Difference between revisions of "BGIOSGA008196"
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Revision as of 18:50, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008196 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008196, complete gene. |
| LocusTag |
OS02G0474300 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008196-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008196-PA |
| Length |
14266 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:17348190..17362455 |
| Sequence Coding Region |
17348190..17348863,17350104..17350755,17350859..17350945,17352953..17352999,17354220..17354321 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:17348190..17362455 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:17348190..17362455 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGAAGGGAAGAAGGGAGTGATATGCACAGTTTGTTTCATAGATCTGAGAAAAAGAAAAGCACATTACCTTCTTGTAGCATCATCACTGATGAGGCTTCAACATCAACTAGCAACCACAGTAAGAGTGCTATTGGTACTGAAAATAGTTCAACAAGCAGAATAAAGGACGTTAGTGAAGATAAGAAGGTATCTATCAAGAAACAGAGCAAATCTGCTAAAACTATTGCGGCAGCAAAGATTGGGACAACTGATGTGAGCGAAGAAGAAAACAAGCGTGAAATTTCCAAATCAGAAAAGAATGCCAATATTTCTAGAGATAAGAAGACATCAAACAGGTTGAAGAAATTTTCAAAAGCAAAGAAATCTGCTGTTGCTAAAGCTGAAATTTGTACGAAGAGTTCTGTTGATAGTTCTGATAGTGAGCAGAAACCACTTGTTCCTCTTTACCCTCCCACAGCTAAATCAGTTCTTGTTGTTGAATCAGTTACAAAAGCAAAAGTTATTCAAAAATACCTTGGCGACATGTATGAAGTGTTGCCTAGTTATGGCCATGTGAGAGATTTGGCTGGAAGATCGAAATCTGTTCGCCCTGATGATGACTTCAGTATGGTGTGGGAGGTGCCTGCTGCTGCCTGGACACATCTTAAGAGAATAAGAACGGCGTTGAGAGGAGCAGAAAATTTGATTCTTGCGTCTGATCCTGACCGTGAAGGGGAAACAATTGCTTGGCATATCAAAGAAATGCTTGAACGACAAGACGCTTTGGGTTGTAATGTTACTGTTGCCAGAGTTGTCTTTCATGAAATAACAGAGGATGCTGTTAAAAATGCTTTAATGTCTCCAAGATATATTGATATGAACCTAATTAATGCCTATCTAGCACGACGTTCCCTTGATTATTTGATTGGGTTTGGCATATCACCGCTGTTATGGAGGAAGTTGCCTGGTTGCCAGTCAGCTGGACGAGTCCAATTTGCGGCGTTGGCTCTTCTGTGTGATCGAGAGGCTGAAATAGAACAGTTTAACCCAGAAGAGTATTGGACTATTGATACTGACTTCAAAACCCAACATTCCGGCCCTTCAAATGGCCTGAACCTTCAAGCCCAGATAAAGCATTTGAATTCAAAAAAGTTGGATCAACTTTCTATATGGTCTCAAGAAGAAGCACAAGATATAGAGAAGAGGATTTATTCGTCTCAATTTGAAGTAATAGGAATTAAGAGAAGTAAAATTCACAAGAATCCTCCTATGCCATATATAACATCTAGCCTTCAGCAGGATGCAGCAAACAAACTACATTTTAGTGCTGGGTATACCATGAAGATAGCCCAAAAGCTTTATGAGGGGATCACCCTTTCCTCAGAAGACGCAACTGGGTTAATTACATACATCCGAACAGATGGCTTTCATATTTCTGATGTAGCTGCAGAAGATATTCTTTCATTAGTAAAGCAAAGGTATGGTGAGGAATATGCTTCAGAGGGCATTAGAAAATACTTCAAGAAGGTGAAAAACGCTCAAGAATCGCATGAAGCCATAAGGCCAACCAGCATAAGGAGTTCTGTCGTAATATACCTTGCAGCATCTTTGGTCAGTACACTTGATGATGATTCTTTGAAACTATATGCCCTAATATGGAAAAGAACTATGGCTTGCCAAATGGAAGCTTCTAGAGCTGAGATGATTCAAGTTGATATTGGTAATTCTAAAGGAGACATGATTTTTCATTCGTCTGCATCAAATCTTGACTTCAAGGGATACCAAGCTGTATATGATGACACGGAAGCAAGTCCTTCCAGTAACAATTCTGAGGATGATGCTGTTCATCAGGATAACTTTGAGGCCTTGTCCAAATTAAAGGTGAAGGACTTGATGTCTCCAGTTAACGTTCATCTTGCACAGAACTTTACTAAACCTCCATCACGTTATTCCGAGAGTGCATTGATTAAAAGATTAGAAGAACTTGGAATCGGAGGGCCATCCACATACTCTTCTATAATGAAAGTATTGCAGGATCGTAACCATGTGACAGTAAAAGGTCAAGTTGTGCACCCCGAATTCCGTGGTCGGATGTTAGTCTCAGCATTTCTTACACATCACTTCTCAGAAGTTGCAGATCTCAGCTTTACTGCTAACTTGGAGACTGAGCTTGATAACGTCTCTGCTGGATCAACTGAATGGAAAGGCCTTCTGAAAGATTTTTGGGAACGATTCAATAAATATTGTGGCAATGCTAGTCGCCTTCAAGTCAGGAAGGTAGAGAGAATGCTTGAAGAAAAATTTGGTTCCATCCTCTTTCCTGACCTTGACAATGATAGTAGGATATGCCCTAGTTGTTCTGAAGGAACTCTGAGATTGAAAGTAAGTAAGCATGGTGAAGGATATTTTATAGGTTGTGATCGACATCCGAAATGCAAGTACATTGCTCGCACATTGTCGGTTGAAGTTGATGAAACTGAGGCATCTGATGAAATTCAAAGCACTTTTACACCTAGGTTACTTGGGGTGCTACCTGATTCTGATGAGAAGGTGTTTCTGAAACAAGGTCCTTACGGTCACTATATCCAGGTTGGAGAGGATATAAAAGGAGTGTCTCGGAAAAGAGCTCCTCTTTCTGAAGTGAAAGATATTGACTCAATCACTTTAGAAGATGCAATCGAGCTATTGCAGTATCCCAAAATCCTGGGAAAACACCCTGATGATGATCTTCCTGTACTTGTAACACATTCTAAATCTGGATTTAGAATCAGACACAGGAGAACTCTTGCTCCATTGCCGAAGAGCGCAGACCCAAAGGAGATTACGCTCGAGCGTGCATTGAAGCTTTTGACAGGTAAAAACGTGATAAGGTTTGGTCGCCCTAAGGGAATCAAGAACCCAGAACCCCTTGAATACCATTCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRREEGSDMHSLFHRSEKKKSTLPSCSIITDEASTSTSNHSKSAIGTENSSTSRIKDVSEDKKVSIKKQSKSAKTIAAAKIGTTDVSEEENKREISKSEKNANISRDKKTSNRLKKFSKAKKSAVAKAEICTKSSVDSSDSEQKPLVPLYPPTAKSVLVVESVTKAKVIQKYLGDMYEVLPSYGHVRDLAGRSKSVRPDDDFSMVWEVPAAAWTHLKRIRTALRGAENLILASDPDREGETIAWHIKEMLERQDALGCNVTVARVVFHEITEDAVKNALMSPRYIDMNLINAYLARRSLDYLIGFGISPLLWRKLPGCQSAGRVQFAALALLCDREAEIEQFNPEEYWTIDTDFKTQHSGPSNGLNLQAQIKHLNSKKLDQLSIWSQEEAQDIEKRIYSSQFEVIGIKRSKIHKNPPMPYITSSLQQDAANKLHFSAGYTMKIAQKLYEGITLSSEDATGLITYIRTDGFHISDVAAEDILSLVKQRYGEEYASEGIRKYFKKVKNAQESHEAIRPTSIRSSVVIYLAASLVSTLDDDSLKLYALIWKRTMACQMEASRAEMIQVDIGNSKGDMIFHSSASNLDFKGYQAVYDDTEASPSSNNSEDDAVHQDNFEALSKLKVKDLMSPVNVHLAQNFTKPPSRYSESALIKRLEELGIGGPSTYSSIMKVLQDRNHVTVKGQVVHPEFRGRMLVSAFLTHHFSEVADLSFTANLETELDNVSAGSTEWKGLLKDFWERFNKYCGNASRLQVRKVERMLEEKFGSILFPDLDNDSRICPSCSEGTLRLKVSKHGEGYFIGCDRHPKCKYIARTLSVEVDETEASDEIQSTFTPRLLGVLPDSDEKVFLKQGPYGHYIQVGEDIKGVSRKRAPLSEVKDIDSITLEDAIELLQYPKILGKHPDDDLPVLVTHSKSGFRIRHRRTLAPLPKSADPKEITLERALKLLTGKNVIRFGRPKGIKNPEPLEYHS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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