Difference between revisions of "BGIOSGA004801"
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Revision as of 18:32, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004801 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004801, complete gene. |
| LocusTag |
P0005H10.23 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004801-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004801-PA |
| Length |
10394 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39936541..39946934 |
| Sequence Coding Region |
39936541..39936657,39937327..39937398,39937498..39937601,39937682..39937784,39937872..39938033 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39936541..39946934 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:39936541..39946934 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGAGAGGAGGGATCGGCGGCGCGGGGCTGGTGGCGGCGGTCGCGAAGGCGGACGTGGAGAACACCGACTCCACCCGCGGCTTCGTCAAGGACGTGAAGCGCATCATCATCAAGGTCGGCACCGCTGTTGTGACTGGGCCGAATGGCCGGTTGGCTATGGGCAGGCTCGGTGCTCTGTGTGAACAGGTGAAGCAGCTAAATTTTGAGGGGTACGAGGTGATTCTGGTCACCTCTGGTGCTGTTGGTGTTGGGAGGCAGAGGCTCAAGTACCGGAAGCTCGTCAATAGCAGTTTCGCTGATCTGCAGAACCCACAGATGGACATGGACGGGAAGGCCTGCGCTGCCGTCGGTCAGAGTGTGCTGATGGCGATCTATGACACGTTATTTAGCCAGCTTGACGTAACATCATCTCAGCTTCTTGTTACGGATCGTGATTTTATGGATCCAAGTTTTGGGAACCAGCTCCGCGAGACTGTTAATTCTCTGTTAGATCTCAAGGTTATACCAGTATTTAATGAGAATGACGCCATCAGTACCAGGAGGCAACCATACGAGGATTCATCTGGCATATTCTGGGATAACGATAGTTTGGCCAGACTGTTAGCGCAAGAACTTAAAGCTGATCTCCTTATCATGCTCAGTGATGTGGAGGGGCTCTATAGTGGTCCACCTAGCGATCCACAATCGAAGATTATCCACACATACGTCCATGAACAACATGGGAAGTTAATTAGCTTTGGGGAGAAATCTCGTGTGGGAAGAGGTGGAATGCAAGCTAAAGTAGCAGCTGCTTTTACTGCTTCATCAAAAGGAATACCTGTTGTAATTGCCAGTGGATTTGCAATCGATAGCATTATTAAGGTCATGCGAGGAGAGAAAATCGGTACGCTTTTCCATAGGGAAGCAAACCAGTGGGGTTGTTCCAAGGAAGCAACAGCGCGTGAGATGGCCGTTGCTGCAAGAGATTGCTCCAGACATCTACAGAAATTGTCGTCTGAGGAGCGTAAGAAGATTTTGCTAGACATCGCCGATGCTCTAGAAGCAAATGAAGATCTAATTACATCCGAGAACCAAGCTGATCTGGATTTGGCGCAAGATATTGGTTACGACAAATCATTGGTTGCTCGGATGACCATAAAGCCAGGAAAGATAAAAAGCCTCGCAGGATCAATTCGTGAAATCGCTGATATGGAGGACCCTATTTCCCATACACTGAAAAGAACAGAGGTTGCTAAAGATCTTGTTTTTGAGAAAACATATTGCCCATTGGGTGTTCTCCTAATTATTTTTGAGTCCCGTCCTGATGCCTTGGTACAGATTGCATCTTTAGCAATCCGAAGTGGAAATGGTCTTCTCTTGAAAGGAGGAAAAGAAGCTATGAGATCAAACACAATACTGCATAAGGTCATAACTGGTGCAATTCCAGATGTTGTTGGTAAAAAACTTATTGGCCTAGTGAAAAACAAAGATGAAATTGCTGATTTGCTCAAGCTTGATGATGTGATTGATCTTGTAATACCAAGAGGTAGCAATAAGCTCGTTTCCCAGATCAAAGCAGCAACCAAGATTCCTGTTCTTGGTCATGCTGACGGTATCTGCCATGTTTATATTGACAAATCAGCTGACATGGACATGGCAAAACGTATTGTATTGGACGCAAAGGTTGATTATCCAGCAGCGTGTAATGCCATGGAAACGTTACTTGTTCATAAAGATCTGAACAGGACAGAAGGCCTTGACGATTTATTGGTGGAGCTTGAAAAGGAAGGGGTAGTTATCTATGGCGGGCCTGTTGCACATGACACTTTGAAACTACCAAAGGTAGATTCATTTCATCATGAGTATAACTCAATGGCATGCACCCTCGAATTTGTTGATGATGTGCAGTCAGCAATTGACCATATAAATCGCTATGGAAGTGCACACACAGATTGCATTATCACTACTGATGGAAAGGCAGCAGAGACTTTTCTACAGCAAGTTGATAGTGCTGCGGTATTCCATAATGCAAGCACACGGTTCTGTGATGGGGCTCGCTTTGGTCTAGGTGCTGAGGTTGGCATAAGCACAGGGCGCATACATGCTCGGGGGCCTGTTGGCGTTGATGGACTCCTAACAACTCGATGCATTTTACGAGGAAGTGGACAAGTAGTGAACGGCGACAAGGGAGTTGTTTACACCCACAGGGAGCTCCCTTTGCAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGRGGIGGAGLVAAVAKADVENTDSTRGFVKDVKRIIIKVGTAVVTGPNGRLAMGRLGALCEQVKQLNFEGYEVILVTSGAVGVGRQRLKYRKLVNSSFADLQNPQMDMDGKACAAVGQSVLMAIYDTLFSQLDVTSSQLLVTDRDFMDPSFGNQLRETVNSLLDLKVIPVFNENDAISTRRQPYEDSSGIFWDNDSLARLLAQELKADLLIMLSDVEGLYSGPPSDPQSKIIHTYVHEQHGKLISFGEKSRVGRGGMQAKVAAAFTASSKGIPVVIASGFAIDSIIKVMRGEKIGTLFHREANQWGCSKEATAREMAVAARDCSRHLQKLSSEERKKILLDIADALEANEDLITSENQADLDLAQDIGYDKSLVARMTIKPGKIKSLAGSIREIADMEDPISHTLKRTEVAKDLVFEKTYCPLGVLLIIFESRPDALVQIASLAIRSGNGLLLKGGKEAMRSNTILHKVITGAIPDVVGKKLIGLVKNKDEIADLLKLDDVIDLVIPRGSNKLVSQIKAATKIPVLGHADGICHVYIDKSADMDMAKRIVLDAKVDYPAACNAMETLLVHKDLNRTEGLDDLLVELEKEGVVIYGGPVAHDTLKLPKVDSFHHEYNSMACTLEFVDDVQSAIDHINRYGSAHTDCIITTDGKAAETFLQQVDSAAVFHNASTRFCDGARFGLGAEVGISTGRIHARGPVGVDGLLTTRCILRGSGQVVNGDKGVVYTHRELPLQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..117#787..858#958..1061#1142..1244#1332..1493#1618..1895#6836..6986#7203..7367#7485..7562#7692..7781#7868..7954#8044..8130#8202..8298#8442..8545#8844..8919#9363..9513#9653..9721#9815..9881#10032..10102#10316..10394#ATGGGGAGAGGAGGGATCGGCGGCGCGGGGCTGGTGGCGGCGGTCGCGAAGGCGGACGTGGAGAACACCGACTCCACCCGCGGCTTCGTCAAGGACGTGAAGCGCATCATCATCAAGGTGAGTGAACGAGGGTGACGTGATGCGCGGGTTGACGATCCCGTCAGCGGCGTCCGGCATGCGACTGTGTCCTCCCTTCCTGTGAAACCTGCCGTTCTGCCGTTGTTGTTGTTTGTTGTTTTCTTTTTTTTTTCAGTGACGATAGTTTGTTTGCGCGATCTGTGATCGGTGAAACTCGAGGCTCTCTCGATCTGATTTGCGAAGGATCGGAGAACCTGACAAAAAAAATGGCCTTACAAACTGCAATAGATTTATTTCATTTTTTGTTTTTGGGAGCTGCAGCATGCGTTCCAAAGGAGTGGTTCTAATCTACTCTTGTGTGCTGTTCATGTTCGTACTTACGTTTGATAGATTCATACAACGCGTGACCATAAGAAGAACAGCAGTAGTAGGTAATTTTTAGTGAATTTTTATGAGCTCCATTATGACAGCATATGCTGTCACCTGTGATTTGTCCTTTTTTTCTATTTTTTTTAATTTAAAATCACTATGGCTATATTTTTATGTTTAACTCTTTACCATTCATACGTTTTTAGGTTTAACTATTTACCATAAATATGTTTTTAGGTTTAACTATTTACCACTCATTAATTAGTACCATTCTCTAATGAAGGATGTTATTTTTTTTCCCTCTAAATATATGTTCTGTTGGCTGGCTTAATTCGACAGGTCGGCACCGCTGTTGTGACTGGGCCGAATGGCCGGTTGGCTATGGGCAGGCTCGGTGCTCTGTGTGAACAGGTAAACTTTCCCCCCAAATTTTTTTACCAGAGGTTAATGCTCTGACCAACCGAGCTTGTGCTAATCAGTGTCAGTTAACCGGTGTGATAAATTTCCCAGGTGAAGCAGCTAAATTTTGAGGGGTACGAGGTGATTCTGGTCACCTCTGGTGCTGTTGGTGTTGGGAGGCAGAGGCTCAAGTACCGGAAGCTCGTCAATAGCAGGTTGCAGAGAGTTAATTGGCTCTGAACAGTAAACAGTGTTCTGCTGTAGCATTCATTTCTGATCTCTCTCTTGCTTGCAGTTTCGCTGATCTGCAGAACCCACAGATGGACATGGACGGGAAGGCCTGCGCTGCCGTCGGTCAGAGTGTGCTGATGGCGATCTATGACACGTTATTTAGCCAGGTTGGCGTGCCATTCCTGATGGATTTTTGTGTAAAAAATATGATTTTTTTGCATATATTTTGACACGTTAAACTTCCTTCGCTGCAGCTTGACGTAACATCATCTCAGCTTCTTGTTACGGATCGTGATTTTATGGATCCAAGTTTTGGGAACCAGCTCCGCGAGACTGTTAATTCTCTGTTAGATCTCAAGGTTATACCAGTATTTAATGAGAATGACGCCATCAGTACCAGGAGGCAACCATACGAGGTGTGTTTCCTAATGTGATTTGTGTGCACTGGGAGCTTCACTGATATATACGTATTCCAAATTCCATTAACAACAAACACTAACCTTTTACACTTTACTGATTGTAATGATCAACCGTGTGTAGGATTCATCTGGCATATTCTGGGATAACGATAGTTTGGCCAGACTGTTAGCGCAAGAACTTAAAGCTGATCTCCTTATCATGCTCAGTGATGTGGAGGGGCTCTATAGTGGTCCACCTAGCGATCCACAATCGAAGATTATCCACACATACGTCCATGAACAACATGGGAAGTTAATTAGCTTTGGGGAGAAATCTCGTGTGGGAAGAGGTGGAATGCAAGCTAAAGTAGCAGCTGCTTTTACTGCTTCATCAAAAGGAATACCTGTTGTAATTGCCAGGTGAGTAAAGCTTGTTTTCTTCTATCGTTGCATGAATTGTAGCACAAATGTTAACCAATAAATATATGTCTAAAAGATAATATACTGCAACTGCAACAACGATTTATATTATTTTTCATTGTATAAGAACTATATGTTCTACTTATGATGGTTAGTTACACTGTCACGTGGTGTTGTATTTGTACACAAGTGTTTACACATTGACTAAGACGGTAATATTTTGATATTTTGGAAGCACTTTCCTGATAATAATAGTTGAGAATGGAGAGCAGCTGCATGCCTGCATCACAATTTTGTTTTAGAAAACTCGTGGACTGCTTTAGTTGCTACTATTAACCACCTGTACGAGGCTCTGGTAGAGACAGTATTCAATAGTATCAAAGTGCTGCATCTTAATTCCTACATTTGGTGTGTTATTATGAAACTAGCTGGGTAGCCCGCACAATTGCGCGGCTAGCACCCAAATAAAATCATATATTTTTTTAGTATGATTTTACTTAAAATTTATTAAATAGCTATCTCATGTCTTAAGAGTTTGAAAGATTAAACCTTATCATCCCCGTGTTTCTAATTATATATTTTTTAAAAGTCACACCAGTTGCTACCCCTTATGACATCTCCTTCTTTATTTGCTTGCTCGATATACCACTATTTCTATTCATTCTCCTTGAAACCTTTAAAAATTGGATCTTATAGTTTTTAGAGTTTATTGTCACGTTGGGTTTCGTTTTTATAATTTCTAGACGTCTCGTCAAACGTTGCCATTATACTCCTCTATGGCCCGTCCACTGTCTCTTTTTTTTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAAATCGAACATAATTATCGTTTCGGTTCATTTTTACTTTCTAGAAATCCCGCCAAACCGTCAGCGGCTTTGCCATTGTACTTCTCTACGGCTCACCCGCTGAGTCCCTTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAATCGAACATGATTATCATTGTTTTTTTTACCTTTTCGAAGTTCGGAACCTTTAAAAATTGAACCTTGTAGTTTTTAGAGTTTATTGTCTTGTTGGGTTTCATTTTTTATAATTTTTAGAAGTCTCGTCAAACAATGCCACTATGCTCCTTTATGGCCCGTCCGCCACCTACTCTTTCTTTATTATCATTGTGATTCTAAAAATTGAGCACAACTATCGTTGCAATTCATTTTTTATTTTCTAGAAGTCACGTCAAACATCACCGGCTCTGAAACTATACTACTATACACCCCGCCCACTGCTTCTCCTTTTTATTATCATTGAGATTTTAAAAATTGAATATGATTATCAATGGGGTTTTTTTTTTACTTTCTAGTAGTCCCGGCAATCACATTGCTCGTTTGCTTTACGGCCTGCCTATCGTCCCTCCTTTTAATCATCATTAGATTATTAACAGTTTTTATATGTCGTATCAACCGCCACCACTCTACTCCTTTATAGGCCTCTTACTTAATTTATCTCGTCATGTGTTTTAGATGGTCTTTCTTTCAATAGTCTTTATTTTTATCACAAATTTTAGTTATTTATAAATTATATTCCTAATTGAAATCTTATTTTTCTTTTTCTAATTTCAGATTTTATTTTTTTCAAATTTTAATTAATATCGTATTGTGTTATTTTAGTATTTTTATTTTTTATTTTCAATTTCAGTGGTTTCAAAATTGTATTCCTACTTGAACTCTCTTTTAGTTTTTCTAATTTTGAATATTATTTTATTTTTTATTCTGAATTTTAATTAATCTCGTATTGGGTTTTTATATGGATTCTTATTTCAATATTGCTTATTTTTAATTCCAAATTTCAGCTAATTTTAAATTGTATTCCTACTTGAACTCTTCTTTTTTTTTTGCTAATTTCGGATTTTATTTTCTTATTCCTAATTTTAATTAATCTCGTAATTGGGTTCTTATATGAACTCTTTTTTTAATATTCCTTATTTTAATTCCGATTTTCAGCTATTTTAAAATTGTATTCCTACTTGGACTATCCTTTTATTTTCTAATTTTATTTTATTTTTTTTTTATTTTGAATTTTGATTATTGGGTTCTTATATGGAAACTTCTTTCAATATTGCTTATTTTTAATTTCGAATTTCAGCTATTTTAAAATTGTATTTCTACTTGGGTCTCTTTTTTTCTTTCTAATTTTGGATTTTATCTTATTTTTATTTTGAATTTTGATTAATCTTGTATTGGGTTCTTATATGGAAACTTCATTTTTAATTCCGAATTTCAGCTATTTTTAGATTGTATTTCTACTTGGACTCTCCTTTTCTTTTTTTTCTTTTTCTCCGATTAATGTGGGAATTTCTAACCTCTACAGCGAACGTGGTGCCTTCTTTCAAAGCTGTATTTTATTATAAATTAAATTTTAGTTGTTAAAAATAATATCATTGGATATTCATTTAAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTAAAAATGGATCTTATAGTTTTTAGAGTTTATTGTCACGTTGGGTTTCGTTTTTATAATTTCTAGACGTCTCGTCAAACGTTGCCATTATACTCCTCTATGGCCCGTCCACTGTCTCTTTTTTTTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAAATCGAACATAATTATCGTTTCGGTTCATTTTTACTTTCTAGAAATCCCGCCAAACCGTCAGCGGCTTTGCCATTGTACTTCTCTACGGCTCACCCGCTGAGTCCCTTCTTTATTGTCATTGAGATTTTAAAATCGAACATGATTATCATTGTTTTTTTTACCTTTTCGAAGTTCGGAACCTTTAAAAATT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