Difference between revisions of "BGIOSGA010357"
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Revision as of 15:33, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA010357 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010357, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_12390 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010357-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010357-PA |
| Length |
13892 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:24351315..24365206 |
| Sequence Coding Region |
24364865..24365206,24364501..24364588,24364359..24364420,24364098..24364238,24362915..24363040 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:24351315..24365206 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:24351315..24365206 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTGCTCCGGGCGTACGCGCACCGCGTGCGGAGGCCGGACTCGCGCCGCTTCGCCGTCTTCCTCGTCCCCACCGTCGTCCTCGTGGGCCAGCAGGCGCGCGTCGTCGAGCAGCACACCGACCTCGTCGTCAAGCAGTTCTGCGGCGAGATGGGGGTCGACTTCTGGGACGCCGCCACCTGGCGATCCCAACTGGAGGACGGCGAGGTGCTCGTCATGACGCCGCAGATCCTGCTCGACAACCTCCGCCACAGCTTCTTCCGCCTCCAGGACATCGCGCTGCTCATCTTCGACGAGTGTCACCGCGCCAGGGGCAATGCGCCGTACGCCTGCATTTTCAAGGAATTTTATCACCCCCAGTTGAATTCTAGTGCGTCAGATCCTCTGCCAAGGATATTTGGGATGTCTGCTACGCTCATTTATTCAAAAGATTTGAATCAGCACAATTATTCAAAGCAAATTTCTGAGATTGAGAATCTCATGAATTCCAAGGTGTACACTGTTGATAGTGAATCAGCTTTGTCGGAGTACATACCATTTGCTTCTACAAAAATAGTGCACTTTGACGATTCCAACATTTCATCTGAGCTGCATGCCAATATTCTCAGTTGTTTGAATGGATTGACAGAAAAGCATATAGAAGCTCTGGACAGAAAACTACATGGTTCATCTCTGGAAAACGCTAAGCGAAGGATATCAAAATTGCATCATACATTTGTATATTGTTTATATAATCTAGGAGTATGGCTGGCAGCAAAGGCTGCTGAGGTACAATCATACGAGGAAAACAGCCTATCCTTCTGGGGTGAAACATTGGATAAAAATGTTGAGGGCTTCATTAGAAACTACAGCGAAGAAGTACATAGAGAACTTTCATGTTTCTTGAAGAATGGTCATATTGGTGAAAAATTTCCAGCTGATTCGCAAGATGGGATATTGACACCCAAAGTTCATTGCCTTATTCGAACTCTTCTGCAGTACAGGCATATGCAAGACTTAAGATGCATTGTGTTTGTTCAGAGAGTTATCACAAGCATAGTATTAGAGCCCCTACTTTCATCTATTCATCAAATGTCTGGGTGGAATGTTAAGCACATGGCAGGAAGCCGTCCTGGTTTGCTATCTCAGAGCAGGAAAAATCATACAGAAATTGTTGAATCTTTTCGAAAAGGAAAGGTACATATAATTATTGCCACACAAATTTTGGAGGAGGGTTTAGATGTGCCAAGTTGTAACTTGGTAATTCGCTTTGATCCATCAGCAACAGTATGCAGCTTTATACAGTCCCGTGGTCGAGCTAGGATGGAAAACTCTGACTATCTTTTACTTATCGGAAGGCACGTTTTCAATTTTGTTGCTTTGGGGGATGTGGAAGCTCATACTAATGCAAAGAAGTTTCTCGCAAGTGGGCAAATAATGCGGGAGGAATCTCTGAGATTGGGATCAATTTCTTGTCAACCACTTGAGAACACCTTATATTTTAAACCTCTACCAAGATTCGATATAGACAAGGCATCTGGCACATGCACTCTGCATCTTCCTAAGAGCAGTCCTGTGCAGACAGTTAATGTAGAAGGAGAAGGTTCTATTCTCAAGGAGACAGTTTGTCTTAAGGCCTGCCAAGAACTACATGCCATTGGTGCACTCACAGATTCTCTTTTACCAGAATTAGATGTTCCATGTGATGAAGAACCTGACATCGTTGTTGAGAACAAAATTGAGCAGCCTTCTTACTTTCCAGAAGAATTTGTGGATAATTGGCGCTCCTTTTCTCGTCTTGGCATATATTATTGCTATAAGATCTCATTGGAAGGATGTCCCAAAACAGCTTCTCCAACTGACATACTGTTAGCTTTGAAGTGTGATTTGGGATCTGACTTTACTTCTAGCTCATTTAAATTGCCAGGTGGGCAAGACAATGCTAGTGTTACCATGAAATATGTTGGCATCATCCATCTCAATCAAGAACAGGTAATTATTGCTAGAAGATTTCAGACAACTATTCTTTCGTTTCTTATTGGTGATGACCATTTGGAGGTTAGCAATGGTATTAAATACTTCCATGAGATGCAAGTGCCTATTGGAGTAGTCTATCTACTTCTGCCTTTAGTTTCTGGCAGAATTGATTGGTGCAGTATGAAGTTCTCATCCTCACCAATATATGAAGCTAACAACAAACATATGACACATTGCCATTCTTGTAAAGATATTGATTTACTGCAGACAAAAGATGGTCCTTTCTGCAGGTGCATCCTTAAAAATTCCATTGTGTGTACCCCTCATAATAACATCTTTTATGTTATTAGTGGGTTTCTTGACTTAGATGCAAATTCCTGTTTGCCTCAACATGATGGGATTGTTGTTACCTACAAAGATTATTTTAAGACTAGGCATGGTCTTACTTTGACTTTTGAAAATCAGCCGCTCTTGGCTGGCAGTAAACATGTGAAAGCGCGGAACTTCCTCCACAACTGCTACTCTAAAAAAGAAAAAGAACCTGGTGATAGATATAGTGTTGAGTTGCCACCTGAACTCTGCAGAATTATCATGTCACCAGTGTCCGCCAATAATTTGCACATCTTCTCATATGTTCCTTCCATAATGTTCCGCATCCAGTGCATGCTTCTTTCTGTGAAATTAAAGGTCCAATTAGGCCCAACAGTGCAGCAGTTTGACGTACCGGTTTTGAAGATCCTGGAAGCATTAACAACAAAGAAATGCCAAGAAGAATTTTCACAGGAATCATTAGAAACACTTGGGGATTCTTTCCTCAAATATGTTACAACTCGGCACCTTTTTAGTGAATACAGGCTTCAACATGAAGGCATATTAACAAAAATGAAGAAAAACTTGATCTCCAATGCAGCTCTGTGCCAGCTGGCCTGCAGCAGTAATCTTGTGGGTTACATTCATGCTGAGGAGTTTAATCCAAGAGATTGGATCATCCCTTGCTTGGACTATGATGAGCGTGATAACAAAAAAATTTCCTTTCTGGCACCCAATGGTATGTACAGCCAAAGGAAAATGTCTATTAAAAGTAAGAGGATTGCGGATTCAGTTGAGGCCTTAATTGGGGCTTACCTCAGTACTGCTGGGGAAAAGGCAGCATTTCTTTTGATGAAATCATTAGGGATGAATATAGAATTTCACACTGAAATTCCAGTTGAAAGGAAAATTTCAATGAAAGCTGAAGAGTTCATTAATGTGAGGAGCTTAGAGGGAATGCTTGGTTACAAGTTCAATGATTCTTTATTATTGCTCGAAGCATTGACACATGGCTCATATCAGACTTCTGGCCCTACTTCATGCTATCAGAGGCTCGAGTTTCTTGGAGATGCTATTTTGGATCATCTTTTCACTGAATATTACTACAGCAAATACCCTGACTGTACTCCAGAATTGTTGACAGATCTTAGATCTGCCTCTGTGAACAACAATTGTTACGCGCATGCAGCTGTTAAATCAGGATTAAACAAGCATATCCTTCACTCATCATCAGAACTGCATAGGAAGATGAGCTACTACCTTGAGGAATTTGGGCAGTCATTTACAGGTCCATCTTATGGCTGGGAAGCGGGCATTGGTCTACCAAAGGTTCTCGGGGATGTGATTGAATCAATAGCTGGTGCCATTTATCTCGACAGCAAGTGTGACAAGGAGGTTGTTTGGAGAAGCATGAAGCGGCTATTGGAACCTCTTGCCACCCCCGAAACCATCGAGCCTGACCCGGTGAAAGGGCTGCAAGAATTTTGTGATCGTAGATCATTCAAAATAACCTACGAAAAAAACCATGTTGATGGAGTCTCATCGGTCATTGCTCGGGTGAAGGCTGGAGAGACTACATACTCCGCAACAAAATCAGGTCCCTGCAAGTTGGTGGCGAAAAAGTTGGCATCAAAGGCTGTGCTTAAAGATCTGATTGCTGGTCACAAAGATACAGAGGCTGCTGCAGTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLLRAYAHRVRRPDSRRFAVFLVPTVVLVGQQARVVEQHTDLVVKQFCGEMGVDFWDAATWRSQLEDGEVLVMTPQILLDNLRHSFFRLQDIALLIFDECHRARGNAPYACIFKEFYHPQLNSSASDPLPRIFGMSATLIYSKDLNQHNYSKQISEIENLMNSKVYTVDSESALSEYIPFASTKIVHFDDSNISSELHANILSCLNGLTEKHIEALDRKLHGSSLENAKRRISKLHHTFVYCLYNLGVWLAAKAAEVQSYEENSLSFWGETLDKNVEGFIRNYSEEVHRELSCFLKNGHIGEKFPADSQDGILTPKVHCLIRTLLQYRHMQDLRCIVFVQRVITSIVLEPLLSSIHQMSGWNVKHMAGSRPGLLSQSRKNHTEIVESFRKGKVHIIIATQILEEGLDVPSCNLVIRFDPSATVCSFIQSRGRARMENSDYLLLIGRHVFNFVALGDVEAHTNAKKFLASGQIMREESLRLGSISCQPLENTLYFKPLPRFDIDKASGTCTLHLPKSSPVQTVNVEGEGSILKETVCLKACQELHAIGALTDSLLPELDVPCDEEPDIVVENKIEQPSYFPEEFVDNWRSFSRLGIYYCYKISLEGCPKTASPTDILLALKCDLGSDFTSSSFKLPGGQDNASVTMKYVGIIHLNQEQVIIARRFQTTILSFLIGDDHLEVSNGIKYFHEMQVPIGVVYLLLPLVSGRIDWCSMKFSSSPIYEANNKHMTHCHSCKDIDLLQTKDGPFCRCILKNSIVCTPHNNIFYVISGFLDLDANSCLPQHDGIVVTYKDYFKTRHGLTLTFENQPLLAGSKHVKARNFLHNCYSKKEKEPGDRYSVELPPELCRIIMSPVSANNLHIFSYVPSIMFRIQCMLLSVKLKVQLGPTVQQFDVPVLKILEALTTKKCQEEFSQESLETLGDSFLKYVTTRHLFSEYRLQHEGILTKMKKNLISNAALCQLACSSNLVGYIHAEEFNPRDWIIPCLDYDERDNKKISFLAPNGMYSQRKMSIKSKRIADSVEALIGAYLSTAGEKAAFLLMKSLGMNIEFHTEIPVERKISMKAEEFINVRSLEGMLGYKFNDSLLLLEALTHGSYQTSGPTSCYQRLEFLGDAILDHLFTEYYYSKYPDCTPELLTDLRSASVNNNCYAHAAVKSGLNKHILHSSSELHRKMSYYLEEFGQSFTGPSYGWEAGIGLPKVLGDVIESIAGAIYLDSKCDKEVVWRSMKRLLEPLATPETIEPDPVKGLQEFCDRRSFKITYEKNHVDGVSSVIARVKAGETTYSATKSGPCKLVAKKLASKAVLKDLIAGHKDTEAAAV</aaseq> |
| Gene Sequence |
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