Os09g0505200
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os09g0505200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Transcriptional activator FHA1 |
| Version |
NM_001070135.2 GI:297609766 GeneID:4347504 |
| Length |
7889 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0505200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:20186979..20194867 |
| Sequence Coding Region |
20186979..20187051,20188664..20188771,20190760..20191488,20192878..20193032,20194128..20194255 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:20186979..20194867 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:20186979..20194867 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtgtgatcttcgctcagaagagcaagaactcagcaagtgaggcagactatttttgttttgaaaggatagcatcgaggagtggaaaggagttcatccttagggttttgagccagatttggggaggcctccacatcctcctctctcgctcagccgctgactcatctcgggcagcgactggaatattgaagatggcttcctctatttctgttatggcatctgctggtcgcaatcgtggcgtaggatttgcaaagcttcaaggtgaagatttcgagtacttcatgcaaacttattcaatcatcttgggacgcgatagcaagagagaaaaggtagatcttgacatctctggtggagatcttactatttcccgccatcacgcacacatattctatgattttgaatgcaagcggttttcccttctagtccttggtaaatgtggatgcactgttgaaggtgtccttcaccttccaggtggtagtcctattaaactggactcccaagacctccttcagattggacataagaaattctactttctcctgccaactcgatctatcttcggcacctcctctaatcagcatggccctagtgcctctgctgcttttcagcctgctaacaatggcaccgctgctgatgagcataatctcactgcaagtgctgctgctcagcctgctcatattggcaccgccgctcctcctcctcatattggcactgctcaacctggtcaaattggcatcgtcactcttcctcctgctcatatccagaacaatgctgaaaatgaaaatatagctggcattgaaacacaagaggaattcatgaatcaaaacaagatgccttttggtgaattggatacatgcagcagccaccacatcacaattgagccaacattagcacctggcggtcagcctgtcaataatttagcaataagaccagcagacaataataaagaccagcaggaggtccttctaaaggaagaggaatatgttctcgcatctattggaatcgtgatatctgacctatgtggtcttaaaaagatgattcctattgaaaaactccattcagagctcgttgcgtgttacagtgcaacatggccccagcgccaggtccagatgcacctggcaccagaggctggctcttcagcagctggaacagaatgcaaaccgtggctcaagctgatgtacctactaaggaagagagggaagcttcatgaaacatacagcaacatatcagggagtttttcgccttggaggttgctcagatcaaacattactccatggttaagagaattggagactgaaaaactatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGVIFAQKSKNSASEADYFCFERIASRSGKEFILRVLSQIWGGL HILLSRSAADSSRAATGILKMASSISVMASAGRNRGVGFAKLQGEDFEYFMQTYSIIL GRDSKREKVDLDISGGDLTISRHHAHIFYDFECKRFSLLVLGKCGCTVEGVLHLPGGS PIKLDSQDLLQIGHKKFYFLLPTRSIFGTSSNQHGPSASAAFQPANNGTAADEHNLTA SAAAQPAHIGTAAPPPHIGTAQPGQIGIVTLPPAHIQNNAENENIAGIETQEEFMNQN KMPFGELDTCSSHHITIEPTLAPGGQPVNNLAIRPADNNKDQQEVLLKEEEYVLASIG IVISDLCGLKKMIPIEKLHSELVACYSATWPQRQVQMHLAPEAGSSAAGTECKPWLKL