Difference between revisions of "BGIOSGA015547"
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Revision as of 16:02, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015547 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015547, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_14948 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015547-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015547-PA |
| Length |
16124 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:5129450..5145573 |
| Sequence Coding Region |
5145521..5145573,5145348..5145387),complement(5145176..5145256,5144598..5144792),complement(5142169..5142279 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:5129450..5145573 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:5129450..5145573 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCAGATCCCCAATCTCGACAATGCTCCTCTCAATCTCGCGGCCCTCAGGGAGCAGTCGCAGAAGGACCTGCTAAACATCCTCAAGAGTATTAGGGGGAAGAAGTGTGTAGTTATTGATCCCAAGCTCGCGGGTACCCTGTCTCTGATTCTGCAGACCTCACTGCTAAAGGAATATGGTGCAGAGTTGCGGCTTCTCTCTGCTGAACCCCTCCAAACTGAGTGCGCTAAGATCCTATATCTCATACGCTCTGAGCTGAAGTTCATGAAATTAATTGCAAGCCAGATTAAGAACGATGAGCCTAAAGGGCTTCAGAGGGAATTCTTTCTTTACTTTGTGCCACGGCGCACAGTTGCCTGCGAAAAGATTCTGGAGGAGGAAAAAGTTCATCAGAAATTGACACTCGGAGAGTACCCCTTGTATCTAGTTCCATTGGATGAAGATGTGATTTGTTTTGAACTTGATCATTCTCTGCAGGAATGCCTTATTGAAGGGGATACTAGTTCTGTTTGGCATGTTGCAAAAGCTATCCATAAGTTAGAGTTTGCCTTTGGAGTGATTCCCAATGTTCGGGCCAAGGGTGTTGCATCCACCAAAGCCGCAGAGTTGCTGAATAGTATGCAACAGGAAGATCCTGTCAACATGGATGATATGGGGACTCCGGAGATAAACACTGTTATTTTGTTAGACAGAGAGGTGGATTTAGTGACACCGATGTGCTCTCAGTTGACATATGAAGGTTTATTAGATGAGATGTTGCAAATAAACAATGGATCTGTGGAGGTTGATGCCACTATTATGGGAGCCCAACAAGATGGTTTCTCTTTCTCCCATCTTTGGGAGGTATTCTGCCTCCCACTACTTGGAAGGTACCTCTTCAGAAAGGGAGGTGCTAAAACTGATCCCACAAGTGGGGGTAGTGATAAGTTGTACAAGGAAATTCGAGATCTCAATTTTGAAGTTGTAGTTCAGGTCTTGCGCCAAAAGGCAACATCTATTCAGCAAGATTACGCCGAAGTAAAATCCACCAATACTCAATCGGTTTCGGAGCTGAAGGACTTTGTGAAGAGGTTACATTCACTGCCAGAGATAGCTAGGCATGTTCATTTGGCACAACACTTGCAATCATTTACTGGAAAACCTTCCTTTCATGCCCGATTAGACATTGAACAAACAATATTGGAGGTGCAAAACTTTGAAATATGTTTTGAATACATTGAAGAGATGATACATAAGCAGGAGCCTATTGAAAATGTTCTTCGCCTTCTAGTGTTACTTTCACTTACAAATGCTGGGTTGCCAAAGAAGAATTTTGACTACTTGAGGCGGGAAATACTGCACAGTTATGGCTTTGAGCACATGCCCTTGTTATACAATCTGGAAAAGGCTGGCCTATTTAAGCGCCAGGAATCAAGAAGTAACTGGATTGGTATTACAAGGGCTCTACAGCTTATAGTTGATGTAAATGATACTGCAAACCCTAGTGATATATCATACATATTTTCTGGATACGCCCCTCTCAGTATTCGCCTTGTTCAGCATGCTGTGAGATCTGGATGGCGATCTATTGAAGAACTGTTGAAACTATTGCCAGGTCCTCATCTGGATTTGAAAAGAGGTAGTTCGGCCATTAATTCTTCATTGGATGTACACCAAGGTTTGGGGCTTCAACAGAGTATTGACAGATTATTTGCTCTCAGTGGTGATGAGGGATTTATGAGAGATCTGATACAAACTTATGAGAGCAAACCAGAAACAGGGGTTGGACATCGTTCTCTGGTTTTGGTTGTCTTTATTGGTGGGGTTACTTTTGCGGAGATTGCTGCTCTTCGATTCCTTAGTGCTCAGGAAGGGATGGGCTATGACTTCCTTGTTGCGACCACAAAGGTTGTCAATGGGAACACAATACTCAGGCCAATTATAACCAATAGCAAAGAGGTGATGATATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAQIPNLDNAPLNLAALREQSQKDLLNILKSIRGKKCVVIDPKLAGTLSLILQTSLLKEYGAELRLLSAEPLQTECAKILYLIRSELKFMKLIASQIKNDEPKGLQREFFLYFVPRRTVACEKILEEEKVHQKLTLGEYPLYLVPLDEDVICFELDHSLQECLIEGDTSSVWHVAKAIHKLEFAFGVIPNVRAKGVASTKAAELLNSMQQEDPVNMDDMGTPEINTVILLDREVDLVTPMCSQLTYEGLLDEMLQINNGSVEVDATIMGAQQDGFSFSHLWEVFCLPLLGRYLFRKGGAKTDPTSGGSDKLYKEIRDLNFEVVVQVLRQKATSIQQDYAEVKSTNTQSVSELKDFVKRLHSLPEIARHVHLAQHLQSFTGKPSFHARLDIEQTILEVQNFEICFEYIEEMIHKQEPIENVLRLLVLLSLTNAGLPKKNFDYLRREILHSYGFEHMPLLYNLEKAGLFKRQESRSNWIGITRALQLIVDVNDTANPSDISYIFSGYAPLSIRLVQHAVRSGWRSIEELLKLLPGPHLDLKRGSSAINSSLDVHQGLGLQQSIDRLFALSGDEGFMRDLIQTYESKPETGVGHRSLVLVVFIGGVTFAEIAALRFLSAQEGMGYDFLVATTKVVNGNTILRPIITNSKEVMI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..53#187..226#318..398#782..976#3295..3405#3575..3640#4600..4707#4784..4828#5041..5097#5759..5822#5916..6018#7639..7690#7854..7913#8526..8588#8660..8766#9336..9458#11561..11642#11748..11818#12844..12924#13831..13888#13966..14033#14691..14765#15329..15416#16023..16124#ATGGCTCAGATCCCCAATCTCGACAATGCTCCTCTCAATCTCGCGGCCCTCAGGTATCTCGTGATGATCCCCACTCATCTGCTTACCCTTGTGTTTGTTCCTGTGAATTTTAACCTGTATGTTTGATGTGCTTCGACTGTGAATTTCAACATGTATGTTTGATGTGCTTCGACTGATGGCATGCAGGGAGCAGTCGCAGAAGGACCTGCTAAACATCCTCAAGAGTGTGCGTTTCTCAACATCCCATTTTCTATTTTTCATACTCGTGTTATTGACGGTGGAAACTGAAAAGTTTGTATTCTTTTCCTGTGTATCAGATTAGGGGGAAGAAGTGTGTAGTTATTGATCCCAAGCTCGCGGGTACCCTGTCTCTGATTCTGCAGACCTCACTGCTAAAGGTGCGATGAGCTGATCATACAGTATGGAAATGTTAACAGTCAATTGTTTTCATCTTAAATGACTTAGCAGCTTCTGTGAAATTTAGCATTGTATCAATAGTATGCTTACATTGCATTTCATGTATGGACAATTAAGCTACTCTCACAGTTAACATATATGGTCTACTAAAGGTGCGATGAGCTGATCATACAGTATGTATATGTTAACAGTCAACTGTTTTCATCTTAAATAATAACTTAGTAGCTTCTGTAAAATTTAGCATTGTATCAATAGTATGCTTACACTGCATTTCATGTATGGACAATTAAGCGACTGTTGCAGTTAACATATATAGATTTTTGGACATGCACACAGCTCATGCATGGTTTTTTGTGCTTGTCAGGAATATGGTGCAGAGTTGCGGCTTCTCTCTGCTGAACCCCTCCAAACTGAGTGCGCTAAGATCCTATATCTCATACGCTCTGAGCTGAAGTTCATGAAATTAATTGCAAGCCAGATTAAGAACGATGAGCCTAAAGGGCTTCAGAGGGAATTCTTTCTTTACTTTGTGCCACGGCGCACAGTTGCCTGCGAAAAGGTGACTATTGTTTTCGTACTTTGCTGGTTCTATTGTTCTACTGTGGCTTAGGATTCAATTATGTTAGAATAATTTGCTAGCCTCAGACACAATTCAATTATTCTTAGTCTGATTGTAGTAAGAATGACAACTTATGCAATCATCGCTCCCAACATGGATACATGTAAATTTGTGTAGTATAATGTATTGTTACTTATATGTTACTGAGATACCATATAGAAAGAAAGTCCACCTTACAGGCCTTAAATCAGGATAATTAAGATTGAATGAGTCGTATAGGCCATACCGCATAATGTATGCTTAGATAGTGACCTATTTTGGAAGATAAAGAAGGCTTGCAATATAACCATTGTTATTTGTTCATCCGATTAATCGCGATTAATTGTCCTGATCGCTCCCCTACCTCCGATCAGGCACAGGTAAGTCGATCAGCCGATCAGAGAGCTGATCGTCCGATTAATCGATGATTAGTCGCAATTAATCGTCCGATCAGGGTGGAAAACGATCAGTTTTCGTTCATGGGCTGCCTCCCTGAGAAAATATAATTTTGGGCCTGCCAGCCCAGCCCATGTTCCATTTTGGGCAGATGATGGGCAGCAAATGATGCTTCTTCTTTGACCAGATGATGCTTGCTTTTTACCATATACTACAGATTATATATTATTGAGTACATACTACCTCCGTCCCAGAATATAGCAACCTAGGATGGGTCCACATACATTGTCCTAGGATGGGTCTCATCCCATCCTAGGTTGCTATATTCATGACATACATTGTCCTAGGATGGGTCTCATCCCATCCTAGGTTGCTATATTCTGGGACGGAGAGAGTAATATATAGCATATATGGCCAGCTGGACACTCCTGCTATATACTAATCGACCACCCTCGATTAATCGTCCTGATCATCCTGATCGGTGCCTAGGAGATCAGGGCTGATCGCCTGATCAGAGAACATTGAATGCAACTATTTAAGATCCTTTCATCCCAATGATGCTTTCCAATTTTAGTACAATTATCTTATAGTCCATGGACCATCTTTGTAAATGCCTTCGTTTATATGCTTATTTACATGTAAATACAATTTTGCCCAAAACTGGCATGTGTTGTAGTTAGTGTAGGTTGAATCATGTCTCAGATAATTCATAGTCTACTAATATGTTCTTCATATCGTGAACAACCCTTTCTAGGATATGTCACCTTCCAGTAATTCCTGTCACTCACCTCCCAAAAAAGGAAAACAGAAAGAAAAGCCCTTTTCAGTAATTCAACTTGGGAAGCATGAGCCATATGCACAGTATTTATAAAAGCCCTTTTCAGGAATTCAGTCTTCTTTTATTAGTATTTCCTGGGACTTAACGCCACATATCAGATATTGGTATTAATAAAGAAAAATATGTGACAAGACAATTGAGGATCCAAGAATGCTTTTACTAGTTTTTGCCTAATCTACAAAATATATGTAGTTAAAGTGCGAATAGCCAAATACTCTAGAAATGTTTTATTATTGCTTCAATTATATTGTCATAAAATTTCTGATTTGATTGATGGGTACAAAACTCCCTACAAAAATGATCATATGTATTAGTTTTTGAATGGAATGCGGTAAAATCAGCTCACCTGAGATCCACCAGTACACAGAGTAGATTAATCTACTGGCAAACAGGCCATACGCAATGTTCATGCTCATGTGCCAAAATTAGCGAAGCTGTTTTCCTTATTCTGACAGTTGGAGGAATGAATTAGGGATCAATATCAGCTGCCGTGTCGTGCCGTTATGGAGAACTTAATTGTTTTGTTATCAGTAGAGCGACTAGAGCCTGATTGTAGTGTGTTTTTCTTGCTGACCTATCTTGATGCTTGGTTCTTCTATACAGGCTTAGCTATTGCAACAGTACTTTATGAGTAATCACATCCTCTTTGAACCCTTGAATTATAGCTGTAAGACTTCGTCAAATCCCCTTCATAAATTCCTATTTGTATGTTACTTAGTGGTCCACATTTTGCTACTGATCATAAAAATATACAAAATAAAAAAAAAATAATTACCTCAAACTTTATGTACGTGACAACATGAGAAAATTAGCCACCTACAGATGTGCATTTGCAAGGAATAAAATTCTTTTTTTTTTAAAAAAGCCATCAAAAGACACCTATGTATGTATATGCAACCACAGATCATCCTTTGGAGTGAGATTTGTTGTACCTGAATTCCTCCTTTTACGACTAAACATAAAGATGAATGTCAGTGAGGCATCTCCAAAGTTGAACTATGACAAGAAGAAGAATTGTGATCTGTATTTTATTCTGCACCTGCAGATTCTGGAGGAGGAAAAAGTTCATCAGAAATTGACACTCGGAGAGTACCCCTTGTATCTAGTTCCATTGGATGAAGATGTGATTTGTTTTGAACTTGATCATTCTCTGCAGGTACTAATCCATACTAGTGCATATTCCCTCCGTCCCAAAATATAAGCATTTTTTGCTATGAATCTAGAGAACTATGTGTCCAGATTCATAGCTAAAAGTTGTTATATTTTGGGACGGAGGTAGTATATTCATAATATTGATATAAATCTTACTGGAGCATGATTTTCAGGAATGCCTTATTGAAGGGGATACTAGTTCTGTTTGGCATGTTGCAAAAGCTATCCATAAGTTAGAGGTATGTGTCTTCCTTTCATGTATTTTGGCATTTACCTTTTCCATTCTTTTTACTTGTTTTTACTAAGGTTGTAATGGTACTCTCGCAACAAGTCGTAGCAAGTCTGGGTGCCAGGCCTCCAAGGCACCTATGCAAGATTATATGTATGCAATACATGTTTGTACAGGAGTGACCACTTAAGCTGCACAATGTCCACCTGCGCTACCTCCCTCCTTCACGATTTCTTAACTTATCCCTTCCCAGTTCTAACCTCCCTACTAGGATGCTCTTATTTCTCAGTAAACATAAGATTCTCAGTTTTCACTCCTGTTCTGCATTTCACATCTTCCTCCTCACATCACTGATCCTAAACTCGCACTAGAAGCAAAGAGGTAAGAAATAAACAGGAATCTGGTGAAGCTGGTGATGGTGAAAAGCTTGTCAGACACTGGAGGGCTGTACACTTTTCTAATCCTGGTCATCTCGGCATTGATCTCTGTTTTCTGCCTCTGGCTGATGCGCTGTCCTAGAGTTGACTAGGCGACCCCTCGTGCTGTCGTAACAACTAGTGTTTGACCATCACCATCACCTTTTCTAGTAACATAATCATATCAAATTTCCCATCAAAAAGCATAATCATATCAAAGTATTATAATGAAAAATCTAGCTGTACCGTTTTCATGTGAATACCTAACTTTCTTGTGGTAAAAGATTCACATAATTTGTGGCCCATACTCTAGGATGACAAATGCAAAAGACCAGAGGGTGTACTACAAAAGTTCAATTATATTTGTTTATAGCAGAAGCATTCTATGGACAGACTAAATTTTTATCATCTATACCATACTGTAGTTTAAAGAGTACTTTTCAGTGCTACAAATCTGCAACCTTATCATCTTTTAATTCCGTCACACGTAAATATCTATACACTATAGAAATATTATAGTACTGCACTTATGCAAATTCCTTTCTTTCCCCAGTTTGCCTTTGGAGTGATTCCCAATGTTCGGGCCAAGGGTGTTGCATCCACCAAAGCCGCAGAGTTGCTGAATAGTATGCAACAGGAAGATCCTGTCAACATGGATGATGTAATGCCGA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