Os06g0218500
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0218500 |
|---|---|
| Description |
MCM family protein |
| Version |
NM_001063693.1 GI:115467117 GeneID:4340503 |
| Length |
12202 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0218500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:6084460..6096661 |
| Sequence Coding Region |
6088209..6088435,6088527..6088574,6088640..6088749,6089103..6089170,6089292..6089413 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:6084460..6096661 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:6084460..6096661 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgccgccggcggaggagttcgccgtcgacgacctcgacgagttcgagagtcgcctagacagtttcctcaaccgcttccacgccgacgacctccgccgcatcctcctccccttcccggacggcaagctccatttccccctcgtcatcgacttcgcggagctcctggagttcgaccccgaggtcgcccaccaactctacgactaccccaaggacgtgctcgagctgttcgacgccgccgcgcaacgcgccctcgacaaattcgatgccgccgctcgacgagctgacaagaggaaggcgggcgacgagacaatggagaagaagttcgtgcacgtgcgcgtcaacacctcggggtcggcactcgaatgccctgaagcgtccccgagcattgggaaggtgagggtgaagcacaggggaactctgctcactttgaaggggaccgtgatcaggtccggtggcgtgaagatgatcgaaggcgagaggaagtatcagtgcaggaaatgcaagtgcaggtttacggttcatcctgagcttgaggctgggaatcgtataactcttcctgcatcttgcaaatccaagagtgcaaaaggttgtggaggtgccaatttccaattgatagaagatagcataacctgccatgattaccaagaaataaaaatccaagaaaatatacagcttctaggtgttgggtctataccccgttcgatgcctataattttgatggatgatcttgttgatattgttaaagctggggatgatgttgttgttacgggtcgattatctgcaaaatggtctcctgacatcaaggatgtacgttcaaaccttgatcctatgctaattgccaattttgtgaggagaaccaatgaactgaagtctgatctagacatacctgttgaaattatcaacaagtttgaggaattctgggcagcttccagagctactccactgaaaggaagaaattccatcttgaaaggcatttgtcctcaaatttatgggttattcacagtgaagcttgcagttgctcttaccttaattggcggggtgcagcatgttgatgcttcaggaacaaaggttcgtggagaaccacatatgcttcttgtcggtgatccaggcactggcaaatcccagtttctgaaatttgctgctaaattgagcaaccgttcagtgatcacaactggtcttggaagcaccagtgctggtttaactgtcacagcagtcaaggatggaggggagtggatgcttgaggctggcgctcttgttcttgctgatggagggttatgctgcatagatgaatttgatagtatgcgagagcatgacaggacaacaatacatgaagccatggagcaacaaacaataagcattgcaaaggctggattagtgacaacactcaacacaaggactacagtgtttggtgccactaacccaaaaggacaatacgatccaaatgaatccttatctgtgaatacaacactttcaggaccactgttgagtagatttgatatagttcttgttctcttggatacaaaaaacaaaaaatgggataaaatagtttcatctcatatattagctgagaacactgaagaaaagaaaggcaagacaagtgatccggaagtaatgtggacactgtccatgttgagaaggtatattcactatgtgaagcagcatttcaaacctgtgctgaccaaggaggctgaaagagttatctctagttattatcagcgtcagcgacaatcaggaactcggaacgcagcaaggacgactgtgcgcatgcttgagagtttgataaggctagcacaagcacatgcaagactaatgttcagaaatgatgttacgaaacttgatgctatcgctgccatattatgcattgaatcctccatgacaacatctgcaatagtagatactgctgggaatgctctgcactcgaattttacagagaaccctgaccaggaatgtatcctgaaatgtgattccatagcttacttatccaagaatatcaaatatttaactgatgaaatctcgaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPPAEEFAVDDLDEFESRLDSFLNRFHADDLRRILLPFPDGKL HFPLVIDFAELLEFDPEVAHQLYDYPKDVLELFDAAAQRALDKFDAAARRADKRKAGD