCCCAAAATCACGGAGGGTTTTATCACCTCTAGAATTAATTCTGTTCAGGCCAGCTTTGCAAACGACTCATCCGATGATACTTTGGATAATGTGGATGTTCTTCAGGAGCAGTTGGAGTCTCTTCCTTACCTTTGTAGATTCCAGTACCAAAACAGTAGCATTTACATCATAAATATTATGGAGCCTCTTCTACAAGCTTATACGGAAAGGTCAAGATTACCAGCTCCTGGAGATGCGAATGAGCTCTCTGTCATTGAAGGACAGCTCACATGGCTAGTCCACATAATTGCAGCCATTCTCAAGATTAGGCAGACCATTGGTTGTAGCCAAGAATCACAGGAGTTAATTGATGCAGAACTTGCAGCCCGTGTGTTACAGTTGATAAACGTTACTGACACGGGGGTGCACGCACAGAGATATCGAGTATTAAGTAAGCAAAGACTTGGTCGTGCTATTCTTATCTTTGTGCAAAATTTCAGAAGGTCATATGTAGGAGATCAAGCCATGCATTCTTCAAAGCAGTTGTATGCAAGATTATCTGAGCTTCTTGGATTGAATGACCATTTAGTTTTACTCAATGCCATTGTTGGGAAAATAGCTACTAATCTAAAGTGCTATGCTGAGAGGGATTCTTTTCCATTTCTTGAAGAATACAGATGTGCCCGCAGTAGAACAACATTCTACTACATCCTTGGCTGCTTGGTTTTCATGGAAGACACCCCAGTAAAATTCAGGAGTTTCATGGAGCCTCTCCTACAAGTTGCAGTTAATTTGGAGGCAACCGCTGATGCTGCTTTCTGGACTGATGTTGTGAAGTACGCATTTATTGGTTTGATGAGAGACTTACGAGGCATTGCTATGGCCACAAACAGCCGCAGGACCTATGGCCTCCTATTTGACTGGCTATATCCATCTCGCATGCCACTTTTACTGAAAGCCATCTCACTCTGTGCTGATGAGCCGGAGGTCACCACACCCCTACTCAAGTTTATGTGCGAGTTTGTTTTGAACAAAGCTCAGAGATTGACATTTGATTCATCATCACCAAATGGGATCCTTTTATTCCGGGAGGTTAGCAAGCTGATTGTGGCTTATGGATCACGTATTCTGTTGCTTCCAAACGGCACTGATATTTATGGAAGTAAATACAAAGGCATATGGATATCACTTGCTGTTCTTTCAAGAGCTTTATGTGGAAACTATGTCAATTTTGGTGTATTTGAGCTGTATGGTGACAGAGCACTTGCTGATGCCCTTGATATATCTTTAAAGATGAGCCTCTCAGTTCCATTGTCTGACATATTGGCATTCAAAAAGCTGTCAAAAGCATTCTATGGATATATTGAAGTTCTGTTCAGCAGCCATATCACTTTTGTTCTCAATTTGGATACAAACACCTTCGTGCATATTGTCAGCACTCTTGAATCTGGCTTAAAAGGTCTAGATACAGGGATATCAACACAGTGTGCCTCTGCCATTGATAGCTTGGCGGCCTTTTATTTCAACAATATCACAGCTGCTGATGGCCCTCCTTCACCAGCTGCACTAAATCTTGCTCGGCATATTGGAGAGTTCCCCACTTTATTTCCTCAGATACTGAAGACGCTTTTTGAGATCATCATCTTTGAGGATGCGGGTAATCAATGGAGTCTTAGTAGGCCAATACTGAGTCTGATAATGATCAGTGAACAGATGTTTAGTAATTTGAGAGCACAGATATTAGCATCACAGCCTGTAGACCAGCAACAACGCCTTTCGCAATGCTTCGAGAAGCTGATGTCTGATGTTGCTAGGAACTTGGAACCAAAGAACAGAGATAAATTCACTAAAAATCTTACAACATTCAGGCATGATTTCCGTGTGAAGAACATTCAGGCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQTHPDLPSARLRSSRLRPSRRRLRRKVSPPPDAHTHPLPIPVGARGGDNQDNSTQAELWLLVCRITKFGWFDDDKFRDIVKEAADFLSLASQDHYFIGLKILYHLVGEMNQANAMPLTLHRKIACSFKDQFLLQIFQISLTSLHQLKSEVPDDFRRDPLSLALRCLSFDFVGCPVDESSEEFGTVQLPASWRPLLQDPSTVQIFFDYYKVNDTCVSKEALECLVRLASVRRSIFVEDPSRTQFLSHLMSGTKEILQTGQGLADHGNYHEFCRLLGRFKVNFQLSELLSIEFYGEWIGLVAEFTTKSLLSWQWASNSVYYLLSLWSRLVTSVPYLKSDTPSMLDETVPKITEGFITSRINSVQASFANDSSDDTLDNVDVLQEQLESLPYLCRFQYQNSSIYIINIMEPLLQAYTERSRLPAPGDANELSVIEGQLTWLVHIIAAILKIRQTIGCSQESQELIDAELAARVLQLINVTDTGVHAQRYRVLSKQRLGRAILIFVQNFRRSYVGDQAMHSSKQLYARLSELLGLNDHLVLLNAIVGKIATNLKCYAERDSFPFLEEYRCARSRTTFYYILGCLVFMEDTPVKFRSFMEPLLQVAVNLEATADAAFWTDVVKYAFIGLMRDLRGIAMATNSRRTYGLLFDWLYPSRMPLLLKAISLCADEPEVTTPLLKFMCEFVLNKAQRLTFDSSSPNGILLFREVSKLIVAYGSRILLLPNGTDIYGSKYKGIWISLAVLSRALCGNYVNFGVFELYGDRALADALDISLKMSLSVPLSDILAFKKLSKAFYGYIEVLFSSHITFVLNLDTNTFVHIVSTLESGLKGLDTGISTQCASAIDSLAAFYFNNITAADGPPSPAALNLARHIGEFPTLFPQILKTLFEIIIFEDAGNQWSLSRPILSLIMISEQMFSNLRAQILASQPVDQQQRLSQCFEKLMSDVARNLEPKNRDKFTKNLTTFRHDFRVKNIQA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..154#1074..1102#2257..2343#2661..2726#4029..4143#4243..4352#4450..4545#5062..5185#5552..5619#6763..6849#6942..7094#7192..7287#8411..8470#8546..8667#8751..8838#9485..9589#9694..9798#10168..10302#10464..10576#10646..10739#10881..11100#11953..12083#13003..13149#13715..13843#13921..14019#14165..14203#15620..15769#ATGCAGACCCACCCCGACCTCCCAAGCGCACGCCTCCGATCCTCTCGCCTTAGACCTAGCCGCCGCCGCCTCCGCCGGAAAGTGAGCCCTCCCCCCGACGCGCACACACACCCCCTCCCGATTCCGGTGGGCGCGCGCGGGGGAGACAACCAAGGTATACTTGGGCTGGCCTCCTCCCCCCCTCCCGATCGCTCCCTTCGGGAAGGTTTGGGGTGGGGGAGGCCGACGCCGTCATCCGTTCCGGGCGTTGGTTGCCGCTGGCGATTCGCCGGCGGGCGGCGTTGACTCGGGCTCCGGGCGGGGGCTCCGGGCGCCTTCGCTGTGGGGGTTTTAGGACTCGGACACTACCCGTGGAACTTGTCGTGGACTTGGTTGCTCGTGGACTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGTGGGGGGGGGGGGGGTTAGGGGATCTTGCGGTGGCGCTCTGCTCGTCGGATCTCTCGACGGTGTTGGGTTTGGTTAGTGGGGCGCTTTGGTGGTGGGTAGACGGTACCTTGGTTTGGTTCGCGGGTTGTTGTTGGATCTTGTGCTTGCTGCCTGATGTGCGTTTGCGTGCCTACATCCTTGGAGGGGTGGTTGCGATAGGGCGATTTCGCTGTACGGATGCTTTTGCTGCGCAATCGGATTGGTGATTAGGGGTTTGGAACTCCGTGTGATGCTTCTGCTGATGTGCATGCATGCGGATAGCATGTTTATGTTGTTTTTGCGGTAGGATTGCGTGACAAATGTGGCATGTATTTTCTTCTTACATGATTGTCCTTTTTCATCTTGTCTTCGCGTGCTACACTTCCGGCCCAGATGTAATATAGGTGCATGTTTGCGCGCACTTTAGTATGAAACAGCTTACCAAATGTAGCACGAAGCTTTTTGTTACTCTCGAATGCTTCCGTTACCTGTGCTGTAACTGTTGCATATGTTTGTGTTAGTGCTCATTTAAGCGTGTTATGAACTAGAAATGCTTAGTCAAGTTCCAACAAAAAGTTCTTCTTAGATGATTATTCTGCCATTGTGCTGCTTTAGCTGTCACTGAGTTTGGCATTTCCACTCTTGCAGATAACTCTACCCAGGCTGAGTTGTGGCTGGTATTGGCGATATAAGCTTGTTAGCTGTTTTCTCTTGTGTCTTTGGTCTTCATCTTTGATTACGCGTCATTGAAAAGACTGTACATGAGAAAACTCTTTTGTTGAAACATTTCTCTTGTAATATGAATGGATTGAGTTTGTGACTATCCTTCTCCTGTGCTAGAATCATATATTTCTGCTTCAAAGCTCTTGTGGTACTTTTCAAGTTTCCTGTTGAACCGAATACCTAGTGCATTAACTCTAAGCTTGTGACAAACATTCATGCAAATTCGTGGATATTAACATTGGATACTTGGTCTACTGGAAAATTGGAGCTCCTTATTCATGTCATCAATGGAGAGCCTAGCACAGTTAGAGCTGTTATGTGAAAAGCTTTACAATTCTAGAGACTCCGCTGAGCGAGCACATGCAGAAAACACCCTCAAGTGCTTCTCGGAGAACAGTGACTACATTTCACAGTGCCAATATATATTGGACAATGCCTCAACACCATATGCCCTGATGCTGGCCAGTTCAAGCTTGTTGAACCAAGTCAACGACCGCAGTCTTTCATTGCAATTGCGTCTTGATATCTGTAATGTTCCTTACCAAAAATTTATCATGAAATCAGTTGTTCACCTGTTTTTGCTTTTCTATTGCATCTGCATGGCATGTTTTCATTTACGTCTCTACCAATTTATTCAGTTATGATTATTTCTGCATTGCAAGTTACCACAGAAAGCAGTAAGCACTCGTTTGTACTGCTATTTAGTATAAGTGGCCATATTTAAATCTTTGTTGTTCCTTCCTTGACTCAACTTATTTCTGTTGCCTTTGATGTCTTATGCTTATTTAATATGGCTCGAGTTGAACAAACAAATATTTATTCTTTGCATTCTATCCTTGAATTCATTTATGCCTCTGCAGCATGTTAGAATGGCCAAATATTTATTTCCATTTACCCATTGTTGTTTTATGCATCGGTAATGTAGCTAAATTGCAAAAATACATGTCTATAAACAATGCTTAAATCTATTTTGTGTACTTTTGTGCCCTTGTCTACTGCTAATTTTAAACCAATATATTGTGATCTGTTTGAAGCGAATTATGTCATAAACTATCTTGCTATGAGGGGACCTAAACTGCAGACGTTTGTGATTAAATCCCTAATTCAGCTTGTCTGTCGAATTACAAAATTTGGATGGTTTGATGATGATAAATTCAGAGATATTGTCAAGGAGGCAGCTGATTTCTTATCTCTTGTAAGTTTGTTGTCTGTTTTGTTGGCATTTAGTTGAGAGCTTTTTAACCGTTGATAACATATTTAAGGACTATGTACCTTCGATTTGAGTGGAGCTATACACCTTGGTACATAAATCCTTGGCAATTTCTATGACCAATGCCCGTTCTTTAGAACTAAGTAATATGAAAAAGGATAACCGGCCTACCAGATAAATCTACATAAGAACCTGATTTCTATTAAAGAATCCATATGAGGAACAGTTATAGGTTTTATTCCATGCTCTATTGCGAGTTAATTGATGCATACTAAAGTTGCTGCTTATGCTTTTCATTTCAGGCATCCCAGGATCATTATTTCATAGGATTGAAGATACTATATCATCTTGTAGGAGAAATGAACCAGGTGCCACCTAGAAACTTCTCTATTATTATAATTGTTCAATAACTATTGATTCTAATCAATAAGATAAGGGTACCCATAAGATAATGCAATTTGGCAATACATAGATTAATTTAAAAGTTGAAAAAAAATATTTCAACAGTATTTTTTTTGTGTTTAGAACTGCACAACGTGCATGGTGTTGTTGGCACTTATAAAACATCGGATGAAACACAGAAGGTCAAACGTACATGAAACACTACATATGCACTAACTTGTGCATGAATCAATTAATATCATAAGTAAAAGTTGTTCTTTATTTTCCTTTGCGACACTTAACAAAGAGTTATAAACATGCAGATAGACATATATAGGCATAGTATTATTGAAAAAATATTAATGGTTAATCCAACCAATGTTAACAAGCCAAAGTTAAACATTGACACTGATGGTTACTGTATTAATTTCCATTTATTTTAAAGAGTATTGGCGGCAATATGATACTCCCTCCTTCCCTAAATGTTTGACGCCGTTGACTTTTTTAGACATGTTTGACCGTTCGTCTTATTTAAAAACTTTTGTGAAATGTGTAAAACTATATGTATACATAAAAGTATATTTAACAATAAATCAAATGATAGGAAAAGAATTAATAGTTACTTAAATTTTTTGAATAAGACGAACGGTCAAACATTTTTAAAAAAGTCAACGGCGTCAAATATTTTGGGATGGAGGGAGTATGTGGCACCTTACTAAATTGTGTTGGGGTAGTGTTGGTAGCATTCCTTTTTACCTGCTTGGAGCTGTGATGCACATTTCAGCCTTTTTACTGTCCCACCTTTCTGTTAGCCTGTCACTTCTTTTTATGCCTTCCTTCTTCATCTTAACTTTTTCTGGTATAGTTTCTTGAATATGATTGCATGTCACTGTATTTCTTGTAATGTTGAGTTTCATTTTATTTAACATGAAATAACACAGATTGCTTGCTTAGTACAAGAAAGGGTTCTAGTTCTACAAATATCTTCTATGAACTGTTTCTCTTTTTTTCCGTTAACAATTCTTTCAATGAATAGTTGATTTGGACCATTAAGCTTTCTCAGTATGTACTTGGCTTCATACTTTTTGCATGCTGTCTTCTGCTTATGAATTATATAGTGTTTGTTAATATCTTCAATTCTGATTGGGTTATGTACTTATGTTGTTGCTTATATCTTTTCAATATAGTTTATACTGCTGTGCCCATTTTTATCCACTCTTGTTCAATTTCCTTTGTCAGGTGGACTGTAATGTGTTTAGCTGACTTTTTGTGTCTGTGTATGCATGCAGGCAAACGCTATGCCTTTGACACTTCACAGAAAAATTGCTTGTTCGTTCAAGGACCAGTTTCTTCTACAGATCTTCCAAATTTCTTTAACCTCATTACACCAACTGAAGAGTGAAGGTAAAGTTCAAGGACCACATTTTGTAAAAAGTAGAGTGTATCGGAATGCCCACACTTTCTCACTTCCATCTTCTGATACAATCTGTAATTAAACTGCAGTACCTGATGACTTTAGGCGTGATCCCCTCTCGCTTGCATTAAGGTGCTTGTCATTTGACTTTGTTGGTTGTCCTGTGGATGAAAGCTCTGAGGAATTTGGTACAGTGCAGGTATGTTAGTTTGCACAATTGTTATCTTCTCTGTAAAACCATTGACCTATCCCAGTTGGTCTATTTCTTATAATTTGTGTAAATTTTATTGATGCAGCTTCCTGCATCTTGGAGGCCTCTCCTTCAAGATCCTTCTACTGTTCAGATCTTCTTCGATTACTATAAAGTCAACGATACATGTGTTTCAAAAGAGGTATACATTGATTGGGTGATTTGAATAATATAGATGATATAATCTCTGATTATTTTTACCGAGTGCTTTGTCCATTACTCCATAAACACAAAAGAGGTATATTTTGCTTCATAGTTCCTCATGTTTAG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