Difference between revisions of "BGIOSGA013689"
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Revision as of 15:51, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013689 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013689, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_13807 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013689-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013689-PA |
| Length |
10665 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:36911617..36922281 |
| Sequence Coding Region |
36911617..36911814,36911885..36911980,36912090..36912189,36912684..36912788,36912868..36913030 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:36911617..36922281 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:36911617..36922281 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCCGCTCAGGAGCTACCTCGGGAGGCTCCTCCTCGAGGAGATCACCCCGGTGGTGATGGTGCTCACCACCCCGCTCGCCGAGGCCGCCTGCCGCAAGAGCGGCCTCAGCGTCGTCGACATGCTCTCGCCGTTCTCCCTCTTCAAAAAAATCGACGGTGATTCACCTCCCCGATGCTCTCCGCTTCCGATAATTTGCCCGTGCGGACGGCGAGTGACCAGCCCTTACAGGCTGCAGATGTTTAAGATTCGGATGGTCTACGCTTCCGACGTCCGGAAGCAGGACTACGAGGTGGCGGATCAGAGGATCAAGCCAGTAGTTTCTGAGGCGAATGAGAGTGCTCTTCCAGATCTGCTTTCAGACCCACCACAGCTAGAAGATGTACTTAGCAAGCCTGAAGCTGAACTGTGCCCTTTGTGGATTAAGAAATTCAACAGAGCTCTGATGCGTACACTCTCATTTTCAGAGCATGAAACATTCGACCACCCTGTGGCATGTCTGTTAGTTGTATCATCAAAGGACAATGAACCAATCAGCAAGTTTGTTGATCTCTTCAACACAAATCAGTTACCTTCTCTTTTAAATGAAGGCATAATGGATCCCCAGATTCTTAAGCACTATCTTATACTTCATGATCAACAAGATGGACCACAAGAGATAGCTATGAACATTTTAGCGGAAATGAAGAGCACTCTTGGTTTGAATGATTGTAAATTGTTGTGTATTAATTCTTCTACAGAAGCAGATGGTGCAGATGCTGAGAATTCATGGTTACCTTATATAAAGGACTTCATGCAAGATTTGGCTTCTAATCATATAATTCCCTACATGGAGCAAAAGATCCGTGTCCTCAATCAGCAGGTAGCCACAACAAGGAAGGGCTTTAGGAATCAAATAAAGAACTTGTGGTATACGTTCACCTCCATAGAGTCACAGATTAGAGTTCTAGGTGACTATGCTTTCATGTTACGGGACTATGAGCTTGCTTTGTCCAATTATAGATTACTCTCAACAGATTATAAGCTTGACAAAGCTTGGAAGCGCTTTGCTGGTGTGCAGGAAATGAGTGGACTGTGCTATTTCATGTTGGACCAGTCAAGGAAGGATGCTGAATATTGCATGGACAGTGCCTTTAGTACATATCTGAGAATTGGATCTTCTGGGAAGAGAAATGCTACTAGATGTGGCATTTGGTGGGCAGAAATGCTTAAAACAAGAGGACAGTATAGGGAGGCATCAAGTGTATACTACCGCGTTTCTAATGAGGAACCTTCATTGCATTCTGCTGTACTGCTTGAGCAAGCCGCTTGTTGCTATGTGTTATCTAAACCACCTATGCTTCGGAAGTATGGATTTCACCTAGTGTTAGCTGGAAATAGTTATTACATATCCGATCAGAAGCAACATGCTGTTCGGGCATACAGAAATGCTCTGTTTGTTTACAAACAACATCCTTGGAGTTATATCAATGATCATGTACATTTTAATGTTGGAAGGTGGTATGGAGTCCTTGGGATATTTGATGTAGCCATAAAGCACTTGCTGGAGGTCATTGCTTGCAGCCATCAGTCCCTGACAACGCAAAGCATGTTCCTCAATGATTTTTTCCATTTTGTTCAGAGTATGGGGAAGAAATTTGATGTCTACAAGCTTCAACTTCCTGTTATCAACATGCCATCACTCAGAGTTATATATGAAGATCATCGTACTTATGCATCAGATGCAGATGTTAATGTTAGTGAAAGCATTTGGCAGGAGCTGGAGGAAGAAATGATCCCATCATCATCTATTGTTAGAACTAACTGGCTTGAAAAATCTCCTGACTTGAGAAAATACAAGGATTCCTGTGTTTGTGTTGTGGGAGAAGCAGTAAAAGTGAGGATTGAGCTTAGGAACCCTCTACAAATTCCTGTTGCTGTTTCTTGCATCTCTCTAATATGTCAGCTTTCCACCAGTTTGGACGCTTCAAGTGCTGTCAATAGTGTGCTGACCACAGGTGCTGGGGAAGATATAGCTAACACAAAGCCTGCGATATCAATATTTGAGGATGATGGAAATAATTTCACAGTTTCAAAGCTGGACATTGTGTTAGGAGGAAGTGAAACTAAAAGTGTACAACTTGAAGTTACTCCAAAAGTTGAAGGTATTCTGAAGTTACATGGGATAAGGTGGACGCTCTCAGATTTATTAGTTGGCTATCAATACTTTGAATTTGACACAAAAAGGAAAACTAAGAAAGGGAAAAAGGGACCTCGTCGTACTTTGAGCAACACCCTGATTGTAATCAAGGGTTTACCTAAACTTACGGGGTGTATTGATCACTTGCCAACAAATGCGTTTGCTGGAGATTTACGGCTACTCAAGCTGAATCTGAGGAACCAGTCAGAATATGCTGTGAAGAATATTAAGATGAAGCTTAGCCATCCAAGATTTGTAATTCCTGGTGATTTATCAGAAGTTGATTTCGAGTTTCCCCAATGCTTAAGAAAGCATGTACAATCAGAAATTAGTACTGTATCGACAAAACGTACTCAGGGAGATGCCAAGGGTTTGCTCTTTACATTTTCTCAAGATATTAAAATTCAAGAAGGAGCCACGTTCTCCTGGCCTATTTGGTTCCATGCTGCAACTCCTGGGAACTTTTCTCTTTATATATCTCTGTATTATGAAATGGAGAGCCCAAGTGAGATAACTTATAGAACATTGCGCATGCACTACAATATTGAGGTTTTTTCATCACTTAATGTGTCCTTTGCTATAAGAATGTGCTCATCAAGATTGAAAGAGTATATTGTGCGCATGGACATCCTGAACAGGACTCCCTCAGAGTCATTTATTCTTCATCAGTTGTCATGCAATGACAGTAAATGGGCAATTTCATCGTTGCCTTTGTGCGATTCTATCCGCTCTATTGAAACAGTATCAGCAAATCAGTCTGTGTCGTGCTTCTTCAAGATAAAGGATTTAGGTACAAATTCTTGTAAAGAAGCTGAAAACAGTTCTTGTAGAAGTGATATGCTTTTTTTATCTCGTGAGGGCAACAGCAATACTGAGGAGTTTGATGTTTCCCAATCTCCTATTACCAATTTCCACTATCAAGAGAGATACCAACAGGGAAGGTTGGCTAAGGGACCACGGGACCTTCTTGATTTTATTCTGATCTCGAAAGCAGTAGGTGGTAACTATTCCAAGTCAGATCCAGACGTTCAACTACTCTCTCATCATGTGTGCCATTGCAGTGCTATCGACCAGAGTCCTATATGGTGGTTTATGGAAGGGCCTAGAACAGTTACTCATGATTTCTCAAAGTCTTACTGTGAAGCAAACATCCAGTTGGTAATTCATAATTCTGTGCAACATAATATTTCAGCGAGAGTAGTTACCTATGACAGCGTGCCAGATAAAAGCCAAACTGTCAATTTGCAAGATTCTAATAGTAATCAGGGTGGATGGTATGATGTATCGCTGGAAAATGACATTAAAGCTATCTCTACTGCCAAGGGGACACATTATCAGAAACAGCCATCAGAGAGCATTTCACCTTTTGTTTGGTGTTCATTGAGTTCTGCTCAAGTTGACCTGAAACCTGACACTTCCACTAAAGTTCCTCTAAAAGTGTGCATATTTATGCCTGGAACATACAATCTTTCGAATTATCAGCTACAATGGAAAGTGCATTCATCCGAGGTAGGACAGGTGGATGAAAATCAAAGATCCGGTGGTGGCCAAGGGCATCCTTTTTATGTCACTGTTCTTCAGGATGCTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPLRSYLGRLLLEEITPVVMVLTTPLAEAACRKSGLSVVDMLSPFSLFKKIDGDSPPRCSPLPIICPCGRRVTSPYRLQMFKIRMVYASDVRKQDYEVADQRIKPVVSEANESALPDLLSDPPQLEDVLSKPEAELCPLWIKKFNRALMRTLSFSEHETFDHPVACLLVVSSKDNEPISKFVDLFNTNQLPSLLNEGIMDPQILKHYLILHDQQDGPQEIAMNILAEMKSTLGLNDCKLLCINSSTEADGADAENSWLPYIKDFMQDLASNHIIPYMEQKIRVLNQQVATTRKGFRNQIKNLWYTFTSIESQIRVLGDYAFMLRDYELALSNYRLLSTDYKLDKAWKRFAGVQEMSGLCYFMLDQSRKDAEYCMDSAFSTYLRIGSSGKRNATRCGIWWAEMLKTRGQYREASSVYYRVSNEEPSLHSAVLLEQAACCYVLSKPPMLRKYGFHLVLAGNSYYISDQKQHAVRAYRNALFVYKQHPWSYINDHVHFNVGRWYGVLGIFDVAIKHLLEVIACSHQSLTTQSMFLNDFFHFVQSMGKKFDVYKLQLPVINMPSLRVIYEDHRTYASDADVNVSESIWQELEEEMIPSSSIVRTNWLEKSPDLRKYKDSCVCVVGEAVKVRIELRNPLQIPVAVSCISLICQLSTSLDASSAVNSVLTTGAGEDIANTKPAISIFEDDGNNFTVSKLDIVLGGSETKSVQLEVTPKVEGILKLHGIRWTLSDLLVGYQYFEFDTKRKTKKGKKGPRRTLSNTLIVIKGLPKLTGCIDHLPTNAFAGDLRLLKLNLRNQSEYAVKNIKMKLSHPRFVIPGDLSEVDFEFPQCLRKHVQSEISTVSTKRTQGDAKGLLFTFSQDIKIQEGATFSWPIWFHAATPGNFSLYISLYYEMESPSEITYRTLRMHYNIEVFSSLNVSFAIRMCSSRLKEYIVRMDILNRTPSESFILHQLSCNDSKWAISSLPLCDSIRSIETVSANQSVSCFFKIKDLGTNSCKEAENSSCRSDMLFLSREGNSNTEEFDVSQSPITNFHYQERYQQGRLAKGPRDLLDFILISKAVGGNYSKSDPDVQLLSHHVCHCSAIDQSPIWWFMEGPRTVTHDFSKSYCEANIQLVIHNSVQHNISARVVTYDSVPDKSQTVNLQDSNSNQGGWYDVSLENDIKAISTAKGTHYQKQPSESISPFVWCSLSSAQVDLKPDTSTKVPLKVCIFMPGTYNLSNYQLQWKVHSSEVGQVDENQRSGGGQGHPFYVTVLQDA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..198#269..364#474..573#1068..1172#1252..1414#1620..1740#2250..2330#2432..2478#2606..2756#3096..3182#3909..4028#4133..4264#4362..4459#4538..4661#4745..4852#5441..5576#6370..6480#6582..6645#6752..6824#7381..7557#7631..7741#8434..8604#8696..8851#9213..9446#9560..9727#9940..10049#10137..10665#ATGGATCCGCTCAGGAGCTACCTCGGGAGGCTCCTCCTCGAGGAGATCACCCCGGTGGTGATGGTGCTCACCACCCCGCTCGCCGAGGCCGCCTGCCGCAAGAGCGGCCTCAGCGTCGTCGACATGCTCTCGCCGTTCTCCCTCTTCAAAAAAATCGACGGTGATTCACCTCCCCGATGCTCTCCGCTTCCGATAATTGTGTGTGTGACGCTTGTCGCATTTCATTCGATTGGGTTCTGTGACCTCATGGGGAATCCCCTGTATGCAGTGCCCGTGCGGACGGCGAGTGACCAGCCCTTACAGGCTGCAGATGTTTAAGATTCGGATGGTCTACGCTTCCGACGTCCGGAAGCAGGACTACGAGGTGATTCTCGAACTTTCTGGAAGCTTCTGGGTTGTGCTGTTGGCTTGGTCAGTATGGATGCCTATAGGTTTATAGAATCTCTTGATGGACATTGGCTGTTTTGGAGCAGGTGGCGGATCAGAGGATCAAGCCAGTAGTTTCTGAGGCGAATGAGAGTGCTCTTCCAGATCTGCTTTCAGACCCACCACAGCTAGAAGATGTACTTAGCAGTGAGATCCCTTACTGCTTCATTTTGTTATGTTCTCACCTGTGGGCATATTTACTTTGAGCAAAATTATGGAGCCGTAGTTGGAATTCTATGGATCACTTAAAGTAGCGTAATCCGATCACCTTGACATTAGAAGCAAACTGTGACTTACTATGAGCAGCAATAATCTTCTATTCAGATTGTTTAATTTGCAGAATAATTTTAGGTTATAATTTTGCGCTGGTAGTGGAAGTATCTTTACAAAGTGATCATACCAAACGAGCGTGTGCATTATATTTTGGATAGCTCAAAGTTCCTGTAAATGGTGTGAATATGCGATGTGTTTCTCAGTGGCTGTGAGTGTAAATAACAAGGGATATTTGGGTGGTTACAAACATAGTGTTTCTTTGCCTTCGTCATGTCTTAGAGTTGATATGAAACTGAAATAATAGTATTATTGTTTGCTGTTTGTTCGGTGCATCTTACATATGGTTCTTTCTTTGCTCTTGATTCCAGAGCCTGAAGCTGAACTGTGCCCTTTGTGGATTAAGAAATTCAACAGAGCTCTGATGCGTACACTCTCATTTTCAGAGCATGAAACATTCGACCACCCTGTGGCATGTGAGATTTGGAACTTTCGTCTTATTTGGTGTTTTTTTTAAGGATATGTTCTTGCTCATGCTTTGACTATTGTTAACAGGTCTGTTAGTTGTATCATCAAAGGACAATGAACCAATCAGCAAGTTTGTTGATCTCTTCAACACAAATCAGTTACCTTCTCTTTTAAATGAAGGCATAATGGATCCCCAGATTCTTAAGCACTATCTTATACTTCATGATCAACAAGATGGACCACAAGAGATGTATATTCTTCACTCAGTTATTATGTTTACATTAGTTCTTGCATAGCCTAGCAACCTGTTACTAATGAACATGTTCTCTCAGTTTTATAGTGTTCTCTAGCCAAACAATGATATAATGTCATATGCCAAATGCCAACATTTTACAGTGTCATGTATGCAATTTTCCCCTTCTTTTTTGCTGACCTTCTTTTTTCTTTTGGTGAAGAGCTATGAACATTTTAGCGGAAATGAAGAGCACTCTTGGTTTGAATGATTGTAAATTGTTGTGTATTAATTCTTCTACAGAAGCAGATGGTGCAGATGCTGAGAATTCATGGTTACCTTATGTAAGTACAGAGAACTACTTCAGATTAAATTGCATTAGTGTTTACGTAGTGCAGCCGATATGCAATCTAGTTACAGTATTTTCTTGACTAAACTACAGAAATCTCATGGTTTGCACAACCAAGACGGAGCTTGTTGGCTTAACACGGATGATTTGAATGAGGTATTGCCCCATTTGATGAATATCATGTCATCTGCTTATCCGTCTTCTTGGGCATATTGAATGTCATGAAACCATTGTCCAACATTTTGTAGCACCTAATGATTCATCTGTTCCCTGGTAGGTATTGTTGGGAAGATTAGTAGCCTACTTGGTAGTTATTACTCAGTGTATGCAAGGTTTTCATGGGTATCGATGCTAAGAATACAAAATGAATATTTCTCGCAGATGTATGGTATTAGATCAATGAACTTTAGTTATTCCTCTGTAGTATCCAGTGTCACATGCAATTATTGATTTCTGAGAGCCAACCCATACAAGATACTTACTAGATAAGCCGTTTTTTTTCAGATAAAGGACTTCATGCAAGATTTGGCTTCTAATCATATAATTCCCTACATGGAGCAAAAGATCCGTGTCCTCAATCAGCAGGTATTTTCTTTATTCCATTACTTTTTTTTTACCTCTCTCAACAAGATTAACCATTCTGTTTTTGAAAATAATAATAATAATAATATTAAGCATTTTTCTAGGTAGCCACAACAAGGAAGGGCTTTAGGAATCAAATAAAGAACTTGTGGTGGAGAAAAAGAGATGATGTTCCAGAAGCTGCAAATGGCCCAATGCAAGTGGTTACTTACATCTTGCCCTTTTCCCTATATAAAAATTCTGTAGTTTGCTGTAACACTTTTTTTTTTCTTCAACAGGTATACGTTCACCTCCATAGAGTCACAGATTAGAGTTCTAGGTGACTATGCTTTCATGTTACGGGACTATGAGCTTGCTTTGTCCAATTATAGATTACTCTCAACAGATTATAAGCTTGACAAAGCTTGGAAGCGCTTTGCTGGTGTGCAGGTGCTTTATACTTGTTTTAACTTCTTGCCTTGATTTACATATGACATTACTTATGTAGTGTTGTTGAGTTTGAAATAAAGTAGCAATCAAGGTGGCGATTCTTAAGGAATATCCTGGGACCAGCTACGTTAACAGCCTAACATACTTTTCACCTCAAACACGAGTTTAGACCTTCTTACTTGTACACCATATCAGAATCATACTGTATGCTTCCAAATTTAAAGCACATGGTTCCTGAATTTGTTTTGATGATTGATTGAGTACTGAATCAAGCTTGAGTGCAGTGGCCAAATATTCAAGTAGGTAGTCACTTCATGATAATGTCTGTGTCTTTTGCAGGAAATGAGTGGACTGTGCTATTTCATGTTGGACCAGTCAAGGAAGGATGCTGAATATTGCATGGACAGTGCCTTTAGTACATATCTGGTATTCATCTCTATGTCCACTTCTAGTTTCTCAGACTAAATTAAATGGTTCTCTTTCTAAATTGTAACCTAACATGCTAGCTCCATCGATATAAATTTGTGTTCTGTGTACTGTCCAATATGTCATACACAAAGAGAAAAGGAGTTCCTATTTAGTTTTGTATGAAGCAGTTTTCCATGTCTATTAAATACAGTTGCATCTGATTTTCAGGACTATTGATATTAACATTGACTTAGCAAGGAGTGATCATATGTCATTGATCTTACTGCGCAAATGCTAGTCTGTTGCATTGTTTTATAGTCATTCATATGATATCAACAGTAGACTCAGTTAATTTTATGGAGTTCCCCAGTCATTAAATTCCTGTGTGCTCTGTTCTTACCCGAATTAGTGCCATGCTTCACCTAGCACTGTTCTAATCCAAGTTGTCATTGGTGGCATCTCTAGGATAGATGACTTCCTTTATTCCCATTATTTTTGGGAGCTGATAGTTGGGTGTGCTTTGTGGCATATAATCAAGAATGCGTGAAACTAGATATCAAGAATTGAAGAATTCATAATTTGCGATTAAGGGCTATAAAGGGGCAGGATGATTCCAAATAATTAATGCTACTCTTATGTGTAATTTCAACTTTTGAAGTTAATTAAATTTGGAATGATTGATATCCTTCGTGCTTCTCTGTTCTCTCTTGATATTGCTCTCGTTTATTCTATTCATATTTGTAGAGAATTGGATCTTCTGGGAAGAGAAATGCTACTAGATGTGGCATTTGGTGGGCAGAAATGCTTAAAACAAGAGGACAGTATAGGGAGGCATCAAGTGTATACTACCGCGTTTCTAATGAGGTAGATCTAGCATCAAGCATACATTGATAAAATTTTACTCATATTTTTTGCAGGAAGAATTTTTAGTTTATTACACAACATTGATGGAATTTTCTAATGTTCAGGAACCTTCATTGCATTCTGCTGTACTGCTTGAGCAAGCCGCTTGTTGCTATGTGTTATCTAAACCACCTATGCTTCGGAAGTATGGATTTCACCTAGTGTTAGCTGGAAATAGTTATTACATATCCGATCAGGTGTACTATAATTATATTTACTGCTGTGATATTTAATTAATGCTTTAGAAGTATATTATATCTTTGTTGAGTCTGAAAATTCAATCTTTGAGTGCAGAAGCAACATGCTGTTCGGGCATACAGAAATGCTCTGTTTGTTTACAAACAACATCCTTGGAGTTATATCAATGATCATGTACATTTTAATGTTGGAAGGTAGTTGTGTGTTTTAGCTCCTATCCATATATTTTTCTTGTCTATAAACTATTATTAACTCTGGTGACTGTAAACTAGGTGGTATGGAGTCCTTGGGATATTTGATGTAGCCATAAAGCACTTGCTGGAGGTCATTGCTTGCAGCCATCAGTCCCTGACAACGCAAAGCATGTTCCTCAATGATTTTTTCCATTTTGTTCAGGTTCTTGACCAGCTCCATTTGTGCTCTCATTTT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