Os07g0636200
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0636200 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001066928.1 GI:115473588 GeneID:4344031 |
| Length |
12318 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0636200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:27077127..27089444 |
| Sequence Coding Region |
27077134..27077514,27079158..27079212,27079290..27079381,27079469..27079524,27079763..27079838 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:27077127..27089444 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008400:27077127..27089444 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatccgttgggtacaaggaagaagaggatactactctccaagtagcgaaaatccacaaattccctctccggctcgcgcgcgcgctctcaattttttgggggaagagaagatctccccttggagggaaccccgcccaagaatggcgggtctcggcggcggatggggcggcgggtacgacgacgacgacgactgggggctgagcgcggagcagctcgaccagctcgagcgggacgcctaccgcaagctcgccgagcgcaaggcctcctcctccgccgcctccaccgccacctcgccgctcccctccgcggcctactcgccggtcaagaacagccaccaccacccggcatccagggtttcccaggagtcttgcttcggcaaggtagaatcactttctccttctcggcttagtcaaccaaatgcatcgggaaatgcagttaataatagtcagggcaatatgtctaaggtatcagtacatcttttccttcattctactggtgtgatcgcagcgaagttccagtaccaccagaaacttgtggatgcagttcacaagatccccaaagccagctggaacgggaaggagagggtatggatgttcccacactcatcattatcagtagcagaggaagttcttagtacagtacctggaatagctgttgaggtccaaaaactggatccgctggttaagcgcgcactaactgcttctttatatgccggagatcttcgagatttgtatggcaagattccaactgatgttgagtcaaagcttatgccgtttcagcgtgaaggtgtcaggtttgctttacagcatggtgccaggaccctgatagcagatgaaatgggtcttggcaagacattacaggcaattgctgttgcttcttgccttcatgatgcctggccagttcttgtaatctctccatcatccttgcgattacattgggcttctatgattcagcattggcttaacatccccacggaagatatcttggtggtgctaccacaaactggaggatcaaataaagcaggatacagattggtatattcaaatactaaaggggattttaatctggatggggtgttcaatgtgatatcttatgatgttgttcccaagataaaggacatgcttctggacttggattttaagattgttatagctgatgaatcacactttctgaagaatgcccaagcaaagagaacaatgcattcacttcctgttctgcagaaagctaaatatgtggttttgctaagtggcacccctgcgttatctcgccctatcgagctgtttactcagctccaggcattgtatccaactgtatacaagaatgttaatgagtatggtaatagatattgcaaaggtggcttttttgggctttatcaaggtgctagcaatcatgaggagcttcataatttgatgaaagcaactgtcatgatccgcaggttgaagaaagatgtcctttcacagttgcctgttaaacgcagacaacaggcctttctggatttaagtgagaaagagatgagacatattcgtgctctatttcatgagttggagactgtgaagatcaaaatccagtcctgtgactcccaggagacgatggactctctcaaatttgctcaaaagaatcttattaacaagatctacaatgattcagctgaagccaaaattccagcagtgctagattacctgggtactataattgaggccgagtgcaaatttttaatatttgcacatcatcaatccatgcttgaagctattcaccaacatctcttgaaaaagaaagttaagtgcataagaattgatggtcaaacacctgtacctgtaagacagactctagtcacagatttccagaataaggatgacatcaaggcagcagtgttatccataaaagctggaggtgttgggttaactttgacagcagcaagtacagtaatctttgctgagttatcatggactccaggtgaccttattcaagccgaagaccgtgcccatcgtattggtcaggtttcttcggtgaacatatattaccttcttgcaaatgacactgtggatgacattatatgggacgttgttcaaggcaaacttgagaatttgggacagatgctggatgggcaggagaaaacgctggatgtgtcccagagcgacactaggcccagcccttccaagcagaagacgctcgacgcctacctcaagcgatgcagcaattccacagaagctgatcagcccaagctcaagaaccctaggttctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIRWVQGRRGYYSPSSENPQIPSPARARALNFLGEEKISPWREP