Difference between revisions of "BGIOSGA008669"
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Revision as of 18:52, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008669 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008669, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_08174 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008669-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008669-PA |
| Length |
12767 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:27013537..27026303 |
| Sequence Coding Region |
27013537..27013584,27014459..27014535,27014994..27015118,27015555..27015625,27017871..27017933 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:27013537..27026303 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:27013537..27026303 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCTTTCACCAAGCTCGAGGACTCCCCCATGTTCCGCAAGCAGGTCAATTCTATGGAACAGCTAAGCGATGAACTGAAACAACGATGTTCGAATCTTCATAAAGGATGCAAAAGATTCATTATTGCTGATAACCTTAGTTTCAGGGGATCACTTGATGAAGGATACGCGGGAGATCTAACATTTGCCGATGCTCTAGAAGCATTTGGTGCTGGTCAAGATGACCCTGTTAGTGTTGCCATTGGAGGGCCTGTCATGTCCAAGTTCACTACTGCTTTTAGGGAGCTGGGAACATACAAGGAACTCCTTCGTTCTCAGGTTGATCATATGCTTAGTGAACGTTTGATGCAATTCATTGATGTGGATTTGCATGGCGTGAAGGATTGTCGTCAGCGTTTGGATAGGGCTACAGTGGGGTATGATCAGGCACGTGAAAAATTTGTATCAGTACGAAAAGGGACTAGAGCAGAAGTAGTGACAGGACTTGAGGAGGATCTACACAATGCCAAGTCAGCTTTCGAACGATGCCGCTTTAACCTAGTTCTAACATATGCACAGCAATCAAAAGAAATGGCTATCAATGAACAAGATAAACTTGCAAAGAGAATTCAAGAATATAGGACTCAAGAGGAAATCGCGAACTTGAGAATGGCTAGTAATGTGGACACATCTACCAGTGGTGATGGTATCCATGTTGTTGGTCTTCAATCCTATAAAAAGATTGAAGCCCTAATGCAGTCAACTGCCAATGGCGAGGTTCAAATAATCAAACAAGGTTATCTCTTTAAGCGTTCTGAAAATTCACGAGAATGGAAGAGAAGGTTCTTTGTTCTCGACAGTCACGGGACTCTTTTCTACTACGGGAATAAAGGACAATCGCAAGGAGCGGCATCACAGCAAACAGCTGGTGAAGGGACTGGTGTTTTTAGTCGTTTCAGATTCTTGAACCAAAAGGCTCCAACTCAGGGTGACAATGCACTTTCATGCCACAAAATTGATCTAAGAACTTCAACAATTAAGATTGATGCAGAAGAAAATGACCTAAGATTTTGCTTTAGAGTAATCTCTCCCATGAAAGCATACACTTTACAGGCAGAATCTGGTGCTGACCAAAAGGATTGGATTGAGAAAGTTACTGGAGTTATTGCATCACTGCTTAATTTACCATTCCCAAGACAGGTGTCGTATGGAAATCTAGAAGCGGAACATCATGGTTCTGCAAATTCTGTTGATTCTCACTCTCTTGAGGAGAACAAAAGTCCAGAGGGACATGATGATATATTCAACCATCTCAGGAATATTCCTGGAAATGACAGTTGTGCAGAATGTCGTTCACCAGATCCTGATTGGGCATCTCTAAATTTAGGAATTCTTATTTGTATAGAGTGTTCTGGGGCTCACAGGAATCTTGGAGTCCATATTTCGAAGGTTCGATCCTTGCGATTAGATGTCAAGGTATGGGAGCCAGTGATAATGGACTTGTTCCGTGAACTTGGAAATGATTACACTAATTCCATTTGGGAAGCTATGCTTCCGAAAGAAGATCAAGGAATAAACGAGTTTAATGATGCTATTCTTTTCATCGAAAAGCCTAAACCCACTGATGCTTTTTCAATAAAGGAAAGGTACATACAGACAAAGTATGTCGACAAGCTTCTTATTGCCAAAGATACCAATCAAATTACCATTGATATATTGGAGGCTATAAGGACGAATGATGTGAGGGCAGCATATCACATTCTTGTGTTGGCTGATGTGAGCCCTAACATGATATATGATGAGTTAAACAATGATGTTCATCATGATCCTTCAGTAACAGACGGGAAGTTATTTGATCCAGCATCTTGTGATGTAAAGGATGATTCTGGGAAACCAGAAGGTTGTCTACAAGGCTGTTCCCTGTTGCACATTGCTTGCCAATATGGTCATTCTATAATGGCAGAGCTTCTGCTTCTTTTTGGTGCGGATATTAATAAGCAAGACTTCCATGGACGGACACCGTTGCACCATTGTGTCCGAAGGAAAAATGATGCACTTACCAAGCATCTGCTAAAGAGGGGTGCAAGAACAACCATTAAAGATGGTGGAGGCTTGACTGCTTTAGAGAGAAGAATGGAACTTGGAGCAATAACTGATGAAGATTTGTTCATTTTATTTGTAAGAGATCGACGAATGGAAGGCCAAACGCCCAGATCATCTGCGAGTCTACGACCTGGAGTGCAAATGGTGTTTGTCTCTGGAACAGAGGAGATGACGACTCAGCTCAAAGCCCCAGAGAGAAACGGTCACGGGATGGTGGCACGCTCGTGGTCGTGGGCGCCTGGGCGACGGACGTGCAAGCTGCAGGAGCATATGAAAGAGCGAGCCATGAAGGACGGGCAGGCCACACTCACGGCGAGCTGCAATGCCTGCAAGGCTGCAAATCAGAGTCTGCGCATCTACAGCGTGTCATTATGCATGATCGCCATTGTTCCAAGATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAFTKLEDSPMFRKQVNSMEQLSDELKQRCSNLHKGCKRFIIADNLSFRGSLDEGYAGDLTFADALEAFGAGQDDPVSVAIGGPVMSKFTTAFRELGTYKELLRSQVDHMLSERLMQFIDVDLHGVKDCRQRLDRATVGYDQAREKFVSVRKGTRAEVVTGLEEDLHNAKSAFERCRFNLVLTYAQQSKEMAINEQDKLAKRIQEYRTQEEIANLRMASNVDTSTSGDGIHVVGLQSYKKIEALMQSTANGEVQIIKQGYLFKRSENSREWKRRFFVLDSHGTLFYYGNKGQSQGAASQQTAGEGTGVFSRFRFLNQKAPTQGDNALSCHKIDLRTSTIKIDAEENDLRFCFRVISPMKAYTLQAESGADQKDWIEKVTGVIASLLNLPFPRQVSYGNLEAEHHGSANSVDSHSLEENKSPEGHDDIFNHLRNIPGNDSCAECRSPDPDWASLNLGILICIECSGAHRNLGVHISKVRSLRLDVKVWEPVIMDLFRELGNDYTNSIWEAMLPKEDQGINEFNDAILFIEKPKPTDAFSIKERYIQTKYVDKLLIAKDTNQITIDILEAIRTNDVRAAYHILVLADVSPNMIYDELNNDVHHDPSVTDGKLFDPASCDVKDDSGKPEGCLQGCSLLHIACQYGHSIMAELLLLFGADINKQDFHGRTPLHHCVRRKNDALTKHLLKRGARTTIKDGGGLTALERRMELGAITDEDLFILFVRDRRMEGQTPRSSASLRPGVQMVFVSGTEEMTTQLKAPERNGHGMVARSWSWAPGRRTCKLQEHMKERAMKDGQATLTASCNACKAANQSLRIYSVSLCMIAIVPR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..48#923..999#1458..1582#2019..2089#4335..4397#4747..4791#4901..4966#5050..5097#5517..5732#6081..6203#6367..6579#6701..6787#7029..7277#8157..8278#8909..8999#10018..10433#11039..11143#12449..12767#ATGGCGGCTTTCACCAAGCTCGAGGACTCCCCCATGTTCCGCAAGCAGGTGCGCCGCCGCCCCGCCGAACCCTCTCTTCTCTCCCTGCCCGCGGGATGTGTCACCTTTTGATCCGGCCCTCTCAGGGTTCGTTGCTTTCGGGGCGAGATCTGGCCTCCGGCTCCGCGTCGTTGGTTGGATTTGGGTTGATTTGGATCGTACGTGGTGGGGGATTTAGGGGGGGGGGGGGTGGAGCTGGAGGTTGGGGTGATTGTGGTAGCTTTGGGCTTGGATTTGGGAGGTTGGGCGCATTCTGTGTGGCGAGATCTCGACCTGATTTCATGCTTTATTGGCCATTGATTGGTTCGGAAATGCGATTGTTCCTGAGTAGAATGGATATCAATTCCGCTTTGGTTTCGACGAATACCGTAGGTTGGCTTTGTCGTGTTGATTCGCCGGCATGAGTGCATTGTAGGTTGCAAAAGGAATATTATTTTACATTTATTGTGTGTTCTCTGTTCCTTTACCGATCGTTTTCATCTTTGAGCAGTGCTGCATTTCTGATTGTAATGGTGCCATTTTATTTTTATTGCTGCATCACACACTTGAACAATTTTTTAATTCATCGACTAATTTCTCGAGAAAAAATCCTGTAAAAACTTAGGGACGAAATAAGCTAGACGGTTTTCTTTTCCAGTTCAAATGGCTGGTTTGGGTTATTAGAAGCCACAGAAAAAACAGTGACCTGTTATTTAGACTCGAAGGCTGTGTGTAGATTGGTTTTAGTAGTTTTAATATATAATTTGGACTGCAAGCTTCCTGCTTGTGCTATCAAGTTGAATCTTCTCTTTTTTTTTTCTGATAAATCCTTTTGTTTTCATCTTAAACAGACCTTTACATGCATATATGCTATTGATTGCGGCTTATTTCCATTGACTTGCAGGTCAATTCTATGGAACAGCTAAGCGATGAACTGAAACAACGATGTTCGAATCTTCATAAAGGATGCAAAAGATTCATGTACATTAAGCTCCCAACTACTGTTTTTTTTGGCCGAGCTACTAACTTTGCAGCACAGGCGTACACTCGATGCAGAATGTGTAGCATGATTATTTCTTTTTTTTTTTGGGTTTAAGAAAGACATCACTCTTTCTTCTAGGTTTATGCCGATGTAAGTCAATATCAAGTTTCTGTAGCATACAACCTTTTACTACAATGCACACAATTACACGATTTCAAAACTTGTTTCTGTTTCTATGGTCCAATATGAATTGTCTGCAAGTTTATATCGATAAAAATGCTTATTGGATAAAATTTTGTGTCAATAAATGACTTTGCATTCTTCTTTCTTACTTTTCTGGTTCAGGATTAATATTTTTTTGTTACCATGTTACATGTAATAATTTGTAGTTCCTATTGTTCCTAGGATAGACAACGATAATAAAAAACCATATGTTTGATATATTGTTTTGTTATAGTATTGCTGATAACCTTAGTTTCAGGGGATCACTTGATGAAGGATACGCGGGAGATCTAACATTTGCCGATGCTCTAGAAGCATTTGGTGCTGGTCAAGATGACCCTGTTAGTGTTGCCATTGGAGGTTAATTTCATCAAATCTCTGTTATATCTGTTGCTTAATTTTTCCTGGTTTCCCATCCATAGATAGCTAAACAACTGAGTCCATCCTTGCCAATTGCTAAACATCTTGCCATGTTGGCGTCCTTTTGTCTCCTATCAAGTATGTACCACATCTTTAATTTTATGTCTGTTCCCTCTCTTAAGGAAAGATCACAGTAACAGATCATTAGAATATATATAAATGCAGACATAAGCAAGCACATACTATGGACTTCTTTTATTTTACTTATTAATATGTTGTAGGCTTGTACTATGATAACACAATGTTTCTTAACTGTAATGGTTTATTGCAATGCCATTTCACTGAAATTATGGAATGCAAATTTGTTAATAAAGTGAAGTTCATGAACACATTCAGCTTTCAATGTGGAAGATCCAAATTCTGAATTCTGTTGCAGGGCCTGTCATGTCCAAGTTCACTACTGCTTTTAGGGAGCTGGGAACATACAAGGAACTCCTTCGTTCTCAGGTAAAATCTATTCTATGCCATTGAATTCTTTATGTACTACTCCCTCCGTCCCACAAAATATGGAATCCTGGATTCCCAATGCAAATTTAGTAATAACATAGAAAGACCAAAGTGCCCTCATTACTACATTCATTCATCCACCCATTAATTCACACAGCACATACTATAAGAAAAAAAAGAGGCATCTGGCACAAAAATAAGCGCCAAAAATTTGAAATTTTCTAGTACCTGCAGAAAGAAAAGAGAACATCTCCCATCTGAACAAATAAATGCTGGCAAGAAATGCTCTTATTTAACCTGCAAAAATTAACAAGAACCAAGAACAGAGAAGAGAAAGGTTGTCCGCCTTCACCAAGGTGGCAGTCATCCACGGTGCACCAAAGGGCAAGAAGAATTCAATACAGTTAACAAGGTCGAAGGGCAGAAAGAAACGTCGGTGGAAAAGAAGAATAGATGGAAAAAGAATACAAATGGGGTTCATTCTAATGACACGCTTCTTGAACTCATCGACCACCTCAGTGTTGGGAGATCCACGGGCGCCTCCCTCTCTGCCGCGGCACCCGAGCTGCATTCCATCTAACGTCGTTGCCAGCATCGGATTTGCCTCTTGCGAATCTCCTCTGCACCGCATCCATCCGGCACTGATGCAGCCATCACATCCGAGTTGCAGCATCAGGGTGGACGCATAAGGTCGTCGGGAGGAGCGAGAGGGGAGCGCGAGACAGTGGCGCAGTGGGCATGGGGATGGAGATGGAGATGGAGATCGTTGGAGCGCCGCATTGATGAACGAGCGAGACGATGGTGAATGAGAGAGACTCGAGCGAGATGGGTGTGTGCCTGGGAAGAGATAAGGTCCTTCTCGACCACCGATGTGAAGTACTCAGTCATTGAATGTTTCACTTTTTTTTGTACAGATCTTTTTTTTTTCTGGGACCCTCCTCCTCCAGAAATCCTTTTTGTGGGACGGAGGGAGTAATTGGCACCCTGTGCGCTGCAACACGCTGATCAATTGTTAATATGAAAAATTAGCTGGGTGATGGAACGAGAAAAAGAGCATAGCATAGTACTACCTCCGTTTCAGGTTATAAAACTTGTCTCTAGATTCATTAACATCTATATGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAACCTGAAACGGAGGAAGTAAAATTTTTCATTTTGATAAATTCTGATAGCGTTGGTGAAAGAATGTGCATTTAATTTCAGATAAAAAATGCTTCCTGTCCAAATTTCAACTGCAATAAATAGGACTCTACATAAAGATTGTCCAGTTTCATCATAACACAAATGTTCCATGAAATACAAATCGAAGTGAATGTACCTCCTTCAATTGCTTAATGCAAACACTTGGAAACAAGAAAAAATAAGTAAGATCTATTCAATTGTTTGTTTCAAAATCAGTAGTTTTGTGACAAGACTCAGTTGAGTCTGACTCACCAAAGCATTCAACGGGAGGAAGCATAGGGAAGAGGAATGAGGTGGGTATTATGACCTGTGATCATTGTATTATTTGATGGGATGATAAACTCACGCATACGTACGGTACTTCTCCGGTAGACCCATGGTGTTGGGTGTCAAGGTGTGGAGGACTTGTGGGCTACGCATTATGCCAGACATGGAGCACCAGAGTGAGGGCAGGTGTGCGCTGAGGAACGGAGGAAGGCATATAGTAGGGGATGGACGCTGAAGATGCAGATTAAATTCCTCACATCCTACCTTGTCTGCAGCAGTGCGGTCCACTCAGATTCCTTGCCATTGCATCAGCGGTTACAGAAGAGGATGTGATGATGATTGATTAGTGAGAGGATGAGAGAATGGAGCATGTAAGGAAGCATGGTAGTTGGGCCGGATCATTTGCAGGTTGATGACTTAATCAGGAATTTTTGGAACATGTAGGTTTTTTGCATGGCATATACAAATTGAGGTGACATAGCACGATGAGAGGAGAGGAAAATAGCTTTAATTGCAGTTAGTGGGAATGAACTTTATAGGTACATAGGATTCTCCTTCTCCATATGTTGTTTCATACGTCCATATCACTCATCGGTAATGAAATTGAAAAGTAAGATTGCTGAATGGGACTAGGAGTTCCCTTTTGATGCAAATAACACTGTGACACTGTAAAAGGGTTATTTGCAAAGAAGAACCATTTTTGTTCTTTTTATTTTTGCTAGCTTAACAGATTGAATCTCTATCATTCTAATCAGTATGTCTCCTCAACCAGGTTGATCATATGCTTAGTGAACGTTTGATGCAATTCATTGATGTGGATTTGCATGGCGTGAAGGTGAGGGTGACAACCTCCTGCCCCCAAAAAATTAAGCACACTACTGAGATCTGTATTTATGTAGGTAGTACCTCAGGTTTTGCTCTTCTTCATGGATACATAGCTTGCGTGCTTGACTTTTTGTTGGATCCGAATTTCAAGCCTTTTGCTTCTGACAATGAAAAAATTGCATGAAGTGATCTTAGAAATGTAGTTTGAGTTTCACTGACTTCCATTTTGGGTAATGGGAACAATATATGGATGTCCTTCTGTCTTAAATACACTTGCCCTACTGTCTTGATGTTCATGTGGAAGTTTTTAACACATTAATTAGTTAATACTATAGGCTAACATCCTGCACTGTATATAGGATTGTCGTCAGCGTTTGGATAGGGCTACAGTGGGGTATGATC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