Difference between revisions of "BGIOSGA010742"
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Revision as of 15:35, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA010742 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010742, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11555 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010742-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010742-PA |
| Length |
12618 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:14609233..14621850 |
| Sequence Coding Region |
14621054..14621850,14615906..14617918,14613227..14613445,14612664..14612799,14609761..14610009 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:14609233..14621850 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:14609233..14621850 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTGGAGCTATAGTGAGTGTTTCAACTGGTGCCCTGAGCACCCTGCTTCCTAAGCTCTCCCTGTTGATACAAGGGGAGTACAAGCTTCTCAAAGGCGTGAAGGGTGGGATCTCCTTTCTGAGGGATGAGCTGACCAGCATGCATACCCTTCTGGTGAAGCTGGCGAACAACGAGGAGAAGTTGGATGAGCAGGTGAAGGATTGGAGGAACAAGGTGCGTGAGCTGAGCTATGATATTGAAGACTGCATTGACCTTTTCCTGCACAAGGTGAGCAGTTCTAATGCTAAAGCGAGCCTTGTCCGGAAGACGGCAGCTAAAATTAGAAAGTTATGGTCGCGCCACAAAATCGCGAACCTAATTGAAGAACTTAAGGCTCGTGTTATAGAAGAAAGTGATCGCCGCTCGAGGTATAATTTTGATGAAGTTGCTGATAAATTTAGCCATGTTCAAATTGATCCTCGACTGCCGGCGCTCTATGTGGAAGCAGAGAAGCTTGTGGGGATTGATGGTCCTAGAGAGAAGATTATCCGATGGCTGGAAAAAGATGAATCTCTGAAACTTAAAATAGTATGCATTGTGGGTTTTGGAGGTCTTGGAAAGACAACTCTGGCAAACCAAGTTTATCACAAAATCAAAGGTCAATTTGACTGCTTTTCTTTTGTGCCAGTTTCACGGAATCCAAATATATTAAAAATACTAGCTGATATGCTCAAAGAATTGGGAAGTAATGTTGATACATCAGATGATCAGCGGCAGCTCATATCCAAGCTTAGAACATTCCTAGAACACCAGAGGTACCTGGTCATTATTGATGATATATGGAGCACACAAGCATGGGAAGTCATCAAGTGTGCTCTCCCTGAGAACAATTTATGCAGTAGAATAATTTCAACGACAAGAAATTCAGATGTCGCAACATCGTGCTGCTCCAGTTTAGCAGGATATATCCACAACATTCAGCCCTTAAATGAGCATGATTCTCAGAAGCTATTTTTCAAGAGGATTTTTGGGGACAAGTCAGCATGCCCTCCTTACCTTGAACAAGTCTCTCATGGAATCATTAGCAAGTGCCATGGATTGCCATTAGCTCTTATCAGTATAGCTAGCCTGCTAGCTGGAAAATCACGTATGAAGGAGCAATGGGAGCAAGTGTACAATTCTATTGGTTTTGCATTTAGTCATCAAGGAATTAGAGATATACTGCTGCTTAGCTACTATGATCTTCCGATTCATCTGAAAACTTGCTTGCTATATCTTAGTGTGTTTCCAGAGGATTACAACATTGGTAGAGAAGAGCTAATATGGAGATGGATAGCTGAAGGGTTCATCAGTGAAGTGAAAGGTCAAACACTGGATCAAGTTGCTGAGAATTACTTGAATGATCTTGTAAACAGAAGCATGATCCAACCAGTTGACATCAAGTACGATGGCAGGGCAGATGCTTGCAAACTGCATGATATGGTGCTCGACCTTATAATTTCCCTGTCAACACAGGAGAATTTCACCACCATAGTGGAAGGGCAACAGTATAAATGTTCTTCTAATAAGATTCGTAGGATCTCAATACATTCAAAATGTCTGGAAGACGAAGTAATGCAGGAGATTATGACGAATTGCTTGCAAGTTCGTTCGATCAGCTTCTATGGATTGCAATATCTGGAAACTAGTCTTCTCCCAACTCTTAATTCTTTGAGAGTACTAGCTTTTGAAAATTGGCACCATCTTGGTAGCAAAAGAATTAAACATCTTGGAAGGTTTTTCCAGCTAACATATTTGCGCATCAATTCTCATGGTATCTATGAGCTTCCAGAGCAAATAGGAGGTCTGCAGAATCTACTGACACTAGACATACGGGGCAGTGGGGTTGAAAAATTGCCATCAACAATTGGTTGTTTGAAAAACCTGGTGCGTCTACTTGTAGATTATAATGTGGAATTGCCCAATGAGATTGGAGATCTACAAGCCTTGCAGCAGCTGTCAGGTGCTGGTAACTATAACTCCATAGTATTTGTGGAACAGCTAAAGCGGTTGGCAAACCTAAGGGAGATTGACATATTACTGCATGGTAGCGCACAACTTGGTGCTCGTGATATGGCAAGGTATATGGAAGCTTTGAAGTCATCTCTTGCTGTGATGGGTAAACAAGGGCTTCAATCGTTGGAAATACGCAACGATGATACGGTGATAGGAGAAAAACTCATGGATTTATTATGCTACTCACCATGCCTCCGAAAGCTTGTCATAGATGGTGACCGTATCAGTCGGCTATCGAAGCAGATGGCGCTGCTTGTTAACCTCAGGCATCTTGACATAGGGGTCAGCAACATTAAGCAGGACGATCTCTGCGTTCTTGGAAGCATACCCACTCTGCTCTTCGTCAGGTTATTTGTAGAAAATGGACCTGATGAAAGGCTTGCCATCATAAGCCATCAATTCCGATGCCTCAAGCAGTTCATCTTCATAAGTCTCGGAGGTGGGCTGGACATGTTGTTTATGCAGGAAGCAATGCCTGAGCTCCGATGGTTGTCTCTTAAATTCCGTGCACATGAATCAGACTGCAAGATGGGTTTTGAGTTCAGCTTCAAGCACCTTGCAAGCCTGGAGCACCTCAAAGTCATAATCGATTGCGGGGACGCCACCAGGAGCCGGGTGGAGGCTGCAGAAGCTTCTGTTAGGAATGCAGCCAGTGCCCACCCAGGATGTCCCAGAATAGAAATCAATAGATATTTGGAAGACTTCATGAGAGATGATAAGGTCGACAAGGAGATACTGAAGGATATAGATGGTCATGAAGTGGCTTTGCATGCGTGGGGAAATAATCTATACGGTGCAGTGGAACTAACCTACTCTCGAGATCGTATAGTTGAATGCTACTTTTGGTCCTATACAATTTACTACGAACAGAAATATGCGCAAGCACGAATCATCCTTGCCAAGATATTCGTGCTAGCAACCTTACTAGATGACACTTATGATATGCATGCTATATTGGAAGAGGGCCAAAAGCTCAATGAAGCAATACAGAGATGGGATGAGAGTGCCATTTCTGTTTTGCCGGAGTACTTGAAGAATTACTATGCCAAGCTAATGAGTACCTTCAAAGAGATTGAGGATGAACTGAAATCAGAGGAGAAGTACTACATTACTTATGCTGTAAAAGCGTATCAAAGGTTATGCAAGTCTTACCTCCAGGAAGCTGTATGGTTTCATCAGAATTACATACCAAGCTTTCAAGAACATTTGGATGTGTCCATCATCTCCTCGGGCTCTTCAATGCTATCTGTTGTGTCATTTGTTAGTGCCGGTGATTTAGCAACAAAAGAAGCCCTTGAATGGGCCTTTGGTTGCACCGATGCTGTCAAGGCTTGTGGCGAAATTGGACGCTTCCAGGATGACTTGGCTGCATTCAAGCACGGGAAGGGCAAACTAGATATGGCCACCTCTGTTGAGTCCTACATGAAGGAGCACAATGTCACTGGTGAGGAAGCCACGGCTGTGATAAGTAATCTGGTCGAAGACGCATGGAAAACTATCAATCAAGCACGCTTTGAGCGTTCCTCGCTTGTGCCGGCTGTGAACCGAGTCGCCAACTTAGCGATGAGCATAATGTTCTTCTACCAAGGCAGCGAAGACGCCTACACCTTCAACAAGCTCAGCATGAATATCATCAAGCAGCTGTTCGTCAAGCCTATCCCCATAATCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGAIVSVSTGALSTLLPKLSLLIQGEYKLLKGVKGGISFLRDELTSMHTLLVKLANNEEKLDEQVKDWRNKVRELSYDIEDCIDLFLHKVSSSNAKASLVRKTAAKIRKLWSRHKIANLIEELKARVIEESDRRSRYNFDEVADKFSHVQIDPRLPALYVEAEKLVGIDGPREKIIRWLEKDESLKLKIVCIVGFGGLGKTTLANQVYHKIKGQFDCFSFVPVSRNPNILKILADMLKELGSNVDTSDDQRQLISKLRTFLEHQRYLVIIDDIWSTQAWEVIKCALPENNLCSRIISTTRNSDVATSCCSSLAGYIHNIQPLNEHDSQKLFFKRIFGDKSACPPYLEQVSHGIISKCHGLPLALISIASLLAGKSRMKEQWEQVYNSIGFAFSHQGIRDILLLSYYDLPIHLKTCLLYLSVFPEDYNIGREELIWRWIAEGFISEVKGQTLDQVAENYLNDLVNRSMIQPVDIKYDGRADACKLHDMVLDLIISLSTQENFTTIVEGQQYKCSSNKIRRISIHSKCLEDEVMQEIMTNCLQVRSISFYGLQYLETSLLPTLNSLRVLAFENWHHLGSKRIKHLGRFFQLTYLRINSHGIYELPEQIGGLQNLLTLDIRGSGVEKLPSTIGCLKNLVRLLVDYNVELPNEIGDLQALQQLSGAGNYNSIVFVEQLKRLANLREIDILLHGSAQLGARDMARYMEALKSSLAVMGKQGLQSLEIRNDDTVIGEKLMDLLCYSPCLRKLVIDGDRISRLSKQMALLVNLRHLDIGVSNIKQDDLCVLGSIPTLLFVRLFVENGPDERLAIISHQFRCLKQFIFISLGGGLDMLFMQEAMPELRWLSLKFRAHESDCKMGFEFSFKHLASLEHLKVIIDCGDATRSRVEAAEASVRNAASAHPGCPRIEINRYLEDFMRDDKVDKEILKDIDGHEVALHAWGNNLYGAVELTYSRDRIVECYFWSYTIYYEQKYAQARIILAKIFVLATLLDDTYDMHAILEEGQKLNEAIQRWDESAISVLPEYLKNYYAKLMSTFKEIEDELKSEEKYYITYAVKAYQRLCKSYLQEAVWFHQNYIPSFQEHLDVSIISSGSSMLSVVSFVSAGDLATKEALEWAFGCTDAVKACGEIGRFQDDLAAFKHGKGKLDMATSVESYMKEHNVTGEEATAVISNLVEDAWKTINQARFERSSLVPAVNRVANLAMSIMFFYQGSEDAYTFNKLSMNIIKQLFVKPIPII</aaseq> |
| Gene Sequence |
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