Difference between revisions of "BGIOSGA015509"
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Revision as of 16:02, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015509 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015509, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0027O01.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015509-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015509-PA |
| Length |
20377 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:6298445..6318821 |
| Sequence Coding Region |
6318007..6318821,6316962..6317077),complement(6315524..6315732,6312859..6312978),complement(6310910..6311038 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:6298445..6318821 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:6298445..6318821 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGGCGGGTGGGATTGTGGGTGGTGGTGCTCGTGGTCGCCGCGGCGGTGGCGGGGTTGGTTGGCGCGTCCCCCGCGTCGGGGCTGGTCCTCGCTGACGAGGGTGGCGGTGGAGGCGGAGCCGGAGGTCGCTCCTTCGATGGCGGAGCGGTGCGGGGGGAGTTCCCGTGCGGGAGCCACACGGCGAGGTCGAGGTCGTGCGAGGAGATGAACGGGTCGGGGTCGTTCGACACCACCTGCGTCATCGGCTCCAGCTCCTCGCTGGACGGCGACCTCTGCGTGTACGGCGACGGGAGCGTGGTGATTTCGCCCCATGTGAAGATCATCTGCCCCGTCGCCGGCTGCTACATCGCCATCAATGTCTCCGGGAGCATCACCATCGGCGAGCACGTGGATTTGATTGCGGGCTCCGTTAGTCTCTACGCGACAAACGTGTCGCTGGATCAACGCTCCACTGTCAACACCACCGGGCTTGCCGGAGAGCCCCCTCCGCAGACGAGTGGGACGCCTCATAGCCTTGAAGGTGCCGGAGGGGGGCACGGTGGGCGTGGCGCGTCGTGTAAGGTCTCCAATGACACCAACTGGGGAGGTGATGTGTATGCTTGGTCCACGTTGGCGTGGCCATGGAGTTACGGCAGCAAGGGTGGTAGCATGGCTGCTGATCATCAGTTTGGGGGAGATGGTGGAGGCCGTGTAATGCTCAGGGCAAGTGAGTTCATGAATGTCGACGGCGATGTACTTGCTGAAGGTGGTGTGGGCAGTCTCAAAGGAGGCGGCGGGTCTGGAGGAAGCATTATGATATATGCTTTCAAGCTATATGGAAATGGTACGATAAGTGCTGCTGGTGGTAATGGATGGGGTGGAGGTGGTGGTGGGAGGATATCTCTGGACTGTTACAGCATTCAGCAAGATCTGGAGATTACAGTTCATGGTGGACAAAGTTTTGGGTGCCCTCAGAATGCAGGTGCAGCAGGTACAATATATGAAAGTTCTTTGCAGACTCTAAAGGTCAGCAATGGGAACTACACCACACATACAGAAACTCCATTGCTGGGTTTCCCGATGACTAGACTTTGGTCCAATGTGCTTGTGGAGTGTAATGCTAAAGTCTTGGTCCCATTGCTGTGGTCCAGAGTACAGGTCACAGGCCAAATTAGACTACTTAGCAAGGGTAGCATCAGCTTTGGGTTGTCTGAAAATCCAATATCAGAATTTGAGCTGGTTGCAGAAGAGCTTTTAATGAGTGACTCAGTTATAAAGGTCTATGGTGCTTTCAGAATGTATGTGAAAGTGCTCTTGATGTGGGATTCTGAGATTCAGATAGATGGTGGGGGTAAGGATGTTGTTCTTGCATCTATGCTTGAGGCCAGAAACCTTGTTGTACTCAGGCATGGGTCAGTCATATCTTCAAATGCTGCTTTGGGAGTCTATGGGCAAGGACTTCTTAACTTGACTGGCCCTGGTGATGGAATAAAAGCACGCCGACTTTTTCTCTCTCTGTTTTACAACATTGAAGTTGGTCCTGGTTCATTTGTTCAGGCACCACTAGATGATGCTGTTCAAAGCAGCTTGGATGCCCTTTCACGCTGTGAAAGTAAAACTTGCCCCAGTGAGCTAATCACACCTCCTGATGATTGCCATGTTAACAACTCTCTATCATTCACACTACAAATTTGCCGTGTTGAAGACATAACTGTCAGTGGCATAGTCAGGGGGAGTATAATTCACATTCACCGAGCAAGAACTGTCACTGTTACAAATAATGGCACAATAAGTGCTTCAGAGTTAGGTTGCAAGGAAGGCATTGGGAAAGGGAAGTTTCTCAAATATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGGCATGGGGGCCGGGGTGGCATAGGGATTTACAATGGGATGAGAAGTGAAGGAGGTCCACAATATGGCAGTGCTGATCTTCCGTGTGAGCTAGGGAGTGGCAGTGGTTCCTCTGAGTCAACTGATAACACTGCTGGTGGGGGATTAATTGTTGTTGGATCCATGAAATGGCCACTATCAAAATTGCTAATTTATGGCTCCTTGAGCTCTGATGGTGAAAGCCATAGAGGCACTAAAAAAAATTCGAATGGGACATATAAAGGAGGGATTGGTGGTGGTTCTGGAGGGACAATCCTGTTATTTCTTCAAGGGCTTCTGCTAGAGAGAAACTCATCACTATCAGCTTCTGGTGGCAATGGAGGTTTAATTGGTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTAGAATCCATTTCCATTGGTCAAATATTGCTACTGGGGATGAGTATGTTCAGATTGCTTCTGTCAACGGCTTAGTAGCATCAAGTGGAGGATCTGGTAATGATGATGGACATTTTGGAGAAACTGGAACAGTAACAGGAAAAAAGTGTCCTGTTGGACTATATGGAACATTTTGCACCGAATGCCCAATTGGTACATACAAAAATGTTGTTGGGTCCGATTCATCTCTGTGTATGCCTTGTTCTCTGGATAGTCTTCCTAACCGCGCTGACTTCATATATGTAAGAGGTGGTGTTACCGAGCCGTCCTGCCCATATAAGTGCATATCTTCTAAGTACAAGATGCCAAACTGTTACACACCACTTGAGGAACTTATTTATACTTTTGGTGGTCCTTGGTCTTTTGCAATTATCCTATCTTTTACCATTATTCTTTTGGCACTTGTCTTAAGTGCTCTCAGAGTCAAGATTGGTGAGAGTGACATCACATACCGGTCAACAAATGCAATCCACAATGATGGCTGTGCTTCTTTCCCCTTTTTGCTTTCATTGGCTGAGGTACCTGGGGCTAGCAGGGCAGAAGAAACACAAAGCCATGCCCACAGAATGTACTTCATGGGACCTAACACCTTCCGGGAACCTTGGCACCTTCCTTACTCACCCCCTGATGCTATAATCGGAATCGTATATGAAGATGCTTTTAACCGTTTTATCGATGAGATCAATTTGGTGGCTGCATACGAGTGGTGGGAAGGATCTATACATAGTATACTTTCAGTACTTGCATATCCTTGTGCCTGGTCTTGGAAGCAATGGCGCAGAAGAAAGAAAATCCATCGTCTTCAAGAGTACGTTAAATCTGAATATGACCATTCATGTCTTCGCTCTTGCAGATCACGAGCACTCTATAAAGGCTTGAAGGTTGGTTCTACACCAGACTTGATGGTCGCGTACATTGATTTCTTTCTCGGGGGTGATGAGAAACGACTTGATGTTACATCCACAATCCAGAAGAGGTTTCCCATGTGCTTAATTTTTGGTGGTGATGGAAGCTATATGTCTCCATACTACCTACACAGTGATACATTGTTATCTAACCTTCTTGGCCAGTATGTGTCAACTGCGATCTGGAACAGATTGGTTGCGGGCTTGAATGCTCAGTTGAGGACAGTACGGCAAGGGAACATCCGATCAACTTTGGGACCTGTTGTTTCTTGGATTAATAGTCATGGAAATCCCCAACTTGAGCGGCATGGTGTTCGAGTGGAGTTAGGATGGTTCCAAGCCACTGCTTCTTGTTATTATCAGCTAGGTATTGTTGTTGCTGTCAATGAGCACTTCTATAAGAGTCTTCATCAGCATGATCATGTCTCAGAATTCATCGATCGCTCAAGGAAGAACATCAGTTCCAAGAAGCTAAATCAAGATCAGCCTTGCACAAGCTATGCTGTTTCTAGAAAGCGTTTGACAGGTGGAGTGAATGGTGGGATAATCAATGAGGGTACACTAAAATCACTGGAATGTAAAAGAGATTATCTTTTCCCTTTCTCATTGCTATTGCAAAATTGTAGGCCCATTGGTTATGCGTACTATTGGATATCTGTTGGAGCATTCCTTGCTGTACTTCTTATTCCTCCCCTTGCTTTGCTGTCTCCCTTTCTTGCTGGTCTCAATGCACTTTTCAGCCGAGGACCAAAGAGATCTTCCGTGACCCGTATTTTTGCACTTTGGAATACTACTTCTGTCATAAACATTATTGTAGCAATCATTTATGGAGCTTTGTACTCTGGGCTGTCTTCTTTATCAGTGTCTTCCGTTCCTCATGCACTAAACACTAAAAGCTTTAAGAGTAGGGAAGACAATGAATGGTGGATACTGCCTATTATCCTCTTTGTTGTCAAATCATTGCAAGCTGGATTCGTCAATTGGCATTTAGCAAATCTGGAGATACAAGATTATTCGCTCTTTAGCCCTGACCCTGATAGATTCTGGGCAATGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRRVGLWVVVLVVAAAVAGLVGASPASGLVLADEGGGGGGAGGRSFDGGAVRGEFPCGSHTARSRSCEEMNGSGSFDTTCVIGSSSSLDGDLCVYGDGSVVISPHVKIICPVAGCYIAINVSGSITIGEHVDLIAGSVSLYATNVSLDQRSTVNTTGLAGEPPPQTSGTPHSLEGAGGGHGGRGASCKVSNDTNWGGDVYAWSTLAWPWSYGSKGGSMAADHQFGGDGGGRVMLRASEFMNVDGDVLAEGGVGSLKGGGGSGGSIMIYAFKLYGNGTISAAGGNGWGGGGGGRISLDCYSIQQDLEITVHGGQSFGCPQNAGAAGTIYESSLQTLKVSNGNYTTHTETPLLGFPMTRLWSNVLVECNAKVLVPLLWSRVQVTGQIRLLSKGSISFGLSENPISEFELVAEELLMSDSVIKVYGAFRMYVKVLLMWDSEIQIDGGGKDVVLASMLEARNLVVLRHGSVISSNAALGVYGQGLLNLTGPGDGIKARRLFLSLFYNIEVGPGSFVQAPLDDAVQSSLDALSRCESKTCPSELITPPDDCHVNNSLSFTLQICRVEDITVSGIVRGSIIHIHRARTVTVTNNGTISASELGCKEGIGKGKFLKYGAGGGAGHGGRGGIGIYNGMRSEGGPQYGSADLPCELGSGSGSSESTDNTAGGGLIVVGSMKWPLSKLLIYGSLSSDGESHRGTKKNSNGTYKGGIGGGSGGTILLFLQGLLLERNSSLSASGGNGGLIGGGGGGGGRIHFHWSNIATGDEYVQIASVNGLVASSGGSGNDDGHFGETGTVTGKKCPVGLYGTFCTECPIGTYKNVVGSDSSLCMPCSLDSLPNRADFIYVRGGVTEPSCPYKCISSKYKMPNCYTPLEELIYTFGGPWSFAIILSFTIILLALVLSALRVKIGESDITYRSTNAIHNDGCASFPFLLSLAEVPGASRAEETQSHAHRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPDAIIGIVYEDAFNRFIDEINLVAAYEWWEGSIHSILSVLAYPCAWSWKQWRRRKKIHRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGLKVGSTPDLMVAYIDFFLGGDEKRLDVTSTIQKRFPMCLIFGGDGSYMSPYYLHSDTLLSNLLGQYVSTAIWNRLVAGLNAQLRTVRQGNIRSTLGPVVSWINSHGNPQLERHGVRVELGWFQATASCYYQLGIVVAVNEHFYKSLHQHDHVSEFIDRSRKNISSKKLNQDQPCTSYAVSRKRLTGGVNGGIINEGTLKSLECKRDYLFPFSLLLQNCRPIGYAYYWISVGAFLAVLLIPPLALLSPFLAGLNALFSRGPKRSSVTRIFALWNTTSVINIIVAIIYGALYSGLSSLSVSSVPHALNTKSFKSREDNEWWILPIILFVVKSLQAGFVNWHLANLEIQDYSLFSPDPDRFWAM</aaseq> |
| Gene Sequence |
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