Difference between revisions of "BGIOSGA010243"
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Revision as of 15:33, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA010243 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010243, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_12616 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010243-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010243-PA |
| Length |
13081 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:27033509..27046589 |
| Sequence Coding Region |
27046271..27046589,27045694..27045854,27045337..27045402,27045115..27045192,27044146..27044260 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:27033509..27046589 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:27033509..27046589 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGAGCCTAGCACAGTTAGAGCTGTTGTGTGAAAAGCTTTACAATTCTAGAGACTCTGCTGAGCGAGCACACGCTGAAAGCATCCTCAAGTGCTTCTCGGAGAACAGTGACTACATTTCACAGTGCCAATATATATTGGACAATGCCTCAACACCATATGCCCTGATGCTGGCCAGTTCAAGCTTGTTGAACCAAGTCAACGACCGCAGTCTTTCATTGCAATTGCGCCTTGATATCCGTAATGTTCCTTTCCAAAAATCTATCATGAAATCAGTTATTCAGCTATTTTTGCTTTTCTATTGCATCTGCATGGCATGGAATTATGTCATAAACTATCTTGCTACGAGGGGACCTAAACTGCAGACGTTTGTGATTAAATCCCTAATTCAGCTTGTCTGTCGAATTACAAAATTTGGATGGTTCGATGATGATAAATTCAGAGATATTGTCAAGGAGGCAGCCGATTTCTTATCTCTTGCATCCCAGGATCATTATTTTATAGGATTGAAGATACTATATCATCTTGTAGGAGAAATGAACCAGAACTGCACAATGTGCTTGTTGGCACTTATAAATCGCACATGCACATACATTCATAAAACATCGGATGAGACACAGAAGGCAAACGCGATGCCTTTGACACTTCACAGAAAAATTGCTTGTTCGTTCAAGGACCAGTTTCTTCTACAGATCTTCCAAATTTCTTTAACCTCATTACACCAACTGAAGAGTGAAGTACCTGATGACTTTAGGCGTGATCCTCTCTCGCTTGCATTAAGGTGCTTGTCATATGACTTTGTTGGTTGTCCTGTGGATGAAAGCTCTGAGGAATTTGGTACAGTGCAGCTTCCTGCATCTTGGAGGCCTCTCCTTCAAGATCCTTCTACTGTTCAGATCTTCTTCGATTACTATAAAGTCAATGATACATGTGTTTCAAAAGAGGCTTTGGAATGTCTTGTGAGACTTGCTTCTGTCAGGCGCAGTATTTTCGTTGAGGACCCTTCAAGGACCCAGTTTCTTTCTCATCTGATGTCAGGCACAAAGGAGATACTCCAAACTGGCCAAGGTCTTGCTGATCATGGAAATTACCATGAGTTCTGCCGCCTTCTTGGACGTTTCAAAGTGAATTTCCAGTTGTCAGAGCTTCTGAGTATTGAGTTTTATGGTGAATGGATTGGTTTAGTAGCAGAATTCACAACTAAATCCCTGTTGTCATGGCAGGCCAGCTTTGCAAACGACTCATCTGATGATACTTTGGATAATGTGGATGTTCTTCAGGAGCAGTTGGAGTCTCTTCCTTACCTTTGTAGATTCCAGTACCAAAACAGTAGCATTTACATCATAAATATTATGGAGCCTCTTCTACAAGCTTATATGGAAAGGTCAAGATTACCAGCTCCTGGAGATGCGAATGAGCTCTCTGTCATTGAAGGACAGCTCACATGGCTAGTCCACATAATTGCAGCCATTCTCAAGATTAGGCAGACCATTGGTTGTAGCCAAGAATCACAGGAGTTAATTGACGCAGAACTTGCAGCCCGTGTGTTACAGTTGATAAACGTTACTGACACAGGGGTGCACGCACAGAGATATCAAGTATTAAGTAAGCAAAGACTTGATCGTGCTATTCTTATCTTTGTGCAAAATTTCAGAAGGTCATATGTAGGAGATCAAGCCATGCATTCTTCAAAGCAGTTGTATGCAAGATTATCTGAGCTTCTTGGACTGAATGACCATTTAGTTTTACTCAATGTCATTGTTGGGAAAATAGCAACTAATCTGAAGTGCTATGCTGAGTGCGAGGATGTTATTGATCATACTCTGTCCCTTTTCCTTGAACTTGCATCTGGCTATATGACTGGAAAACTGCTTCTCAAGCTGGAGAGTACAAAATTTATAATTGCAAATCATTCTAGGGAGACTTTTCCATTTCTTGAAGAATACAGATGTGCCCGCAGTAGAACAACCTTCTACTACATCCTTGGCTGCTTGATTTTCATGGAAGACACCCCAGTAAAATTCAGGAGTTTCATGGAGCCACTCCTACAGGTTGCAGTTAATTTGGAGGCAACTGCTGATGCTGCTTTCCGGACTGATGTTGTGAAGTACGCATTTATTGGTTTGATGAGAGACTTACGAGGCATTGCTATGGCCACAAACAGCCGCAGGACCTATGGCCTCCTATTTGACTGGCTGTATCCATCTCGCATGCCACTTTTATTGAAAGCCATCTCACTCTACGCTGATGAGCCAGAGGTCACCACACCCCTGCTCAAGTTTATGTGCGAGTTTGTTTTGAACAAAGCTCAGAGATTGACATTTGATTCGTCATCACCAAATGGGATCCTTTTATTCCGGGAGGTTAGCAAGCTGATTGTGGCTTATGGATCACGTATTCTGTTACTTCCAAACGGCACTGATATTTATGGAAGTAAATACAAAGGCATATGGATATCACTTGCTGTTCTTTCAAGAGCTTTATGTGGAAACTATGTCAACTTTGGTGTATTTGAGCTGTATGGTGACAGAGCACTTGCTGATGCTCTTGATATATCTTTAAAGATGAGCCTCTCAGTTCCATTGTCAGACATATTGGCATTCAAAAAGCTGTCGAAAGCATTCTATGGATATATTGAAGTTCTGTTCAGCAATCATATCACTTTTGTTCTCAATTTAGATACAAACACCTTCGTGCATATTGTCAGCACTCTTGAATCTGGCTTAAAAGGTCTAGATACAGGGATATCAACACAGTGTGCCTCTGCCATTGATAGCTTGGCAGCCTTTTATTTCAACAATATCACAGCTGCTGATGGCCCTCCTTCACCAGCTGCACTAAATCTTGCTCGGCATATCGGAGAGTTCCCCACTTTATTTCCTCAGATACTGAAGACGCTTTTTGAGATCATCATCTTTGAGGATGCGGGTAATCAATGGAGTCTTAGTAGACCAATACTGAGTCTGATAATGATCAGTGAACAGATGTTTAGTAATTTGAGAGCACAGATATTGGCATCACAGCCTGTAGACCAGCAACAACGCCTTTCGCAATGCTTCGACAAGCTGATGACTGATGTTGCTACGAATTTGGAACCAAAGAACAGAGATAAATTCACTCAAAATCTTACAACATTCAGGCATGATTTCCGTGTGAAGAACATTCAGGCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MESLAQLELLCEKLYNSRDSAERAHAESILKCFSENSDYISQCQYILDNASTPYALMLASSSLLNQVNDRSLSLQLRLDIRNVPFQKSIMKSVIQLFLLFYCICMAWNYVINYLATRGPKLQTFVIKSLIQLVCRITKFGWFDDDKFRDIVKEAADFLSLASQDHYFIGLKILYHLVGEMNQNCTMCLLALINRTCTYIHKTSDETQKANAMPLTLHRKIACSFKDQFLLQIFQISLTSLHQLKSEVPDDFRRDPLSLALRCLSYDFVGCPVDESSEEFGTVQLPASWRPLLQDPSTVQIFFDYYKVNDTCVSKEALECLVRLASVRRSIFVEDPSRTQFLSHLMSGTKEILQTGQGLADHGNYHEFCRLLGRFKVNFQLSELLSIEFYGEWIGLVAEFTTKSLLSWQASFANDSSDDTLDNVDVLQEQLESLPYLCRFQYQNSSIYIINIMEPLLQAYMERSRLPAPGDANELSVIEGQLTWLVHIIAAILKIRQTIGCSQESQELIDAELAARVLQLINVTDTGVHAQRYQVLSKQRLDRAILIFVQNFRRSYVGDQAMHSSKQLYARLSELLGLNDHLVLLNVIVGKIATNLKCYAECEDVIDHTLSLFLELASGYMTGKLLLKLESTKFIIANHSRETFPFLEEYRCARSRTTFYYILGCLIFMEDTPVKFRSFMEPLLQVAVNLEATADAAFRTDVVKYAFIGLMRDLRGIAMATNSRRTYGLLFDWLYPSRMPLLLKAISLYADEPEVTTPLLKFMCEFVLNKAQRLTFDSSSPNGILLFREVSKLIVAYGSRILLLPNGTDIYGSKYKGIWISLAVLSRALCGNYVNFGVFELYGDRALADALDISLKMSLSVPLSDILAFKKLSKAFYGYIEVLFSNHITFVLNLDTNTFVHIVSTLESGLKGLDTGISTQCASAIDSLAAFYFNNITAADGPPSPAALNLARHIGEFPTLFPQILKTLFEIIIFEDAGNQWSLSRPILSLIMISEQMFSNLRAQILASQPVDQQQRLSQCFDKLMTDVATNLEPKNRDKFTQNLTTFRHDFRVKNIQA</aaseq> |
| Gene Sequence |
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