RPRMAGLGGGWGGGYDDDDDWGLSAEQLDQLERDAYRKLAERKASSSAASTATSPLPS AAYSPVKNSHHHPASRVSQESCFGKVESLSPSRLSQPNASGNAVNNSQGNMSKVSVHL FLHSTGVIAAKFQYHQKLVDAVHKIPKASWNGKERVWMFPHSSLSVAEEVLSTVPGIA VEVQKLDPLVKRALTASLYAGDLRDLYGKIPTDVESKLMPFQREGVRFALQHGARTLI ADEMGLGKTLQAIAVASCLHDAWPVLVISPSSLRLHWASMIQHWLNIPTEDILVVLPQ TGGSNKAGYRLVYSNTKGDFNLDGVFNVISYDVVPKIKDMLLDLDFKIVIADESHFLK NAQAKRTMHSLPVLQKAKYVVLLSGTPALSRPIELFTQLQALYPTVYKNVNEYGNRYC KGGFFGLYQGASNHEELHNLMKATVMIRRLKKDVLSQLPVKRRQQAFLDLSEKEMRHI RALFHELETVKIKIQSCDSQETMDSLKFAQKNLINKIYNDSAEAKIPAVLDYLGTIIE AECKFLIFAHHQSMLEAIHQHLLKKKVKCIRIDGQTPVPVRQTLVTDFQNKDDIKAAV LSIKAGGVGLTLTAASTVIFAELSWTPGDLIQAEDRAHRIGQVSSVNIYYLLANDTVD DIIWDVVQGKLENLGQMLDGQEKTLDVSQSDTRPSPSKQKTLDAYLKRCSNSTEADQP KLKNPRF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8..388#2032..2086#2164..2255#2343..2398#2637..2712#3401..3467#3808..3874#4887..4953#5370..5453#5546..5587#6360..6515#7252..7329#7934..8002#8087..8152#8234..8362#8975..9031#9473..9562#9917..9982#10379..10447#10514..10618#10985..11110#11298..11356#11443..11479#11981..12130#gaatcccatgatccgttgggtacaaggaagaagaggatactactctccaagtagcgaaaatccacaaattccctctccggctcgcgcgcgcgctctcaattttttgggggaagagaagatctccccttggagggaaccccgcccaagaatggcgggtctcggcggcggatggggcggcgggtacgacgacgacgacgactgggggctgagcgcggagcagctcgaccagctcgagcgggacgcctaccgcaagctcgccgagcgcaaggcctcctcctccgccgcctccaccgccacctcgccgctcccctccgcggcctactcgccggtcaagaacagccaccaccacccggcatccagggtttcccaggagtcttgcttcggcaaggttagggtctcatctcctctctctcttcttattcttttcttttctttcttttttttccttcttttgttaaaaaaaaaacttgggtcagtgagggttgcatcttcttgcgaattggcatattttcatcttaatacatttcgtgaaaaatgtgtagtgttcgttctggcaatttccttatatttcttttacctaattcgtcatagtgaattttcgttcaaacaaatggatggggctcttgtccaagaatttagccagtgaataaaattcttattgacaaccatagccagtgtgaattgcagtacgaccttagctcagagtttgtataccgtggtaattttacgaattttcttgtgctctgcagttgagttctttgcgttaccggctatctgtttcaactttcaagaatagtttttttctctgcgttgctgtttcattgagttctttatatgtcctgcattgcagtatgaaaaccaaaagccaaaacttttttgcacctgacaaacccaaaaaaaaatttggtggtttctggcagaagaattaatcatggattttgtgccaagataataagtgatggggcctgttctgtttcctagcgatctgttaaacttagtgggccgtgtgttaaattgcagctgcacaatattagcaccatcaggggtttcttgttaactcatgagaatacgaccaggcagagcgtgtattttagtatttactgttacaagaccatgatcctggccattttctaaggctgtgttcgtttggacgttttcccagcgcgctacagtaacacggaaaacggaacggttcattaacacgtgattaattaagtattagctaatttttttttcaaaaatggattaatttgatttttaagcaacttttgtatagaaactttttgcaaaaaagtacaccgtgtagtagtttgaaaagcgtgcgcgggggcaaaacactgtagcgcgctgggaaaacgtccaaacgaacacagccttcattgcagtattaattttgaaaaatttaaggcatttgattccatcatcatcatttgatgtacttgaaaactatctagcatttgatgtattacgggtgtgtggccactttaaagtttgggatcatatggttgacagggcttgctttggtgatctctagctaaattcactggctatggctgtcaataagaattattctcttactcactgtgttgtgtggattttttattcattcttgagtagtgttgtttagcgcaacttcaatatgtttatgcctttccaaagagttgatttttacttacccatgtactcatagattggtaaacacagactctaaaagaggcacccaatttatccggagtaaggacagcagttgagaagggttttcatatctccaaattggcttaatctttcagttttaaaccaactgcccttctaattattctaatgtaattgtgcaaatctccagcacttgaaatcggtacgaatatatgataccatagtgcaagagcatccctgtatatgtctgtgttattcactttattttatttaccatcatttattatagagtttgcataattgtttgacaaaactgatatttactcatctctttttatatcactaactgccattatgctaatgaataatatttcttaggtagaatcactttctccttctcggcttagtcaaccaaatgcatcgggaaatgcaggtataagacattcttggtgctttatttttattctaattggacatgtggcttatctccttttttgtttgtcatttaagttaataatagtcagggcaatatgtctaaggtatcagtacatcttttccttcattctactggtgtgatcgcagcgaagttccagtaccaccaggtacaattctccccaatgaaatctttaatcagttgttactgtattatattgtgatccatatatttgactcctctgttcctttcccagaaacttgtggatgcagttcacaagatccccaaagccagctggaacgggaaggagaggttttcattaatcttctacctgacaaatttacaagatttttctatggcctatcaaagctcaacttgtagtgcttttatgctctcaaaaaaaaatgcaactctgtaaacacatcgggagcctgatatgcaactaataatactgttttaggagcataggatcatttatcaagcttgatacctcctgtaaaaattgcagcttattcctgattctattttacctttttcttgaaaactatagggtatggatgttcccacactcatcattatcagtagcagaggaagttcttagtacagtacctggaatagctgttgaggtaacagttattttgtacttcataaaaccgacttactgtttgttgtaatgacctctcacctcctgttgttttgattaatttattttacttcctcctgttttagttggttgacctgggctgcttctagttagcttagcattattagtaggattgttttttagttttctattttgaaaattttcaaatattagaaattcttatatgactgttaacaaatcctctgtaatgcttaaacaattcagaacatagatgatgaagttggacagtgacttttatgacttttctgttcattgcgtacatggctactatttttatttttctttccacaaggaagtttgaaagcttgcattttcagtttatgcaaacaagaagtaaacagactcaaggcataggctttaatgtgcggtccactatatcatcgaaacctttctaatctttcagggaatgcctatctgacagtctatagatggttcagcaataccctgtattcctgttgacccatggttactctatattttgcagttgatggtcactaataacggtgaccaaaaaagtttaatatgactgaagtaaatttgctagtttgctacctttcctttactttattattgttgttgatatggagcaaaatctagttttgaacttctaaagatattcattctggccataccttgtactttcctagcaggtccaaaaactggatccgctggttaagcgcgcactaactgcttctttatatgccggagatcttcgaggtgaataaaattgaaatagctttggaaattccaaatcatgcttataaaattgttcttcactttgtactaatactgttggaaaacaacccaattgtgcatgtgcctaatacaaaagtgttggttatgcactgtttctttctgttctctccactaatctacttggagtttatattaaatgtgttggagaacctaaataattctgtatgcaatactatagtgtaaactatgcaattgagtgcaaactttactttatattttccttggtgttaggctttgaaacttcaatgccttgccttttcctagtattttctttagatgctaacttcactttttttggaagatttgtatggcaagattccaactgatgttgagtcaaagcttatgccgtttcagcgtgaaggtgtcaggtatgactatatgatgatgcaatgttcagtggacttttttctcacatgacagtgtaaaaatcatttttgtagatatgtgctgcatgttgaacttaattgtccagagatatcaaacatggcagatgaccattaataaatatgagaattttgtctagtctctagcattatacttaatgttgttagtctagtcatactaggaatgttatgttgcagatacttatggctcaaactgggtatggggccagaggactaaggtagggcacttgccctcaactagccattggcaggggctattccttcatgtggtagagggttaaagaaaaggggggaaattgtaaacttcatttactagctaaatgcccgtgctttgctacggataaaaggaaaaaaacatcatagtattgccaaataataaaaacatattttccattgaatatgtacccaccttaagttaattttatatgtggctaaccatttagatttagttgttatgtactattaagaagttcaaggggtgatatgtaaaagctacaatgggagcaggtaggtggcggattcactgtcactacaattggagtctttttaaagtaagtatagattcgttgcttaataataagagataaaaccccattgtcgtttagatgggataacttggagccttaataagcttatctctaaaataaagaaaaactcaagctaatcttatctctaaaatatgccctagaaggtatgcttcactgcctacagggcccaaaccccataacacaaagcttgaactttgtaagtaccaaaacccaggaccaggagcataagtaccattcaatatttgaaaagtgtagt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