Difference between revisions of "BGIOSGA006497"
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Revision as of 18:40, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006497 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006497, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_07167 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006497-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006497-PA |
| Length |
23749 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:17144339..17168087 |
| Sequence Coding Region |
17167781..17168087,17166712..17166740,17164055..17164136,17162521..17162624,17161696..17161791 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:17144339..17168087 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:17144339..17168087 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGACGATGGGAAGGAACAGAGGAGGAGCGGTGGTGGCCTGGATGGAGGTGGAGACGGCGGCGGCCTGGATTGCGGTTGCTCCTCGGCTGGACGAAGACCAAGGCGGACGAGGGAGGAGCGCGCGCGGGCATCAACGACCTCCCCAACGAGCTCTACGACATCGCCTGGGACATCATGCTCATCGACGGGTCATCCGGATGGAACCCGACCTCGTCGGGGCAGATGCTATCCATCGCATCGCCGGCAGCGGCACGCCGTCGCTCGGCCACTTCGTGGTCCGCCCGGACGGCCGACGCGACACAGTGATAAATTGTTTTAAAAATGCTGATATGGTGCTGTATTTGCTTCGCAAGTATTTGGGCGAATATGTTGAAGGGCTCTCTGTTGAAACACTCCGGATAAGTGTTTGGCAAGGTGACGTTGTTCTTAAAGACCTAAAATTGAAGGCTGATGCACTGAATTCTCTTCGGCTTCCAGTAACAGTGAAAGCTGGGTTTGTTGGCACCATAACTTTAAAGGTTCCATGGAAAAGCTTGGGTAAAGAGCCAGTTATTGTTCTTATTGATCGTCTGTTTGTTCTTGCTCATCCTGCCCCTGATGGACAGACTCTGAAGGAAGAAGATAGAGAGAAACTTTTTGAAGCAAAACTTCAGCAGATTGAGGCTGCAGAGGCAGCAACTCTTGAAGCAACAAGTAGGAGCTCGAAAGGAGGACCTGTACCAGGGAGTAATTCATGGCTATACAATTTAATATCAACAATTATTGGAAACCTTAAAGTCACCATCAGCAACGTGCATATCAGATATGAAGATTCTGTCAGCAATTCTGGGCATCCATTTGCATCTGGCTTCACGTTGTCAAGACTTGCAGCCGTTACAGTCGACGAAGACGGTAACGAGACATTTGATGCTGGTGTAGCATTAGATAAGCTGCGGAAGTCGGTCGAACTGCATAGGCTAGCCATCTACCATGATTCTGACAGCAGCGCGTGGAAGCTTGCTAAGAAATGGGAAGATCTAAATCCTACTGAATGGGGCGAGATATTTCAAGATGGCATTGATGATCATTCTGGCAATTCTGTTTGGGCAATGAATAGGAACTATTTAGTTTACCCTATAAATGGAACTCTTAACTACAAACGACTTGGAAAGCAGGAGAGAGGGGGTCCAGATATCCCTTTAGAGAAAGCATCACTTGTTCTTAGTGATGTTTCACTAACTGTTACTGAGGCCCAGTATTATGATGGCATTAAACTGTTGGAAACATTTTCAAGGTTCAGGACACGTGTTGACGTGTCCCATTTACGGCCTATTGTGCCAGTTAAAGTGGATTGCCGTGCTTGGTGGCGTTATGCTGTGCTGGCTGGCTGGCAGCAGGTGAAGCTTGCTGTTGGTGGGCCCCAGATCATCAGTTCCCTGACAAACCCATTGCCATGGTCAGCTCATTGGCACATGGAATTTGCATTGATGGTAGTTGATACAGCATGTGAAGCAACCCATGTCTGTGGGGTAGTGCATTTAAAGGACAGCATGGAGTTACAACAACGTACAGCACAAGTGGTACAAGGAACTCGGGGGGAGCGTAGCTGCGTAGGAGTCGAACCCAATTACTATGTTCTGTCTAACAGAATTGGTTCCGTCAACCAGGCGAATTGGCCCTTCTATTGGTTCTCATGGGAGAGAACTAGGCATCTCTGCCAGCTTCGTCGACGCTATGTTCAATTGTATGCCACATTATTGCAACAAGCATCTAATGTTGATATGTCCGAAATTCGGCAGATAGAGAAAATTCTGGACACAAAAGTCATAATACTTTGGAGGTTGTTGGGACATGCTAAAGTTGAGACCGTGAAATCAAAGGAAATATTACATAAGAAGGGGGCATCAAAGAGAAGATGGTGGACTTTTGGATGGAACTCGGCTGAATTACCTTCTGAAGAGAATGCCCTTCTAGAACCGCAGTTAGATGAGGAGGAGAGATTAACAAAAGAAGAATGGCAGGCCATTAATAAGCTGTTGAGTTACCAACCAGAAGATGATCTGTCTTCCCCCCTTGAAAAAGTCTCCCCGAATACAACCCGATTCTTGGTGGATGTGTCTATTGGCCAAGCTGCTGCAAGGATCATCAATATTGACCGGACAGAAATTTTGTGTGGTAGATTTGAGAAACTTCAAGTGGTCACGAAATTGTATCCCAAGAGTACGCGGTGTGATGTTACTTTGAGATATTGTGGTTTGTCTTCTCCTGAAGGTTCTCTTGCTCAGAGTGTTGTCAGTGAGGGAAAGAGTAATGCTCTAGATGTCAGTTTTGTGCGTGCGCCTGTCGGCTTGGACCTGGATTGGCAGCTCGTGGCAAAGATATCACCATGCCATGTTACGGTTTTGAAGGGAAGCTATGAACGGTTTCTAGAGTTCATTAAACGGAGCAAAGCTGTTAGCCCAACAATGAAGATAGAGCAGGTCACACGTAGAGCTCAGGAGCAGCTTCAGATGGTATTGGAAGAGCAGAGCAGTTTTGGACTTGATATTGATTTGGATGCACCAAAAGTTAGGATTCCTTTAATCACTTGTCAACCTTTGCTGGGGAATGAACATTTTGTTCTGGATTTAGGCCATTTTACGTTGCATACAAGGGACGGCACACGTGAAGAGGAAAGACGCAGTTTATATTCACGGTTTTATATTGCTGGGAGGGATATGGCTGCTTTTGTTGTTTGTGATACAGCTGAAGACATATATTCTGTACCAGAAAATCAGCGTGTGCTGTCAGGTCCTACTGTTGATGCTAATCAGTTTTGTTCTCTTCTTGATCGTTGTGGAATGTCAGTGATAATTGATCAGATCAAAGTTCCACACCCGAGTTATCCATCAACTCGTGTTTCTTTTCAAGTGCCGAATCTGGATATTCACTTCTCACCAAAAAGATACGGCAAGATTGTTGAACTACTTGGTGTACTTTGCAAGTTGAAGGGAAGTGATAGTGAAGATTCTGATAGCTGTGAAAATTGTAACCTGGCACCTTGGTATCCTGCTGATCTAGCTGGTGATGCTAGAACATTGGTTTGGAAGGGTCTTGGTTATTCGCTAGCTGAATGGCATACAAGTTATGTTGTATTATCTGGGATGTATCTGTACATCTTGGAGTCTGAAGTGTCCCAGGATTACCAAAGGTGTTGTAGCATGGCTAGCCGTCAAGTAATTGAGGTTCCATCAACTAGTGTTGGTGGGTCTCTTTACAGTATTGCTGTGTGTTCTAGAGGTGTGGACATGCAGAAGGCGCTGGAATCAACTAGCACACTGATAATTGAATTCCATAATGAAATCGAGAAGGCCAATTGGATGAAAGCGCTTGTCCAAGCAACATATCAAGCTTCTGCCCCTCCTGAAGTGAACATACTAGGAGACCCTGTCAGTACAACAGAACCAAGCACTCCAAGGCTGAGCAGCTTGGGATCAGTGGATCTTCTTGTGAATGGTTCTGTGGTTGAAACGAAGCTTTCGCTGTATGCAAAGTTGGACAGGAAGAAGAAAGATCCAGAAGAGGTTGTAATGTTAGAGCTCCTTGGAAGTGGAGGCAAGTTCCCTAGGAAATGGTTCTATATCGTGAGATGTTGGGATATTCGTCAGTTGCAATCCACCCTAGGCTTGGAAGAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLTMGRNRGGAVVAWMEVETAAAWIAVAPRLDEDQGGRGRSARGHQRPPQRALRHRLGHHAHRRVIRMEPDLVGADAIHRIAGSGTPSLGHFVVRPDGRRDTVINCFKNADMVLYLLRKYLGEYVEGLSVETLRISVWQGDVVLKDLKLKADALNSLRLPVTVKAGFVGTITLKVPWKSLGKEPVIVLIDRLFVLAHPAPDGQTLKEEDREKLFEAKLQQIEAAEAATLEATSRSSKGGPVPGSNSWLYNLISTIIGNLKVTISNVHIRYEDSVSNSGHPFASGFTLSRLAAVTVDEDGNETFDAGVALDKLRKSVELHRLAIYHDSDSSAWKLAKKWEDLNPTEWGEIFQDGIDDHSGNSVWAMNRNYLVYPINGTLNYKRLGKQERGGPDIPLEKASLVLSDVSLTVTEAQYYDGIKLLETFSRFRTRVDVSHLRPIVPVKVDCRAWWRYAVLAGWQQVKLAVGGPQIISSLTNPLPWSAHWHMEFALMVVDTACEATHVCGVVHLKDSMELQQRTAQVVQGTRGERSCVGVEPNYYVLSNRIGSVNQANWPFYWFSWERTRHLCQLRRRYVQLYATLLQQASNVDMSEIRQIEKILDTKVIILWRLLGHAKVETVKSKEILHKKGASKRRWWTFGWNSAELPSEENALLEPQLDEEERLTKEEWQAINKLLSYQPEDDLSSPLEKVSPNTTRFLVDVSIGQAAARIINIDRTEILCGRFEKLQVVTKLYPKSTRCDVTLRYCGLSSPEGSLAQSVVSEGKSNALDVSFVRAPVGLDLDWQLVAKISPCHVTVLKGSYERFLEFIKRSKAVSPTMKIEQVTRRAQEQLQMVLEEQSSFGLDIDLDAPKVRIPLITCQPLLGNEHFVLDLGHFTLHTRDGTREEERRSLYSRFYIAGRDMAAFVVCDTAEDIYSVPENQRVLSGPTVDANQFCSLLDRCGMSVIIDQIKVPHPSYPSTRVSFQVPNLDIHFSPKRYGKIVELLGVLCKLKGSDSEDSDSCENCNLAPWYPADLAGDARTLVWKGLGYSLAEWHTSYVVLSGMYLYILESEVSQDYQRCCSMASRQVIEVPSTSVGGSLYSIAVCSRGVDMQKALESTSTLIIEFHNEIEKANWMKALVQATYQASAPPEVNILGDPVSTTEPSTPRLSSLGSVDLLVNGSVVETKLSLYAKLDRKKKDPEEVVMLELLGSGGKFPRKWFYIVRCWDIRQLQSTLGLEE</aaseq> |
| Gene Sequence |
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