Difference between revisions of "BGIOSGA011843"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA011843

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA011843, complete gene.

LocusTag

OsI_09982

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA011843-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA011843-PA

Length

16231

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:2851983..2868213

Sequence Coding Region

2851983..2852036,2853041..2853113,2853362..2853426,2853560..2853637,2854152..2854271
,2855293..2855363,2856081..2856173,2856515..2856584,2856949..2857013
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,2863578..2863721,2864101..2864250,2864673..2864816,2865091..2865178
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,2868019..2868213

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCATCCCCGTCGAGGAGGCCATCGCCGCCCTCTCCACCTTCTCCCTCGAGGATGAGCAACCAGATGTGCAGGGCTTGGCTGTGCTCCTATCGAGTGAAAGATATGCAACTAATAGTCCTATTGAATACAGTGATGTTGCTGCTTATCGTCTGTCATTAGGAGAAGATACAAAAGCGATCAACCAGCTGAATACTCTGATTCAAGAGGGAAAAGAAATGGCTTCTTTGCTGTACACATATCGTAGCTGTGTTAAAGCGCTACCTCAGCTGCCCGATTCAATGAAGCATAGTCAAGCAGATTTGTACCTTGAAACATATCAAGTTCTTGACCTGGAAATGAGCCGCTTACGTGAAATCCAGAGATGGCAAGCATCTGCTGCTTCTAAGTTGGCAGCTGATATGCAGAGATTTTCTAGGCCTGAAAGACTGGTTAATGGACCCACAATAACTCATTTTTGGTCTATGCTGAAGTTGCTTGATGTCCTTGTGCAGCTTGATCATCTTAAGAATGCAAAAGCAAGTATACCAAATGATTTTTCATGGTACAAGAGAACATTTACTCAAGTAAGCACCCAGTGGCAGGATACTGACACTATGAGAGAAGAGCTGGATGATCTTCAGATTTTTTTGAGCACCAGATGGGCCATCTTGTTGAATTTGCATGCCGAGATGTTTCGAACAAATACTGTTGAGGACATTCTACAGGTTCTTATAGTATTTTGTGTGGAATCACTTGAGTTAGACTTTGCTCTTCTTTTTCCCGAGCGCCATACTCTACTTCGTGTTCTCCCAGTTTTGGTTGTTCTAGCAACTTCTTCAGAGAAAGAGAGTGAGTCACTCTATAAGAGAGTCAAGATGAACCGTCTTCTCAATATTTTTAAGAACGATCCAGTTATTCCAGCGTTTCCAGATCTGCATCTCTCTCCTGCTGCAATTTTGAAGGAGCTATCATCGTATTTTCAAAATTTTTCCAGTCAAACCCGTCTTCTTACTCTTCCATCTCCTCATGAAATCCCCCCTCGAGAGCTACAAGAATATCCTTTTCTGCATTACTTGATTTTGAACCACATGGGAACTATCAGAGCAGAGCATGATGACTTCTCTATACGTTTTGCCTCTGCAATGAACCAGATGATAATATTGAAGTCATCAGATGGTGCGGATAATGACTGGTCAAGAGATATTAAGGGGAACATGTATGATATTGTTGTTGAAGGCTTTCAGCTTCTTAGCCGATGGACTGGCAGGATATGGGAGCAGTGTGCCTGGAAATTTTCGCGCCCTTGTAAAGAACCACCTTCAGATTCTCAACATGGATCGACAACATTTTTTGACTATGAAAAGGTAGTACGCTGGAACTACACTGGAGAAGAACGGAGGGCTCTTCTTGAATTAATTGGTTACATAAAAAGTATTGGATTGATGATGCAACGCTGTGACACCTTAGTGTCTGAAGCCTTATGGGAAACGATACACATGGAGGTCCAAGATTTTGTACAGGATAAACTAGATACTATGCTCCGTACAACATTTCGGAAGAAGAAGGACCTATCTAGGATCCTCTCTGATATGCGAACCCTCTCCGCAGATTGGATGGCCAACACTAGCAAGGGAGATCCAGAACACAACTCGTTAGAAACAGAGGAAATGAGACAAAGCACATTCTACCCAAGGCCAGTTGCACCAACAGCTGCACAGATTCATTGTTTGCAATTTCTCATCTGTGAGCTTGTATCTGGTGGTAATATGAGAAAACCTGGAGGACTATTTGGCAATAGTGGCTCTGGAATACCTGTGGAAGATCTTAAACAGCTAGAGACATTTTTCTATAAGCTCAGTTTTTTCTTGCATATTTTGGACTATACAGCTACAATTGGTACTTTAACTGATCTTGGATTTCTTTGGTTCCGAGAGTTTTACCTGGAATCATCTCGTGTTATCCAGTTTCCAATTGAATGTTCACTCCCCTGGATGCTGGTTGAGCACGTCACTGAAACACAGGATGCTGGTCTTCTTGAAAGTGTTTTGATACCATTTGACCTTTACAATGACTCTGCCCAGCATGCGTTAACTTGTCTCAAGCAGAGATTTCTTTATGATGAAATTGAAGCTGAGGTCGATCTTTCCTTCGATCTTCTTGTTGAAAAGCTTAATGAGATCATCTTTACATATTACAAGAGTTGTGCAGCAAGTACTCTTCTTGATAGTTCATTTACCTACTTATGTGATGATGGTGAGAAGTACTTCGTCAAACCCCTGCGGTTTGACGCCATATTCAAGCTAAGAAGAGTAATGGTCCTAGGGAGGACAATTGACCTAAGAAGCCTGATTACTCAGAGAATGAACAAACTGTTTCGGGAAAACATTGATTTCCTACTGGAGCGCTTTGAAAGTGGGGATCTATGTGGTGTAGTGGAACTGCAACAACTGTTGGATATTTTGGAGCTTACGCATCAGTCAATATCAAAATTTCTTGAGTTGGATTCTTACTCTCTTATGCTTAGCGAGATGCAAGAGAACCTTTCGCTGGTTTCTTATTCTAGTCGCATCTCTTCTCAGATATGGAATGAGATGCAGACAGATTTCTTGCCCAATTTTATCCTATGTAATACCACACAGCGATTTGTTCGATCATTAAAAGGAACCCATCACTCTTCTCAGAGATCAAGCGCCTCTACCGGGAAGGCCTATTTCTATTGTGGATCACATGATTTGACCATGGCATACCAGGGCATTTCTGGTTTGTACCGTGACTTTTTTGGGATCCCTCATATGTTTGCAGTTGTTAAGCTTCTTGGTTCCAGATCATTACCTGGTATTATCCGTGCTTTATTGGATCATATATCAAGTAAGATAACAGCTATGGTGCCAAAAATAACTGCATTGCAAGAAGCACTGCCCAAATCTATTGGACTTCTTTCATTTGATGGTGGTATAGCAGGTTGTCAGAAGATAGTTCATGAAATATTGACTTGGGAAGCAAAATCAGAAGTGAAAACTGAAGTTCTTCATGATCTCAAGGAAATTGGGAGTGCTTTGTATTGGATGAGCCTTCTGGATATTGTTTTGAGACAAATAGACACTACACAGTTCATGCAGTCTGCTCCATGGTTGGGATTGATTCCAGGAAATGATGGGCAAGTGAAGCATGCATACTCTGATAATACTCCATTTACCACTTTGTTAAGTGCTGCCACCAATGCAGTTGCATCAAGTCCTGCATGCCCAAATCCATCTTCATTTCTTGTCATGGCAAAGCAAGCTGAAGCTGCCAGTCTACTCTACAAATCAAACCTAAACTCTGGGAGTGTGCTTGAGTATGCTCTTGCTTTCACGAGTGCTGCGCTGGATAGGCATTACAGTAAATGGAGTGCAACTCCAAAGACAGGATTTATTGACATCACCACATCAAAGGACTTTTATCGTGTTTTTAGTGGTCTTCAGTATAGCTACTTGGAAGAGAGCATCAATCCTTCGAGGAAACAAGAAATGCTGGGTGACTCTGTAGCTTGGGCTGGCTGTACAATCATGTATTTACTGGGACAGCAGCAGCATTTTGAGCTTTTCGACTTCTCTTACCAATTTCTCAACGTGGCAGAAGTAGAAAATGCAACAGTTTCACTTTATCAATATTCAGATAGGAACAAAAGCCCGAATTTCTTGCAGGGTTACGAGGGTATCCTTGAAGCGATGAGGAAAGCCAGGAGGCTCAATAACCATGTTTTCTCCATGTTGAGAGCACGGTGCCCCCTCGAGGACAAGATTGCATGTGCTATCAAGCCAAGTGGGGCGCCTCTTCACCGTATGAAGTTTACGAACACCGTTTCTGCGTTCGAGACATTGCCACAGAGAGCTACTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAIPVEEAIAALSTFSLEDEQPDVQGLAVLLSSERYATNSPIEYSDVAAYRLSLGEDTKAINQLNTLIQEGKEMASLLYTYRSCVKALPQLPDSMKHSQADLYLETYQVLDLEMSRLREIQRWQASAASKLAADMQRFSRPERLVNGPTITHFWSMLKLLDVLVQLDHLKNAKASIPNDFSWYKRTFTQVSTQWQDTDTMREELDDLQIFLSTRWAILLNLHAEMFRTNTVEDILQVLIVFCVESLELDFALLFPERHTLLRVLPVLVVLATSSEKESESLYKRVKMNRLLNIFKNDPVIPAFPDLHLSPAAILKELSSYFQNFSSQTRLLTLPSPHEIPPRELQEYPFLHYLILNHMGTIRAEHDDFSIRFASAMNQMIILKSSDGADNDWSRDIKGNMYDIVVEGFQLLSRWTGRIWEQCAWKFSRPCKEPPSDSQHGSTTFFDYEKVVRWNYTGEERRALLELIGYIKSIGLMMQRCDTLVSEALWETIHMEVQDFVQDKLDTMLRTTFRKKKDLSRILSDMRTLSADWMANTSKGDPEHNSLETEEMRQSTFYPRPVAPTAAQIHCLQFLICELVSGGNMRKPGGLFGNSGSGIPVEDLKQLETFFYKLSFFLHILDYTATIGTLTDLGFLWFREFYLESSRVIQFPIECSLPWMLVEHVTETQDAGLLESVLIPFDLYNDSAQHALTCLKQRFLYDEIEAEVDLSFDLLVEKLNEIIFTYYKSCAASTLLDSSFTYLCDDGEKYFVKPLRFDAIFKLRRVMVLGRTIDLRSLITQRMNKLFRENIDFLLERFESGDLCGVVELQQLLDILELTHQSISKFLELDSYSLMLSEMQENLSLVSYSSRISSQIWNEMQTDFLPNFILCNTTQRFVRSLKGTHHSSQRSSASTGKAYFYCGSHDLTMAYQGISGLYRDFFGIPHMFAVVKLLGSRSLPGIIRALLDHISSKITAMVPKITALQEALPKSIGLLSFDGGIAGCQKIVHEILTWEAKSEVKTEVLHDLKEIGSALYWMSLLDIVLRQIDTTQFMQSAPWLGLIPGNDGQVKHAYSDNTPFTTLLSAATNAVASSPACPNPSSFLVMAKQAEAASLLYKSNLNSGSVLEYALAFTSAALDRHYSKWSATPKTGFIDITTSKDFYRVFSGLQYSYLEESINPSRKQEMLGDSVAWAGCTIMYLLGQQQHFELFDFSYQFLNVAEVENATVSLYQYSDRNKSPNFLQGYEGILEAMRKARRLNNHVFSMLRARCPLEDKIACAIKPSGAPLHRMKFTNTVSAFETLPQRAT</aaseq>

Gene Sequence

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