Difference between revisions of "BGIOSGA006892"

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Revision as of 18:42, 20 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006892

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006892, complete gene.

LocusTag

OsI_06330

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006892-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006892-PA

Length

17615

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:7048623..7066237

Sequence Coding Region

7065923..7066237,7057707..7057768),complement(7057540..7057594,7056944..7056980),complement(7056543..7056868
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,7048623..7048642

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:7048623..7066237 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:7048623..7066237 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCAAGAAGAGGAGAGAAGGAGGCGGCGGAGGAAACATCGGCTGCGACCCGCCGGTGATCAATGCGCTGTCCATGGACGGCGGCCTCCGCGAGGTGTCCCTCTCTGTCGTCTTCTCCGTCTGGTGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTTGCTCCCAGTTCCTCCACAGCCAGACCGACCCTTCAGGTACCCACGAACGATCCACCTCCTCTCATGGATCGATCAATGTCATGTTACCCTGGCGTTTGATTGATCGCTTCTTTGTAGATTTCTATGACTACGCCGAGGACGGAATGCGTGAAAACTACTGCAAGAGGAAGCTCGCGCAGAGGTCGGAGAGGGTCAAGTCCGTGGATCTGCATCCGACCGAGCCATGGATTTTGTCGAGTCTGTATTCAGGGAGCGTCTGCATCTGGAACTACCAGACGCAGACGATGGTGAAATCATTTGAAGTCACAGAGTTACCAGTTCGGTCATCTAAATTTATCGCACGGAAACAATGGATAGTTGCTGGTGCCGATGATATGTTCATACGTGTGTACAATTACAATACGATGGATAAGGTCAAGGTTTTTGAAGCTCATACGGATTACATCAGGTGTGTGGCTGTTCACCCAACCCAGCCTTTTGTGCTGTCATCATCTGATGACATGCTGATCAAGCTTTGGGATTGGGATAAGGGTTGGATGTGCACTCAAATCTTCGAGGGGCATTCTCACTATGTTATGCAAGTCACATTTAACCCGAAAGATACCAATACTTTTGCTAGTGCTTCCCTTGATCGCACAGTAAAGGTATGGAGTCTTGGTTCCCCTGATCCTAATTTCACATTAGATGGCCATTCAAAAGGTGTCAATTGTGTTGATTACTTTACTGGTGGTGATCGCCCATACTTAATTACAGGCTCTGATGATCAAACCGCGAAGGTTTGGGACTATCAAACGAAGAGCTGTGTTCAAACGCTTGAAGGACATGCACATAATGTCTCTGCTGTTTGTTTCCATCCGGAGTTACCTATAACACTTACTGGCTCCGAGGATGGGACAGTTCGCTTGTGGCACTCTACTACCTACAGGCTTGAGAACACTCTTAACTATGGCCTTGAGCGAGTGTGGGCTTTAGGATACATGAAGGGTTCAAGAAGGGTTGTGATCGGATATGATGAAGGGACAATAATGATAAAAATTGGCCGTGAAGTTCCTGTTGCTAGCATGGACAGCAGTGGAAAAATCATATGGTCAAAACATAATGAAATCCAAACTGTTAATATCAAGACTATTGGTGCAGACAATGAGATTGCAGATGGTGAGCGCTTACCCTTAGCTGTGAAGGAGTTGGGAACCTGTGATCTTTATCCACAAAGCTTAAGGCACAATCCGAATGGGAGATTTGTTGTTGTATGTGGAGATGGAGAATACATAATCTACACTGCATTAGCATGGAGAAATAGATCATTCGGGTCTGCACTTGAATTTGTTTGGTCAGTTGATGGAGAATATGCTGTCAGAGAAAGCACGTCGAGGATAAAGATATACAGTAAAAATTTCCAGGAGAGAAAGAGTATAAGACCACCATTTTCTGCAGAACGTATATTTGGTGGAGTATTGCTGGCTATGTGTACAAATGATTTTATTTGCTTCCATGACTGGGAAGAGGGCAGGATGATACGCAGAATTGATGTCAATGTGAAAAATCTCTATTGGGCCGATAGTGGTGATTTAGTGACAATTGCAAGTGACACCTCATTCTACATTTTGAAGTACAATAGGGATGTAGTTTCTTCTCACTTGGATGGAGGGGGTTCAGTTGGCGAGGAAGGTGTGGAAGATGCCTTTGAACTACTTCATGAGATCAATGAACGCATCCGAACTGGCCTATGGGTTGGTGATTGTTTTATCTACAACAATTCTTCGTCACGGCTTAATTACTGTGTAGGAGGAGAGGCCTCAGAATCTGAAGATAACCCTTTTATTTTCAGTGTGGCACGTTTCTTGGAATCACGGGGCATGTTGGAAGAAGCCCTTGAGATAGCAACAGACTCTAATTACAGATTTGACTTGGCCGTGCAGCTTGGCATTGCCATTGAGGCACAACTTGATATGGCAGAGGAGTGTCTTCTACATGCTATGGACCTCAGTGGTTTATTACTTCTGTATTCATCCCTTGGTGATGCTGAAGGGCTAACAAAATTAACATCTATGGCTAAAGAACAAGGGAAGAACAATGTTGCTTTCCTTTGTTTCTTCATGCTAGGAAAACTTGAAGAATGCCTTCAGTTGTTAATCGAAAGTAATCGTATACCAGAAGCAGCATTGATGTCGAGATCTTATCTTCCGAGCAAAGTCCCTGATATTGTAACATTATGGAAAAAGGATCTCCAAAAGGTAAACCCCAAAGCAGCAGAATCATTGGCAGATCCTGACGAGTACCCAAACTTGTTTGAAGACTGGCAAATTGCTCTCAATGTAGAAGCTAATGTCGCGCCCAAAAGGGGTATTTATCCACCAGCTGAGGAGTACATTATCCATGCTGAGAGGCCCAATGAGACTCTGGTGGAAGCTTTCAAAAGTATGCATATACATCTAGAGGAGGTGCTGCTAGATGAAAATGGAGATGACACTCACGAGGCTATTGAGGAAAATGGAGTAGAAGAGAGCCAAGAAGATGCTGTTGAGGTTGATGTTGAAGCTGATGGTTCGACTGATGGTGCTGTCCTTGTGAACGGAAATGATACCGAGGAACAGTGGGTATTGACTCCTGACCAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSKKRREGGGGGNIGCDPPVINALSMDGGLREVSLSVVFSVWCLLLLLLLCSQFLHSQTDPSGTHERSTSSHGSINVMLPWRLIDRFFVDFYDYAEDGMRENYCKRKLAQRSERVKSVDLHPTEPWILSSLYSGSVCIWNYQTQTMVKSFEVTELPVRSSKFIARKQWIVAGADDMFIRVYNYNTMDKVKVFEAHTDYIRCVAVHPTQPFVLSSSDDMLIKLWDWDKGWMCTQIFEGHSHYVMQVTFNPKDTNTFASASLDRTVKVWSLGSPDPNFTLDGHSKGVNCVDYFTGGDRPYLITGSDDQTAKVWDYQTKSCVQTLEGHAHNVSAVCFHPELPITLTGSEDGTVRLWHSTTYRLENTLNYGLERVWALGYMKGSRRVVIGYDEGTIMIKIGREVPVASMDSSGKIIWSKHNEIQTVNIKTIGADNEIADGERLPLAVKELGTCDLYPQSLRHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTALAWRNRSFGSALEFVWSVDGEYAVRESTSRIKIYSKNFQERKSIRPPFSAERIFGGVLLAMCTNDFICFHDWEEGRMIRRIDVNVKNLYWADSGDLVTIASDTSFYILKYNRDVVSSHLDGGGSVGEEGVEDAFELLHEINERIRTGLWVGDCFIYNNSSSRLNYCVGGEASESEDNPFIFSVARFLESRGMLEEALEIATDSNYRFDLAVQLGIAIEAQLDMAEECLLHAMDLSGLLLLYSSLGDAEGLTKLTSMAKEQGKNNVAFLCFFMLGKLEECLQLLIESNRIPEAALMSRSYLPSKVPDIVTLWKKDLQKVNPKAAESLADPDEYPNLFEDWQIALNVEANVAPKRGIYPPAEEYIIHAERPNETLVEAFKSMHIHLEEVLLDENGDDTHEAIEENGVEESQEDAVEVDVEADGSTDGAVLVNGNDTEEQWVLTPDQ</aaseq>

Gene Sequence

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