Difference between revisions of "BGIOSGA013332"
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Revision as of 15:49, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013332 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013332, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0680200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013332-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013332-PA |
| Length |
15718 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:31029485..31045202 |
| Sequence Coding Region |
31029485..31029572,31029749..31029817,31030460..31030633,31031451..31031582,31032830..31032969 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:31029485..31045202 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:31029485..31045202 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGAGGGGGCGCGTGCCCGGCGGCTCGACCGCCAACTTCAGCGCCCACCTCATCGCGGCCCAGCTCGGGATGCAGTGCCGCATGGGTCCCGCGGCGGCGGAGCAGATGAGGCGCGTCATCGCGTCGTCGGACTGCGACACCGGCCGCGTCATGAGGATGTTTGGTGCCATGGAAGGTGGCGACAGTGATTCTGATTCTGATGACTCTGCGGAGACGGAGAAAGTTGGGCCACTGCATGAGGCAGCAAGCGCAGGGAAAATGGATACTTGCAAACATTTGGTGGAGCAGCTTGGGTTTGACATCAATGCTGAAGCAAGTGATGATTTGGGTATGACACCTTTGGCTTGTGCGGTGTCCAAGGGAAAAGCAATTGCTGTGAGGTATTTTCTTGACAAAGGTGCTGATCCAAATAAGCAAGACAACATCGGTTTTACTCCTCTGCACTATGCTACAAAAGAAGGGTATGATGGACTGGCACGACTACTGCTGTCTAAAGGGGCTAGTGTTGATGTTATTTCTTCTAAAGGCACAGCCCTGCATCTTGCTGCCTCCAGTTGGAAGTCTGGCATCATGAAGATTCTATTGGAGCACAATGCAGATCCAAACAAGGTCTCCGCAGATTCAGAGACACCATTAGCTGCAACACTTGTAGCTTCTGATGGACTGAATGAACCTGCTGTGCTGAAGTGCATAGAGCTTCTTGTTAAGGCTGGTGCTAATTTGAACTGCGCTATTCCTGATACACCACTGGTGATAGCAACTAACAAAGACTTTGTTGAATGTGTTGAGTACTTGTTGGAGGCTGGTGCAAACGCCAATATTCCAACTAATAACGGTGGTAAGACACCAATAGAAATAGCCGCGAAGTCTGGAAGAAGGAAGCTTGTGGAGATTCTATTTCCTTGCACGTTGCCAATTAAAGGTGTGTCAAACTGGACTGTTGAAGGAATCATCACCCATGTGAAATCAAAAAAATCAAAGAAGAAAGCATGCGCTCAGGATAAGGAAAGTGGTACAGACAAAAAGGCTCAGTTGAAATCATTGGGTGCAAGTGCAGTTCAGGGGAAGGACTATGTTGGTGCATCCAAATTCTACAGTGAGGCCATCCAGCTGGACCCTACCGATGCAACATTGCATTCAAATAGGAGCTTTTGCTACCTAAAAAGTGGTGAAGCACGGGAAGCTTTGGTTGATGCTAAGACTTGCATAGGACTGAAACCAGATTGGCCAAAAGGTTACTATCGGAAAGGAGCTGCCCTGATGTCGCTCAAGGAATACAAAGAAGCGTGTGATGCATTCATGGATGGAGTGAAACTGGATCCTGCAAGTGGGGAGATGCATGAAGCATTTTGGGAGGCAGCCGCGGCATTGAAGAAGAAACATTTGGCTGGGAAGACTGAACATGCCCTTAGCCTCGTGCTGCTACGCGCACGCGGAAATCACGCTCCACAGGCACACACAGCAGGTGCCGCTATCCCACGTTCCCGCCCCCTCGCCGAAATCTCTCGATTCCGCCTCTTCCGCTTCTTCCCCTCCACTTCCATCTTCCTCCTTCCCCTCGAAGCCATCGGCTACAACGCCGCCGCGCCGCCACCCCACGGAATGGATCGGCCGCCGTGGCGGCGGCCGCCGGAGGAGGTCAGCAAGTCGGCGTTCCTCTCCTGGCTCACCTACCGCATGTTCGGGAGCGGCGGATCGAGGGAGAGCCCGTTCCTGAAGGCCGTGGCGGAGGGAAATGTCCGCCGCCTCAAGGAGATGGTGAATAGAATGGGCGCGAAGGACAGGGAAAAGCTTGCTGATATGAATATAGATGTCATTGGGTTACTGGAAGTGGCAGCGGACCTGGGAAAAATTGATGTCATCAGGTACTTCGTGGAGGAGCTTGGCTTTGATGTCAATGCTGGTTGCCTCTCCGCTGGTGCAACAGCTTTGTGTTCTGCCGCATTGTTGGGAGAAGCTGATGCTGTGAGATATCTTCTTGACCATGGGGCTGATCCTAATAAGATAGATGAGACAGGCTCTGTTGCTCTTCATCGTGCTGTGAAAAATGGGTATGAAGAAGTAGTGCGTCTCTTGTTATCCAGTGGAGCCAGGGTTGATATAGCTGTTGCTCATGGGACACCACTACATATCGCTGTTTCCTATGGGAAGACTGGTGTTGTCAAGATTTTATTGGATCACCATGCAGATAGCGGACTTACACCTATAGAAATTGCTGCAAGTGTTGGAAGAAGAGATCATGTGGAGATTCTATTTCCTTTCACTTCCCCTGTCAGAGCAGTAACAAACTGGACAGTTGAAGGAATTATTGCTCATGGGAAATCGAGACGCTTGATTCCCAAGGATGAGTCATGTAGCAAGGTCAGTGACAGAAAGGCTGAGCTAAAATCACAGGGAGAAAAAGCCGTTAAGAGAAAGGACTACCTTGCTGCATCAAAGATCTACACTAAGGCGCTTGAGCTAGACTATTTTGATGCTACCTTGTATTCAAACAGAAGCCTTTGTTACCTACAAATTGGAAAAGCACAAAAGGCTTTGCTTGACGCAAAAAAATGTGTAAAACTGCGGCCTAAGTGGATGAAAGGTCACTACCGGGAAGGAGCTGCTTTGATGTTGCTAAAGCTTGATATCGAGCATCTGCCCAATTTTCTGCCGCAGGAGCACAAGAAAGCATTCGAGGCATTCTTGAATGCGCTGAAACTGGATCCTGCTAATGCCGAGATTGAGAAAGTGATGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPRGRVPGGSTANFSAHLIAAQLGMQCRMGPAAAEQMRRVIASSDCDTGRVMRMFGAMEGGDSDSDSDDSAETEKVGPLHEAASAGKMDTCKHLVEQLGFDINAEASDDLGMTPLACAVSKGKAIAVRYFLDKGADPNKQDNIGFTPLHYATKEGYDGLARLLLSKGASVDVISSKGTALHLAASSWKSGIMKILLEHNADPNKVSADSETPLAATLVASDGLNEPAVLKCIELLVKAGANLNCAIPDTPLVIATNKDFVECVEYLLEAGANANIPTNNGGKTPIEIAAKSGRRKLVEILFPCTLPIKGVSNWTVEGIITHVKSKKSKKKACAQDKESGTDKKAQLKSLGASAVQGKDYVGASKFYSEAIQLDPTDATLHSNRSFCYLKSGEAREALVDAKTCIGLKPDWPKGYYRKGAALMSLKEYKEACDAFMDGVKLDPASGEMHEAFWEAAAALKKKHLAGKTEHALSLVLLRARGNHAPQAHTAGAAIPRSRPLAEISRFRLFRFFPSTSIFLLPLEAIGYNAAAPPPHGMDRPPWRRPPEEVSKSAFLSWLTYRMFGSGGSRESPFLKAVAEGNVRRLKEMVNRMGAKDREKLADMNIDVIGLLEVAADLGKIDVIRYFVEELGFDVNAGCLSAGATALCSAALLGEADAVRYLLDHGADPNKIDETGSVALHRAVKNGYEEVVRLLLSSGARVDIAVAHGTPLHIAVSYGKTGVVKILLDHHADSGLTPIEIAASVGRRDHVEILFPFTSPVRAVTNWTVEGIIAHGKSRRLIPKDESCSKVSDRKAELKSQGEKAVKRKDYLAASKIYTKALELDYFDATLYSNRSLCYLQIGKAQKALLDAKKCVKLRPKWMKGHYREGAALMLLKLDIEHLPNFLPQEHKKAFEAFLNALKLDPANAEIEKVM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..88#265..333#976..1149#1967..2098#3346..3485#3582..3689#3837..3962#4185..4349#4709..4810#6142..6312#6396..6475#6753..6798#9021..9306#9444..9512#10239..10403#10997..11128#11722..11861#13376..13528#14563..14670#15381..15551#15602..15718#ATGCCGAGGGGGCGCGTGCCCGGCGGCTCGACCGCCAACTTCAGCGCCCACCTCATCGCGGCCCAGCTCGGGATGCAGTGCCGCATGGGTACGTGCTCCGATCCGGGGCTTTCTTTTCTTTCCGGTTTTTATTCATTTTTTTGATCCGGTTTTCTCTGTATTCTGGATGCTTCGCGCTTCGATCCGTCACGGATTGGGGTTTCCTGCTTCGGAAAATCGCCTAATTTTGTTGTTGTTGCTTGCCGTGCCATGGCATGGATGCAGGTCCCGCGGCGGCGGAGCAGATGAGGCGCGTCATCGCGTCGTCGGACTGCGACACCGGCCGCGTCATGAGTGAGATCACCACCAGCCCACGCTCTCCTTTCCAGCTCCCGCCCCGGAAAAATGGCTCCTTTTTTTTATATAATATATATTTTTAAAAAAATTTTGGGCTAGGGTTTTGCTTGGGTTTTTGGCTACTGGAACATTTTGGCATGGCATGGGTAATGTTGGAGTGGTTTTCTACTTCCTCATGGAAGATTAGCGCGAAAGGCATGGTTATTTTAGGCTCCACTGTTCGTTTCCCGATCAGTTCGGATTTGGAAGATCGTGTTAGTAAGCACGCATGCGTGTTTGGTGGTTGGTTGAGGCCGAATCCTCGTGCCTGTATTAGCTAGTATTATAGGTGTAGTCCGATACTGTTTTGGGGGAAAAAAAGAGTTTTTTTTATTCGTTCTAGTCAATGCTGGTTTCATGCATCTAGTGTAGCTTGATGATATTGTAACCTCGTTGCTCGTTGTTCTGTCCCTTTGGTGAAACATTTTTTGTTCTCATTTTGTAATCAGTCAGTAGGCCTCTGGTGTGGTTTAGGAAATTCCCCCTTCTTGGCGACCTATTTATATCTTGGTTTACTCCATGGCATGTTGAGAAAAGATAATTAGACTGTTCAGCGATTATTTATCTTACTGTGTTTCTTCTTAAAATGGCTTGTTGAAGGGATGTTTGGTGCCATGGAAGGTGGCGACAGTGATTCTGATTCTGATGACTCTGCGGAGACGGAGAAAGTTGGGCCACTGCATGAGGCAGCAAGCGCAGGGAAAATGGATACTTGCAAACATTTGGTGGAGCAGCTTGGGTTTGACATCAATGCTGAAGCAAGTGATGATTTGGGTATGTTCCATCGCAGTTTACAACTTGAATGCTTTCATGTTTCTCCTAGGTACTATTTTGTGCACCATCTAATGTAAGCTTTTAGATGCAACACAAAGATCATTTGCGATGTAAATTGTTAACGAACATCATGAAGGGACCTTACCTTAACAGCTCCAGCACCGGAAGCTCTGGCTTCAAATGCCACATGGTTTTTCTTGTGTATTGTGATCATTCTATGACCATCAATGGTGTGCCAACATTGATGAAATCATAATCAGCTGATATAATACCTTTGTCTTTATTTTTTCAAGAATATCTTCTCCCATTTTGTTTGCCTTGTCTCCGTGTTTTTATCTGATGTTTATTGGTCGTGCAAAATTGTGTCTCTGGCTACTGGTCCTTCACTCCTGGTGCATATGTTTTCCCATGCCACTTTGTTAAAGTGTATGCTAGTAATTTGATATTTGTTCTGCTTCTATCACATAATATAAACATGTGTGGTGATAGCCAAATATGTTCCGAGAGGCCCAAGTAATTGGGTAACGAATATGACTGCCATAATGTTTATTTTTTTAGGCTGGTCATATTGCATCGAGTGCATTGTCCATATAAACCGGGAAGCTAGTGCCTTTCATTTGTGCATTTAGTTTTGGTTGATATGCATCATAAATTTACTATTTTCTAAAGCGGAGGGTCCCCTGTTGCATGTTGACTTGACGTATCTTGTGAATTGTTGCTATCTGCATATAACTATTATGTGCTTTGTTGAATTATAGAACTTTTATGCCCCATGTTTTGTTGTGACTAAATTGCTTGATCATAACACTCATGGCAGGTATGACACCTTTGGCTTGTGCGGTGTCCAAGGGAAAAGCAATTGCTGTGAGGTATTTTCTTGACAAAGGTGCTGATCCAAATAAGCAAGACAACATCGGTTTTACTCCTCTGCACTATGCTACAAAAGAAGGTGTCCTTTTGCACATGCTGGCATTTATATTTGCAGTTCTTGTACCGATCTGTCGCTGCATGAAAGAAATGAATTACAAATGCATCCACATTATTTATCATATTTCCGTAATTTTCTTATCTGGTTATCATCCCTAACTTCCTACCCACTCTATCCCAAGATATAGCTACCTTTTACCTATGAATCTGGACAAGTGCTTGGCCAGACTCATAACGGAAGGTAGGTATATCTTGGGACAGTGGAAGTTCCTTTTTGGGATAATAATAGTAGCCAATTTTTGTCCTAAAGCCTTTCTTGAGGATCAGTTTGGTTTCTGAAAATTGTTGTTTGTCCAATAAAGTTATCCAAAATTGGTTTTTTGGTTCAGAATGATCCTTGAACCCACTCGAAGTGCCACATGGGCAATCAAACTGCTGAGCAGTAGTCCGTGGTTGGCAGCTTCCTTGTGAAAATATATTATGCCCTTACGTCTCACATAAAAAAGAAAGGAAAAACTGTTGCCCGACACCTTATAGTCCTCTCTTCATGTTTCCCTTAAATTATTTATTTTTAGCTCCTACTTCTTGAACTTCATCATCTTCTTTCTTTCTTTTGCTATGGGAGACATGAGTGGCATAATAGATTTTTCAGAATGGAGCTTGCCACCAAGTAAAAGCATTAGCTGAGTTGGGTTTCCTAAATGGTGCTTCAGGTGGGCTCAACGTCCATTTTGAATGAAATGCCAAACTTGGAACACTTGGGCAAAATTCGATGGGCTAAATTGGCCATTATCCTTTTGTTTCCTTATGACATTCATTGTAGCTAACTTGAGATGGGAGTGGGGAGCCTCATATTATATCAATATCTTAGACATGGATAATTATGCTGCATGATTTTCATATTCAACATTTTTCTCCACTCTGTGTTAGCATGATTATGTTTTAAGTTTTATACTTAGTACAAAATATATGTATACTTTGAGTCAGATCTTGTCATGGTTATGCTTTAGGGAAATTTAAGAATCGTAGAACAAAGTAGTCAATATTGGCATATTGCACATGGGCTAATCCAAATCTTCATCTATATGTCTTCACTGTCATCGATTACTTATGCTGATACAAAAATCACCCCCATGCATATTAAGCACTTTGTTTTAAGGTTTCTAAACTTTCCTAAAAGAGGTGCACGGAAGCAACGGAATGTCGAATATCCAAGTTCTAAAATTCTTCACTGGAGTACGACCCTATCTATATTACATTTTTTTACAGGGTATGATGGACTGGCACGACTACTGCTGTCTAAAGGGGCTAGTGTTGATGTTATTTCTTCTAAAGGCACAGCCCTGCATCTTGCTGCCTCCAGTTGGAAGTCTGGCATCATGAAGATTCTATTGGAGCACAATGCAGATGTAATGGGTTATTTAATGTTTTTGTCTGCACAACTACTTGTCTACAAAGTTCTATTGTCCACCACATGGCTAACCTTTTCATTTTGAAAATCGTAGCCAAACAAGGTCTCCGCAGATTCAGAGACACCATTAGCTGCAACACTTGTAGCTTCTGATGGACTGAATGAACCTGCTGTGCTGAAGTGCATAGAGCTTCTTGTTAAGGTCTGTTACCCAATTCAGAATGTTCTTTACCTTTAAATCACCGGGGGGAATTGTATTATGTGATGTGCTTCTAATTAGATCCATATGCTTTATTTGAACTATGATATCCACATTTTTTTCTTCATATTATGATGTCTGTATACACAGGCTGGTGCTAATTTGAACTGCGCTATTCCTGATACACCACTGGTGATAGCAACTAACAAAGACTTTGTTGAATGTGTTGAGTACTTGTTGGAGGCTGGTGCAAACGCCAATATTCCAACTAATAACGTGAGTTCTAAACTCTTTTTTATTGCGATCCTTATTTTATTTTTTGAGTGTGTGTATGCTTTGCTGTTGGGGGGCTTGCTGCTGCTGCTGCTTTAATGTAATGTGTTATGTTGTCAACATGCCATCTAGATGGTGCGCAAGGGCCTATGTCTTCTATTACGGAGTATTACTTATTACATATTGTGAAATATTTTTCTCCATCTCTCTTTTGATACGCAATAGGGTGGTAAGACACCAATAGAAATAGCCGCGAAGTCTGGAAGAAGGAAGCTTGTGGAGATTCTATTTCCTTGCACGTTGCCAATTAAAGGTGTGTCAAACTGGACTGTTGAAGGAATCATCACCCATGTGAAATCAAAAAAATCAAAGAAGAAAGCATGCGCTCAGGTCTGAACGTCTGAACTCTCAGCTCAGTGTTGTATGTGCGATTATGCATTTCTTTGTTGTGTATCTTCTGTAGTCTGTAACTTTTTCCCTGCTTCTGAGATCAGAGTTAAAAATGCATGCTATCTCTATCTTGTGCTTCACCTGCCTACCTGCTAGTAACAAACATGTACTAGTTCTGTAGAAGATCTTTTTACCTACACACTGACTCTGTTAGTTAGTCAAGCCGTGGTCTGCATAGGTACTTGCAAGAATTGTACTGCATTCCTATCAGAAAGCCATCGTCATGCATAAGAGTAAACAAGTAGTCAACAAGAGGCTTTAATTTGGAGTTCTCAGTTTAAGTTTTCTTAATGATTTAGGATAAGGAAAGTGGTACAGACAAAAAGGCTCAGTTGAAATC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