Difference between revisions of "BGIOSGA007511"
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Revision as of 18:46, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA007511 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007511, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0018G11.20 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA007511-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA007511-PA |
| Length |
13460 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:2582211..2595670 |
| Sequence Coding Region |
2582211..2582422,2583262..2583389,2583829..2583889,2584315..2584472,2585438..2585520 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:2582211..2595670 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:2582211..2595670 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCACCACCACCCCCGCCGCCCGCAAAATAGCCGGCACCGAGGTCCCCATCCCGGGCTCGGACAGGGTGCGGTGGATCGAGCTCACCGTCCCCTCCACCCCGTCCCCCTCACCGGAGGGCGATTCCGATCCCTTCGTCCTAGTGCCCCCGCGCGCCGCCTCGGGGTTCCACGTCGTCTCCTCCGGCGACTCGCAGTGCTATCTCGCCTGGAGGTTCCATGAGGAACAACAAAATGTTCTAGAGGTTATTGATCTCTGTGCTTTCAAGGAGTTTCCAAGCTCTGGACTGCGGTTGGTATTCCAGGAGGAGCTATGCCCGTTTTCCTTCTTATGTGCACGTTTCTTGAATGAGCTCCGAGATGATGCTGGGATCGGACGTTTATGGTCTCTTGTGTCAAGAACAAAGGCTGTGGGCCCTGTACAAGATATAGTAACAGCTACTGTAAATGAAAGGGAACTGCTGTTTGTTCTCCATCTGGATGGAAGTTTGCGCATATGGGATATTTTTAATCACACTAAACTTCTCAGTTACAATGTTCGCTCGAATGATATCGAAGGTCAACCATCTAGGATATGGGTTGGTGATGCTGATGATGATCAAGAGTTGATTTTTTTGGCTGTTCTGCGTCAAGGCACTGTGACTGGAGCTTGTGATTGCGTTTCTGTATATGGTTTTAGTTTTGGTGCTGGTGAAAGGTTCTTGTTTTCTCCTGAACCTTCATTTTTTTCTATACCTTTGGTGGAGGGAAAGCTTATCGACTTGAAAATAAGCATGGACAAGCTTTGGATACTTAAGGAAGTTGGATCAATGCTATATGAAATAGTGCAGTATGATTGTGATACTGAGATAATGCATTCATATGTGCTACAAGAAGTTTCTGTCAGTGACCAGTTGTTTCAAAGCTCTGAGAATACATTGGATGATTTGGTCTGGACAGCTGATTCAATATTCTCATCCAAGAAGATAAGGTCACCTATTGATCTATATGACTTCTGGTTCAACTTGAATTATAAGGGAAGTTCACAGACTGCAAGTTCGACTGCTTATCATTGGAAAAAGTTTTCTGCACGGTATCTCCACAATTGGTGCTGGAACAATAGGCCATATGGGTTACTTCTTGATACTAACAGAGAAGTTTTTGGTTTAATAAGAAAGGGTTCATTTTCTCTCTTCCGTTGTTTGGAGGGCATGGAGCAGTTTATTTATGGTTCCTCTGATGACCTGCGCAATCTTGATATCCTTGGGGTGAACCCATCGGATAATATATCTCAGTCTGAAATCCTCATTGAAGTTCTAAGGTGCATGGATCATATAAGCCATCTGCTGGGGAGATCTGCTGCTGCAATATATCATGAATCCCTCATCAGTTCTGTTATATCACCTGATGAAATTGTTTCTCAGATCTTAAAGATTCTGGGCACTGGTTTCAGTCCTCAGTCTCCCTCAGCCCTCATTACATTATTTGGAACAGATGCTTATGCAGAAAGAAGGCAGACCGCTCACAAGAGTCAGAGGAAGTTTTCTGTTGAAATGTTACTATCTTTTCGTAAATTGCAATCAAAGTCGACATCCTGGTCAGCAGTATTTGATGTGATTGAGAACTTCATGAAGTATTTGAACACAAACGTGACCATCCAAGAGTATGAGCTGAAGAGAGTTTGCAATGTGAATACTGCGTTATTGGTTCAAGCTACTTCACAGGTAGCAAGAACAATGTTCGAGTCCACTTTTGATCTATATCTGTTCCTCAATTATCTGGTCTCCATTGGTGGGCAGGGAAGTTCACAGACTGCTAGTTCGACTGCCATGCTATTACTCAAACTTGCTCCGGTCTCCTTGTCACAAAATGATATTGCCAGAATAAAACTGAAGTTGTTCCCAGTGATTCAAGATATACTGGGACAGTGGATTGTCCTCCACTTTGTAGGAATTTCACCTACTACACCACCAACTATTGAGGATTTCAGCTATCAGCTTTCTTCTCTCCAGCTAGGAAAAGCTGATGACCTGTCTTTGCACAGAAAGTTTGGCTGCTCTTATTTTACATTGGCTTGTTTACTTGATTTTCCAAAATCTGCTGACGGGGATGTTCTCTCACCCTGGTTTCCTAATCCAACTGAGTTGGTCAACTTGGTAAGGAGGTTTAGTGGCTCAATTATGAGTGAAAATATTGCTGGAAATGCTGACTGTTTCTTGAGTTCCACAATTAATCTGGCAGCAGTTCTTGTTCGCCATGGTCAATATGAAGCTGCTCAGAGTCTTCTGGGCATTCTCGACACACACATGAACTATGTGAAAGCATCTCAAGCTGACCAGGATACAGATCTTGCACGCTCATCATGCCTTCATCTCAATGGATTTTGCCTTCTGGTGCTTGCACGTGATGAAGCAAACATTGTCCTGAAAGAATCCAAGGTTCATGAAGCTATCCGATGCTTCTTCAGAGCTGCATCTGGGCAAGAAGCTCCAAAGGCTCTTCAGAAGTTCTCTGTGGAAACAGGGTTTCAAATCTCCGGGGAATGCAGATCTTTTACAGCATGGAGGCTTCGTTACTATGAGTGGGCAATGCAAATTTTTGAGCAGCACTCCATGAGTGAAGGGGCATGCGAGTTTGCTCTTGGTGCTCTTGAACAAATAGATAGCATCGTCGATTTAGATAATGGAAGTGAAGCTGAGGATATCCCTGAAACTACAACTATGATTAAAGGGCGACTATGGGCTAATGTATTCAAGTACAAATTGGATTTGAAAAATTTTCAAGAGGCGTATTGCGCAATAATCTCAAATCCAGATAATGATAGCAAGTATGTCTGTTTAAGACGTTTCATCATAGTTCTTTGTGAGCTTGGCGAGACAAAGGTAATTTGCAATGGCGAGATACCATTCACTGGCTTGGTGGAAAAAGTGGAGCAAGAGCTCTTCTGGAAGGCTGAGCGCTCGGATCTTTTGTCTAGACCAAATCTTTACAAGGTCCTTTATTCATTTGAGGCTTATAGGAACAATTGGAGGAAGGCTGCTGCACATATGTATAGGTATTTCGTTAGATTGAGTAGAGAGGGTAATGCTGGTGGAACCCGGCAACTTTCTCATACATTGCAAGAGAGGCTGCATGCTTTGTCTGCTGCTATCAATGCATTGCAGCTTGTTGATCCCTCATTCGCTTGGCTTGATTCTGTTTGTGAAGCGGATGATCAAATCTCACCAAGTAAAAAGCCCTGTAATCTTTTGATGAAGAACTCTGCTTTTGGCACAGATTCAGAGCTGTCTAGGTTGAAGTTTTGTGTTGACATTGAAATTCTCGAAAAGGAATATACACTAACAGAAGCACTCTATATGCTCAGCACTGTAAATTCTAGATTCAACTTTTCAGATAACCAATCTATTGAAGCACTGACGGATATTCTTATAAATGAGAATATGTACGACATGGTGTTCACCATTGTGCTGAAATTTCGGAAGGAGTCAGGAATGAAAAGGGAGTTGGAACGTGTATTTGCAGCAATTGCGCAGCAATGCTGCCCTAATAGAGTGGGCAACTCAGGGAAGAATTTACTGCTGCCATCTTCCGATGATGATGCCTGTGATGGCAATGGTAACAGTATTGCCATGGCTCATCAATCCCAGGGGAGTTGCCATTGGGAGACTCTTGAAATATATTTGGAGAAATACAAAGATTTGCATCCTAGGTTGCCTGTCATTGTTGCGGAAACACTTCTTTACACAGACCCTGAGATTGAGCTACCACTTTGGCTAGTCCAGATGTTTAAGACCACCAAGGCTGGTAACAGGATGATTTCATGGGGTATGTCTGGCACAGAGGCAGACCCTGCTACATTATTTAGATTGTACATAAATTATGGACGGCACACAGAAGCGGCCAATTTGCTGGTCGAGTACTTGGAATCATTCACATCATCGAGACCTGTGGACGTTCTCCACCGCAAAAAGATGTCAGCGGCCTGGTTCCCATACACTGCCATCGAGAGGTTGTGGTGTCAGCTAGAAGAGATGCAAAATGCTGGCCACAGCGTGGATCAGTGCGACAGGCTCAAGAAGTTGCTACATGGATCTCTGATTAGTCACCTGCAGCAAGTTGTGGTTGATTCAGATGATGTGCTTTCATCGCTTGGAGGAGGGAAAGGAATGGGGAGCCAAAGCAATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATTTPAARKIAGTEVPIPGSDRVRWIELTVPSTPSPSPEGDSDPFVLVPPRAASGFHVVSSGDSQCYLAWRFHEEQQNVLEVIDLCAFKEFPSSGLRLVFQEELCPFSFLCARFLNELRDDAGIGRLWSLVSRTKAVGPVQDIVTATVNERELLFVLHLDGSLRIWDIFNHTKLLSYNVRSNDIEGQPSRIWVGDADDDQELIFLAVLRQGTVTGACDCVSVYGFSFGAGERFLFSPEPSFFSIPLVEGKLIDLKISMDKLWILKEVGSMLYEIVQYDCDTEIMHSYVLQEVSVSDQLFQSSENTLDDLVWTADSIFSSKKIRSPIDLYDFWFNLNYKGSSQTASSTAYHWKKFSARYLHNWCWNNRPYGLLLDTNREVFGLIRKGSFSLFRCLEGMEQFIYGSSDDLRNLDILGVNPSDNISQSEILIEVLRCMDHISHLLGRSAAAIYHESLISSVISPDEIVSQILKILGTGFSPQSPSALITLFGTDAYAERRQTAHKSQRKFSVEMLLSFRKLQSKSTSWSAVFDVIENFMKYLNTNVTIQEYELKRVCNVNTALLVQATSQVARTMFESTFDLYLFLNYLVSIGGQGSSQTASSTAMLLLKLAPVSLSQNDIARIKLKLFPVIQDILGQWIVLHFVGISPTTPPTIEDFSYQLSSLQLGKADDLSLHRKFGCSYFTLACLLDFPKSADGDVLSPWFPNPTELVNLVRRFSGSIMSENIAGNADCFLSSTINLAAVLVRHGQYEAAQSLLGILDTHMNYVKASQADQDTDLARSSCLHLNGFCLLVLARDEANIVLKESKVHEAIRCFFRAASGQEAPKALQKFSVETGFQISGECRSFTAWRLRYYEWAMQIFEQHSMSEGACEFALGALEQIDSIVDLDNGSEAEDIPETTTMIKGRLWANVFKYKLDLKNFQEAYCAIISNPDNDSKYVCLRRFIIVLCELGETKVICNGEIPFTGLVEKVEQELFWKAERSDLLSRPNLYKVLYSFEAYRNNWRKAAAHMYRYFVRLSREGNAGGTRQLSHTLQERLHALSAAINALQLVDPSFAWLDSVCEADDQISPSKKPCNLLMKNSAFGTDSELSRLKFCVDIEILEKEYTLTEALYMLSTVNSRFNFSDNQSIEALTDILINENMYDMVFTIVLKFRKESGMKRELERVFAAIAQQCCPNRVGNSGKNLLLPSSDDDACDGNGNSIAMAHQSQGSCHWETLEIYLEKYKDLHPRLPVIVAETLLYTDPEIELPLWLVQMFKTTKAGNRMISWGMSGTEADPATLFRLYINYGRHTEAANLLVEYLESFTSSRPVDVLHRKKMSAAWFPYTAIERLWCQLEEMQNAGHSVDQCDRLKKLLHGSLISHLQQVVVDSDDVLSSLGGGKGMGSQSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
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