Difference between revisions of "BGIOSGA012924"
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Revision as of 15:47, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012924 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012924, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0091B22.11 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012924-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012924-PA |
| Length |
11296 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:20158368..20169663 |
| Sequence Coding Region |
20158368..20158509,20159635..20159734,20160212..20160320,20160961..20162463,20163304..20163546 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:20158368..20169663 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:20158368..20169663 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGTCGCTCACCAGGGCGGAGGAGGAGGAGACGGCGGCGGCCGAGGAGTGGTCGGGCGAGGCGGTCGTCTACGTCAACGGCGTCCGCCGCGTGCTCCCCGACGGCCTCGCTCACCTCACCCTGCTCCAATACCTCAGAGACATTGGTCTTCCTGGAACAAAGCTTGGATGTGGTGAAGGTGGCTGTGGAGCCTGCACTGTGATGGTCTCATGCTATGATCAAACTACAAAGAAGACACAGCATTTTGCAATCAACGCATGCTTGGCTCCGCTTTATTCTGTGGAAGGAATGCACATAATCACAGTAGAGGGAATTGGGAATCGTCAGCGAGGTTTGCACCCAATCCAGGAACGTTTAGCCATGGCCCACGGTTCACAATGTGGATTTTGCACCCCTGGTTTTGTGATGTCGATGTATGCATTGCTGAGATCAAGTGAACAGCCTCCTACTGAAGAGCAGATTGAAGATAGCCTTGCAGGAAATTTATGTCGCTGTACTGGCTACAGACCAATAATAGACGCCTTCCGTGTTTTCTCGAAAAGAGATGATCTTTTGTACAACAATTCATCTCTGAAAAATGCAGATGGCCGACCTATCTGCCCTTCAACAGGAAAACCATGTTCCTGCGGAGATCAGAAAGACATCAATGGTAGTGAATCTTCATTATTGACACCTACGAAAAGCTACTCACCTTGTTCATACAATGAGATTGATGGAAATGCGTACAGTGAGAAAGAACTCATTTTCCCCCCAGAACTTCAGTTGAGAAAAGTTACGTCACTTAAATTGAATGGGTTTAATGGGATTCGGTGGTATAGACCTCTTAAACTAAAGCAAGTATTGCATTTGAAAGCATGCTACCCAAATGCAAAACTAATCATTGGTAACTCTGAAGTAGGAGTTGAAACAAAGTTCAAGAATGCCCAGTATAAGGTCTTGATCTCAGTTACTCATGTTCCAGAGCTTCATACCCTTAAAGTGAAAGAGGATGGTATACATATTGGTTCTTCTGTAAGACTTGCACAGCTCCAAAATTTCCTCAGAAAGGTTATTTTAGAGCGTGATTCACATGAAATTTCATCCTGTGAGGCAATACTGCGGCAATTAAAATGGTTTGCTGGGACACAAATCAGGAATGTTGCTTCTGTTGGAGGTAACATTTGTACTGCTAGTCCAATATCAGATCTAAATCCACTTTGGATGGCTACAGGTGCAACGTTTGAGATAATTGATGTGAACAATAATATTAGGACCATTCCTGCAAAAGATTTTTTTCTGGGTTATCGTAAAGTTGACTTAAAACCTGATGAGATATTGCTCTCTGTTATACTGCCATGGACAAGGCCATTTGAATTTGTCAAAGAATTCAAGCAGGCACATAGAAGGGAGGATGACATTGCGTTGGTGAATGCTGGAATGCGTGTCTATATAAGAAAAGTTGAAGGTGATTGGATAATTTCGGATGTTTCAATTATCTATGGAGGGGTAGCTGCAGTTTCACACCGTGCTTCAAAAACTGAAACCTTTCTCACTGGAAAAAAATGGGACTATGGATTGTTGGATAAGACTTTTGATCTGTTGAAAGAAGACGTAGTTCTGGCTGAAAATGCACCTGGTGGAATGGTTGAATTTCGCAGTTCACTTACTTTGAGTTTCTTTTTCAAATTTTTCCTTCATGTTACTCATGAAATGAATATAAAAGGATTTTGGAAGGATGGATTACATGCAACCAATCTTTCAGCCATACAGTCTTTCACTAGACCTGTCGGTGTTGGAACTCAATGTTATGAATTGGTTAGACAAGGAACTGCAGTTGGCCAACCTGTGGTTCACACATCAGCTATGCTTCAGGTTACTGGTGAAGCGGAATATACTGATGACACACCGACACCCCCCAATACCTTGCATGCTGCTCTGGTGCTGAGTACGAAAGCTCACGCACGCATATTATCTATTGATGCTTCACTTGCCAAATCTTCCCCTGGGTTTGCGGGTCTCTTCCTTTCAAAAGACGTGCCTGGCGCTAACCATACTGGGCCTGTTATCCATGACGAGGAGGTTTTTGCATCTGATGTTGTTACATGTGTTGGCCAGATTGTTGGACTTGTTGTGGCAGATACCCGTGATAATGCAAAAGCTGCTGCAAATAAAGTCAATATTGAGTATTCTGAACTTCCAGCAATTTTATCCATAGAGGAAGCTGTGAAAGCTGGTAGCTTTCATCCAAATAGCAAGAGATGCCTAGTTAAAGGTAATGTTGAACAATGTTTTCTGTCGGGTGCATGCGATAGAATTATAGAAGGAAAAGTACAAGTTGGAGGTCAAGAGCACTTCTACATGGAGCCTCAGAGCACTCTTGTATGGCCAGTTGATTCTGGAAATGAAATTCATATGATTTCATCTACCCAGGCTCCCCAGAAGCACCAAAAGTATGTTGCTAATGTTCTTGGTCTTCCACAATCAAGAGTTGTTTGCAAGACTAAGCGTATTGGTGGTGGATTTGGTGGAAAAGAAACCAGATCAGCAATATTTGCTGCAGCAGCATCTGTAGCTGCTTATTGTTTAAGGCAGCCTGTAAAGCTTGTTTTGGACAGGGATATTGACATGATGACAACTGGACAGAGGCACAGTTTCCTAGGGAAGTACAAGGTGGGATTTACCGATGATGGGAAGATATTGGCCTTAGACCTTGATGTTTATAACAATGGTGGTCATTCACATGATTTGTCCCTTCCAGTCCTGGAGCGTGCTATGTTTCATTCAGACAATGTCTATGATATACCAAATGTCAGAGTCAATGGGCAAGTATGTTTCACAAATTTCCCAAGCAATACTGCTTTCAGAGGTTTTGGTGGTCCACAAGCTATGCTGATTGCAGAGAATTGGATTCAGCACATGGCTACAGAACTCAAGCGAAGTCCTGAGGAGATAAAAGAACTTAATTTTCAAAGTGAGGGATCTGTGCTTCATTATGGCCAGTTGCTTCAAAATTGTACAATACATTCAGTATGGGATGAACTAAAGGTTTCTTGTAATTTTATGGAAGCTCGCAAAGCTGTAATTGATTTTAACAATAATAACCGTTGGAGAAAGCGTGGCATTGCTATGGTTCCCACCAAGTTTGGGATATCCTTCACCACAAAATTCATGAATCAGGCTGGTGCTTTAGTGCAAGTTTACACTGATGGAACTGTCCTTGTAACACATGGTGGGGTTGAAATGGGGCAGGGTTTACACACAAAGGTAGCCCAAGTTGCGGCTTCATCATTCAATATCCCTCTTAGCTCTGTATTTATCTCAGAAACAAGCACTGATAAGGTACCAAATGCAACACCAACAGCAGCCTCTGCTAGTTCAGATTTATATGGTGCTGCAGTTTTGGATGCTTGTCAGCAAATTATGGCTCGGATGGAACCTGTTGCTTCAAGAGGAAACCACAAGTCCTTTGCTGAGTTGGTTCTAGCATGCTACCTGGAAAGGATAGATCTCTCTGCTCATGGATTTTATATCACTCCTGATGTTGGGTTTGACTGGGTGTCTGGCAAGGGAACTCCATTCTACTATTTCACATACGGAGCAGCATTTGCAGAAGTTGAAATTGATACCCTAACTGGGGATTTCCACACAAGGACAGTAGATATTGTTATGGATCTTGGCTGTTCAATTAATCCGGCTATTGATATTGGCCAGATTGAAGGAGGTTTTATCCAAGGATTAGGTTGGGCGGCCTGGAAGAACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSLTRAEEEETAAAEEWSGEAVVYVNGVRRVLPDGLAHLTLLQYLRDIGLPGTKLGCGEGGCGACTVMVSCYDQTTKKTQHFAINACLAPLYSVEGMHIITVEGIGNRQRGLHPIQERLAMAHGSQCGFCTPGFVMSMYALLRSSEQPPTEEQIEDSLAGNLCRCTGYRPIIDAFRVFSKRDDLLYNNSSLKNADGRPICPSTGKPCSCGDQKDINGSESSLLTPTKSYSPCSYNEIDGNAYSEKELIFPPELQLRKVTSLKLNGFNGIRWYRPLKLKQVLHLKACYPNAKLIIGNSEVGVETKFKNAQYKVLISVTHVPELHTLKVKEDGIHIGSSVRLAQLQNFLRKVILERDSHEISSCEAILRQLKWFAGTQIRNVASVGGNICTASPISDLNPLWMATGATFEIIDVNNNIRTIPAKDFFLGYRKVDLKPDEILLSVILPWTRPFEFVKEFKQAHRREDDIALVNAGMRVYIRKVEGDWIISDVSIIYGGVAAVSHRASKTETFLTGKKWDYGLLDKTFDLLKEDVVLAENAPGGMVEFRSSLTLSFFFKFFLHVTHEMNIKGFWKDGLHATNLSAIQSFTRPVGVGTQCYELVRQGTAVGQPVVHTSAMLQVTGEAEYTDDTPTPPNTLHAALVLSTKAHARILSIDASLAKSSPGFAGLFLSKDVPGANHTGPVIHDEEVFASDVVTCVGQIVGLVVADTRDNAKAAANKVNIEYSELPAILSIEEAVKAGSFHPNSKRCLVKGNVEQCFLSGACDRIIEGKVQVGGQEHFYMEPQSTLVWPVDSGNEIHMISSTQAPQKHQKYVANVLGLPQSRVVCKTKRIGGGFGGKETRSAIFAAAASVAAYCLRQPVKLVLDRDIDMMTTGQRHSFLGKYKVGFTDDGKILALDLDVYNNGGHSHDLSLPVLERAMFHSDNVYDIPNVRVNGQVCFTNFPSNTAFRGFGGPQAMLIAENWIQHMATELKRSPEEIKELNFQSEGSVLHYGQLLQNCTIHSVWDELKVSCNFMEARKAVIDFNNNNRWRKRGIAMVPTKFGISFTTKFMNQAGALVQVYTDGTVLVTHGGVEMGQGLHTKVAQVAASSFNIPLSSVFISETSTDKVPNATPTAASASSDLYGAAVLDACQQIMARMEPVASRGNHKSFAELVLACYLERIDLSAHGFYITPDVGFDWVSGKGTPFYYFTYGAAFAEVEIDTLTGDFHTRTVDIVMDLGCSINPAIDIGQIEGGFIQGLGWAAWKN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..142#1268..1367#1845..1953#2594..4096#4937..5179#5290..5604#6858..7097#7434..7718#7794..8015#8564..8725#8870..9004#10911..11147#11246..11296#ATGGGGTCGCTCACCAGGGCGGAGGAGGAGGAGACGGCGGCGGCCGAGGAGTGGTCGGGCGAGGCGGTCGTCTACGTCAACGGCGTCCGCCGCGTGCTCCCCGACGGCCTCGCTCACCTCACCCTGCTCCAATACCTCAGAGGTCCCTCTCTCTATCTCCTCAATCCCTTCTCATTCTGCATGCGCCGGGATTGGCACGCGAATCCGATGGACTTCCCTGCATTTTTAGTATATATATATATATAGTTTCCTTTTGGAGCTTCGGCGATGGATGTTTGGGGGATTGATTGGTCGATGCACGTTGAGGCGGTGTTGCTTTTCCAGAGTAGTGTTCATCTATAACAGCGTTTTCTACTACATCAGAATAAGAATATTCTCTCTTTTTGCGCGGACAGAATCAGAATAAGAATATTTGATGCACTAGCTTAACGCAGCACTCTGAACCCAAGGTTCGACAATAATTAAATTCATGGGTGGAGACACCATTGACAGTTTCTTCTTGTACACCCCTGCTGGTATTTGGATATTTGTCTATTCGAAAGATTTAAAAAACCAACATGTTACATCTATAAGGGGCTAAAGGCCAAAGGAAAATAAGCTGAAAATTCCCTAAAGAAAGATCTAACACGAACTAAAGACACTATAATTAGCGCATAGCGAGTCCCAAGCAGATCATGCAAATCTTCATACAAGTATGTGGTAGAGTGTTTCTTGATGATTTCCATCACATATATTAACTTGCAGTGGTAGACTAGTAGTCTTTGAAGTGGGACTCCTTCTCTGTAGGTTCCTGTTCTGTACTTTGCATTTATGGCACAGAATATTTTTAAGCAATCCAATTAAATGCCATTGGAGGTCTCCCCATGATCTTCTAAGCTCAGTGAGAGGATTGGATAGCATAAATCTAAACATAGAGCAATCAGTCATCTTCAGAGGTTACCTGCACTTCGGCAATAATGGTTGAATGCTTATGATGGTTAAAATGCTCATGATAGTTCGCTCTTGCTTTTCTCTGAGTTTTGAACTTAGCAGCCTTTCTGAGATCTTCTCTTATCCTCAACTCTTTTATACCTATGATCCAAGGTCAAGCTACATTTAATATTGTATTCCAGTTTCTTTTACTGTTCCAATCTGTTCAGAACAAAGGGCTGTATTTGCCAGCTTCATAATATATATATTATAAGTTTATAACCATGTTATATTTGCATCATTCATATTTGGCTCTTTGGATTTTCATTTCTAACTTTTCTCTACAACTATATTATAGACATTGGTCTTCCTGGAACAAAGCTTGGATGTGGTGAAGGTGGCTGTGGAGCCTGCACTGTGATGGTCTCATGCTATGATCAAACTACAAAGAAGACACAGTGAGAACTACATCCCTTCAACAAACCATGTTATGCAGTTTTTATCCAACTACAATGAAATCACTGTATCATGCAGTATTAGAATGAATATTGCACCACCCTCACCCTTTATTCAGTGTTTCTTATACCTTGTTTTAAACAACCTTGAACTAGCAATAATTCGAGATACATTTGCAAGCTGCAGCTTGCTTGCATTTCTTGACCTTCCACATTGAACAGGTGTTTTCTTATACCTTGTTTGAAACTATCTTGCAGTAGCTGTAAAGCGAGATACATTTGCATGCTGCAGCTTTCTTACATTTCTTAACCTTCCATGTTTAACTAGTGTTTTGTGCTAGTATGCTATTCTTAGATTTGAACGTAAGATCCTTAATATTGAACATCACATTTGTGGTTGTATACTTGTATCACGTACCTGATATGTAATGGTCTGATTTTAGGATTTGAGCTTTACTTTGGTTAAAAAAACTTCATCAGGCATTTTGCAATCAACGCATGCTTGGCTCCGCTTTATTCTGTGGAAGGAATGCACATAATCACAGTAGAGGGAATTGGGAATCGTCAGCGAGGTTTGCACCCAATCCAGGTGATGCTCTAAACTAGAAATCATTATTTTTTCTTTTTTATTAATGGTGTTTTTGAAAATATTGAAGCTGTGTGGAACTATTTATGTGATGAGGTAGTTACTTGTTGGCTAAAGACCTTGAGAAAGGTAAAGATTCCTAAGCAGTAAAGCTGAGCCTGGATCAAGTACCTACTCCATTAGATCCGGTGGGTTTTTAGATCTGTTCTGATGTGGACTCATTGAGCTGGACAGTAACACAACAACAGTGTTAAAAAAGGATTAAATATGTGTAGAAAACAGCGCAACACAATATGACAGGCAAAAAGAACATAGCTTGCTTAGCACAGCTAAAGCAACCAAAATTGACATGATATGAATAGTAAATGGGTTTCACAAGTTGTCATGTAGGCCAATCAAAACCCAACCCATTCAAACGCAACATGCTCTCATTGTTTTGAAAAACGCATATATGTGAAATGCATCTCATACCCGTTGTGGTTGTATATTTTTGACAGCAGTACTATGTGGTGATTAAGAACAACTTAAATGTTGACAAACAAGATGTCATCAGTTTCTGAATCCTGTATTTTCACTTTCATCCTTTCCTACCAATAGGATTTGCTCTTGATCATGATGTTCAGATGGTCTGCTTTCCTTACAGGAACGTTTAGCCATGGCCCACGGTTCACAATGTGGATTTTGCACCCCTGGTTTTGTGATGTCGATGTATGCATTGCTGAGATCAAGTGAACAGCCTCCTACTGAAGAGCAGATTGAAGATAGCCTTGCAGGAAATTTATGTCGCTGTACTGGCTACAGACCAATAATAGACGCCTTCCGTGTTTTCTCGAAAAGAGATGATCTTTTGTACAACAATTCATCTCTGAAAAATGCAGATGGCCGACCTATCTGCCCTTCAACAGGAAAACCATGTTCCTGCGGAGATCAGAAAGACATCAATGGTAGTGAATCTTCATTATTGACACCTACGAAAAGCTACTCACCTTGTTCATACAATGAGATTGATGGAAATGCGTACAGTGAGAAAGAACTCATTTTCCCCCCAGAACTTCAGTTGAGAAAAGTTACGTCACTTAAATTGAATGGGTTTAATGGGATTCGGTGGTATAGACCTCTTAAACTAAAGCAAGTATTGCATTTGAAAGCATGCTACCCAAATGCAAAACTAATCATTGGTAACTCTGAAGTAGGAGTTGAAACAAAGTTCAAGAATGCCCAGTATAAGGTCTTGATCTCAGTTACTCATGTTCCAGAGCTTCATACCCTTAAAGTGAAAGAGGATGGTATACATATTGGTTCTTCTGTAAGACTTGCACAGCTCCAAAATTTCCTCAGAAAGGTTATTTTAGAGCGTGATTCACATGAAATTTCATCCTGTGAGGCAATACTGCGGCAATTAAAATGGTTTGCTGGGACACAAATCAGGAATGTTGCTTCTGTTGGAGGTAACATTTGTACTGCTAGTCCAATATCAGATCTAAATCCACTTTGGATGGCTACAGGTGCAACGTTTGAGATAATTGATGTGAACAATAATATTAGGACCATTCCTGCAAAAGATTTTTTTCTGGGTTATCGTAAAGTTGACTTAAAACCTGATGAGATATTGCTCTCTGTTATACTGCCATGGACAAGGCCATTTGAATTTGTCAAAGAATTCAAGCAGGCACATAGAAGGGAGGATGACATTGCGTTGGTGAATGCTGGAATGCGTGTCTATATAAGAAAAGTTGAAGGTGATTGGATAATTTCGGATGTTTCAATTATCTATGGAGGGGTAGCTGCAGTTTCACACCGTGCTTCAAAAACTGAAACCTTTCTCACTGGAAAAAAATGGGACTATGGATTGTTGGATAAGACTTTTGATCTGTTGAAAGAAGACGTAGTTCTGGCTGAAAATGCACCTGGTGGAATGGTTGAATTTCGCAGTTCACTTACTTTGAGTTTCTTTTTCAAATTTTTCCTTCATGTTACTCATGAAATGAATATAAAAGGATTTTGGAAGGATGGATTACATGCAACCAATCTTTCAGCCATACAGTCTTTCACTAGACCTGTCGGTGTTGGAACTCAATGTTATGAATTGGTTAGACAAGGAACTGCAGTTGGCCAACCTGTGGTTCACACATCAGCTATGCTTCAGGTATTGTTTCTCTAATAATTGTTTCGTTTTGTTATTCTGGCTGTTCCAGATGAGATTTTGGGAGCTGGAGCCCAGCCAAACTCTCCTTTTAAGAAAAGTACCAGGATAATATATATTCTTTGTTGCAAGACAACATGTCACAGTTCACCAATACAGATTTAGGGCATACTAGTTAAACTTCAAGATCAAATTAATCTAATTGTGAAGTACCAAAAAGCTCTGTTTTATATTTTGGTGCGCCTTCATATTTTGCTCTTCGCCCTTGTTCGATGGTCACAAACTGCATGTTGCTTTTTTAATATTATCTAGCAACACAAAGGTTGATATTTCCTGTGCTGTTGCGAATGTTATGGACAAACACACTGATTGAGAATTTTGTCTATCTACTAATCATTTGGTGAACTATCAATCAAGAAATATAACTTATTTTATATAATAATTCTCTTGAAAGTTTGATATGCATTTAATATCGGATTCATGTGGCTCATCAGTCTCTTTGTGGACATATCTTACTCTACTGAGATCTTTTGGCTTTAGGCAAATTTAAATTTCTCATTGATTAGTTTTTTGTACTTAGCAGATCCAACTTGTTGATGCTTCCAGTTTCATAACAGCTTGCCATCTACAAGTATTTTATTTTTCTTTTTTGTGTGATGCTGGGCCAATGTTTTGAAAACTGAAAACCAAGAAGGCCAAAACCAGCTTTTGATTGTATACCACGGCTGGTCTAAGTTCTCTTAATATTTT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