Difference between revisions of "BGIOSGA004534"
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Revision as of 18:30, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004534 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004534, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03914 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004534-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004534-PA |
| Length |
21941 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:35918761..35940701 |
| Sequence Coding Region |
35918761..35918865,35920528..35920713,35921020..35921109,35921722..35921795,35921953..35922030 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:35918761..35940701 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:35918761..35940701 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCTTCATGGCGGCGCTGGAGGCCGATCTGCGCGCGCTCTCCGCCGAGGCTCGCCGCCGCCACCCCTCCGTCAAGGACGCCGCCGAGCACGCCATACTCAAGCTCCGTTCTCTATCTAGTGCGATGGAAATAGCTCAAAATGAGGATATATTGCGGATGTTTCTGGTGGCATGCAGTGTTAAATCAGTGAAGCTGAGTGTAATAGGACTATCCTGTTTGCAAAAGCTTATATCTCATGATGCTGTAGCTTCTTCTGCATTGAAGGATATACTGACTACTTTGAAGGATCATGCAGAGATGACAGATGAGATTGTTCAACTTAAGACTTTGCAAACAATTTTGATTATTTTTCAGTCGCACCTACAACCTGAAAGCGAGGTGAACATGTCTCAAGCACTTGACATATGCCTTCACCTACTTGAAAGCAACCGTTCTTCTGACAGTGTCCGCAATAAAGCTTCTTCAGCAAGACTCAGTTCACGTGCTAGCTCTGTTGCTGATAATGTCACTCGTAGCTTCAGCCACACACTGTCATTAGGGAGGAACTCTGTGGAGCCTACCGTGAGGGAAAAACTGAGCAATGTTGGCAAGCTTGGTCTCCGTTTACTTGAAGACCTGACAGCTCTTGCTGCAGGTGGATCTGCTACGTGGCTTCGTGTTTATTCATTGCATAGGACATTTGCCCTTGACATTCTTGAGTTTGTGCTATCAACATATGTTTCTGTATTCCGGGCATTGTTACCTTACCAGCAGGTCTTGCGGCATCAGATATGCTCGCTTCTTATGACTTCACTCCGTACAAATGTGGAACTTGAAGGTGAAGCAGGGGAACCTGCCTTCCGTCGTTTAGTCCTACGTTTGGTAGCTCATGTCATCAGACTGTACAGCTCTTCACTTGTTACTGAAAGCGAGGTTTTCCTTAATATGCTCGTAAAGGTTACTCGTCTGGACTTACCATTATGGCATCAGATACTCGTTCTTGAAATTCTAAGGGGTTTTTGTATAGAAGCCCACACACTGCGATTGCTATTTCAAACATTTGACATGAATCCTACAAATACTAATGTGGTGGAGAATATAGTCAGAGCACTTGCTTTGGTGGTAGCCACTATTCAGGCTTCAGACTTAAGTGAAGAGACTCTAGCAGCTGTTGCTGGAATGTTCAGCAGTAAAGCTAAAGGGATTGAGTGGAGCATGGATAACGATGCATCAAACGCTGCTGTTCTGGTGGCTAGTGAAGCACATACCATAACTCTGGCTCTTGAAGGCCTCTTAGGTGTAGTTTTCACTATTGCCACTTTGACTGATGAGGCTTTAGATGTCGGCGAGCTTGAATCGCCAAAATGTGAATTGGGTAGTACAGAATGCTGTGGACAATTGGCTCTACTTTGTGCGGCTATGGTCAACTCATCATGGCTAACCATCCTTGACTCTCTTTCACTTATTTTGATGAGGTCAATCTTCAAAACTACCTTTCCTATTATTGCCTGTGGAGTTCTCCGTGCTATAGAACCCTTAAACTCTTTTCTAGCATCACTTTGCAAGTTTACCATCAATAACCCAAATGAAGGGGAGAAGAGAAGCATTGTACTCTCTCCTGGATCAAAGAAGGTAGAGATGTTAGTGGATCAGCGTGATAGTATCATTCTAACACCGAAAAATGTGCAGGCCCTGAGGACACTTTTCAATGTGGCACATCGGTTACACAATGTGCTTGGTCCTTCCTGGGTTTTGGTCTTGGAGACTCTTGCAGCACTTGATAGAGCTATCCATTCACCACATGCTTCAACCCAGGAAGTGTCTGCTTCTGTTTCAAGACTCTCAAGAGATACATCTGGACAGTACAGTGACTTCCATATTCTCTCATCTTTAAATTCTCAGCCTTTTACAGGAGTTGAACCAATTTGGGACCAAATTGCTGCTCATCATCTTGAGGGCATCAGTTCAGCTCCTCATCATTTTCAAGAGGAAAAATTGCTCAAAGAAAGCGAAACTGTATCATTTGAGTATGCTGTTTTATCTCCATTGGTGATCCTCTATTCCTCCAACAAGAATATTGATGTTCAAATGGGTGCACTTAAAATACTACTGCATGTTCTTGAGAGACATGGAGAAAAACTGTCCTATAGCTGGCCTAGCATTCTTCATATGTTGAGGGCTGTTACTGACGCATCAGAAAAAGATCTTATCTCCTTGGGTTTTCAGAGTATACGTGTGATAATGAATGAAGGATTGGCAACCATTCCTGTGCAATGCCTTGATGAATGCATTTTGGTAACCGGAGCTTATGGCACCCAGAAAACTGACATAAACATAAGTTTAACAGCAGTTGGCCTTTTGTGGACTGCTACTGACTTTGTTGTGAAGGGATTAATAAGCAAATCTGCTGAGAAAGCAAATGGCATGGATGAAGAAGCTGAGTCTGGTGGAGCAGTGAAAGAGGAAGTGCTATCTTCCAGTGAGAAAGACATCAAACAAAGTCCTCTAAAAAGTGTGGTTGATTATAATAAACTTTTCTTCTCAGTGTTTTCTGTGCTTCAAAAACTGGGCGCGGATGATCGTCCTGAGGTTCGGAACTCTGCAGTCCGGACTCTCTTTCAGACACTCAGCACCCATGGGCAAAAACTTTCGAAAACCATGTGGGAGGATTGTCTCTGGATATATGTTTTCCCTATGTTAGAGCGTGTTTCCCACTTGGCATCTACTTCGTCTAGAGATGAGTGGCAAGGAAAGGAACTTGGAACTCGAGCAGGGAAAGCTGTTCATATGCTTATCCACCACAGTCGAAATACAGCACAAAAACAATGGGATGAAACTATCGTTCTTGTACTAGGTGGCATAGCACGACTTTTGCGTTCCTTTTTCCCTTTCCTCCAGCAATTGAGCAAATTTTCTTCTGGTTGGGTGCTTTTGCTTGATTTTGTCAAAAATGGTATCCTAAATGGTAGCAAGGAGGTCGCTCTTGCAGCTATAAATTGTTTGCAGACGTTTGTTGGCTCAAACTGTTCAAAGGGCAATCTAGAATCCTCCTATGTCAAATCTGTTCTTGATATTTATGAACTTGTTCTTCAAACTTCGCCAAATTATAAGAATGACTCTGCTGATAAAGTGAAGCAAGAGGTTCTTCGTGGTCTTGGAGATCTCTATGTTCAAGCACAATCTCTGTTTAATGATGAAATGTATCTAAGGCTCATGGCCGTTATGCATCTGATGATTAAGAGTTCCATGAATCCTACAGATTACGATAATGAATTGGGTAGTATCCCTGCTCTGCAACGAGGTATCTTGGAAATTATTCCTATGCTACGCCCAACAACTATGTTATCTTCAATGTGGTCACCTCTCCTCCTCGAACTACTGTGCTACCTTAATAGCCATGATACTCCCCTGCAGAAACAGGGTAAAGAGATGCATGAACAGAAATCTGATGCAGCAAATGGTGCAACACATGGTTTTCTTGAACAGAGTCATCTCAATAACAGCAGCACAAAAATGGATAATGCAGTGGGCTGTGGCTGGGGTATTATGTTCATAGAAAAGCTTGTGCCGATTGTTGTCAACCTATTTCTGGAGGCTCCACAGAATGAAAGGTTTAATTCCTCTCCGGAAGTTATTCGATGTCTTGGAAGGTGCATGAACACAAGAAGAGACAATCCAAAGGGTACACTTTGGAGAGTTTCTGCTGAATGCTTCAATCGTGTTGTGGTAGATGAAGTGACACATGACAGCGCTGATTGTAAAAGCGGCATGAGTTCATATAAATTTTCTAGAGCTCGTTTCTGGAAGGAGGTTGCAGATGTGTATGAAACCTTTCTTGTTGGATCTTGTGGACGTGTGCTGTCGTCAGATGTTCCTTCGGTTGACTCTGTTACTGCTGATGAGACTCTTGAGATGGCTGTACTCACTGTTTTTGGAGACAACGTTCTGAAATTGCAGAAGGATGCTCCTGTTGAGGTATTACAAAGACTTGTGAACTGCCTTGATCACTGTGCATCACGAACAGGATCCTTGCCTCTTCAAACCGTTGGCCTTGTACCTTTGCACTGCAGCAGATTTTCACTGAGCTGCTTGCAGATGATGTTTTCTTTATGCTGTTGTACATCGGGGACAAGCTTATGTGCTACAGTATCAGAAACCAGCAAAGTATCGATCTCAGTTCTTACGAAGCGGTGTGAGATTATACTGGGTCAGTTTTTAGCTGATGAAAATGATCTAGGAGAAGGACCATTGCCTAGTGTAAGGATTGATGAGACAATTTGTGTTCTACAAGAACTCGCTAGACTAATAATAAACATGGAAACAGCTAATGCCCTCAGCATGCCATTATATCTAAAAGAAGCTTTAGAGAAGAATGAGTCCCATGGACGGGCTCATTTATTGGCTTTGCTACCAACCTTTTCTGAGCTTGTTGTCTCAAGGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAFMAALEADLRALSAEARRRHPSVKDAAEHAILKLRSLSSAMEIAQNEDILRMFLVACSVKSVKLSVIGLSCLQKLISHDAVASSALKDILTTLKDHAEMTDEIVQLKTLQTILIIFQSHLQPESEVNMSQALDICLHLLESNRSSDSVRNKASSARLSSRASSVADNVTRSFSHTLSLGRNSVEPTVREKLSNVGKLGLRLLEDLTALAAGGSATWLRVYSLHRTFALDILEFVLSTYVSVFRALLPYQQVLRHQICSLLMTSLRTNVELEGEAGEPAFRRLVLRLVAHVIRLYSSSLVTESEVFLNMLVKVTRLDLPLWHQILVLEILRGFCIEAHTLRLLFQTFDMNPTNTNVVENIVRALALVVATIQASDLSEETLAAVAGMFSSKAKGIEWSMDNDASNAAVLVASEAHTITLALEGLLGVVFTIATLTDEALDVGELESPKCELGSTECCGQLALLCAAMVNSSWLTILDSLSLILMRSIFKTTFPIIACGVLRAIEPLNSFLASLCKFTINNPNEGEKRSIVLSPGSKKVEMLVDQRDSIILTPKNVQALRTLFNVAHRLHNVLGPSWVLVLETLAALDRAIHSPHASTQEVSASVSRLSRDTSGQYSDFHILSSLNSQPFTGVEPIWDQIAAHHLEGISSAPHHFQEEKLLKESETVSFEYAVLSPLVILYSSNKNIDVQMGALKILLHVLERHGEKLSYSWPSILHMLRAVTDASEKDLISLGFQSIRVIMNEGLATIPVQCLDECILVTGAYGTQKTDINISLTAVGLLWTATDFVVKGLISKSAEKANGMDEEAESGGAVKEEVLSSSEKDIKQSPLKSVVDYNKLFFSVFSVLQKLGADDRPEVRNSAVRTLFQTLSTHGQKLSKTMWEDCLWIYVFPMLERVSHLASTSSRDEWQGKELGTRAGKAVHMLIHHSRNTAQKQWDETIVLVLGGIARLLRSFFPFLQQLSKFSSGWVLLLDFVKNGILNGSKEVALAAINCLQTFVGSNCSKGNLESSYVKSVLDIYELVLQTSPNYKNDSADKVKQEVLRGLGDLYVQAQSLFNDEMYLRLMAVMHLMIKSSMNPTDYDNELGSIPALQRGILEIIPMLRPTTMLSSMWSPLLLELLCYLNSHDTPLQKQGKEMHEQKSDAANGATHGFLEQSHLNNSSTKMDNAVGCGWGIMFIEKLVPIVVNLFLEAPQNERFNSSPEVIRCLGRCMNTRRDNPKGTLWRVSAECFNRVVVDEVTHDSADCKSGMSSYKFSRARFWKEVADVYETFLVGSCGRVLSSDVPSVDSVTADETLEMAVLTVFGDNVLKLQKDAPVEVLQRLVNCLDHCASRTGSLPLQTVGLVPLHCSRFSLSCLQMMFSLCCCTSGTSLCATVSETSKVSISVLTKRCEIILGQFLADENDLGEGPLPSVRIDETICVLQELARLIINMETANALSMPLYLKEALEKNESHGRAHLLALLPTFSELVVSR</aaseq> |
| Gene Sequence |
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