Os06g0244100
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Structured Information
| Gene Name |
Os06g0244100 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001063809.1 GI:115467349 GeneID:4340633 |
| Length |
8562 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0244100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:7487067..7495628 |
| Sequence Coding Region |
7487155..7487661,7487762..7487899,7488837..7488916,7489359..7489768,7491834..7492018 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:7487067..7495628 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:7487067..7495628 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcggccgccgtctccctcaccggtcgtccccgtcaagcgagagcccgacggagccaccgccgcggtctcggatgcctacacgccccgcccaccgctgcggaagaggcgccgcctcccgtccaccccgacccagcccctcctcctcacgccgcaggccatgagctcgacgcgcgactccttcgcgggggagcggagcggcctggctccggcgtccgtgcccacctccgtgaagcgcgaactcggcgccgacggtgacggcgatggcgacggcgaccgggacgcccgcgggaaggcggtcagcgtggcggagggcaacctccagccccggaaaaccgctctggcggagctccccaccctcttggccaaccgccgccgcctcgaccgcctcctccacgagctcgtccgctcgcaccgctggggcgacgcggccggcgtcatctccgcgctcgtctccggcacacggcaccccgaatccttcgatgagatgcgcagcgtgttcgcggtcgggatggagatccataggcggctcgctgagaacagcggcatccaacagaacaccaggagtcgctactacctcaggacgcaaaagttgtacgatgtttggatgcggaggctaatgtggttacccacttgtgaaagaaaatacatggttaaactcgagctagctcttttttatctttcacaaggttgtatcgacagcgcatacaacacaacaaaaactcttattgctaaggatggactaaagacaccaattgtaaatcttatacatggtctgatatcatatgataattggtattctggcctccctgaagatatgcaacttgaggagtttgatgtttactgtgaatcacacacagtttcaatggcaacacatcactgtgatgaaaatggtcagcaggatacttcagatgataattgcagcattgatgctgattccagttctcctggttgctcttcaaaaagttcaatcaataattggaacatagacaagcaaagaaagtttcccgagaaacctggttttgttcattctgcacgggaagatgattcagttggatcacaggtggacgagaaaatggttgatacagattttcgaagcgtgtttttcaataccgccaacagtcctacttgtggattggaaaaaagcttgttgccattacggctaaagcattctgatgggactccaaatgcttgctttgattcatattggaagtacaagtcaacacctaatgctttctatgaagacgcagagaaatgtctaagggtggctctttattcaacaccaccaataatggcagccttactgccattaatacagattctcttgcttggtgataaattgaaagatgcacttgctgagcttgagaagatctgccacagttcaactacagcgcttcctttcagattgagaggtagattgctggagtattttgaccaaaaccaagtatcaattatttcttcttgctatgctgaagctttgagaagagatcctacatgtacctactcaatggagaggctaaccagactgcatagaaaaggctattataatacaatcgaactacttgaggcaatagctttacatctagattctgtcaatgggaaaccttgcatctgggaggagcttgtatcatgcttccttcggctcttttctgagtggactactgattacggggattgcatgtcatgtaacgtgcaaggagatgcaaccttcactgcttctagtaaattttcctgcgtcttttttgagcaaaatacaagagaaacatggaaggtccggtgcacatggtggatgaaccgccatttcagccaaagtatttgtacatcggaaaccctaacaggtgattgcaaactcctcgcttccaaggctgcttgtgcctgtcacttgtttggacccgagttcgagtacgtcgaagccgttgagggttatctttccgggcaaaaagctgatgacgagattgcattcttatctagaaatatgcagaactctgtaagactattacaaacgttggaggggctaacttcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARPPSPSPVVPVKREPDGATAAVSDAYTPRPPLRKRRRLPSTP TQPLLLTPQAMSSTRDSFAGERSGLAPASVPTSVKRELGADGDGDGDGDRDARGKAVS VAEGNLQPRKTALAELPTLLANRRRLDRLLHELVRSHRWGDAAGVISALVSGTRHPES FDEMRSVFAVGMEIHRRLAENSGIQQNTRSRYYLRTQKLYDVWMRRLMWLPTCERKYM VKLELALFYLSQGCIDSAYNTTKTLIAKDGLKTPIVNLIHGLISYDNWYSGLPEDMQL EEFDVYCESHTVSMATHHCDENGQQDTSDDNCSIDADSSSPGCSSKSSINNWNIDKQR KFPEKPGFVHSAREDDSVGSQVDEKMVDTDFRSVFFNTANSPTCGLEKSLLPLRLKHS DGTPNACFDSYWKYKSTPNAFYEDAEKCLRVALYSTPPIMAALLPLIQILLLGDKLKD ALAELEKICHSSTTALPFRLRGRLLEYFDQNQVSIISSCYAEALRRDPTCTYSMERLT RLHRKGYYNTIELLEAIALHLDSVNGKPCIWEELVSCFLRLFSEWTTDYGDCMSCNVQ GDATFTASSKFSCVFFEQNTRETWKVRCTWWMNRHFSQSICTSETLTGDCKLLASKAA CACHLFGPEFEYVEAVEGYLSGQKADDEIAFLSRNMQNSVRLLQTLEGLTS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>89..595#696..833#1771..1850#2293..2702#4768..4952#5398..5483#5759..5892#7609..7908#8117..8304#agaattccagggcgcaaaaaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctgcccctcctaaaacccttgcggccaggcggtgcgccgcacgcccatggcgcggccgccgtctccctcaccggtcgtccccgtcaagcgagagcccgacggagccaccgccgcggtctcggatgcctacacgccccgcccaccgctgcggaagaggcgccgcctcccgtccaccccgacccagcccctcctcctcacgccgcaggccatgagctcgacgcgcgactccttcgcgggggagcggagcggcctggctccggcgtccgtgcccacctccgtgaagcgcgaactcggcgccgacggtgacggcgatggcgacggcgaccgggacgcccgcgggaaggcggtcagcgtggcggagggcaacctccagccccggaaaaccgctctggcggagctccccaccctcttggccaaccgccgccgcctcgaccgcctcctccacgagctcgtccgctcgcaccgctggggcgacgcggccggcgtcatctccgcgctcgtctccggcacacggcaccccgaatccttcgatgagatgcgcagcgtgttcgcggtaagcatagggggggtgcctgatgaaaatctcatgtggctgcaattttggttttggtcgattttgtgttctctgatgcgggcgaaatgctcgatgaaaggtcgggatggagatccataggcggctcgctgagaacagcggcatccaacagaacaccaggagtcgctactacctcaggacgcaaaagttgtacgatgtttggatgcggaggctaatgtggttacccacttgtgaaagagtaagtttcaaattgtgtctaatgtaccgagtgaaatgctgtttttctcatagctaattaattgtctgatgctaccgtggtttaatttggaaattatgattgactatgcacttgttgccgcccctcattttttctccggtagcccatcaaaaaaaatcctagatcacaccctgtccctgtgaggtctaactgcccacggcaccgaccttatgtcacaggcctcaccgttgcttttgcttattaacctgttctttttatgaatggtgcgaaaaaaatgtaggtgaatactaaaagcgaactgatctgtgtttccatatagattcgtcaaaagccaaaggcattatattcctttaaatcatgtctttacatcctccaaccctgatagtgtactctggaatagcaatttctgaagaggatttttacacaaaatttcatttttgacttcttcatgtttttcgtatcacatattcacatcccagcataattttctacatttctgcatttcacaatcctgtagggtactagggtgtagagttacactttcattcctatgtttctcttgtgtttttggttgtgttttgtagattttggggaaaagagtgatagtactgtcatagttttatttatttccttgtatttttgtattgttagattggcctttatgtaaacagttagctgtacacctgtatcatgacaaaattgaaactcagggaacaaaaaagtttgaaacatgatgttaactggctctacattacctgattagtaagattatggcatcagctgactactttttttataaaacacacatgaatgctgaaatattggatcataataatgttccatgctgactttgttttaatgttttatcaaatatcaatgcatggaagaccatcattaatgctttgctattccctaaccctgttaatttgtttggcagaaatacatggttaaactcgagctagctcttttttatctttcacaaggttgtatcgacagcgcatacaacacaacaaaaacgtatgtaaaatgtttgctctttctactttttgtttattttttactcattggtctgttgcattgtagttctggtatttcaatgcgttttgttaataacctacttcatttgcttttcttaattcattatagggacccaagtatgtgtttagcttgttagggaattgtgatttgcacagattatcaggcatacttgttgtcaaatctgtcttactctcatttttttaagtgccagcatactgtcaagaattaatgaattataaattcttcaaatttacatatacatcacttcaaaaggcttgtgcataaggtgttgtgactgaaatacttcttaagtgccaatgctttaggataattggtgacctcttagctttacttctctttcggtttttcactattgataataatgttagtactttattgcatttcttgtttttcttttcagtcttattgctaaggatggactaaagacaccaattgtaaatcttatacatggtctgatatcatatgataattggtattctggcctccctgaagatatgcaacttgaggagtttgatgtttactgtgaatcacacacagtttcaatggcaacacatcactgtgatgaaaatggtcagcaggatacttcagatgataattgcagcattgatgctgattccagttctcctggttgctcttcaaaaagttcaatcaataattggaacatagacaagcaaagaaagtttcccgagaaacctggttttgttcattctgcacgggaagatgattcagttggatcacaggtggacgagaaaatggttgatacagattttcgaagcgtgtttttcaataccgccaacagtcctacttgtggtaagttccatcaatgcctgtttttgttcatactttcatctagcttttggttttgttgagtattatggtagccacagtcttgtactgttgtacagtgtcaaatatacaagttatgaatttgataacacaccaacgtgcactgtgacctcatccacgcgaatgttttttggtgtttcatgttgtggttaggtgcaagcaaggctggctccatgatttcgtttcctaattattctcatatgaggctatgccaggtagctttgggacccacagctgtaagactggactttcgagtcgtgggcaccacagccaagctaattcagcaagtttcacaattctttaataaagtttttcagtttgtaattaagttgattagcaattttcttggtaaaagaattagttcaagccttttcgtatttgagtatgaggtttttattctttcaagataatgttttggatgcaaatagaggaactcgtaagttttcagtagaaagtttttataattgagtgcaaactatgttgtttcagttgaaaatttgaaagaaattataaaaaaaaaagattactgtttttttagaacatgcaggagatctgcatatcatttcattaagatagagggaaaaagttggatggcgttagagataaactccgacacccacccacccgaaagtacaacagcaacaccgcacacccaagaggaacaaaacaaacctagagcactagcactatagccctagacaaaaaaggtcacagagcttagaagctcctgctaggcaccaaagggctccctcactagcaatggcttgaaggacatcagccgtgcttggggtagtgccattaaaaacacagttgtttctatgcttggaaagttagaagtaaaaaattactgcttgactaagttttggggctgatcggaactgctagctgctgcagccactatggctgcggccctttttcagctgctgcgctacagctgtttttagctcttgcagccgcagcggctgcagcagcaagcgctgccgatcactctctttcttatcacaaatttttaatgaagtctctaatcagaaagttttcaatgggaaagtttatcatagtaagtttttaatgaaaagttctgttgttgagtgcaatttttagattaaaaaagctatcagttgaaagtatcaaaaacagagataattgcaagaacgaaaaagaaataaaatgcatgcatcggtggttttgccacgatgcatacattgatagggaccaccattggtgtggacacaggaaattactaattactccctccatctacttttgatagtcatatttcatcttggcacacagaccaaggataagtaattctacttatcatccatttaaacatgctactagtcattcctcgtaaacaagcgattcattaatatttacatttctcgatgcccatgtagccaatcttatatggaagaatggatagtcatgcattaaatccaagaaaatcattaagaggataggatgttgaattgaaatatgcctatcaaaaatatttttttcagatttggaaatatgactatcaaaagtagatggagggagtactaattagaaatctcccacaaattatacatagcttgaacacactactggaacctgatagagctatcactgttcacaaagaccgatgctagggtgtaatgtcacagttatctaaaattttcttgggtgttgagggtactagtacacatattgttcttgggtcatgtagtgctgcacacaacacaacaatcctttttatgttcagaaccatttatcctctgatgctgttcattaggatatatatttctggattatttagaatccgttacctcagcaatatgatgctgttcactaggatctagatatctggaattctggattctgaaacatcctttttagtatagatcgcgccagaagtgtccttgcattgtgtagccatgtctgcccgttgtcacttgtcagattaaattttagactaaccttgttaagctgactctgtcgattctattaccttctattagtttcttaatctctttcaaactcattgaaggattggaaaaaagcttgttgccattacggctaaagcattctgatgggactccaaatgcttgctttgattcatattggaagtacaagtcaacacctaatgctttctatgaagacgcagagaaatgt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|
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