Difference between revisions of "BGIOSGA014376"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA014376

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014376, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0085I10.4

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA014376-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA014376-PA

Length

19120

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:29761536..29780655

Sequence Coding Region

29780020..29780655,29779328..29779393,29779030..29779203,29778822..29778952,29778627..29778703
,29778462..29778526,29778345..29778398,29778149..29778203,29776866..29776926
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,29769126..29769203,29768866..29768984,29768350..29768403,29768071..29768173
,29762808..29762936,29761987..29762098,29761536..29761567

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:29761536..29780655 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCGGCGGCTCCTCCCCCTCCCCGGCCGCCGCGCCCATCCAGGTGCGCTGCGCCGGATGCCGCGGCGTCCTCGCCGTCGGCCCAGGCATGACCGAGTTCATCTGCCCCAAGTGCGGCATGGCGCAGCGCCTCCCCCCGCAGCTGATGCCCAAGCCGCCGCCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCCCCGCGCCTCCCGCCCCGGCGGCACCGCCGCCGCCTACGTCCCGGAGAGGAGGCGGAGGCGGCGCGGCCCTTCCGCCCCCGCAGGCGCAGGGGGTGGACCCCACGAAGATCCAGCTCCCCTGCGCCAACTGCCAGGCCGTGCTCAACGTGCCCCACGGCCTCGCCCGCTTCCGCTGCCCGCAGTGCGGCGTGGAGCTCGCCGTCGACCTCGCCAAGCTGCACAACTTCCTGGCCTCCTCCAACAACAACGCCGCCGCGGCGCCGCCGGACAACGTCCCGCCGGCCTCGGGACCCGCGTCGCGAGCGCCTTTGGTGCCTGCGCCTCCGCCCGCCCCGTTCCCCCCCGTGCCGACGCCAGGCATGACGCAGGCGCCGCAGATGGTGCCTGGCGCGTTGATCCCGATGGTGCTTCCCATCACTGATCCGCCTGAGGAGATCAACGAGGTTGCAATTGATGTTGAGCGTGAAGAAGATGAAGGTGGTACTGTTGGAGAAACGTTCACTGACTATAGGCCTCCCAAACTCTCTCTTGGTCTGCCTCATCCAGATCCAATAGTAGAAACTTCTTCTTTGTCAGCTGTACAGCCTCCTGAGCCAACTTACAGCTTGAACATCATGGATGAATTGGATGAGACAAAGGCCTTGTCTTGCTTGCAAATCGAAACATTAGTTTATGCTTGTCAGCGGCACCTTTATCATCTCCCTACTGGTGATAGAGCAGGTTTTTTCATTGGTGATGGAGCTGGTGTTGGTAAGGGCCGGACAATTGCTGGATTAATATGGGAAAATTGGCAACAGGGAAAGCATAAGGCAGTGTGGGTATCTATTGGCTCTGATTTGAAGTATGATGCTCGAAGAGATTTGGATGACGTTGGTGCAAAATGTGTACAGGTGCACCCTTTAAATAAGCTACCATATTCTAAGCTAGACTCAAAGGCCATTGGGATCAAGAATGGGCAATTGGTTCAGTGGTGTGGACAAGAATTTGATGGTCTTCTAGTGTTTGATGAGTGCCACAAGGCCAAAAATCTCATTCCTGATGCAGGGAGCCAGCCCACTCGCACTGGATCTCTCGAGAAAGGTGGTGTGGGCGCTCTTGAACTTGTTGCCATGGACATGAAAGCCAGGGGTATGTATGTTTGCCGCACACTAAGTTATAAGGGGGTTGATTTTGATATTGTGGAGGCTCCCCTTGAGGAAAGAATGATGAATATGTACAGAAAGGCAGCCGAATTTTGGGCTGAGTTCCGCCTTGAGCTCCTATCAGCAGGTGAATCATTTACAGAAGGCATTTCAAATCAAATATGGCGGCTATATTGGGCTAGCCATCAGCGTTTCTTCAGGCATATGTGCATGTCTGCAAAAGTACCTGCTGTTGTGAAGTTGGCTAAGGAGGCCCTGGCAGAGAATAAGTGTGTGGTGGTTGGTCTTCAGAGCACTGGAGAGGCTCGAACAGAAGAAGCTATCACAAAATATGGTGTTGAAATGGAAGACTTTGTTTCTGGTCCTCGGGAGCTGCTTCTAAAGCTGGTAGAAGAAAATTACCCTCTACCTCCGAAGCCTGATTCTTTTCAACAAGGTGAAGAAAAAGTCACAGAAATTCACCGTAAGCGGCATTCTGCCCCAGATGTATCATTTAAAGGACGTGTTAGAAAAGTAGCAAAACTGGTAGAAGTGAGTGATGATGACAGTGATGATTACTCTCCATCTGAGTCAGATCATGGATCGACAGAGTCTGATGAGGAGTTTCACATGTGTCAAATCTGTAACACAGAGGAGGAGAAGACTCTGTTGCTTCATTGTTCTGGTTGTTCTCGACATGTTCACCCTGGTTGTCTGACACCACCTTGGACTGGGGTATTAACTGATGACTGGTCATGCTACACATGCAAGAAGTTAGAAGGAGAGGAAAATGAACAAGATGCTCATGTAGCTGATTTTTCACAGAGGTATGATGCTGCAGTAGAGAAAAAAAAGAAGATTTTGGATATGATACGTTCTTTGGATCTCCCTAACAATCCTCTTGATGACATCATTGATCAGCTAGGAGGCCCTGACAATGTTGCAGAAATAACTGGACGGCGTGGTATGCTAATAAGAGCTTCTGACGGAAAAGGCGTTGTTTATCAGGCGCGGAATGCGAAAGAAGTGTCGATGGAGATGATCAATATGCATGAAAAACAGCAGTTCATGGATGGCAAAAAACTAATATCTATTATATCTGAAGCAGGATCAGCTGGCGTTTCGCTGCATGCTGATAGAAGGGCAAAAAACCAGAGAAGAAGAGTACACATAACACTTGAGCTCCCTTGGAGTGCAGATCGTGCAATACAACAGTTTGGGAGAACTCATCGTTCTAATCAAACTTCTGCACCACAATATAGGCTTCTCTTTACAAATCTTGGTGGTGAAAAGCGATTTGCATCAATCGTAGCAAAAAGACTGGAGTCTCTAGGAGCTTTAACGCAAGGAGATCGCAGGGCTGGACCTTCTCTGAGTGCTTTTAACTACGACAGCAATTATGGGAAAAAAGCCCTAACCATCATGTATAGAGGAATAATGGAGCAGGATTCTTTTCCAGTTGTTCCTCCGGGGTGTTCTGACAATCAATCTAGCATCCAAGAGTTCATTGCTGAAGCAAAAGCTGCTCTAGTATCAGTTGGGATTATCAGGGATGCTGTAGTGTGCAATGGAAAAGTTGCTGGGAAGCTTTCTGGTCGGATTGTTGACTCAGATATGCATGATGTTGCTCGTTTTCTTAACCGCCTTTTGGGACTGGCTCCGAAAATCCAGAATAGGTTATTTGATCTTTTTACAAGTATACTTGATGTTGTTTTGCACAATGCACGAATAGAAGGGCAGCTGGATTCTGGAATCGTTGATATAAAAGCTAAAAATGTTGAAATGAAAGAATCACCCAAGACCGTTCACATTGATAGCTTGTCAGGCGCGTCAACTGTACTTTTTACTTTCACCATTGACCGAGGAGTTACTTGGGAGACGGCAAAATCAATGCTTGATGAGAGGCAAAAGGATGGTGCTGGTTCTTCTAATGATGGGTTTTACGAGTCCAAAAGGGAATGGATGGGAGGAAGGCATTTCATACTTGCTTTTGAAGGCTCAATCGAAGGGATGTATAAAATAATTCGACCTGCTATTGGTGAAGCATTAAGAGAAATGCCTTTAACAGAACTGAAAAGCAAGTACAGGAAAGTGTCATCAATAGAAAAGGTTAACAAAGGTTGGCAAGATGAATATGATGCTTCGTCCAAGCAGTGTATGCATGGATCGAAATGCAAAGTGGGAAGCTACTGTACAGTGGGAAGAAGGTTGCAAGAGGTTAACATCTTGGGTGGTCTCATACTTCCAGTTTGGGGTACAATAGAAAAGGCCCTAGCTAAGCAGGTTCGTCAAAGTCACAAGCGAGTACGTGTTGTCCGTTTAGAGACAACAACTGACAATCAGCGAATCGTTGGACTACTCATTCCGAATTCAGCTGTGGAGTCAGTATTAACAGGCTTACAGTGGGTCCAAGATATTGATGACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAGGSSPSPAAAPIQVRCAGCRGVLAVGPGMTEFICPKCGMAQRLPPQLMPKPPPSSSSSAAATPAPPAPAAPPPPTSRRGGGGGAALPPPQAQGVDPTKIQLPCANCQAVLNVPHGLARFRCPQCGVELAVDLAKLHNFLASSNNNAAAAPPDNVPPASGPASRAPLVPAPPPAPFPPVPTPGMTQAPQMVPGALIPMVLPITDPPEEINEVAIDVEREEDEGGTVGETFTDYRPPKLSLGLPHPDPIVETSSLSAVQPPEPTYSLNIMDELDETKALSCLQIETLVYACQRHLYHLPTGDRAGFFIGDGAGVGKGRTIAGLIWENWQQGKHKAVWVSIGSDLKYDARRDLDDVGAKCVQVHPLNKLPYSKLDSKAIGIKNGQLVQWCGQEFDGLLVFDECHKAKNLIPDAGSQPTRTGSLEKGGVGALELVAMDMKARGMYVCRTLSYKGVDFDIVEAPLEERMMNMYRKAAEFWAEFRLELLSAGESFTEGISNQIWRLYWASHQRFFRHMCMSAKVPAVVKLAKEALAENKCVVVGLQSTGEARTEEAITKYGVEMEDFVSGPRELLLKLVEENYPLPPKPDSFQQGEEKVTEIHRKRHSAPDVSFKGRVRKVAKLVEVSDDDSDDYSPSESDHGSTESDEEFHMCQICNTEEEKTLLLHCSGCSRHVHPGCLTPPWTGVLTDDWSCYTCKKLEGEENEQDAHVADFSQRYDAAVEKKKKILDMIRSLDLPNNPLDDIIDQLGGPDNVAEITGRRGMLIRASDGKGVVYQARNAKEVSMEMINMHEKQQFMDGKKLISIISEAGSAGVSLHADRRAKNQRRRVHITLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQTSAPQYRLLFTNLGGEKRFASIVAKRLESLGALTQGDRRAGPSLSAFNYDSNYGKKALTIMYRGIMEQDSFPVVPPGCSDNQSSIQEFIAEAKAALVSVGIIRDAVVCNGKVAGKLSGRIVDSDMHDVARFLNRLLGLAPKIQNRLFDLFTSILDVVLHNARIEGQLDSGIVDIKAKNVEMKESPKTVHIDSLSGASTVLFTFTIDRGVTWETAKSMLDERQKDGAGSSNDGFYESKREWMGGRHFILAFEGSIEGMYKIIRPAIGEALREMPLTELKSKYRKVSSIEKVNKGWQDEYDASSKQCMHGSKCKVGSYCTVGRRLQEVNILGGLILPVWGTIEKALAKQVRQSHKRVRVVRLETTTDNQRIVGLLIPNSAVESVLTGLQWVQDIDD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..636#1263..1328#1453..1626#1704..1834#1953..2029#2130..2194#2258..2311#2453..2507#3730..3790#4011..4092#4329..4451#4667..4810#4920..5022#5380..5508#7774..7844#8292..8461#8546..8639#9407..9504#9584..9719#9812..9918#10514..10609#10683..10770#10858..10975#11066..11177#11247..11370#11453..11530#11672..11790#12253..12306#12483..12585#17720..17848#18558..18669#19089..19120#ATGGCCGGCGGCTCCTCCCCCTCCCCGGCCGCCGCGCCCATCCAGGTGCGCTGCGCCGGATGCCGCGGCGTCCTCGCCGTCGGCCCAGGCATGACCGAGTTCATCTGCCCCAAGTGCGGCATGGCGCAGCGCCTCCCCCCGCAGCTGATGCCCAAGCCGCCGCCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCGACCCCCGCGCCTCCCGCCCCGGCGGCACCGCCGCCGCCTACGTCCCGGAGAGGAGGCGGAGGCGGCGCGGCCCTTCCGCCCCCGCAGGCGCAGGGGGTGGACCCCACGAAGATCCAGCTCCCCTGCGCCAACTGCCAGGCCGTGCTCAACGTGCCCCACGGCCTCGCCCGCTTCCGCTGCCCGCAGTGCGGCGTGGAGCTCGCCGTCGACCTCGCCAAGCTGCACAACTTCCTGGCCTCCTCCAACAACAACGCCGCCGCGGCGCCGCCGGACAACGTCCCGCCGGCCTCGGGACCCGCGTCGCGAGCGCCTTTGGTGCCTGCGCCTCCGCCCGCCCCGTTCCCCCCCGTGCCGACGCCAGGCATGACGCAGGCGCCGCAGATGGTGCCTGGCGCGTTGATCCCGATGGTGCTTCCCATCACTGATCCGCCTGAGGAGATCAACGAGGTATGCTGTTGTGCACTAACTTGCTCTGCCATTTTGTTGGTTAGTGTATACGATCTTATTCGTTAAGGCTTGATGAATGCGCTTTGACCTTTGAACGGTGTTAATCGAGGCAATTTTGGACCGATAGTTTATCATAACGAGAAATTCTGTTTGTAATGGGCTATATATTCGCTAGGAAGGCAATTTTGGTATAGTTCCATTTATACTTTTATTATGCATGAAATTGGACAATTGTTTTGCTTGAGATGATAACGAGGGCTTCACATGACATAATTATGTACAATCTGATTTCCTTAATTTTCATTTTTAATGGTTAGGGCAATATTTTTTCATTTCTGGTGATTGGCTTTGGCTGGTCGGTTTCAATTTTTGAATTCATCTGCTTGGTCGTCCATACATTGTTCTCTGCTCTTTGGATGTGTACAGCAGGATTTAAAAGTTTCTGCTGATTAATTTCAAACTGTACAATGTTTTACACCCATAAACATTCAGTTTCTCTGACATTGTTGATGCATGCTTCATATATTGTATTATAATAGTTTACCAGGTTTACAGCCTTATATATTGTATTATAATAGTTTACCAGGTTTACAGCCTTTCACTTGCTGGGCTTTTTTGTCAAGCAGGTTGCAATTGATGTTGAGCGTGAAGAAGATGAAGGTGGTACTGTTGGAGAAACGTTCACTGACTATGTAAGGATTCTATGTACTTTAACAGCTGATTCTTTACTATGCATAAATATTCGTACACATATTTATTACTGTGATTCATATTTAATTTCTTGAGAATTTTTCCCATATTTTCACTTGTTTCCAGAGGCCTCCCAAACTCTCTCTTGGTCTGCCTCATCCAGATCCAATAGTAGAAACTTCTTCTTTGTCAGCTGTACAGCCTCCTGAGCCAACTTACAGCTTGAACATCATGGATGAATTGGATGAGACAAAGGCCTTGTCTTGCTTGCAAATCGAAACATTAGTTTATGCTTGTCAGGTTAGTGCCATTCTATATTCTTCTATGAAGTTTTATATGTCACACCTCTTGTAAATCTTTATGTTGTTGTATGACAGCGGCACCTTTATCATCTCCCTACTGGTGATAGAGCAGGTTTTTTCATTGGTGATGGAGCTGGTGTTGGTAAGGGCCGGACAATTGCTGGATTAATATGGGAAAATTGGCAACAGGGAAAGCATAAGGCAGTGTAAGATTGTTGCCAAGAAACAACATTTAGTGATCTGATGAATTCATAACAATATCTTATAGTTATGTTTCCATGCTTCATTGTTTGATTCTAGTTGTATTATGGTTGTATTTTCCAGGTGGGTATCTATTGGCTCTGATTTGAAGTATGATGCTCGAAGAGATTTGGATGACGTTGGTGCAAAATGTGTACAGGGTATGAAGCCAATTAACTCATAAAATTAAATTTTCACCTTAAGTGATCAAAAGTATTTATGGTTGATATGTGTTTGATGTTGGGTTTTTTTTTCATGCAGTGCACCCTTTAAATAAGCTACCATATTCTAAGCTAGACTCAAAGGCCATTGGGATCAAGAATGGGGTAATTTTTGTAACGTACAGCAGCTTGATAGCATCATCTGAGAGAGGTCGTTCCCGTTTGCAGCAATTGGTTCAGTGGTGTGGACAAGAATTTGATGGTCTTCTAGTGTTTGATGAGGTAATGGATTTGCTTTGAACTTGTGATAGCAGCATGCCCCCCTCCCACCCACGCACAACACTCCACATCATATTTATTTTATAGCCAGAATCTATATTGATAAGTGTATTTATCTGTGCTGAACTTGTAAATCCCTTACAGTGCCACAAGGCCAAAAATCTCATTCCTGATGCAGGGAGCCAGCCCACTCGCACTGGTAAAGCTGTTCTTGAAATCCAGGTTTGTACATGGATTCAGCTATTCAACTGTAATCTTACTGGCGAAGAATTATTCTCTCTATTTATATACTGCCTTGAGTTGATGTGTGCAAGTAGGGATGGTCGCGGGCTGCTCTTTGGGTACCCATGCACCCACTCTAGTTCAACCAAATGAACTAGATACTAAAATGCATTGATTTTGTTGAGCTAGAGTAACGCGTACCCACGGACTGATCCACGTCTATAGCTTGGTGCAGTTTTAGGATCAGATCCATCTATGAACCCTTGAAGTTGGGTTTCACAGATCAACGGCCGCAAGTCACTAGGCCAGTAGATCCATCACATACCAAAATGGGTGAGTCCAACTTTGAGTTCGGACCATGTCATCTTCCCTATCCAAAAAATGGTTAGAAAAACCTAGGTGCTAGAAGTTCTATGTATACTGTTTTGTTTATTAATAGATGCTTTCATTTATCTAATAGGGCATGATACGTTCATTTACTAATCCAGTTTGCTTGCCAGTATCTGAATGTTGAACTAATCTGTGAAACATTATTTTGGGTTGATGTACGTTTGTTGCGCTAATATGGTGACATTACCAAGCATCACAGGAAAAGCTACCTGAGGCACGGGTTGTTTATTGCTCGGCAACTGGTGCATCAGAACCACGGAATTTGGGCTATATGGTTCGGCTTGGACTTTGGGGCGATGGAACATCATTTCAGAATTTTGCGCAATTTTTAGGTCTACTTCTTTAACCTATTTGTACTTGAATCCTTCTTTTCTTTTATTATTTATTATTTGCATTTATTTTAACTTCGATACAAAAGAACAGCTTGGCTTTTCATGTTGGCATCAAGCATGCTGGTCAATACTGAACCCTAGTAATGGGCTATAAATTGTGGCTGTACTAGACTATTTTGTGGGGGATCACCAGAAACTTATGGTTGAGTCATACTAGTAGAGTTGTGAAGCACTGTATTTGGTTTCTGCTTCCCCAAGTAATTCAAACTGCATTATAAATTTACATGTATTGAGTGTGCCCCGTCTCCATTGCTGGGCTTCCAACACTTGTTTAGGGCAATTAGTAGTTATGGTTTTCGGGGTTGTATACTCCAGTTTTGATTTTTCTTGGGTGTTGTGTAGTTGGTAACTGAAGCATTGCATGTGACGTCATACTAAATGCTATCATTACTCACATTTTATGGAAAAAAAACATAGGATCTCTCGAGAAAGGTGGTGTGGGCGCTCTTGAACTTGTTGCCATGGACATGAAAGCCAGGTTAGCATTTTTTTTTCCAAGATCTTTAGTTCCATGGGCATGAAAGCGTCCATCTGCAATGGGTAACTGTTGCCACTAATATGTTTTGTCCAATGTTTTTTCTGTATATGGAAAACTGGCTAGTAGCCTTCGAAACCTTTTTTGGTTCAAGTATTGTCTCTTGCTTGTGTTTTTCCCCAGAATGATTTATTGAGTACCATCTCTATAAAATTTGTTGCAGGGGTATGTATGTTTGCCGCACACTAAGTTATAAGGGGGTTGATTTTGATATTGTGGAGGCTCCCCTTGAGGAAAGAATGATGGTAAAAAGTGACTTTCTGCTACTTTACTTTATTTCAAGATGCATTATTGCTTTGCTCTTTTGTGTCTTCTCTGTATCAGTGTTCTCTTTCATACTCTGATTGCTTATCAAGAAAAAACATTCTTTGAATTATTCCTATGCATTGATCATTGTTACAATATTAATATTAAACTTAAGCTAGTTGGTTTTTCCTATCGTATAGCTCATGGTAAAGTTTCCATCTTATTGGTAATGCAGAATATGTACAGAAAGGCAGCCGAATTTTGGGCTGAGTTCCGCCTTGAGCTCCTATCAGCAGGTGAATCATTTACAGAAGGCATTTCAAATCAAATATGGCGGCTATATTGGGCTAGCCATCAGGTGTTACCTCCTTACATATTCTGAAATAAATTTCTATCAAACCTTTTGTTTTTACTTTGCAATATTTGCATCCTTCTCAGTTCCATGAATGCATTTCTAGCATAAATATTACCCCTGATTTAGCATATTCAAAAGTTGACAAGTAAACTTCTAATATGAAATA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