Difference between revisions of "BGIOSGA008183"
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Revision as of 18:50, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008183 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008183, complete gene. |
| LocusTag |
OS02G0469200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008183-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008183-PA |
| Length |
19614 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:17038940..17058553 |
| Sequence Coding Region |
17038940..17039005,17039105..17039237,17039333..17039404,17039745..17039789,17040264..17040365 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:17038940..17058553 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:17038940..17058553 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCCCCTCCGGGCGGCTCCCCGCCCCCTTCGTCTTCCCCCTCGTCCTGCTGCTGCTCGCTCTGGTGCCGTCACCGGAGGCGGCCGAGTCCACGCCGGGGACGCGGACGCGCAAGATCGGCGGCGCCGCCTCGGTGTTCTCGCTCTTCAACCTCAAGCCCCAGAACAAGTTCTGGTCGGAGTCCGTCATCCGCACGGAATTCGATGACTTGGAGGGCTCAACATCGCGGGACTCCAGCAAGAAGGCGCTGCTCAACTTCACTAGAGCTGCCATGAGGGTGCTGATGCTATATTTCAAGAACCTCGAGTTCTTTAGTAATATTGCCAACTATATGAGCCTTGCAGAGGTTGATTCTATATATCTTTCAGTACCTGTAAACTTCATCTTTATAGGATTTGATGGAAAAGGAGGTCACGAGTTTAAACTGGGACCTGAAGAACTGGAACGCTGGTTTACAAAAATAGATCACATATTTGAGCAAACAAGAATACCCCCAGTTGGCGAAGTTCTTACTCCGTTCTACAAGACCAGTGTTAAGAAACTAAAGCAATATGACCTTCCTTTAATCAGCCACATAAATCACAATTTTTCCGTACATGCAGTACACATGGGTGAAGATGTCATGTCTGTTTTTCAACATGCTATAAAAGTTCTATCCCGTAGAGAAGATATCACAGATTCAAGAGAAGGGGCAGAAGCACTTTGGCAGGTGGACAGTGACCAAATGGAACATTTATTTTCAACACTTGTTGATCACCTTCAAATACAAGAGGCATACAACATCTTCATACTTAATCCCAAAACCATTGGCAAGAGTACCCAGTATGGTTATCGGAAAGGCTTCTCTGAGTCTGAGATCAACTTACTCAGGGAGAATAAGACCCTGCAAGCTCGGATTCTTCAATCTAAAAGTGACAAGAGACTCTATCTGGATATTGAAAAGGGAGTCAACAGAAGACCCTTGTATGAGAGTCATCCTTTATCATCATTTTCGTGGACAACATCTGACAATATGGATATGGGGGATTGGTCAAAGAAGTGCAAGGAAGCCTTAAGCAATTTTGAGCTGTTGAAGGAAGGAAAGAGCAAAGATGATATTATTTATGACAAAGCTGTCCAGGTATTACATGGCAAAAAGGATGAGTTGCATGATATATTTGAGAGTGCACTCAAGTCCAGTGATTTGAAGGGTCTGCATGCTGAATGCCTTACAGATATGTGGATTGGCAGAGACAGGTTTGCTTTCATTGATCTGAGTGCAGGGCCATTTGCCTGGGGCCCTGCTGTTGGTGGGGACGGTGTTCGTACTGAACTTAGTCTACCCAATGTTGCAAAGACTGTTGGGGCTGTTGCAGAAGTTATAGAAGAAGAGGCTGAAGCTAAATTACAAGATACAATCAGAGAGAGATTCTCATCTTTTGGCGAGAATTACCATGCAGTAGATATCCTATTGGCAGAGATTGATGTATACGAACTTTTTGCCTTCAAGCATTGTGTTGGAAGAAGGGTACAGCTTGCCCTTTGCAAAGAACTTGATGAGAGAATGCATGATCTGAAAAGTGAACTGGAGGGTTACAATACTGGAGATTCGGATGATATTAATAAGAAGAAAGCTCTTGATGCATTGAATAGGATGGAAAAGTGGAACTTATTTAAAGATGTTCCAGAGGAACATCATAGTTACACTGTGGCTCGCGATTCATTCCTCGCACACCTTGGTTCCGTGTTATGGGGCTCTATGAGTCATGTAATTGCTCCTTCTGTTTCTCATAGGGCTCACCATTACTATGATAAGTTGTCGTTTCAACTGTACTTTGTGACACAAGAGAAAGTCAGGAACATGAAGCAGTTTCCTGTTAATGTAAAATCAGTAACAGAGGGCCTTAGTTCTGTGTTACTACAATTCCAGAAGCCAATGTTCAGTCAACGCATGTTGTCATTATCAGAGGATCCTGCCTTGATGATGGCATTTTCAATAGCACGTCGTGCAGCTGCAGTCCCACTTCTGTTGGTTAATGGTACCTATAAGTCAACTGTCCATACATATCTTGATTCTGCCATTCTCCAACATCAGCTACAGAGGTTAAGCGAGCACAACTCGCTCAAAGGAGGACACTCAAATCACAGGTCAACATTGGAGATTCCAATATTCTGGTTCATACATAGTGAACCCCTATTATTGGATAAACATTATCAAGCCAAATCTCTTTCAAACATGGTTGTAGTAGTTCAATCAGAAGTTGATTCTTGGGAAAGCCACTTGCAGTGCAATGGGAGGTCAATCTTATGGGATTTGAGGAGACCAGTAAAAGCTGCCATTGCTGCAACTGCCGAGTATGTATCTGGTTTACTTCCTTCACATCTGGCTTATAGCCCAGCTCATGAAACTGCAACAGAGGACTGGACTTGGTCTGTGGGCTGTAATCCCTTATCTATTACTTCAAAAGGCTGGCAACTTTCGGAGTTTCAACGTGATGTTATTGCTCGTAACTACATCATTACTGCAGTGGAGGAATCTATACAAATCATCAATTCAGCAATTCAACAATTGATTACAGAAAGGACAAGTGAACGAGGCTTTAAACTTTTCAAGGCTCAGGAGAGAGTGCTGGTTGAAAAGTATAATTCTGTTGTTAGCTTGTGGAGAAGGGTTTCTGCTATGTCCAAAGGATTACGATATGGTGATGCTGTAAAGCTTACTTCAATGCTCGAGGAGGCTTCTCATGGATTTGCTAATGCTGTTAACTCAACCATTTCAAGTCTACACCCTGTGCAATGTACTCGTGAAAGAAAAGTCGACGTGCAGCTAGACTTGACAACGATTCCTGCTTTCTTGGCTGTTTTTCTGCTGCTCTGGTTTCTTCTACGACCAAGGCGGCCAAAGCCCAAGATCAACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSPSGRLPAPFVFPLVLLLLALVPSPEAAESTPGTRTRKIGGAASVFSLFNLKPQNKFWSESVIRTEFDDLEGSTSRDSSKKALLNFTRAAMRVLMLYFKNLEFFSNIANYMSLAEVDSIYLSVPVNFIFIGFDGKGGHEFKLGPEELERWFTKIDHIFEQTRIPPVGEVLTPFYKTSVKKLKQYDLPLISHINHNFSVHAVHMGEDVMSVFQHAIKVLSRREDITDSREGAEALWQVDSDQMEHLFSTLVDHLQIQEAYNIFILNPKTIGKSTQYGYRKGFSESEINLLRENKTLQARILQSKSDKRLYLDIEKGVNRRPLYESHPLSSFSWTTSDNMDMGDWSKKCKEALSNFELLKEGKSKDDIIYDKAVQVLHGKKDELHDIFESALKSSDLKGLHAECLTDMWIGRDRFAFIDLSAGPFAWGPAVGGDGVRTELSLPNVAKTVGAVAEVIEEEAEAKLQDTIRERFSSFGENYHAVDILLAEIDVYELFAFKHCVGRRVQLALCKELDERMHDLKSELEGYNTGDSDDINKKKALDALNRMEKWNLFKDVPEEHHSYTVARDSFLAHLGSVLWGSMSHVIAPSVSHRAHHYYDKLSFQLYFVTQEKVRNMKQFPVNVKSVTEGLSSVLLQFQKPMFSQRMLSLSEDPALMMAFSIARRAAAVPLLLVNGTYKSTVHTYLDSAILQHQLQRLSEHNSLKGGHSNHRSTLEIPIFWFIHSEPLLLDKHYQAKSLSNMVVVVQSEVDSWESHLQCNGRSILWDLRRPVKAAIAATAEYVSGLLPSHLAYSPAHETATEDWTWSVGCNPLSITSKGWQLSEFQRDVIARNYIITAVEESIQIINSAIQQLITERTSERGFKLFKAQERVLVEKYNSVVSLWRRVSAMSKGLRYGDAVKLTSMLEEASHGFANAVNSTISSLHPVQCTRERKVDVQLDLTTIPAFLAVFLLLWFLLRPRRPKPKIN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..66#166..298#394..465#806..850#1325..1426#1521..1689#1814..1912#2348..2497#4189..4228#4697..4754#6510..6598#7353..7451#7542..7657#7741..7859#11124..11194#11771..11873#12245..12384#12591..12749#12831..12934#14423..14598#16686..16875#17747..17846#18214..18382#18963..19045#19129..19205#19443..19614#ATGAGCCCCTCCGGGCGGCTCCCCGCCCCCTTCGTCTTCCCCCTCGTCCTGCTGCTGCTCGCTCTGGTAAGCTGATCCCCCTCCGAACCTCGATCTCCGGTTAGATCTGGTCATTTCGGCTTCTCGACGGTTTTCGCCCTTCGATTGACTCCCCCTTCGCTGCAGGTGCCGTCACCGGAGGCGGCCGAGTCCACGCCGGGGACGCGGACGCGCAAGATCGGCGGCGCCGCCTCGGTGTTCTCGCTCTTCAACCTCAAGCCCCAGAACAAGTTCTGGTCGGAGTCCGTCATCCGCACGGGTTCGGTTCCGCGCTTCGCAGTGGTTTCGTTGTTTGCATGTTGCATCCCTTTTTTTGGTTGGTGGTATGCTGACGGGTTATGTAATTTTTGGTAGAATTCGATGACTTGGAGGGCTCAACATCGCGGGACTCCAGCAAGAAGGCGCTGCTCAACTTCACTAGAGCTGGTAGATTTTTGCGTTGCTCGTAAATTTTATTGGGCTTTTGACCATATTGCAAACAAACCAGATTAGCTTACAATTCTCCCCTAAAGTTGTGGTGTTGCATGGCCCTTTACTAGCTGCTGCAGTGATAATTTTTCTTTTGGACGTGTTCAAGTTGCAGGACAATGTAAAACTGCTGATTGAGGCTGATATGATTTTGTTTATAGGCTTCTCATTATTGATTCCTGAAGAGTCTGGCATAATTAAATTATGTTAGACTACTATATCATTGCTTTGTTGTACTTTCTGACCTGACCTTGTATGTCATATAATACTTGAGATTACTGTAACTCTTTTGTTTTAGCCATGAGGGTGCTGATGCTATATTTCAAGAACCTCGAGTTCTTTAGTAAGTATAAATGGAATTATTGATGGAAGGTTAAGAGTGGAGAGAGAAGTGGTTGTTCCTAAATAGTCATAATGCAACAGAACTAAGAACTACCTTAGAAAATGATTTTTTTTATTGTGATATATCCGATAATCATTGAGCAGGAATGTATAACCAATGCAACTTCAATATCTGCAAACAAATCATACCGATATCGTTCAGAAATGGCTATGTTAGAGAGGCAATATGCCTGTTATTGAAGCATTACTTTGTGGTAAGGACTGTATTTTTGCATGATTAGTTTAGTCAAGAAACGACTACTTATTTATGTACTCCCTCCGTCCCAAAATAACTGAACCTAGGAGTACATTTGAGACAATTAGTTGCATGCGAAATGTGCATAGTGTTGAAAATTTTATGGTGTACTCATGAATTACATAAGACGACTGTTCACTACTAAATCTGTCATTTTTTTTTGCCATCTGTTGTTCTTAGGTAATATTGCCAACTATATGAGCCTTGCAGAGGTTGATTCTATATATCTTTCAGTACCTGTAAACTTCATCTTTATAGGATTTGATGGAAAAGGAGGTCACGGTAAGCCGACAAACTATCCTTATGCAATACTTATGTCATTCTCTATTTCTTATTTGTTCATACGAAGTACTAACAGTATCTTTACTTTATTTAGAGTTTAAACTGGGACCTGAAGAACTGGAACGCTGGTTTACAAAAATAGATCACATATTTGAGCAAACAAGAATACCCCCAGTTGGCGAAGTTCTTACTCCGTTCTACAAGACCAGTGTTAAGAAACTAAAGCAATATGACCTTCCTTTAATCAGCCACATAAATCACAAGTACGTTCCTTTACTTCTCTGACAATTGTTCTTACTTGGCCCAATGTTTTCATCTATTTTGTATAAATATGCCACACATAATTAAATTTTGCCTTTAATTTACCTCACTTTCTGTGTGGTGCAGTTTTTCCGTACATGCAGTACACATGGGTGAAGATGTCATGTCTGTTTTTCAACATGCTATAAAAGTTCTATCCCGTAGAGAAGATATCACAGATTCAAGGTCAGATGCTCTTGAGACACACATATTGCTTCAAACTTAACAATTATTCTCATCCAGCAGTTTGATAAAATTTGGCAAGTGCTTCATCACATAAAAAAACTAAGTGCAAGTGTAGCACAAAACAGATATGGTCTTTGCATTCTTTTCCTATTACTTGGCAATGATGTTTACAAAAAAATAGATGGTTCTGTTTTTAGTTTTCACAGATTTCTGCTTGTTTATTACTATCTGTTGGAATCCATACAAGAGGAACTTGTTACCATGCTTGTAATTGTTTGTAAATTTGTTTGCTTTATTGTAAACCAGCTAATTAACTATGAACAGCTACTAGGAGGACCCTTTGTGGTGGCACTTGTTACTTCTATAATGTTAACTTATGTTTCTCATCAATGTCTGCTGTTGGTAACAGATTCATTTTTTGATTATGTTGTACAGAGAAGGGGCAGAAGCACTTTGGCAGGTGGACAGTGACCAAATGGAACATTTATTTTCAACACTTGTTGATCACCTTCAAATACAAGAGGCATACAACATCTTCATACTTAATCCCAAAACCATTGGCAAGAGTACCCAGTATGGTTATCGGTGAGTTTGTCGGCACTGTTAATACAATGCATATAATTAATGCAACAGGAGTTAGAAAAATGCACATTTATTATATTTAGCATGGCAGGATCATGGACTCGTAATATAACAAAAACACTACAGGTCATTTATGGTAGCTTTTGATAGTACCAACATGGCTATGTTTCATTGCAGTGCTACCCTGCATCTGAATTTCTTCAAGATATTAATCTAGAGCCTATTTTGCACTGCTTTTTCTAAAAAAAGCCCATCTCATTTTGAATTTAGAATTTGATTTTAGAACAATTTATGTGTTTTTTTTTTTGCTTTTAAAAAAAGCAGTGCCAAGCGGGGCAATAAATTGAATGGCACCAATGTAGCTAGTCTTAAATTTATCCATTATCAATGTTAAATCCTTTGCTCAATATAAATATTGACTAAGGCTCCACTAGGTGCTGAGGTGGATTATGATAATCCTATAACCCAAATGAAGATACTGTTGCATTCCACAGAAATATTGTGAGAAACAACAGCTAAATAACATATTTTGTCTAATCTAATCTGATTTCTCAAAAATACCACAACGATTTTCTGATCAGCTCAAGAAACAAACACATCATAGTGCAGTGCACCAATTCCAAACGGTGTCATTTACATTCATGGTCTGTTCTCTGTTGATTGTTTTATCACATGGAGATATAATATGTTCTTAAATTAGACATGCGTTTTGATGGGAACACCTCTGAGGCACGTCACACAAACAAATAAAAGGAGACTCGTTTTTCTTGGCTGAACTGCCTAGAAATTTAGTTTAATATTAGAACAAAAATGGTGTCAGTTCTTATAAATATATTTTGTCGTGTTGTTGTATCATGCAAACGTTACCTCTTTCTATTCGATCCTATTTTCTGAGTGTGAGCTTGGAGCAATTTCCATAAGTTTAAATAGCCCGCAAATGGAGTTCTACAACTAGTCTTATGAATAATTGTACAGTTTTATTTCTTCTGAGAGGAAATAATTCAAATAATTGTACTGTAACACTGTTACTTGATAAGTGATGTTATGGAATGCATCAGGTCAAATATCCTTGGCCTCTATTACATGTGAAATTGTCAACAATGGCTGCATGAATATCAGAAGGACCTCTGTGGTGTTATATTTGTATATTCCATATATATTTTACAATGTCTACATTACTATAAAACGAGAACAGTCAAATTTGACCTTTGATATTGTTAAAATTACCGAACATTGCTTATTGGAGGATGAAGTTCCTAAGCACCTATGGTAGCTTTCAGCTGAAAATGGGTGCATGTGCATCAAAATAAAGTTATGTGGTAACATGCTAGGCACATGCAGAATTATCCTGTATACATAGTAACTCAAACATTGCTTAAAATGGTGGCATATTGTTACTCTTAGGTGATTTTAATAACCATCTGTGTTTACGTAGTAAGCAATCACTTTGTTGTTCATCAGCTAACTGAATTAATTATTTTTCTTCCATTTTTTTTGATTTGTTCAATACAGAGTCTGTTGGTAAGATGAGAAAAATCTTTGCTGTAGAAATAACCACTAGTTTGTACACTGGGTTCTGGATTGTTTCATGCATTTTCTCCTGTGATGTTTGATTATTTAAGTGTAATTTCAAAGAAATCACCTAACTGTTTTTGTGTTAATTTTTTCATCTTATTTTGTCTATGTTTTCATAGGAAAGGCTTCTCTGAGTCTGAGATCAACTTACTCAGGGAGGTAAGATGTGGCATGCTTTATCCATTCTGCTATATATTTAAGAATACCACTGCTTATATCTTCTTGGTAGCATAGATGATAGATCTATTTATTGTTGTTGCAATTTCTGGTAATATATCTTTGGTTGGAAGCTGGTGGACCTGCTGATAACAAGAGGGCGCCCTCATATTTTTCTTTATACTTATGCATTTTAAGGAGTTATTTTCAGTTATAACTGTAATTCACTTTATATTTACTGTCTTCCTTTCTGCTCTTTCCATTTCGAAGTTGACATGAATACATGATGCTTGACTCCAGTTTATCAGGCCTTAAATATATGCTGTGCAGATTATGTTCTTCTGAATGGATATGCTGTGCAGATTTATGTTTACCTTTCTGTATATTTCCTTAGTAACATTGGATTTGTTTGTTGAGAAACACTGTACTTTTGTGGACAATGACATGTTAGTTTTTTTTTTT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