Difference between revisions of "BGIOSGA008767"
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Revision as of 18:53, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008767 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008767, complete gene. |
| LocusTag |
P0461B08.4-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008767-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008767-PA |
| Length |
16900 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:28708093..28724992 |
| Sequence Coding Region |
28708093..28708468,28709166..28709244,28709337..28709410,28709767..28709876,28709957..28710037 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:28708093..28724992 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:28708093..28724992 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGGCACTTGCGGGGGAGGAGCTCCGTGACCGCAGCAGCAGCCGCAGCGCTACATAAACCGGTCGCCCACCTGCGCCTCCTCCTCGCAGTCTCCGCCTGGTCCGTCCCCGCCGCAGCCTCCAACGTCGCGGCGGCTTCGACTACGACTCGAGGCGGCCCGAGCCCTAGCGCGGGCGTCGCGCCTAGAGCGATGCCTTCCTCGTCCTCCTCGCCGCCTTCCGCCGCCGAGGGGACGACCGCTGCAGCGGGTGGGTTCCGCCTCACCGAGCCCTCGTTCCTCGAGTCGCTGATGCCGAAGAAGGAGATCGGCGTCGACCGCTTCCTCGCCGCGCATCCCGAGTACGACGGCCGCGGCGCGCTCATCGCCATCTTCGATTCTGGAGTTGATCCGGCTGCAGCTGGTTTGCAGACTACTTCAGATGGAAAGCCCAAGATCCTTGACGTTATTGACTGCACGGGTAGTGGTGATGTTGACACGTCCAAAGTGGTGAAAGCTGATGATGATGGTTCTATTGTTGGTGCTTCAGGCACCCATCTGATTATAAATCCCTCATGGAAGAACCCTTCTCAAGAGTGGCATGTTGGCTGTAAATTAGTCTATGAACTCTTCACGGACACACTTACCTCTCGTTTGAAGAAAGAAAGAAAGAAGAAATGGGACGAGCACAGCCAAGAAGCAATATCTGAGGCCTTGAAACAGCTGAATGAATTCGAAAAGAAACACAGTAAATCTGATGACGCCAAACAAAAAATGGCTCGTGAAGACCTGCAAAGCAGGCTTGAGTACCTGAGGAAACAAGCAGAAGGTTACGATGACAGGGGGCCGGTAATTGATATTGTTGCATGGCACGATGGTGATGTGTGGAGGGTTGCTGTTGATACCCAGGGCCTTGAGGGCAACAAAAATTGTGGAAAACTTGCAGATTTTGTTCCATTGACAAACTACAGACTTGAGCGGAAGTTTGGGATTTTTAGCAAATTAGATGCTTGCTCTTTTGTAGCAAACATTTACGATGATGGAAACCTTGTTAGTATAGTAACTGATTGCTCTCCTCATGCTACCCATGTTGCGGGCATTGCAGCTGCTTTTCATCCTGATGAACCTTTGCTCAATGGAGTTGCACCGGGTGCACAACTGATTTCCTGCAAGATTGGCGATACCCGTTTAGGATCAATGGAGACAGGGACAGGCCTGGTTAGGGCCTTGATAGCTGCAGTAGAGCACAAATGTGATCTGATTAACATGAGCTATGGAGAGCCTACCCTTCTTCCTGACTATGGCAGATTTATTGATCTTGCTAGTGAGGTTGTAGACAAGCATCGTATTATATTTATTAGTAGTGCTGGAAACAATGGTCCTGCTTTAAACACTGTCGGTGCTCCTGGTGGTACTAGTTCAAGCATTATTGGCGTTGGCGCTTATGTCTCACCAGCTATGGCTGCTGGAGCTCACTGTGTCGTACAAGCACCAGCTGAGGGGATGGAGTACACATGGTCTAGCCGAGGTCCTACTGCTGATGGGGATCTTGGTGTCTCCATTAGTGCACCGGGTGGAGCAGTGGCTCCTGTACCAACATGGACACTTCAGTCTCGCATGCTCATGAATGGAACTTCCATGTCATCACCTTCTGCCTGCGGTGGGGTTGCTCTTCTTGTTAGTGCCATGAAGGCTGAAGGCATTCCATTAAGCCCTTATACTGTGAGGAAGGCAATTGAGAATACAGCTGCATCAATAAGTGATGTGCCTGAGGAGAAGCTAACCACAGGGCATGGGCTTTTGCAAGTTGATAGGGCTTTTGAATATGCTCAACAGACTAAGGAATTGCCACTTGTTTCTTATAGAATATCAATCAATCAAGTGGGCAAGCCAACTTCTAAACTTAGAGGAATATATCTACGTGGGAGTAACACATGCCGGCAAACAAGTGAGTGGACTGTTCAACTAGACCCAAAATTTCATGAGGATGCAAGTAACATGGAGCAATTGGTTCCATTTGAGGAGTGCCTGCAGCTGCATTCCACTGATAGCTCTGTCATCAAAATTCCTGAGTATATAATGGTGACAAACAATGGGCGCACTTTCAACATTGTTGTAAATCCTGTTAATATCAGCAGCGGCCTTCACTATTATGAAGTTTATGGTATAGATTGCAAAGCACCATGGCGTGGACCTATTTTCCGCGTACCAATCACTGTAATAAAGCCTATTGCTCTATCAGGAGAGCCACCTGCATTGACTCTTTCAAATCTTTCCTTTAAGTCAGGTCACATTGAAAGAAGGTTCATAAATGTGCCTATTGGAGCTTCATGGGTGGAAGTTACAATGCGCACATCAGCCTTTGATACTCCTAGGAGGTTCTTTTTGGACACTGTTCAGATCTGTCCACTGAAGCGACCTATTAAATGGGAGGCTGTTGTCACTTTCTCTTCACCTTCTCTCAAGAATTTCAGTTTTCCTGTAGAAGGTGGCTTAACTTTGGAGTTGTCCATAGCCCAGTTCTGGTCTAGTGGAATTGCTAGCCATGAACCTACCTGTGTTGATTTTGAGATTGTGTTTCATGGAATATCCGTTGATCAGAAAATAATTGGCCTTGATGGTAGTGAGGCACCTGTGCGTGTTGTTGCTAGATCTCTATTAGCATCAGAGAGGCTTGTTCCTGTTGCCACTCTGAACAAGGTCAAGACCCCTTATCGACCAGTGGAGTCTAATCTTTGTTCACTTCCTCCCAGCCGTGATAGATTACCATCCGGCAAGCAAATCATAGCACTAACTCTGACTTACAAATTCAAACTAGAGGATGGTGCTGAAATAAAGCCCCGTGTGCCCCTACTTAACAACAGAATATATGATAACAAGTTCGAGTCTCAGTATTATAGAATATCAGATTCAAACAAGTGTGTCTACTCTTCTGGTGACGTCTATCCTAATTATGTCAAACTCTCAAAAGGTGAATACACGCTGCAATTGTACATAAGGCATGACAATGTGCAGTTATTGGAGAAACTGAAGCAGTTGGTTCTATTTATCGAGAGGAAGCTAGAGAAAAAGGATTTCATTCAATTGAGTTTCTACTCTGAACCTGATGGCCCTACAGTTGGAAATGGCACCTTCAAATCCTCTATTTTAGTTCCAGGAGAACCAGAAGCATTCTATGTGGGTCCACCATCTAGAGAAAAACTTCCAAAGAATGTTCTACCTGGGTCTGTTTTGGTTGGGTCAATTACCTATGGTGTGGTAAGCTCTTTCAGCAAGAAAGATGACCAAAACCAGCATGCTCCAGCATCTTATAGTATCTCGTATCTCATTCCACCATCAAAGGTTGATAATGATAAAGAAAAGGGAGTTTCATCTGGAAGAAAGAGTATTTCAGAGAGATTGGATGACGAGGTTCGAGACACCAAGATAAAGTTCCTTTCTGGCTTTAATCAAGAAACTGAGGATGACAAGTCTTCTTGGACGGCACTTGTTGCTTCTCTTAAGTCAGAGTATCCCAAGTATACACCTTTGCTTGCCAAAATTTTGGAATGCATAGTTCAGAAAGCAACTTCAGATGATAAGTTTAGCCATCAAAAAGAGATTATAGCTGCAGCTGATGAGGTTGTGGACAGTATTGATAAAGAGGATCTGGCAAAGTCTTTGTCCCTTAAACCAGATCCTGAAGATGAAGAGGCACAGAAAAATAAGAAAAAGATGGAAGAAACACGAGACCAGTTGGCTGATGCACTATACCAAAAGGGTCTTGCATTGGCAGAGATTGAGTCGCTAAAGACTGATGAGTCAACTGAGGCATCTGCTAAAGATGTTTTTGAAGAGAATTACAAAGAATTAATTAAATGGGTTGATGCCAAAACTACAAAATACGGCTCTTTAACTGTCCTGCGTGAGAGGCGCTGTGGAAGACTTGGCACTGCATTGAAGGTTCTGAATGACATGATTCAAGATGACTCTGAGCAACCAAAGAAAAGACTCTATGATTTGAAGATCCAATTGATTGAGGAGATAGGATGGGTCCATGTATCGGCCTACGAGAAGCAGTGGATGCATGTCCGATTTCCCCCATCTTTGCCTCCGTTTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MWHLRGRSSVTAAAAAALHKPVAHLRLLLAVSAWSVPAAASNVAAASTTTRGGPSPSAGVAPRAMPSSSSSPPSAAEGTTAAAGGFRLTEPSFLESLMPKKEIGVDRFLAAHPEYDGRGALIAIFDSGVDPAAAGLQTTSDGKPKILDVIDCTGSGDVDTSKVVKADDDGSIVGASGTHLIINPSWKNPSQEWHVGCKLVYELFTDTLTSRLKKERKKKWDEHSQEAISEALKQLNEFEKKHSKSDDAKQKMAREDLQSRLEYLRKQAEGYDDRGPVIDIVAWHDGDVWRVAVDTQGLEGNKNCGKLADFVPLTNYRLERKFGIFSKLDACSFVANIYDDGNLVSIVTDCSPHATHVAGIAAAFHPDEPLLNGVAPGAQLISCKIGDTRLGSMETGTGLVRALIAAVEHKCDLINMSYGEPTLLPDYGRFIDLASEVVDKHRIIFISSAGNNGPALNTVGAPGGTSSSIIGVGAYVSPAMAAGAHCVVQAPAEGMEYTWSSRGPTADGDLGVSISAPGGAVAPVPTWTLQSRMLMNGTSMSSPSACGGVALLVSAMKAEGIPLSPYTVRKAIENTAASISDVPEEKLTTGHGLLQVDRAFEYAQQTKELPLVSYRISINQVGKPTSKLRGIYLRGSNTCRQTSEWTVQLDPKFHEDASNMEQLVPFEECLQLHSTDSSVIKIPEYIMVTNNGRTFNIVVNPVNISSGLHYYEVYGIDCKAPWRGPIFRVPITVIKPIALSGEPPALTLSNLSFKSGHIERRFINVPIGASWVEVTMRTSAFDTPRRFFLDTVQICPLKRPIKWEAVVTFSSPSLKNFSFPVEGGLTLELSIAQFWSSGIASHEPTCVDFEIVFHGISVDQKIIGLDGSEAPVRVVARSLLASERLVPVATLNKVKTPYRPVESNLCSLPPSRDRLPSGKQIIALTLTYKFKLEDGAEIKPRVPLLNNRIYDNKFESQYYRISDSNKCVYSSGDVYPNYVKLSKGEYTLQLYIRHDNVQLLEKLKQLVLFIERKLEKKDFIQLSFYSEPDGPTVGNGTFKSSILVPGEPEAFYVGPPSREKLPKNVLPGSVLVGSITYGVVSSFSKKDDQNQHAPASYSISYLIPPSKVDNDKEKGVSSGRKSISERLDDEVRDTKIKFLSGFNQETEDDKSSWTALVASLKSEYPKYTPLLAKILECIVQKATSDDKFSHQKEIIAAADEVVDSIDKEDLAKSLSLKPDPEDEEAQKNKKKMEETRDQLADALYQKGLALAEIESLKTDESTEASAKDVFEENYKELIKWVDAKTTKYGSLTVLRERRCGRLGTALKVLNDMIQDDSEQPKKRLYDLKIQLIEEIGWVHVSAYEKQWMHVRFPPSLPPF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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