ETMEKKFVHVRVNTSGSALECPEASPSIGKVRVKHRGTLLTLKGTVIRSGGVKMIEGE RKYQCRKCKCRFTVHPELEAGNRITLPASCKSKSAKGCGGANFQLIEDSITCHDYQEI KIQENIQLLGVGSIPRSMPIILMDDLVDIVKAGDDVVVTGRLSAKWSPDIKDVRSNLD PMLIANFVRRTNELKSDLDIPVEIINKFEEFWAASRATPLKGRNSILKGICPQIYGLF TVKLAVALTLIGGVQHVDASGTKVRGEPHMLLVGDPGTGKSQFLKFAAKLSNRSVITT GLGSTSAGLTVTAVKDGGEWMLEAGALVLADGGLCCIDEFDSMREHDRTTIHEAMEQQ TISIAKAGLVTTLNTRTTVFGATNPKGQYDPNESLSVNTTLSGPLLSRFDIVLVLLDT KNKKWDKIVSSHILAENTEEKKGKTSDPEVMWTLSMLRRYIHYVKQHFKPVLTKEAER VISSYYQRQRQSGTRNAARTTVRMLESLIRLAQAHARLMFRNDVTKLDAIAAILCIES SMTTSAIVDTAGNALHSNFTENPDQECILKCDSIAYLSKNIKYLTDEISN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8227..8453#8088..8135#7913..8022#7492..7559#7249..7370#6951..7032#6783..6849#5595..5667#5330..5446#4219..4311#3983..4048#3260..3357#2462..2561#1818..1992#1584..1650#766..904#567..648#348..486#115..266#gcgtcagtcagtcccgtcagccgtcgtcaccgccttgtgtcctctccgcggccagcttttctccgccctttcctgcccgtacggccaccatacgcggcccaaaccgccgcccaaatgccgccgccggcggaggagttcgccgtcgacgacctcgacgagttcgagagtcgcctagacagtttcctcaaccgcttccacgccgacgacctccgccgcatcctcctccccttcccggacggcaagctccatttccccctcgtcatcgagtgagtcctcgtcctcctccccagctgccgccgttctctcccccctccaaaccctaaccccgtctcccctccctctcgcagcttcgcggagctcctggagttcgaccccgaggtcgcccaccaactctacgactaccccaaggacgtgctcgagctgttcgacgccgccgcgcaacgcgccctcgacaaattcgatgccgccgctcgacgagctgacaaggttagtagtccaggcggccgtacgacctgcacctgcttgttccccccattttttttttctcagagactcttgattctcagaggaaggcgggcgacgagacaatggagaagaagttcgtgcacgtgcgcgtcaacacctcggggtcggcactcgaatgccctggtgagcgcacgcatgcgacacctgtgttcggcgtaatgcccgtgtagttttttttggtgtttttgggcagttgcttacgggctatcgtgatttggtggtaatggtggtgttcggcagaagcgtccccgagcattgggaaggtgagggtgaagcacaggggaactctgctcactttgaaggggaccgtgatcaggtccggtggcgtgaagatgatcgaaggcgagaggaagtatcagtgcaggaaatgcaagtgcaggtttgttatgcatgtctcagggctttataccagtattagttgaagactgaagcttttgcttcttctattagaaccagtgggcttgtgaagttgtgatgtatatatccctggctctggcttgcatattaattctgcggtttagatggtgctcaccgctcagtggtctactgacagagctggtttggcagaaccatagaaagcttttctaaagcaaaagttaacagattgtttttagtacttccacagttccactcgtgctcgcaaagtggcaggattgtcattgtgtatttgtgttatacattacttgtaacactggcctatttgggttcctaagcttgtaagccaaaagctgggaagtaaaattaagtatctacgcaagtggggttaagattctcttgaaattacttggaaaaacatttttctagataacgacttgaaaaaaaatgcatgaggatttaacttcttgaaagcagtagattttgaagaatcgggaggggattcaaagatcagagcaatttcgtgattgccttaatatgaacataatattgcattttgtgctaccttaagacatgatgacctcaatactttttacaaggtttgtgttgattagcatgctcatatatgttcgtgctagactctagccatactgaacctttgacttctttggtatcttgaacaggtttacggttcatcctgagcttgaggctgggaatcgtataactcttcctgcatcttgcaaatccaaggtatttcatgtccttggcattatttttctcgttctacctataacggttcacctgtggttaacacatctggttatcacattttatatattgttatttctatatttgtaattgcttgaacttctgctactactatgaagttgctcttgctaattttgctattgatccagagtgcaaaaggttgtggaggtgccaatttccaattgatagaagatagcataacctgccatgattaccaagaaataaaaatccaagaaaatatacagcttctaggtgttgggtctataccccgttcgatgcctataattttgatggatgatcttgttgatattgttaaagctgggggtaagcaaccttttcatattcatgcatttacgtaattctgtggaactaatagttgtccttttttgttcttttatgtcttagtggataacatcctggattctttaacatatggaattcatagactgcgttctagtgagctttaaatatttcaaaattgcattgtatttatatgagtagcttaaccagataattgagagtatacatgagcaaattgcggacctgaactggctgtggtttggtccaattcctcttgagctgaagtctgaatcaccaaggcctgagcctggagtcctggtccaccaaaccagttggccctgccaccctggtgaaccaggctgcaagaataaaatttaagccagcttgatctcgtgtttggccgaaaaatggattttgttgtgtttcttttgtgtaatcatcaattgtcggtttagcatattttgctgtgatagtcaccttatctgttcttcagatgatgttgttgttacgggtcgattatctgcaaaatggtctcctgacatcaaggatgtacgttcaaaccttgatcctatgctaattgccaattttgtgaggtaactgataacttatactgagggtgttctccaaatattagttctctaattttaatcttccaaattatgattctttgaacatatttagagtatgcaatgaaccaggtatagtttcttctcttcttagcatattttattgcatagtgttcttcttacgaacctgaagggacacattatacttctgaagatctatcacagtaataccagcaataatgtgccattcttagtgtatttcattacatagtgttgttttaacgaacctgcaggggctcatttaagcttctccaaatctatcacagtaataataccagcaatggctttggcacataattgccgatccagaaagtacatggaatggcttttggtgtttattagttaaatgatgaaaaactaaaaaagacatttaggaaacatgcagtttatgacaacagagtagtattgtctggtctcattactcatatgaaggaaaggcttcccatacactgtactttcactctactagtttattgcgttgtagtttttcttatttttcattttattgcctgccaaggtagttggatgcaaccatagttgggcatatttttagcactttagtattttaattttagcgccttttctgttccttggtttcaagttcaaagatatcagctagtcttgccttctgtgcattatgaatgtctatgtactgcactcaacaggagaaccaatgaactgaagtctgatctagacatacctgttgaaattatcaacaagtttgaggaattctgggcagcttccagagctactccactgaaaggtgcttatgttccaatgtcagcttattttccttttgttgctgtctagatcttggcctgaatcctgtgagctaatattgaagcaattacaatgtactacattgtcttattgacttacatttgaccaaaaaccctgatcctgttcccaaatgtaatactccctccattccaaattgatcatcatataatatttttaagaatattctaaaatgatcatcatatttgtgttcattcattaagtttatttgttatttgtgcattgaagtaaatgaacattgatgcatgcatccatgcacaaagtgttttgatttgctattggctaaaaaatagtggagaatgtgcatgcatcgagtttgttgtcagagtaaatgtagtatgagatagttattatattttcttggtcttaatgcacccatgtaatatgatcaatttggaatggaggaagtattaggaagctttctaccttttatttaatgcattattgcactgtaaattgtgcattgacttacatttgaactatggaccctgatcctgttcccaaatataatattaggaagctttctaccttttatttaatgcattattgcactgtaaactgtgcattcttttgttcttttgggtacacaggaagaaattccatcttgaaaggcatttgtcctcaaatttatgggttattcacagtgaagcttgcaggtacagaactatttgccagtattctaaatcattgcgagtaattcacttgtgtttagctttctctgaaaatccagttggagattgtttctgaaaagctatttaactcttttttggagtatctataacaactgctatagttggtattgtttcatgatctgtttaattttcagttgctcttaccttaattggcggggtgcagcatgttgatgcttcaggaacaaaggttcgtggagaaccacatatgcttcttgtcggtgatccaggtactaatatccataacatttgttatatacttaaatcaaaaccatcctttctgtacataagttgaactagtgtttaacctttttccagaaaacaacatattcagttaatatgctttcactgtaatagctacacagtggactaccgattaccgctaggctagcttagtccatatcttcggccagaccttctctaagctcctggaaaactagcttgacccatagctggacgccatcatctagcttgtccgtacatggactcaatcctctcctgctgaagcacctgcgtgaaaaagtgcatccaagatgatttcctgtataccaaaatgttactcgtgcactgcacaaattccaacactgcctcttgtatatggcagaaatgttcaattcagtccagtggggatagatacaacaactaggcttagggccaaagtggagagaatagatatccatcctttttggttcatcaacctcgaa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