Difference between revisions of "BGIOSGA013359"
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Revision as of 15:49, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013359 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013359, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0022C08.16 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013359-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013359-PA |
| Length |
16256 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:31526964..31543219 |
| Sequence Coding Region |
31526964..31527029,31527437..31527496,31528499..31528545,31528708..31528791,31529665..31529728 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:31526964..31543219 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGGTGGAGGGGAATGGCCGCGCCGACTCGATCACCATTGGCGTCTGCGTCATGGAGAAGAAGGTGTTCTGCTCTCCTATGGAGCAGATTCTTGAGAGGCTCCGTGCATTTGGAGAATTCGAGATTATAATATTTGGGGATAAAGTTATTCTCGAGGATCCTATTGAGATTTGGCCAAAATGCGATTGCTTGATTGCCTTCTATTCATCTGGTTTCCCTCTTAAAAAAGCTGAGGCTTATGCTGCTTTACGAAGGCCTTTTTTAGTGAATGAATTGGAGCCACAACACCTACTTCACGACCGCAGAAAAGTATATGAGCATCTGGAGAAGTATGGAATTCCTGTACCCAATTATGCTCTTGTCAATAGAGAATATCCGTACCAAGAGTTAGACTACTTTATTGAGCAAGAAGATTTTGTTGAGGTTCATGGAAAGCGATTTATGAAGCCCTTCGTGGAGAAACCTGTCAATGGGGATGACCATAGAATAATGATATATTATCCTAATTCTGCTGGTGGTGGAATGAAGGAACTGTTCCGAAAGGTTGGTAACCGATCTAGTGAATTTCATCCTGATGTCAGGAGAGTGAGGCGTGAAGGATCTTACATTTACGAGGAGTTCATGCCTACTGGTGGGACGGATGTTAAAGTTTACACAGTTGGCCCAGGATATGCACATGCTGAGGCACGTAAATCACCAGTTGTTGATGGTGTTGTTATGAGGAACCCTGATGGGAAAGAAGTACGGTATCCTGTGCTTTTGACCCCTACAGAGAAACAAATGTCAAGAGACGTGTGCAGTGCTTTTAGGCAGATGGTTTGTGGTTTTGATCTCTTAAGGTGTGATGGAAGATCATATGTTTGTGACGTTAATGGATGGAGCTTTGTGAAGAACTCGTACAAGTATTATGACGATGCTGCATGCATCTTACGAAAGATATTTCTAGATGCAAAGGCACCTCATCTTTCTTCAACCATCCCTCCAAGCCTTCCTTGGAAATCTAATGAACCAGTTCAGCCCACTGAAGGTCTTACACGACAAGGAAGTGGAATAATTGGCACATTTGGGCAGTCAGAAGAATTACGTTCTGTCATTGTTGTGATACGCCATGGCGATCGGACACCAAAGCAGAAAGTGAAATTGAAAGTTACTGAGGAAAAACTCCTGAATTTGATGTTGAAATACAATGGTGGAAAGCCAAGAGCTGAGACAAAACTGAAAAGTGCCGTGCAACTACAAGACTTGCTAGATGCCACAAGGCAGCTTGTACCACCAACAAGGTCTGGCCGGGAAAGTGACAGTGATGCTGAGGATTTGGAGCATATTGAAAAGCTTCGTCAAGTCAAAGCAGTACTGGAGGAGGGTGGGCATTTCTCTGGTATTTATAGAAAAGTGCAACTAAAGCCACTGAAATGGATTAGAGTTCCAAAGCGCTGTGGTGATGGTGAAGAGGAACGACCAATTGAAGCACTGATGATTCTAAAATATGGCGGTGTACTCACTCATGCTGGGAGAAAGCAGGCTGAAGAGTTGGGTAGGTTTTTCAGAAACAATATATATCCAGGTGAAGGAACTGGTTTGCTTCGCCTTCATAGCACGTACAGACATGATTTAAAAATATACAGTTCAGATGAAGGCCGTGTGCAGATGTCAGCAGCAGCATTTGCCAAAGGCCTTCTTGATTTGGAAGGGCAACTAACACCTATACTGGTCTCTCTAGTAAGTAAAGACTCATCTATGCTAGATGGATTGGAAGATGCTAGCATCGAGATGGATGAAGCAAAGGCTAGATTGCATGAGATCATCATTACAAATGCTAAAGCAAAGAATACCAATGAACCAGTGGAGTTTCCATGGATGGTTGATGGTGCAGGATTGCCTGCAAATGCTTCGCAGCTTCTCCCTAAGATGGCCAAGTTGACGAAAGAAGTAACTGCACAAGTCAAGCTACTTGCTGAAGATGAAGATGAGAAGCTTGCATTAACAAACTCGTTTTCTAGATATGACCAAGCAAAGGCTTTTGGAAAAACAACAATTGATGTAGCTCGTATTGCTGCCGGGTTGCCTTGTGGTAGTGAGAGCTTCCTCTTGATGTTTGCTCGATGGAAAAAACTTGAGAGGGATTTATATAATGAAAGAAAGGACCGATTTGACATTACACAAATCCCAGATGTCTATGACTCCTGCAAATATGACCTCCTGCATAATGCACATCTTAACCTTGAAGGTTTGGAAGAGCTTTTCAAAGTTGCTCAACTTCTTGCTGATGGCGTAATTCCAAACGAGTATGGGATCAACCCAAAGCAAAAACTAAAAATTGGCTCAAAGATAGCACGTCGGTTACTTGGAAAAATTTTAATTGATCTACGGAACACTCGTGAAGAAGCAATAAGTGTTTCAGATCCAAAATTTACAGAAGATGAAGCTACATTCTTACCAACGAAAGAATCAGAGTACCAACAAAAACTTCAAACTAGAAATGAGGATGGAAGAAGATCTAGTTCCACAAGTGAGAAATCATTGGATCAGGAAGATGAAGATGATAGAGAAACTAAATACCGCTTAGATCCTAAGTATGCTAATGTAAAGACACCTGACAGACATGTCCGGACAAGGCTTTATTTCACATCAGAATCTCACATACACTCCTTAATGAATGTCCTTCGCTATTGCAACTTGGATGAATGTCTACAAGGGGAGGATAGCCTTGTCTGCCAAAGCGCTTTAGACCGACTGCATAGAACCAGGGAGCTTGACTACATGAGTAATATTGTGCTTAGAATGTTTGAAAATACTGAGGTTCCTTTAGAAGATGAGAAAAGGTTCCGGATTGAAATGACATTTAGTCGTGGTGCTGATCTTAGTCCTCTAGAGGATAAAACCAGTGAAAATACTTCCTTGCTCCAGGAGCACACCCTGCCGATAATGGGGCCTGAGAGACTGCAGGAAGTTGGTTCCTGCCTAACACTGGACAAGTTTGAGAAAATGGTGCGACCATTTGCGATGCCTCCTGAAGACTTCCCTCCAGCTGCTGCGCCACAAGCCTTTTCTGGCTACTTCAAAGGCTCTGGAATGCTTGAAAGACTCGCTAGTCTCTGGCCTTTTCACAAGGGCGCGACTAATGGGAAATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVVEGNGRADSITIGVCVMEKKVFCSPMEQILERLRAFGEFEIIIFGDKVILEDPIEIWPKCDCLIAFYSSGFPLKKAEAYAALRRPFLVNELEPQHLLHDRRKVYEHLEKYGIPVPNYALVNREYPYQELDYFIEQEDFVEVHGKRFMKPFVEKPVNGDDHRIMIYYPNSAGGGMKELFRKVGNRSSEFHPDVRRVRREGSYIYEEFMPTGGTDVKVYTVGPGYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYPVLLTPTEKQMSRDVCSAFRQMVCGFDLLRCDGRSYVCDVNGWSFVKNSYKYYDDAACILRKIFLDAKAPHLSSTIPPSLPWKSNEPVQPTEGLTRQGSGIIGTFGQSEELRSVIVVIRHGDRTPKQKVKLKVTEEKLLNLMLKYNGGKPRAETKLKSAVQLQDLLDATRQLVPPTRSGRESDSDAEDLEHIEKLRQVKAVLEEGGHFSGIYRKVQLKPLKWIRVPKRCGDGEEERPIEALMILKYGGVLTHAGRKQAEELGRFFRNNIYPGEGTGLLRLHSTYRHDLKIYSSDEGRVQMSAAAFAKGLLDLEGQLTPILVSLVSKDSSMLDGLEDASIEMDEAKARLHEIIITNAKAKNTNEPVEFPWMVDGAGLPANASQLLPKMAKLTKEVTAQVKLLAEDEDEKLALTNSFSRYDQAKAFGKTTIDVARIAAGLPCGSESFLLMFARWKKLERDLYNERKDRFDITQIPDVYDSCKYDLLHNAHLNLEGLEELFKVAQLLADGVIPNEYGINPKQKLKIGSKIARRLLGKILIDLRNTREEAISVSDPKFTEDEATFLPTKESEYQQKLQTRNEDGRRSSSTSEKSLDQEDEDDRETKYRLDPKYANVKTPDRHVRTRLYFTSESHIHSLMNVLRYCNLDECLQGEDSLVCQSALDRLHRTRELDYMSNIVLRMFENTEVPLEDEKRFRIEMTFSRGADLSPLEDKTSENTSLLQEHTLPIMGPERLQEVGSCLTLDKFEKMVRPFAMPPEDFPPAAAPQAFSGYFKGSGMLERLASLWPFHKGATNGK</aaseq> |
| Gene Sequence |
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