Difference between revisions of "BGIOSGA012546"
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Revision as of 15:45, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012546 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012546, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11399 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012546-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012546-PA |
| Length |
13261 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13379135..13392395 |
| Sequence Coding Region |
13379135..13379224,13380011..13380173,13380260..13380378,13380969..13381081,13381177..13381232 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:13379135..13392395 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:13379135..13392395 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTCCGCGGCGGCGGCGGGGGAGGGGCAGCGGTTCAAGCGCATTCCGCGGCAGTCGTTGGCGGGGAACCTGGAGCTGGATCCACTGCTTAATGAAAATTTAGATCAATGGCCACATCTAAATGAGCTGGTTCAGTGCTATAAGGCTGATTTTGTGAAAGACGACTGCAAATATGGACGATATGAAAGTGTTGCACCACCATCTTTTCAGAATCAAATTTTTGAGGGACCTGATACTGACTTAGAAACAGAATTGCAGCTTAGCAATGATAGGCAATCCAAGCCTGATGAAGTTACTGAAGATGATATGCCAAGCACATCAGGGAGACAATTATATGAGACTGAAGTGCCCGCTTCATCCTCAAAAAAACACTGCAGTCTATCACCTTTACCAGCATATGAACCGGCATTTGATTGGGAAAATGAGAGATCTTTGATATTCGGCCAACGGGTGCCAGAAAGTGTCCCTGCAATAAACAGCAGTGGATTGAAGATAACTGTCAAGGTGTTATCTTTGTCATTTCAAGCTGGATTAGTTGAGCCTTTTAGTGGTACAATCTGCTTGTACAACAGAGACAGAAGAGAAAAATTGTCAGAAGATTTCTATTTTCATATACTCCCAACAGAAATGCAAGATGCTCAGATTTCTCTAGACCGCCGAGGTGTTTTTTCATTGGATGCCCCTTCACCATCAGTGTGCCTTCTGATTCAGCTAGAGAAGGCTGCCACTGAGGAAGGGGGAGTAACACCCTCTGTTTATTCTCGTAAAGAACCTGTTCACTTGACTGATAAAGAGAAGCAAAAATTGCAAGTCTGGTCTCAAATCATGCCATATAGAGAGTCGTTCGCATGGGCTATGATTCCACTGTTTGAGAACAACCAGGCTGGTGGTGCTGCCTCTCCCAGTAGCCCTCTAGCACCAAGTATGTCAGGCTCAAGTTCTCAAGATAGTATAGTGGAGCCTATTTCCAAGCTCACTTTGGATGGAAAGCTCAATCATTATTCAAGTGGAAGCTCAGTTATTGTAGAGATATCAAATTTGAACAAAGTGAAGGAAAGCTACATAGAGGACTCCCTCCAAGACCCCAAAAGAAAAGTACACAAACCAGTGAAAGGTGTACTGAGGTTAGAGGTGGAAAAACTTCATAATGGCCACAACGACATGGATAACATTTCTGAGGGCGGTAGCATGGCCAATGATTTGAATGATGCTGGTGAACTCAATAATGGTAGATACAACCGGAGTAGCTTTGATGGGATCCATGGTTCTTTGAATTCTAGTGCCGTGGCCCAGAAAGATGCACATCAGAATGGTCAAGCTTCCAATACAGAGAGTGGTGAAAATTTTCAAGCTTTTGACTTTCGGATGATGACCCGAAGTGAGCCATTTTCACAACTCTTCCATTGTCTCTATGTGTACCCACTGACTATTAGCTTGGGCCGTAAAAGAAATCTATTTGTAAGAGTGGAATTGAGAAAGGATGATTCTGACATCCGCAAGCCTCCATTAGAGGCTGTTCATCCAAGGGATCGGAACACAACACTACAGAAGTGGGCGCATACTCAGATTGCTGTTGGAACGAGAATGGCTTGCTACCATGATGAAGTTAAAATCAGTCTGCCTGCTCTCTTGACACCCCAACATCATCTTCTGTTCACATTTTACCATGTAGATCTCCAAATGAAACCTGAAGCCCCCAAACCAGTTGTCGTGGGATATGCTGTTCTTCCACTGTCGACACACATTCAGTTACTTTCAGACGTATCTTTGCCAATTTTAAGAGAACTTGTTCCACATTACCTGCAGGAAAGTGGAAAGGAAAGAATGGACTATCTGGAGGATGGCAAAACTGTTTTTAGGTTGCGATTAAGACTTTGTTCTTCATTATTCCCAGTTAATGAAAGAATAAGAGACTTTTTTGTCGAGTATGATCGCCATACACTTCATACAAGTCCACCTTGGGGTTCTGAGCTTCTTGAGGCCATAAACAGTTTAAAGAACGTTGAATCTACTGCACTGTTGCAATTTCTCCAACCCATACTTAATATGCTACTTCATCTTATCGGTGATGGTGGTGAAACCCTTCAGGTTGCCGCATTTCGAGCTATGGTCAATATCCTAACCCGGGTCCAGCAGGAATCATCTGATGGGGCTGAGAGAAATCGGTTTCTTGTTAATTATGTTGATTATGCTTTTGATGACTTTGGTGATCGGCAAGCACCTGTATACCCTGGTCTGTCTACTGTTTGGGGAAGCCTGGCTCGGAGTAAGGCTAAAGGTTATAGAGTTGGGCCAGTCTATGATGATGTGCTGGCAATGGCTTGGTTTTTTCTGGAGCTTATTGTAAAATCGATGGGATTGGAACAAAGTCGTCTATTTTACCATAATCTTCCACTAGGTGAAGATGTCCCACCGCTACAGTTGAAAGATGGTGTCTTCCGATGTATCATGCAGCTGTTTGATTGCCTTCTAACTGAGGTTCATGAGCGCTGTAAAAAGGGTTTAAGCTTGGCGAAGCGCTTGAACAGCACACTTGCTTTCTTTTGTTATGATCTTCTATCAATTATTGAGCCACGCCAAGTTTTTGAGCTGGTTTCATTGTATATGGACAAGTTTGCAGGAGTTTGCCAGTCAATTCTCCATGATTGCAAATTGACATTCCTTCAGATAATATGTGACCATGATCTTTTTGTTGAGATGCCTGGTCGTGACCCCTCTGATAGAAATTATCTCTCGTCAGTACTTATTCAAGAGATTTTTCTCACCCTTGACCATGATGATCTATCTCAGCGAGCGAAAGCAGCCCGTATTTTGGTTGTTCTAATATGCAAGCATGAATTTGATGCACGATATCAAAAAAGTGAAGACAAGCTGTATATTGCTCAGCTGTATTTTCCTCTTATAGGACAGATTCTAGATGAGATGCCTGTATTCTATAATCTAAATGCTGTTGAAAAGCGTGAGGTGCTGGTAGTCATTTTGCAAATCATAAGGAACTTGGACGACATGACTCTGATCAAAGCATGGCAACAGAGCATTGCTAGAACCAGATTGTTCTTCAAGCTACTTGAAGAATGCATTACCCATTTTGAGCACAACAAAACAGGAGACAGCTTGTTACTAGGCTCAAGTTCACGGAGCCCTGATGCTGAGCGCCCTGCATCTCCAAAGTACTCCGATCGATTATCCCCATCAGTTAATGCATATTTGTCTGAGGCATCACGCCATGAAATAAGGAAGAATATTTCAGATGGTAACATGCCTCAGGGAACACCAGAAAATGGATACATGTGGAACAGGGTTAGTCCTCAACTGAGCTCTCCTAACCAGCCCTATTCATTGAGAGAAGCACTTGCTCAAGCGCAGTCTTCAAGGATTGGATCAACCGCGAGGGCACTGAGAGAATCTCTACATCCAGTGCTGAGACAAAAGTTGGAACTGTGGGAAGAAAATCTCAGTACTGCTGTGAGCCTGGAAGTGTTGGGAATAATTGATAAGTTTTCAGTCGCTGCAGCTTCTCGTAGCATCACTACTGATTACGCAAAGCTAGATTGTGTAACATCTGTATTAATGGGTCTTTTATCAAGGAGCCAGCCCTTAGCTTTTTGGAAAGCTTTCCTTCCTGTGGTGTATAATATATTTAACCTCCATGGCGCAACACTGATGGCAAGGGAGAATGATCGCTTCTTGAAGCAAATTGCTTTTCATCTTTTGCGCCTTGCTGTTTTCCGGAATGATTCTATTAGAAAAAGGGCTGTTGTCGGGTTGCAGATTCTTGTTAGGAACTCGTTTAATTATTTTAAGAACACCACAAGGTTGAGGGTGATGTTGACAATCACTTTGTCAGAACTTATGTCTGATGTGCAAGTAACTCAGATGAAATCTGATGGCTCTCTTGAGGAAAGTGGTGAAACTCGGCGCCTTAGGAAATCACTAGAGGAAATGGCTGATGTACGAAGTAAGGATCTCTTGAAAGATTGTGGCCTCCCTGTTAATGCACTGGAGGCAGCGCCTGAAGGTTCGACTGATAATAGGTGGTCTTGGGTAGAAGTTAAACATCTATCCAAATGTCTAGTCCAGGCCCTTGATGCTGGTCTTGAACATGCCCTCTTGGGCTCTGAAATGACTCTGGACAGGTACGCGGCTGCTGAGGGTTTCTATAAGCTAGCAATGGCCTACGCGCCTGTGCCAGATCTTCATATAATGTGGTTACTGCATCTATGTGATGCACATCAGGAGATGCAATCATGGGCTGAAGCTGCACAATGTGCAGTTGCTGTAGCTGGTGTTATCATGCAGGCACTTGTTGGAAGGAATGATGCGGTGTGGAGCAAGGAGCATGTTGCTTCCCTATGTAAGATTTGCCCTATTGTGAACACTGATGTTAGCTCAGAAGCATCTGCAGCAGAAGTTGAGGGATATGGTGCATCCAAGCTTACTGTGGATTCAGCTGTCAAGTATCTTCAGCTGGCAAACAAACTTTTTGCACAAGCCGAACTCTATCACTTTTGTGCTAGTATTCAGGAACTCATCATTCCTGTGTATAAAAGCAGAAGGGCATATGGGCAGCTGGCTAAGTGTCATACATCACTCAAGGATATCTATGAGTCAATTCTTGAACAGGAGGCTAGTCCTATACCATTCATTGATGCTACCTACTACCGGGTAGGGTTTTATGGGGAGCGGTTTGGCAAACTCAACAAAAAGGAGTATGTGTTCAGAGAGCCAAGAGATGTTCGTCTTGGTGACATAATGGAGAAGCTTAGTCATATCTATGAGGCTAAAATGGATGGCAATCACACCTTACACATCATTCCGGATTCGAGACAAGTCAACGCTGATGAGTTGCAACCTGAATCTCTAGAGTTTTCTCCTGTTGAGAATGCGATTGGAATGATCGAGACAAGGACAGCTGCCTTGCGAAATGAACTAGAAGAACCACGCAGTTCGGAAGGTGACCAACTCCCAAGACTCCAAAGCCTGCAGAG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| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
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