MYLLRKRGKLHETYSNISGSFSPWRLLRSNITPWLRELETEKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..73#1686..1793#3782..4510#5900..6054#7150..7277#7385..7487#7878..7889#atgggtgtgatcttcgctcagaagagcaagaactcagcaagtgaggcagactatttttgttttgaaaggataggtagaagaactaagaacaagggcatagctacatatgtcctcttttatttatttatttatttatttttacgatgaaaatgtatatgcttcagcacactagtctgtcacagggcattgatctatctgctagggaccgtgcagtatatttgctgctgcaatctcaatattgataaacttgatctatgccgccatttatgtccaaagtgaagttggaccgttttggtgatcatttgtagtagactgcacatgaaagcaatttttgttgtacttggatcaatttcatgaaataattatagcctaacagataaaaatccattgaagctcctagatttctttggttgaaacaatgtcattttgtgcgtgataatgttttgctacttcattaatctatgaccatcttgaagctcatggggtattgcgtccttttagttctggaaaatatccacatgctgtattcacaccagtcaaggctattctatagtaccacactactatgtctacttaaaatcacatactaagaggtgaattcgatggatactgcatcaatattattgtctttgctttaagtgacagttctggtatattccctagaaaggttggtgagatgagcatatgccataaaatgtgtgcctagttttcgcacactttgatcatttctttttatggtttcaatgtacaccgtcacaatttgagtctaccaaacctttgcatgtaatgcgccttgtaactgcacttaaacttttctctctttcttctttaatgcattaagacaaagtatatctctttcctcttcctctagctcttccatgtctgttgtttctttagttgtgtattgaaaaaattatattctgaattgttcggcatagagtggcttctactgcagtacttgcgtgaggaagattcttccaattagtcttgcgaggttttggtactgggtgtggtcttttctcagaagagcaataactcaacaagtgagatggaataattaagaacgagagcatagctgcaaacacatttttttaaaatgaaatatatgtttcatcaatcatcacactagtctgtgacagggcattgatctatctggtagtgtatattttctgcaatctcaatattggtaaacttgatctatacccattatgtccaaagtgaagttggactgaattgatgatcacttatagttgactgcacatgaaagcaatttttgcagtactttggatcgatttcgtgaaataattatagcctattgagagcttttctgaataaatcatatttagagctttaccatcatactttgctgaagaagtaaataaacaaaaatccattgcagttcctaggtttcgttgattgaaaaaatgtcagttgtgtgtgtgataatgtttttgctacttcattattctatgaccatcttgaagctcatagggtattgagtccttttagttgtggaaaatatccacatgctatattatagttatcctttatgcataccagtcaaggccatctcatggttttcttgggtttttttttaggggttttcctgtgggcggagtagaacacgcaaatcatcatgaaggtggtgagaaaattgtaactgaaatttttggatttaaatgcagcatcgaggagtggaaaggagttcatccttagggttttgagccagatttggggaggcctccacatcctcctctctcgctcagccgctgactcatctcgggcagcgactggtgatctttgcgctctccggaggaatcgcgagagcttggctaagtatatctctttcaccttcatctagctcttgcaccgtgttttttctttagctgcgtcttgaaaataattccaaatattcgtcatagattggcatctactgtagtgcttgcttgaggaatattcttgattcttccaattggttttatgtggtagtggtaatgggtgtgatcttcgctaagaacttcagaagggcaagaactcagcaagtgaggtagaagaattaagaacaagggcatagctacacacacacacacattttcttttaatgaaatatatgtttcatcacactagtctgtgacagggcattgatctatctggtagtgtataatttctgcaatctcaaattctcaatattgatccccgcaaaaaaaaattctcaatattgataaacttgatctatgccattatgtccaaagtggagttggactattttggtgatcatttatagttgactgcacatgagagcaacacacacatttgttttattgaaatgtatgtttcatcgcactagtttgtgacagtgcattaatctatctggtagtgtatattttctgcaatctcaatattgataactttttttttctcgaaaacgtaggagaactacacttcatttcattaagaagaaacaaaaaaggaaaataattacaaaggagagtaacaaaactgtcctccccacagaacacacgtgcgtgcgcgcacacacgcacacacacaacatacacacacacaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacccctaaaaggtgatacacaaggccattatgtgtccattgattaacttgatctatgcccattatgtccaaagaggagttggactgttttggtgatcatttataattggctgcacatggaagcatttttttgagtacttggatcaatttcatgaaataattatagccttttgagggcttctctgaatacatcctatgtagaactttaccatcatacattgctgaagaagtaaacaaataaaaattcattgcagttcctagatttcgttggttgaaacaatgtcagttttgtgtgataatgttttactgcttcattaatctattacctcttgaagctcatagggtattgagtccatttagttgtgaaaaatatccacatgatgtatcatagctatcctttattcataccagtcaatgccattctatagtacaccgctatgtttacttaaaaccacatactaagaggtagaaaggttggttagacaagcatatgtcactaaaatatgtgcctagtttttgcacactttgattatttctcatttttagtgtcaatgtgcattgtcacagtttgagtctaccaaacctttgcatgtaatgtgccttgtagttctgattttttggttcactaccacaatttgcctcaagttaggcaggtttgactgagttaggtgtctgtttggttcgtgccacgcttgtagtaagattccttcatcatcacatgggtcccagatgtcattggcacataaaagtgtggcaaggttgctctcttcgaactaaagtgtggcttcaattttggtagccgcatgttaggctgttagctaaaaaagtatggcaagctttgacaatttgagtatgccaaacaaacatgccacattataaaattaaattaatgtgagccttccctataggaaaatgtgggtaacatatttcatggaaaatatgcttttatttattttagaaaatattatgatatttttttccttctatggatagcaaagcacaggcatttagctagtaatacaataaaaagaaccgatagtacccatttgtctagtatattagcatcttttgaaccatttcatttttataacatgaaaggattttaatgcatccgccttgcttttactttgtagaagaaactgaaaggcagtagcactcagtgtactgctactaccaggaatattgaagatggcttcctctatttctgttatggcatctgctggtcgcaatcgtggcgtaggatttgcaaagcttcaaggtgaagatttcgagtacttcatgcaaacttattcaatcatcttgggacgcgatagcaagagagaaaaggtagatcttgacatctctggtggagatcttactatttcccgccatcacgcacacatattctatgattttgaatgcaagcggttttcccttctagtccttggtaaatgtggatgcactgttgaaggtgtccttcaccttccaggtggtagtcctattaaactggactcccaagacctccttcagattggacataagaaattctactttctcctgccaactcgatctatcttcggcacctcctctaatcagcatggccctagtgcctctgctgcttttcagcctgctaacaatggcaccgctgctgatgagcataatctcactgcaagtgctgctgctcagcctgctcatattggcaccgccgctcctcctcctcatattggcactgctcaacctggtcaaattggcatcgtcactcttcctcctgctcatatccagaacaatgctgaaaatgaaaatatagctggcattgaaacacaagaggaattcatgaatcaaaacaagatgccttttggtgaattggatacatgcagcagccaccacatcacaattgagccaacattagcacctggcggtcagcctggtatgtctttgacacattcttctgctagacctgattccttcctatcttactttatttatgtatttacttttatgaatgacacctggtggtgatggtagtgccaccttggtgtatctgcataagtttgaatgtgtataatcagtctgtttgtaattaggatcttttatggaatatgtaatatacacattcatggcatatgcaacatacacattcatggcatatgtagtatacacatttatggaatatgtagtatacacattcatgggcttatgtagcagtagtatacacattcatggcatatgtatgctgataaatatgcctgattccgtgaattatcttttgttacttacctggcatgatacccaatttcaaataggaaacgtaaaactggaaatcatacttctcagaaaaactgttcagatgaatcgtaaagcaaataatcaggcatgcatgaggatttgtttggcttattttctattccttatgtagttcaaattttggttttctgctgcaaagtgtatgcaaccaactcatacagacaataaaatttatgggcctgttttatttatagccacatattggcacacttcaattagacaaatttcactgatttaggcattttttggttattgccacactagtggcaagatttttttaacacctaggtcccatgtgtcattgatgcaaaaaaaatgtggcaagtatgtcctttgcttgccaaagtggcgcagattttgttcgcatatccttaggcatgcatgccaaaaaaaatttgtggcagtcgttggcacacattcccctgttcttatcaggttgaaatggcatcatattacttcttaataatactatcacttctttggcctatattgatttttacgttgcatcccactgtagtagaggataaacaattagctctcatgattacagaaactaatggttagagatggacaaatagaggtccatgcacagaactgtccaagactactagccttctcaatgctatctttctgattttccaattgtcatatcatgtgattatgtgaacctgtcttatgatatcccttgttataacaaaatttagttgatcctgatctcttggaataattaaatttttcactgcttgttttttcaatacagagttgtgcaaagtgttaaaaaaaatattaacagaacaaatatgggatactacaagtttttgttttcctttttctgcaaaattgtggatacactgaaacataattctagactaaatggtacatgctatgccaattcacttgtattattttttttgttaacattatgctcttcagatatgcaagaaatcagtttttactacatttcttattttatttgtagatatgcctaactagcttatttttctttatgcagtcaataatttagcaataagaccagcagacaataataaagaccagcaggaggtccttctaaaggaagaggaatatgttctcgcatctattggaatcgtgatatctgacctatgtggtcttaaaaagatgattcctattgaaaaactccattcagaggtttgttgtggaagagtactcatttctgtccagtgtctctttatttcagaaagttagtgtaaccacctccagatatgttttgtgcaggaatgtgggttgtgttatccagcactttaattttcctttcgtacatgttgcactaaagtatcagcatttttgagaaataataatttgttaactaatagacaattcctctactcaaagaaaaaaaaagaaacaattccctagcatccatatacagaaaaaggcatttactttcatttccatatgtcatcaggctacgctttgcactgaaggaccaagtatattcatcagttgcactgtccttagttccacattgaacagaaatatttgggtaactacattcatgtgtcctcattcttagaagttcaatgatccttcgatagccttgttgatgtggccatgatacccctggtcgcatcacttgtgccagaagttatgcataaactcacaggtctaaaaatagcctaaagtaaaaccttgctgtatctggtaatcaatgtcaatttctgccttttgcatgcatgcagaaataacctttttataaactctctttagcatgcaatgtccaatttagttgtgaaatgttcacctacctgatatgccctaccgtatcctcagattaacatgttgtggaagtcatgaaataagctcgcgaccttttggaaatatccagtgtctctcattactcactagtttggaaatactttgtgtctttgtcaacttgagaggtggtactgaccctaggattgtgagcttccactaaggaattggcgaattgctatttaaatcaatcattttacatgagtggtatactaaattaagtgactactcagcatattacaagttagtggtgcctgccaattgtaccattgtcactatcctcccaattagttagatacttcagctgccattaatagaaacttgaacaagacattgttacattattatgattttttttttgccgggtcggccgaaggaacggcgaccgaattcattaagatgggggaagtacattatttcgcattattgctgcacccatgaacgcgaaaactgatctgtgattatttgcagctcgttgcgtgttacagtgcaacatggccccagcgccaggtccagatgcacctggcaccagaggctggctcttcagcagctggaacagaatgcaaaccgtggctcaagctgatgtacctactaaggaagtacccagaacgctttactgtcatgaattcatcatgtgatgaggagggcaggcaacatcggtgtatgttacgctgaactccttgtggccttgttgatgaaattgcaggagagggaagcttcatgaaacatacagcaacatatcagggagtttttcgccttggaggttgctcagatcaaacattactccatggttaagagaattggagactgtatatatccccagctcctgtagtatgagagctttcatgttgtcttgtaaacctgtttgtgtgtttctttaggcgtctgtactctttatggtgatggtactgtttgtgtgttcttaaaaagaacctgaacttggcattagttgatggtcccatgtggtgatggtactgtttgtgtgttcttaaagagaacctgaatttgggattggttgatggtcccttgtggtgatggtactgtttgtgtgttctcaaagagaacctgaatttgggattaattgatggtccgtttcctgagctaatatttgtgcttgttctatgcaccgttggatgttttgaagatttcgtagtttttgcagcagttttgtgcatatgattgcacgtgcgttgcaacaggaaaaactatga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
