Difference between revisions of "BGIOSGA015476"
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Revision as of 16:02, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015476 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015476, complete gene. |
| LocusTag |
OS04G0252400 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015476-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015476-PA |
| Length |
16962 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:7613705..7630666 |
| Sequence Coding Region |
7630530..7630666,7629680..7630026),complement(7627921..7627976,7627725..7627806),complement(7626544..7626622 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:7613705..7630666 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:7613705..7630666 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACGGGAGAGAGAGGGAGAAAGAGGGGTGGCGGTGAACGCCGGCGACGGGAGAGGCGGCCCTCCTCGTCGTCCTCATGGCCGCCGGCGACGGAAGAGGCGAGCGGCAGCGGCGGCGAGAGGGAGAGGCGCCTTCCAGAATCCTCTGCTCCGCCCGAATCGCCGCCGCTTCTTCCGAACCGGTGGCGCGGCCGCGGAGCCCTAACCCCTAACGCGTGCTGTGACATCTCCGGCTGTGACAAGGCAGTGGGGGCCTCCGGGGACCTCATTTTCCGCAAGTGGAATCCGCTGCTCCACCCGAATCGCCTCCGCGTCTTCCGAGTCGGTGGCGCGGCCGCGAGCCCTAAACCTACGGCGTGCTGCGACGTCACCGGCGGTCTCGAGGCAGTCGGGGTTCTCCGGGCGGCCATGTCGATGGACTCGGTCATCTCCTCGCGCAGCGGCGCCGACTACAGGAGCTTCCGCCAGATCACCCGGGATCGTTTATTATTTGAAATGTTGAGATCAACGAAGAAGAGCTCAAAATCGGCATGGAAGGTTCTTATCATGGACAAACTTACGGTGAAGATTATGTCATTTTCTTGCAAGATGGCAGATGTGATGGAAGAAGGTGTTTCATTGGTTGAGGACTTATACATGCGGAGGCAACCATTACCATTGATGGATGCAATTTATTTCATTCAACCAACTAAGGAAAACATTCGCATATTCATGTCCGACATGTCAGGGAAAATACCACTGTATAAGAAAGCCTATGTGTTTTTCAGTTCACCCGTACAAAGAGAGTTGGTGGCCCAAATAAAAAAAGATTCAAATGTTAGAGCACGCATAGGTGCACTCAGTGAGATGAATCTGGAATATTTTGCTATCGATAGCCAGGGCTTTACAACTGACCATGACAAGGCCCTAGAAGAGCTATTTAGTGAAAATGCAGAAGGTTCACTCAAGTATAACTCTTGCCTTAACATGATGCCCACTCGTATTGCTACAGTATTCGCATCAATGAGGGAATTTCCTCGTGTGCACTATCGTGTTGCCAGGACGATTGATGCTTCTACTTTGACAACACTACGAGATTTGGCACCCACAAAGCTTGCTGCTGGTGTGTGGAATTGCCTTGCAAGATTTAAGGCTATGATACCTGAATTCCCTCAGACTGAAACATGTGAATTACTTATCGTAGACCGATCAATAGATCAGATCGCACCAATTATTCACGAATGGACCTATGATGCCATGTGTCATGATCTACTCTGCATGGATGGCAACAAGTATGTACAACAGGTCCCAAGCAAGTCTGGTTCAGGCACTGAGAACAAGGAGGTTTTGTTGGAGGATCATGATCCAATATGGCTTGAGCTTCGGCATGTACATATAGCCAATGCTAGTGAAAGATTGCATGAGAAGATGACCAATTTTGTATCAAAAAACAAAGCTGCTCAACTACATCAAGCAAGAAATGGTGGAGATTTATCAACCAAAGAGTTGCAAAAAATGGTTCAAGCTCTTCCGCAGTACAGTGATCAAATTGACAAGCTTGCGCTTCATGTTGAGATTGCTGGAAAGCTCAATAGCACAATTAAAGAGCAACAATTGAAAGATGTTGGGCAGCTTGAGCAAGATCTTGTGTTTGGTGATGCTGGGACAAAAGAACTCATAAATTTCTTCAGGACACATTTGGATATCAGTCGTGAAAATAAGCTGCGTTTGCTTATGGTTTATGCTGCCATCAATCCAGATAAAACTCGAAGTGATAAGGGTGCAAAGTTGATGCAGCTCGCAGGATTATCTGCTGATGACATGATTGCAGTGAGTAATATGCGTTGCCTTTGTGGGCATGATTCTAAAAAGTCTTCGGCAGGTGGCTTTACTCTGAAATTTGATCTACGTAAGAAAAGGCATGGTATCAGAAAGGAGCGGATAGGAGAAGAATCAAAATGGATGTTGTCCCGGTTTTATCCCATCCTGGAGGAGTTGATTGAGAAACTTAGCAAGGGTGAGCTACCAAAAGATGAGTATCACTGTTTGAATGACCCTAGTCCTAGTTTCCGGGGAATTCCAAGTGCATCTACCCAAACAAGCCCAGCTCACCAGCCAGCTCAATCCATGAGATCTAGAAGGACAGGTGGCACATGGGCCAGGCCTCGAGACTCTGATGATGGGTATTCAAGTGACTCGGTACTGAAGCACACATCAAGTAATAGCAGAAAGTTGGGTCAGCGATTATTTGTTTTTGTTATTGGTGGTGCTACTCGATCTGAGTTATGTGCTGCTCACAAGCTATCATCAAAACTGAAGAGAGAAATTATCCTTGGCTCCTCTAGTCTTGATGATCCACCCCAGTTCATCACTAAATTAAAAATGTTATCAACCGATGATTTGACACTTGACGATCTACAGATATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATGERGRKRGGGERRRRERRPSSSSSWPPATEEASGSGGERERRLPESSAPPESPPLLPNRWRGRGALTPNACCDISGCDKAVGASGDLIFRKWNPLLHPNRLRVFRVGGAAASPKPTACCDVTGGLEAVGVLRAAMSMDSVISSRSGADYRSFRQITRDRLLFEMLRSTKKSSKSAWKVLIMDKLTVKIMSFSCKMADVMEEGVSLVEDLYMRRQPLPLMDAIYFIQPTKENIRIFMSDMSGKIPLYKKAYVFFSSPVQRELVAQIKKDSNVRARIGALSEMNLEYFAIDSQGFTTDHDKALEELFSENAEGSLKYNSCLNMMPTRIATVFASMREFPRVHYRVARTIDASTLTTLRDLAPTKLAAGVWNCLARFKAMIPEFPQTETCELLIVDRSIDQIAPIIHEWTYDAMCHDLLCMDGNKYVQQVPSKSGSGTENKEVLLEDHDPIWLELRHVHIANASERLHEKMTNFVSKNKAAQLHQARNGGDLSTKELQKMVQALPQYSDQIDKLALHVEIAGKLNSTIKEQQLKDVGQLEQDLVFGDAGTKELINFFRTHLDISRENKLRLLMVYAAINPDKTRSDKGAKLMQLAGLSADDMIAVSNMRCLCGHDSKKSSAGGFTLKFDLRKKRHGIRKERIGEESKWMLSRFYPILEELIEKLSKGELPKDEYHCLNDPSPSFRGIPSASTQTSPAHQPAQSMRSRRTGGTWARPRDSDDGYSSDSVLKHTSSNSRKLGQRLFVFVIGGATRSELCAAHKLSSKLKREIILGSSSLDDPPQFITKLKMLSTDDLTLDDLQI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..137#641..987#2691..2746#2861..2942#4045..4123#4451..4501#5048..5144#5241..5273#5431..5559#6483..6674#6812..6895#6984..7082#7155..7228#8705..8801#9017..9142#9222..9317#11021..11137#11232..11309#15565..15764#16517..16607#16744..16833#16909..16962#ATGGCGACGGGAGAGAGAGGGAGAAAGAGGGGTGGCGGTGAACGCCGGCGACGGGAGAGGCGGCCCTCCTCGTCGTCCTCATGGCCGCCGGCGACGGAAGAGGCGAGCGGCAGCGGCGGCGAGAGGGAGAGGCGCCTGTGCGCAGTGAAAAAAAAAGAGAGGGGGAGGCGAGAGAGAGATTAGGGGTAGGGTTGGAAAAATAAATATGGGGCTTTGTGTACTGGGATACCTATTGTGGGTTTGAGTGTCTCTGTTAGTTGCTTCAGATTTTAAGGAGCCCATCCAGAGATGTTCTCCATTGCGAGCTGAGTTTTCCTACGAGAAGAACGCTCTAGGAGTAGCTTGCATTGTGGATGCCCTAATAAAGGCCTTACGCATCCTGCTTTCTAGAAAGTGTAATACCAGCCACCTCCATTGACGCGTGGGCCCCAGGAGACTCCTCCTTTCTGGCCCCACCCGCCATAGACCCCTCCAAAACCCATCGGCCAAGTCCCAACGGCTCCATCGGCCGCCCGCCTCGCACGCTTCCTGTAATCCCGTTGGAGGAGGAAGCCAGTTACCACCTCCCGTCTCCCTCTCTCGCGGTGGTGGATTTCTTGCCGACGTTTCCGTCCCCCTCTCTCGCTCTCCCTCTCCGCAGTCCAGAATCCTCTGCTCCGCCCGAATCGCCGCCGCTTCTTCCGAACCGGTGGCGCGGCCGCGGAGCCCTAACCCCTAACGCGTGCTGTGACATCTCCGGCTGTGACAAGGCAGTGGGGGCCTCCGGGGACCTCATTTTCCGCAAGTGGAATCCGCTGCTCCACCCGAATCGCCTCCGCGTCTTCCGAGTCGGTGGCGCGGCCGCGAGCCCTAAACCTACGGCGTGCTGCGACGTCACCGGCGGTCTCGAGGCAGTCGGGGTTCTCCGGGCGGCCATGTCGATGGACTCGGTCATCTCCTCGCGCAGCGGCGCCGACTACAGGAGCTTCCGCCAGATCACCCGGGATCGTGAGTGCCTTCCTGCCCTGCCCCCACGCTTGCCTTCCATTGTCGTTCATCGGATAAAGCTGTATTTGATTTTGGGGGAGATGGACGGGAATGGGGATTGGTTGGCACCTGCTGTATAATGCCGATTTATATATCTTGAATGTGAGATTGAATGATTAACGGGGAGCACGAGGTACTTCATCTGTACTGGGATTTGTGTTGGGCCAATTTAGTTAACGGGGAGTTCATTTATCCAATTTAGATCACAAAGCTGTAGAAACAAGAACAACGTTCTGTTGAGCAATGCTAATAATACAGCCGACCTGCTGGCTATAAGGTTCTTTATAGCCTTCTCTCAGCCTACCTATACAATAGTTAGCTCTTCACAATTAATACAGTGCCCACTTGTCTCTCTCACGGAGTTTCTTGGTTCTTTTGTCCAAGCCGGCTGTAAGTTTACAGCCCGCTTCCCCTCTCTCTCCTCTCTTCTTTCCTCCAACTTAGCATTTAGCCAGCTTATAGCCTACTATTATACTTGCTAGCAGTTAGCTTCTTCTCTGGTTTATTTACCCTCTGAACTTCAATATAATATTGTTTAGTTTCAGCTCTGAACTATTAAAACTGGCACTAGTTTCATAGATTAATTTGTCCTTTCTGTATTAATTTTTCTGGTAACATGTTTTGAGTTAAAATTATAAAATCAGCGTGTTTTTTTTGGCACGCTTGTGTTATAGCACATGCAAATTGTTTCCATGTGTTACTAAGAAGTATAATTTTTGTAATTTTTTATAGAATTAGTTTAATTTCCTTTAGTTTTAAAAATCCTTAATTATCTTTTCTTGGGTATTATTTAGTGTTCATGTGTTGTGTATAGTTATAATTGGATCGTCTATCAAATGATAAAATAGGTGATGATATTTTTAAAGGTGTATTGGGTTTTGTTTATAAATTTATGCTCGATGAGTGGAATTCATGCCATAAAACCTATGCCCATGACGGAATAAAATCTATGATTGATAGGTACTATGGGATAACCAACTTGCATGTGGGCTTCGTTGATCTATGCTAGATATTTGCTCCTTTGTTCAAAATATTTTTAGAGCCTTCTGGTTTCTTCTAGATTAATTCCTAGTCATTCCTTCTGTGATTTATTTGGAAAGTAAGGGGCACCACATGGCCCAATCAAAACTGGCAGACACTGCTATCATGAGAATATTAGATCTGTATCATCGTGCATGTATCATTTTTTTTTCTTTTTACACATGGCATCCACATCATCTCGTTAGTAAAAATCTAACATAGTTTTCTTTTTGTGAATCATTATTGACATCAGTGCACGCATGACATAGGATGCTACATCACCCCAAACAACCTGCAACACCATCATATAATAGATATTTTTTCCTTTAAAAGATTCTCTTTGCATAGGATGGTCTCCAGCATTGAAACAATTTGACTTTTCTTGTTTTTTGTGCATGAAATAGCCTGAATTTCAAGCATAACAAAAAAACTCATTGTATGGAATGGCTATTGAGTTTGACTGGGTAATTAGAAATAACAAAAGCAAGGCACTTGAAAGTCATAGTGCAAGTGAACTGAGGAACATACATACAACATGCTACAGATTAAACATGTTCTTTACTGTGTTCTTTGGTTCTTGTTGACATCCCTGCCGTTTTACTATCTGACTGTTTTATTTGTTTATGATTGTGGCACCTATATAGGTTTATTATTTGAAATGTTGAGATCAACGAAGAAGAGCTCAAAATCGGCATGGAAGGTGTTCTTTGAGATATGGCGTTCAAGTTTTTTATATTGCCAGAAAATAATTTTATAGCACCTTGCAGCAAAAGGGGAGAATGTGATACGCATAAAATTGTTTTGTAACTCCTAGGTTCTTATCATGGACAAACTTACGGTGAAGATTATGTCATTTTCTTGCAAGATGGCAGATGTGATGGAAGAAGGTGTTTCATGTAAGTATGTTTTTTACCTTATTAAGAAGCCATCAGTGTTTTACTGTTTCGTTCCTTACGAAATATTTGATGTGTCCATACTCCATTTGTTCAGTTTCAGTGCATTTGAATTTATGCGGCAATATATGAAGTATGGCTAAGACCCTACAATAGTGGTACACGGTGAAGATTGTACTGCGAAGTTTGTCATACAGCCTAAATCATTTTAGCTTATCAGTCTAGGGACTCTTAAGTGGTCCTGGTGAAGCCACGTGAATATCTATTGGTAGTTTCTTGTCCCGAGATGTCATGAAAATAGCTTATGCCATCCTTAAATAAGCTTTATATTATGCTAGTTGCCTAGTTCTACAACTCTGATTTGAAAGCTCTGTAGCAATGTTTGTAACCCTTGGCACTAGCCAGATTTCTGTTGTAAGTTCAAGTTGGTCATAGCATTTATTTTTCAAAGCTCCTGGGGCCTTTGAATTCCTTAAAATGGAGGCCTTATAGTTTCGAATGTTCTGGTTAGTCTTTGAAAAGAAATGATAATATAGAAGTTTAAAATTGTCAATTACGTACAGAATTAGAGTAAGTTCACAAAACTATAGATACTTCTCCCAAATCATCAAAAACTACAGATTTAAAAAATTCTATCGGAGAACTACAGTTTGCCCTCATGTTATTATTGCATAACTACTTGTTTTAGGCTTCACCGTCACAGTTATCTGACAAATGGGTCCAACCTGCATTCCTGCAATCACACAAAGATTCAAGCACTGGTATTGGTTGTCACTTCGAATCCCAGGTCTGCTGGCATGGTGAGCTAATTTTCATGACCAGGTCACTGCTTGCCTTTGCAGTACCATTATGGGTTACCGTGCCAGATTGAGGGAAGGAATGAAAAGGGTAAAGCAAAGGCAAGCAGCGACTCTGGTCATGGAATTGGAGCCATGACATGGCACTGTATAAGGAATATTTAACTTTATGCCACTCCGGAGGGGCAAATATTTAAATTCCCCTGTATCGTTATGATAATTTATCTTTAGTTTTTTGAAATTTTCCTCGCAGAAATATTGTCTATCTATATACATTTGAGAATTTGCTTCTTTTTTTTTTTTTGCAGTGGTTGAGGACTTATACATGCGGAGGCAACCATTACCATTGATGGATGCAATTTATTTCATTCAACCAACTAAGGAAAAGTAAGTGTGACTAGTTACCACATCCTATTACCATTGTTACTGATTGATCACAGAAATAATTTACTGATTGATAGTAGGCACAAAACCGAATTTTTCCATTTGTTAGTGAATAATTATATATGATGTGTTAAATTTGTTTTTATCCTTTAATTTGTGCTGGAGCTTTCATTTAATTCCACTGAAAAACATATGTGGAAATATAGATAGACAATGGTTTCCTGCTGATATTGATAACTGCCAGTCATATATGTCAATGGTTTGCTGCTGATATTGAAAGTTGTATTGTCCATCAAACTCTCTAACCAATTTATTATGGTGTTGATGCAGCATTCGCATATTCATGTCCGACATGTCAGGGAAAATACCACTGTATAAGAAGTATGTGTCCTGTGCATTTACTTGTTTATGCATGTTGTATCACTTCCAAGTTTAGTTCATGGTTGTTAAGGCAGTAAGGCAACCTAAGGCGACCCTAGACTGCCTTAGCGGCAAGGCATAAGGCGAGGCGACGGCTTAGACACTAGTACACAACTGGATGTAAGTGTGGGAAGGAACAGATGGTGCCTGGGGAGGAAGAGCATAGAAGAGTACAACAGCAGGGGATGTAAGCGTTGG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