Difference between revisions of "BGIOSGA016052"
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Revision as of 16:05, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016052 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016052, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_15188 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016052-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016052-PA |
| Length |
17262 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:9691996..9709257 |
| Sequence Coding Region |
9691996..9692142,9692231..9692346,9692435..9692570,9693374..9693472,9693561..9693629 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:9691996..9709257 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:9691996..9709257 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGCCGACCTCGTGCAGCGCTGCCTCGAGGCCGGCGGCCGCGACCTCCTCCTCCACCACCCCTCCTCCCCTCCCTCCCCCACCTCCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCTCCTCCATCCTCCAGTCCCTCCCCCTCCACGTGTCCTTCGACCGCGGCTTCTACCTCCTCGTCAAGGCGATCCAGGAGCTGCGTGAGCGCAAGGACGGCCTCGTCGTCACCGTCGGCATCGGCGGGCCAACCGGCTCCGGCAAGACCAGCCTGGCGGAGAAGGTGGCGTCGGTGCTGGGGTGCGTCGTGATCGTCTCCATGGAGGACTACCGCACGGTGGCCGGGGCCGACGACGGCAGCGACGTTGACGCCATCGACTTCGACGCCCTCGCTTGTAACCTCCAGGATCTTGTAAAGGGTAAAGATACATTGATGCCATTGGTTGATTTTCAAGAGAAGAAACGTACAGGATGGAGGCAACTGAAGATTTCGCCATCTGGAGTGGTGATTGTTGATGGTGCTTATGCTCTTCATTCAACACTGAGGTCACTGCTTGATATTCGTGTTGCTGTGGTTGGTGGTGTTCATTTTAGCCTTCTGTCTAAAGTCCAGCATGATATTGGAGATTCTTGCTCGTTGGACTATCTGATTGATAGCATATTTCCCTTGTTTAGAAAGCATATTGAGCCAGACTTGCATCATGCTCAAATTAGAATCGACAACAGCTTTGTCTGCTCATTCCGAGAACCATACTACAAGCTTAAATGCAAAAACGAGTTACCAGATGGACATAATTTGTATTTTTTTAATCAAAATGAAGGAGAAACTGAGAACTTTATTGAGATGTACCTTAGGCCACCTTTTGCTTCCGAGGAAATAAAAATTGATGATTGGATTAAAGTTAGGCAATGTGGAATAAGATATTACTTGTCTCTTGGGGATCAGAGGATTGTGGACAAATACTTTATTATCCGTCCAAAAGCTGAGTTTGAGGTTGGACGTACAACTCTGGGAGGATTGTTGGCCTTAGGATATAGTGTTGTTGTTAGCTTCAAACGTACATGCACATCTGTCAGCAGAGATCAGTTGTTAATTGCAGCAGAGACTATTGACACCCTAAATGAAACATTTCTGGTGCTAAAAGGTCCAAGTAGGAAGATTGTTGCAGCAGAAGCTAGAAAGCTCGGTATAAAGGGGCCATGGATTACGAAGTCATACCTTGAAATGATCCTAGAGAGCAAAGGGGTCCCACGACTTAATACGCCACCACCAATCTCAAGGAAATTACTGACTGAAAGTCAAGAAAAAAAAATTGTTGCACCAAAGCCAATTCGTGTTTCGACCGAAAATGTTGCAAATTTTGATGACTTTGCACAACCATGGACGAGGTCTCCACCCAAAAAGTTTGACCAGGAGCCTGTTATGGGAAAATGGCAGTTCAATCAAGATTCTTCGTCAGGAAGTAACATCCAGTTAGCTCCACTGCCAGACTCCTATGACTTAGATAGGGGTCTTCTCCTATCAGTTCAAGCAATTCAGGCATTGTTGGAGAACAAAGGATTTCCTGTCATTGTTGGGATTGGTGGCCCTAGTGGATCAGGCAAGACAAGTTTAGCTCAGAAGATGGCCAATATAATTGGTTGTGAAGTTATAAGCTTGGAGAGTTATTATAAGCCTGAACAAGTGAGGGATTATAAATATGATGAGTATAGCTCATTGGATATAGGTTTGCTTACTAAGAACATTATGGAGATCAGAAAGAATCACAAAGCAGAAGTTCCTTGCTTTGACTTTGAGAAGTGCAAAAGAAAGAAATTCGAGGAGCTTCATGTCTCTGAGGAATGTGGAGTGCCTTCCTCAATCACTTTTGACCTCACTAGGGATCACCATGACTCCATGAGAATGTACACAATCAAGGTAATCTTCGAAGGTGTCTATGCTTTGCATCCTGCTATAAGGAAATCACTGGATTTATGGATTGCAGTTGTTGGTGGAGTACATTCTCATCTTATTGCAAGAATACAGAGAGACAAGAATCGTGCAGGCTTTTCTATTTCTCAGAGTGAAATTATGACTACCGTGTTTCCGCTATTTCAGCAATACATAGAACCACATCTTATCGATGCTCATCTTAAGATTCAAAATGACTTTGACCCTGTGCTCTCTCCTGAAAGCTCACTTTTCGTACTAAAAAGTAAAAAACAGGTATCTTATCAAGACATATTGAAAGTACTCGATGCTAGTAAAGCCTGCAGCTGTGTCCAGAATTTTACTGATGTGTATCTAAGACTTCCTGGCATACCGTTGAGTGGACAGCTGACAGAAGGCGAATGTATTAGGGTCCGAATATGTGAAGGAAGATTTGCACTGTTAATACGAGAGCCTATAAGGGAAGGAAATTTTATTATCCAGCCAAAGGTTGATTTTGACATTAGTGCCAGCACTGTCGCAGGACTTCTTAAGCTTGGTTACCGAGCTGTGGCATATATTGAAGCTTCTGCAACGATTTACCAAGATGGAAAGGTGCATTTCCTTGAACTGTGGGTAGTGTCCCCTCCTCCGATTCTTATAGAGGTTGATAGTCTACAAGGTGAGACAAATCCGTATCTTCAGATTAAAGGAACGAACAAGGAAATAGTTTCCTCTGCTGCATCTGCACTCAGCTTAGATGATTCATACACGACAAAGAGCTATCTTCAAATTATTCTGGAGAGTTTGCCAGCGGATGAAAATGTTCATACTGGTATTCATAACCAACAAGCTGCTAGGCTACAAGAACTTGTTGAGTTTATCCAGTCACAAGGAGGTAGCTTCAATTCAGATTTATCTTCACCTACAAGAGAAGTTTCTTCTACAGATAGTTTTATGGACTATATTACTGTCTGCTCTTGTTGGATACTCACTCTTCCAGAAAAAGACGACGCTAAGGCGCTGACAATTCATACATTTGACCCCAACTTGACCTCACTAGTGCTGCTTTCAGCACTAATCCTAATAAGGACTTTTCGCTCTTTGATGCGATGTGATGAGAAGAATCCTCTTGAGTTAGCAGGTGGACTGACTTGTTCAATCATGCATACTACAGTTGAATGTTTGCTACAAAGTCTATTCTTGGGAGGGTACCGGTTTCTACTGAGCTTTGATTTGTTGAGTCCCATGCCACAGTTTTCAGAATGGACTTGTATCGATACGAGTACCACATGGTTAATTGGCGATGGAAAAACGGATGGGATATGTTGCGTCCGTAGGAACCAGATCCTCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDADLVQRCLEAGGRDLLLHHPSSPPSPTSASASAAAASSILQSLPLHVSFDRGFYLLVKAIQELRERKDGLVVTVGIGGPTGSGKTSLAEKVASVLGCVVIVSMEDYRTVAGADDGSDVDAIDFDALACNLQDLVKGKDTLMPLVDFQEKKRTGWRQLKISPSGVVIVDGAYALHSTLRSLLDIRVAVVGGVHFSLLSKVQHDIGDSCSLDYLIDSIFPLFRKHIEPDLHHAQIRIDNSFVCSFREPYYKLKCKNELPDGHNLYFFNQNEGETENFIEMYLRPPFASEEIKIDDWIKVRQCGIRYYLSLGDQRIVDKYFIIRPKAEFEVGRTTLGGLLALGYSVVVSFKRTCTSVSRDQLLIAAETIDTLNETFLVLKGPSRKIVAAEARKLGIKGPWITKSYLEMILESKGVPRLNTPPPISRKLLTESQEKKIVAPKPIRVSTENVANFDDFAQPWTRSPPKKFDQEPVMGKWQFNQDSSSGSNIQLAPLPDSYDLDRGLLLSVQAIQALLENKGFPVIVGIGGPSGSGKTSLAQKMANIIGCEVISLESYYKPEQVRDYKYDEYSSLDIGLLTKNIMEIRKNHKAEVPCFDFEKCKRKKFEELHVSEECGVPSSITFDLTRDHHDSMRMYTIKVIFEGVYALHPAIRKSLDLWIAVVGGVHSHLIARIQRDKNRAGFSISQSEIMTTVFPLFQQYIEPHLIDAHLKIQNDFDPVLSPESSLFVLKSKKQVSYQDILKVLDASKACSCVQNFTDVYLRLPGIPLSGQLTEGECIRVRICEGRFALLIREPIREGNFIIQPKVDFDISASTVAGLLKLGYRAVAYIEASATIYQDGKVHFLELWVVSPPPILIEVDSLQGETNPYLQIKGTNKEIVSSAASALSLDDSYTTKSYLQIILESLPADENVHTGIHNQQAARLQELVEFIQSQGGSFNSDLSSPTREVSSTDSFMDYITVCSCWILTLPEKDDAKALTIHTFDPNLTSLVLLSALILIRTFRSLMRCDEKNPLELAGGLTCSIMHTTVECLLQSLFLGGYRFLLSFDLLSPMPQFSEWTCIDTSTTWLIGDGKTDGICCVRRNQIL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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