Difference between revisions of "BGIOSGA007008"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA007008

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007008, complete gene.

LocusTag

OsI_06123

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA007008-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA007008-PA

Length

16912

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:5410035..5426946

Sequence Coding Region

5426413..5426946,5425667..5425732),complement(5425437..5425580,5424491..5424684),complement(5423977..5424139
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,5412476..5412539),complement(5412120..5412208,5411896..5412037),complement(5411605..5411668
,5411464..5411531),complement(5410856..5410978,5410710..5410775),complement(5410338..5410364
,5410171..5410203),complement(5410035..5410052

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:5410035..5426946 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGACGAGGTGTGCGAGGGGAAGGACTTCTCCTTCCCGGCGGAGGAGGAGCGGGTCCTCCGCCTCTGGGAGGAGCTCGACGCCTTCCACGAGCAGCTCCGCCGCACGGCGGGCGGCGAGGAGTTCGTCTTCTACGACGGGCCCCCCTTCGCCACGGGCCTCCCGCACTACGGCCACCTCCTCGCGGGCACCATCAAGGACGCCGTCGCCCGCCACCACGCCATGCGCGGCCGCCACGTCGCCCGCCGCTTCGGCTGGGACTGCCACGGCGTCCCCGTCGAGCGCGCCGTCGACGAGGCCCTCCGGATCGCCACCCGCGCCCAGGTGCTCGAGATGGGGGTCGCCAGCTACAACGACGCGTGCCGCGGCGTCGTCACCAGGTACGTCGCCGAGTGGGAGGCCGTCGTCACGCGCATGGGGAGGTGGGTCGATTTCGAGGACGGGTACAAGACCATGGACATCAAGTTCATGGAGAGCGTGTGGTGGGTTTTCGCACAGCTGTGGGACAAGGACCTTGTCTACAAGAGTTTTAAGGTGATGCCTTACAGCACTGGCATGAAAACACCATTGTCGAACTTTGAGGCAGGACAGCACCGCCAGTTTGTTCCGGCCGAAACAGCCATGGTGTCCTTCCCTGTTGTTGGTGATGTGGACAATGCAGCTCTTGTTGCATGGACAACAACACCCTGGACGCTACCTAGCAACCTAGCACTCTGTGTCAATGCAAATTTTGTTTATGCCAAGGTTAAGGACAAATCAAATGGGAGCGTATATATTGTTGCAGAAACTAGGCTAGACCAATTGCCGGTCACGGTCAAAGTTACTGGAAAGAAGCCAGGGCCTTCAAAGGGGAGCAGTGGAGCTGCTAAAAATGGACTGGATACTGAATCGTATGAACTACTCGAAAAGATTCATGGATCATCCTTGGTAGGCCTTAGATATACTCCTTTGTTCGACTATTTCTCAGAGCTGCAGGACACCGCATTTAGAGTCGTAGCAGATAACTGTGTAGCTGATGATACTGGAACTGGTGTTGTACATTTTGCCCCTGCTTTTGGTGAAGATGATTATCGTGTCTGTCTTGCTTCGGGGATAGTTGAGAGTGCACGGGGATACCAGTCGATGTTGATCACGTTCAATGCCGACGCGATTTCTACAGCTTTGATTTCTCAAGCTATTAGCGAGAAGCTTTGTATCCCACCTGCCGAGTTCCGGGTGGAGATTCTTCCAAAGATGACAAATGACAATGTTGGTGCCGAGTCCTGGGTGGAGGTTCTTCCAAAGATGACAAATGACAATGTTGGTGTCCCCAATAAGGTGGTTTTGGGGTGCCATTTGCCAGATGGTCAGGAAGTGCCCTCTTCTCCACCCGAGGGAGATTTGGAGAAGCTTACAGCAGCGCCCCTTCCTTCAGTTGTATCGCCCCTTTCTCTGAGTGCACCTAACACAGCCGTCGCATTGACTGTTTCAACATCCCATGGGAGTGTTCCTTCATCTCTCAATGAAGGACATGGGGTATCTAGCAAGATAGCTGCACCAAAGGAAGAGCATGTTACTCCAACTATGGACCCTCCATCTAGGTGTGAGCATCTTCCTCTTGAGGTTGCACCAAGCAACCTGGTGACAGATAAAGCAGAGCTACTTGAGATCACAAAAGCTCCAGCGGTGAAGAATAGGTTGGCCAAAAGAGTGCGGCAAAAGATTATCACTGCCACCTCTCGAAGAAGTGTCCCTCTACCTTCAAACATGAAGAAAAGGCGACTCCTCATTGACCAAATGAAAACATATGTACTCATGAAGAAGCTAGGCATTATCACAAAGGATGAGGAGGTGGATGAAGACACTATGGATAGTCCAGTGGCGGCTCATCAAAGATTCACAGGAACGATGGCAGCCTTCAGATGTGTTCCGCCATGCCTCGGGAGCAATATCCTTGATCCGGGTAGGGGTTTTCTTTCGGACAAGTGCTTCAACTGCCGCGAGCGAGAAGCTTGTATCCCACCTGCCGAGTTCCGGGTGGAGATTCTTCCAAAGATGACAAATGACAATGTTGGTGCCGAGTCCTGGGTGGAGGTTCTTCCAAAGATGACAAATGACAATGTTGGTGTCCCCAATAAGGTGGTTTTGGGGTGCCATTTGCCAGATGGTCAGGAAGTGCCCTCTTCTCCACCCGAGGGAGATTTGGAGAAGCTTACAGCAGCGCCCCTTCCTTCAGTTGTATCGCCCCTTTCTCTGAGTGCACCTAACACAGCCGTCGCATTGACTGTTTCAACATCCCATGGGAGTGTTCCTTCATCTCTCAATGAAGGACATGGGGTATCTAGCAAGATAGCTGCACCAAAGGAAGAGCATGTTACTCCAACTATGGACCCTCCATCTAGGTGTGAGCATCTTCCTCTTGAGGTTGCACCAAGCAACCTGGTGACAGATAAAGCAGAGCTACTTGAGATCACAAAAGCTCCAGCGGTGAAGAATAGGTTGGCCAAAAGAGTGCGGCAAAAGATTATCACTGCCACCTCTCGAAGAAGTGTCCCTCTACCTTCAAACATGAAGAAAAGGCGACTCCTCATTGACCAAATGAAAACATATGTACTCATGAAGAAGCTAGGCATTATCACAAAGGATGAGGAGGTGGATGAAGACACTATGGATAGGTGCATTGCGTTCCTAAAAGAGCATTACCCAGGACACTATGTTCAGCTTGCTGTTTTCATTGTTGTACCCAACAATAATCACCATGGTTTTAAATCATTAGCTACTGGTACCGATCTTGTTGTTGCTGTTGATGATGATGGTTTCTTCAAAGACAAGATCTCCGAATTTAATGGTCTACTTGTCACAGACAAAGAAACCAACAAATATGTAATCAATGCTGTAAAGAAAAAAGGAAGACTTGTTAGTCACGGAAGCGTTATACATAAGTATCCATACTGTTGGAGATCTAATACACCTCTCATATATCGGGCAGTTCCAAGCTGGTTCATCAGAGTTGAAAGGATTAGAGATCAGTTGCTGGAATGTAATAAGGAGACATACTGGGTGCCTGATTACGTTAAGGAAAAGAGATTCCATAACTGGCTTGAAGGGGCTAGAGACTGGGCTGTTAGCCGAACTAGATTCTGGGGCACTCCTCTTCCTCTATGGATCAGTCAAGACGGAGAAGAAATAATTGTTATGGACTCTGTTGATAAACTCGAAAAGTTGTCTGGTGTCAAGATTAGTGATCTTCACCGACACCATATAGATGGCATCACAGTTCCCTCTCAGAGAGGGGAAGAGTTTGGGGCGTTGAAACGCGTTGATGAGGTTTTTGATTGCTGGTTTGAGAGTGGATCCATGCCATATGCCTACATTCATTACCCATTTGAGAATCGCGAACTATTTGAAAAGAATTTTCCCGGAGATTTCATAGCCGAAGGGTTGGACCAAACTCGTGGATGGTTCTATACTCTCATGGTCCTGTCCACAGCTTTGTTTGGGAAACCTGCATTTAAAAATCTTATATGCAACGGTCTGGTCTTGGCTGAGGATGGCAAGAAAATGAGCAAAAGTAAAAATAATTACCCTTCACCCATGGAAGTCATTGATAATTATGGAGCGGATGCCCTGAGGCTATATGTAATAAATTCTCCTGTCGTCCGTGCGGAGTCCCTACGATTCAACAAAAATGGTGTCCATGGTGTGGTGAAAGATGTCTTCCTCCCATGGTATAATGCTTATAGATTTCTTGTTCAAAATGCTAAGAGGCTTGAAGTTGAGGGTCTTGCTGTATTTTCACCAATCAATCAAGCTATTCTTCTGAGGTCATCTAATGTGCTAGATCACTGGATACAGTCCGCTACTGAAAGTCTAGTTAGTTTTGTTCGACAGGAGATGGATGCATATAGGCTTTACACGGTTGTCCCTTATTTAGTAAAGTACATTGACAACCTTACCAACATATATGTGCGTTTCAATCGCAAGCGTCTGAAAGGTCGTACTGGAGAAGATGACTGCAGGATTTCTCTTTCAACACTTTACCATGCGCTTGTAACAACTTGTGTTGTGATGGCTCCGTTTACTCCCTTCTTCACTGAAGTTCTGTACCAGAACTTAAGAAAGGTGTCCAGCAAATCAGAAAAGAGCATTCATTTCTGCAATTTCCCTTCCTCAACTGGGCAGATAGATGAGCGTGTTGAGCACAGTGTCAACAGGATGATGACCATCGTTGATCTTGCTCGAAATATTCGGGAGCGGCATAACAGACCTTTGAAAACACCATTAAGGCATGCTCATTATACAACTATACTATTTACACAATTTCTTGTTTTATGGGAGATGGTAGTTGTGCATCCTGACAATGATTTTCTTGAAGACATAACTGGAAAGCTGAAAGAGTATGTCAAGGAGGAGATGAATGTCAAGATGGTCACTGCTTGTAGCGATCCCTTAGTGTATTCATCTTTACGTGCTGAACCTAACTTCAGTGTGTTAGGCAAAAGATTAGGAAAAGACATGGGCAAAATATCAAATGAGGTGAAGAAGATGACTCAGGATCAGATCCTAACATTTGAGGAAAGTGGCGAAATATTTTTTGGCAGTCATCTCTTGACGTTGGAAGATATTAAGGTTTTTCGAGAATTCAAGCGCCCCGCAAATGTGTCAGAGAAGGAAATTGATGCTGCAGGAGATGGTGATGTTTTGGTTATCTTGGATCTCCAAGTTGATCAATCATTGTTTGAAGCTGGAGTTGCTCGTGAGGTTGTGAACAAAATTCAGAAGTTGAAAAAGACTGCTCAGCTGAGACTGACCGACCCAGTTGATGTTTACTACAGTTCACAGGATAGCAGTGATAGCTCTCTCGAAAAGATTTTGCAATCGCAGGATCAATATATTAGAGATGCACTTGGTTCCCCTCTTACCTCGAAGGCACAGGCACAACCCAATGTGGAAGTAATCTGTGAGGAGGCCTACAACGAAACAGTGAAGCTTGTTCATCCTTTTATCAAGATTGAAGATTTCCCGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDEVCEGKDFSFPAEEERVLRLWEELDAFHEQLRRTAGGEEFVFYDGPPFATGLPHYGHLLAGTIKDAVARHHAMRGRHVARRFGWDCHGVPVERAVDEALRIATRAQVLEMGVASYNDACRGVVTRYVAEWEAVVTRMGRWVDFEDGYKTMDIKFMESVWWVFAQLWDKDLVYKSFKVMPYSTGMKTPLSNFEAGQHRQFVPAETAMVSFPVVGDVDNAALVAWTTTPWTLPSNLALCVNANFVYAKVKDKSNGSVYIVAETRLDQLPVTVKVTGKKPGPSKGSSGAAKNGLDTESYELLEKIHGSSLVGLRYTPLFDYFSELQDTAFRVVADNCVADDTGTGVVHFAPAFGEDDYRVCLASGIVESARGYQSMLITFNADAISTALISQAISEKLCIPPAEFRVEILPKMTNDNVGAESWVEVLPKMTNDNVGVPNKVVLGCHLPDGQEVPSSPPEGDLEKLTAAPLPSVVSPLSLSAPNTAVALTVSTSHGSVPSSLNEGHGVSSKIAAPKEEHVTPTMDPPSRCEHLPLEVAPSNLVTDKAELLEITKAPAVKNRLAKRVRQKIITATSRRSVPLPSNMKKRRLLIDQMKTYVLMKKLGIITKDEEVDEDTMDSPVAAHQRFTGTMAAFRCVPPCLGSNILDPGRGFLSDKCFNCREREACIPPAEFRVEILPKMTNDNVGAESWVEVLPKMTNDNVGVPNKVVLGCHLPDGQEVPSSPPEGDLEKLTAAPLPSVVSPLSLSAPNTAVALTVSTSHGSVPSSLNEGHGVSSKIAAPKEEHVTPTMDPPSRCEHLPLEVAPSNLVTDKAELLEITKAPAVKNRLAKRVRQKIITATSRRSVPLPSNMKKRRLLIDQMKTYVLMKKLGIITKDEEVDEDTMDRCIAFLKEHYPGHYVQLAVFIVVPNNNHHGFKSLATGTDLVVAVDDDGFFKDKISEFNGLLVTDKETNKYVINAVKKKGRLVSHGSVIHKYPYCWRSNTPLIYRAVPSWFIRVERIRDQLLECNKETYWVPDYVKEKRFHNWLEGARDWAVSRTRFWGTPLPLWISQDGEEIIVMDSVDKLEKLSGVKISDLHRHHIDGITVPSQRGEEFGALKRVDEVFDCWFESGSMPYAYIHYPFENRELFEKNFPGDFIAEGLDQTRGWFYTLMVLSTALFGKPAFKNLICNGLVLAEDGKKMSKSKNNYPSPMEVIDNYGADALRLYVINSPVVRAESLRFNKNGVHGVVKDVFLPWYNAYRFLVQNAKRLEVEGLAVFSPINQAILLRSSNVLDHWIQSATESLVSFVRQEMDAYRLYTVVPYLVKYIDNLTNIYVRFNRKRLKGRTGEDDCRISLSTLYHALVTTCVVMAPFTPFFTEVLYQNLRKVSSKSEKSIHFCNFPSSTGQIDERVEHSVNRMMTIVDLARNIRERHNRPLKTPLRHAHYTTILFTQFLVLWEMVVVHPDNDFLEDITGKLKEYVKEEMNVKMVTACSDPLVYSSLRAEPNFSVLGKRLGKDMGKISNEVKKMTQDQILTFEESGEIFFGSHLLTLEDIKVFREFKRPANVSEKEIDAAGDGDVLVILDLQVDQSLFEAGVAREVVNKIQKLKKTAQLRLTDPVDVYYSSQDSSDSSLEKILQSQDQYIRDALGSPLTSKAQAQPNVEVICEEAYNETVKLVHPFIKIEDFP</aaseq>

Gene Sequence

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