Os06g0470800

From RiceWiki
Revision as of 20:23, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os06g0470800

Description

Protein of unknown function DUF159 family protein

Version

NM_001064153.1 GI:115468037 GeneID:4341015

Length

10621 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0470800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:16525707..16536327

Sequence Coding Region

16526795..16526943,16527025..16527208,16530517..16530602,16533220..16533337

Expression

GEO Profiles:Os06g0470800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:16525707..16536327 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008399:16525707..16536327 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtgcggcagggctcgctgcacccttagcccgtcccaggccgctagggctttcggcttcccgaccacgacctctgtcgcgggcggtgggactgggggcggctgcggaggaggtgacgcacccgctgtgccgttgctccggatggaccggtatcggccatcatacaatgtgtcgccagggacatacctgccggtgggcaccgttcgggcgcggccggcggggtatgatggtggaggggacatggacggggaggtgtcggtaatccagtgcatgaagtgggggcttgtgcccagcttcaccggcaagaacgagaagcccgatcatttcaggatgttcaatgcacggtcagagtctataaaggaaaaggcttcctttcggcgacttatcccaaataataggtgtcttgtggcagtagaaggtttctacgaatggaaaaaggatgggccaaagaagatgccgtattacattcatttccaagatcagaggcctcttgtctttgctgccctctttgacacttggacaaactcggaaggttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MCGRARCTLSPSQAARAFGFPTTTSVAGGGTGGGCGGGDAPAVP LLRMDRYRPSYNVSPGTYLPVGTVRARPAGYDGGGDMDGEVSVIQCMKWGLVPSFTGK NEKPDHFRMFNARSESIKEKASFRRLIPNNRCLVAVEGFYEWKKDGPKKMPYYIHFQD QRPLVFAALFDTWTNSEG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1089..1237#1319..1502#4811..4896#7514..7631#attccctccatcctctctcgcactcaccccgacgccgccgcctccctcctctctctctctcactacctgcgcgctcgctccaccccgcgccctaatctccgtcacgcccttcgcaagcaccaccattgccgtcgccgccgccgccgccgcccgtcgtggcctcccctccgtgcgcccggttgctccttcacatcctgatgagagaaaagaggtaagctttctattccacagcggaagtttggatcttgattcgaaaaaaagaacacttttctctcccttgttactgacctgcaagaaatcatgttctgattataaattttccatcttttctaagaaccgtgagatactgattcttggagatgttcaatagtaaattagccgatagattatactctagattgaaatcaggtttaggagacccctccccggattgatggattgattgatctcgtgtgatgttaatttcagaggggaaattgagatacagtcatctgcgtaacgttagtaacatgcacgtgctaacattttattcattattatggcttgccaacatgacatagtgttgattaagccataaaacatccggttttctctgtgttggtgaattacagtgggagctttaccaatcagtactattttctatataacaatgatttatgaaaaaagatagtagcagctttggttaggtcactggtcacactatctgactgcccgcgtacatgtttatgctttacacttccaagttgccaaaaaaaaaagaatgatctcatattggttctctgaaaattgtatagagaatcaatagttcttctgggttatagttgttcatctgaattaatctttccggactgaataattatctcacttggagtgttcttgttagaattgagaacaatttgcttgctcttgatgtatatagggatgggaagaaaatggcattatgttcaggatgatgcgatgctctgaccattttacactgttcttctcaggtttgcccagggtaatcatcgttcgattccattccttcaaccattacatttcaaatgcaaagctaatcttaattaacatgtgcccgggcagagtacgagatgtgcggcagggctcgctgcacccttagcccgtcccaggccgctagggctttcggcttcccgaccacgacctctgtcgcgggcggtgggactgggggcggctgcggaggaggtgacgcacccgctgtgccgttgctccggatggaccggtaggaagggagttttgaggtatggggtcatcctgctcagctgtattttgccaatcatgagattctggttgtgagatgcaggtatcggccatcatacaatgtgtcgccagggacatacctgccggtgggcaccgttcgggcgcggccggcggggtatgatggtggaggggacatggacggggaggtgtcggtaatccagtgcatgaagtgggggcttgtgcccagcttcaccggcaagaacgagaagcccgatcatttcaggatggtatggactggttgttctttctatacaatcttgttcttatcccttgaatagctttttttgagtcttgagaagttatgattgctgattacagtttattgtagtgggttgattgcctatgtaacagctagataaaccacaaacaacagaccgattgatccacatttgatgactatgttttgactaattggttgggtgtttatcatttaacaccatctctatttctttaacgtgggatgagatgtttgatttgtacaactacaattccaaattgtcaatatctttcttaaaagtcattttcttataagaaagtgagatgaactcaagcttagacaattaggtatttggcaactaaggttaactagttggagcggcgtggacgtcttaaaagtccaacagtcttgtcaagttgtttgcactatccaaggcacgttgttattcatgcaatgttttgatttgaagtcgaccaagctgctgctggatctgccgcctttagggctgccctgccagagacagctacgtccttgtccgctgtcggctgagcgtgtgcttcctgctccctttggattgttgcctgaactgagctttggctcactccttgttggcatctcctgccttgccagcaggaccgcatcaatggcaatggatggaggcttccaattaagctttggtagatggaggcattagcttttctttgatccatatttttttatcagcttctcatttatttttcttgtttcttttcaaaaaccaaaagtttgagtttcgaagaagataagcctctaggaaaagccactccacataaagaatgccatttcctttctggtatacatgtacttatgtgtaaatacatactccatctgtcccatctgtcccattttaagcgcaaccatgagtttccgtgtccaactttgattgtccgtcttatttgaatttttttatgattagtatttttattgtattagatgataaaacatgaattgtactttatgagtgacttatatttttatttttttaaaaatatttttaaataagacggattattaaatttggacacagaaattcatggctacgcttaaaatggaatggaaggagtacattactttttcatatttatgctccttcatattcgtagaacgataaaccccaatcttgttggtgctatctgctgctttttttttaagaattttctccataattaaattcacctattatttacagccatgtagtcaaactaaaaaaaaatataggtattgtgcagtatttagcatcaaaatggtagaatatatgtatataaatttactctaaaccctaacaataaaatctagtcatatatcaactacaataaaacaattcagaacatatctgcatgccctgacagtgatcggaggttgtagttgtggttgactggcgccctaggccgcagtccccatggcagcgaggcacggcgacattaagattgaacaaagtaagaaagaagtgcacaggcagaagggcacaccgtgggacagaagaaacgacagagggagagggtttagattaattcttcttcattgatcacaatgaacgaattacaagcttaaataagacccaatctaacaaatcttgtaacaaactcttcctaacaacttatctctaagaatgaggataaaggtaacacatttaaacttcatctttaaacaatgctgagtcttccgtgttctagacgttgctgcacgtgctctgtccattgttgcacgcgctctgtcctgtgttcatgccccgccgttcggctccatcacaatgcctgtggaacagaatcccgcacatgagaatatttttcaaatgcaggaatgtccttgtaataaattatttgtcaaaataattagggagaatacaggaaattggatgccaaagccttgcctagctattgtttccccagttgtggataaaggccatagggagaagaggctggaacctggaggatagtacgacgtggccagcaaggaaagcgacctcgggaacatcctgtagatcttagcactgatctacatctaacaatgggttatagttgtcttgttagatggcgtcaggaccattgcataaggaaagtaacaggagcaacaagggaagaaaatagaatatgaacaggcgcgtggacgtggaaattttttttatatttatttctttaatgatttacataaacaaactactatttcaaatttttgcaaaaatatactcctccacaccgcaacgtagggcggggcatataaatcgccctatggtagggtgggctatgtgatgtggcatagggtgggcgaggggtatgccgtgttaattttgcaggtggccccttctcgccctctggatttttcacaacttggtccttttgaaaaacttattttgcaaatagacccctggaaaacttatcccagaaatggtcttttttgggacgccagagtcgctagctccgtggtccaacgggacggcgccaacatctctggcgccgtccccctgccaccgtggcgggccggcgatgagtggcaggggggagctgcaaattttaaccatccaagttagttgattcctgtttgattactacgtttactccaattaggcaatttggacggcttctgcaattgtgatgttggttttcagtgtcacatttatggtaataatgccccatttgaaaggacaggttgttagtacactcaaagctactccatctatcccaaaatataagcacttctagagtttttcacagagattaaggagagaggtgaaattaaacaggggatggttgtgattggttgagatgagggagtaggtggagaaattaaatgggagatggctgggattggttgaaatggagtaggtagagaagtagctatatgatgggaccacatttaaacgctagaagcgactatattttgggacggagggagtattgaacacagtgtaatgctttgcaatttttttccaaaacatgaaatatttgtgctgtcatcctagtatatattttatattcttgatttttctgtgtgcttatttgtctatcatctttcaaattctagcatttatttggaatgttctcttaaaaatatgttctatggacatcagaatgggaatctgttcctatgtacgctagcttagctgcttcattttatagctaaaattattcatttctttatttgactcctctaaaactgatgtcttactccacattgcttatgcattggactgcctgctatagagcttgatttacattttattatgtcccattactgtgcttctttaaattgatttaatcactgaaatattttattgtgcagttcaatgcacggtcagagtctataaaggaaaaggcttcctttcggcgacttatcccaaataataggtgtcttgtggcagtagaagggtatgcacaaaatagttgtctccttttatttggaacttccaactatcatatgctttgttaaagttttgcatgagcatgctctgatttaccccttgaagttggtacagtatgcatgtacttgctcaatatttgcttgcattgatagaggctaaaaggctacagaatgatttgcacctggatgtaaaatttgacatctggatttatagtagtttgatataacttctgtcctgctcttcttgctttccgtgtctcgctccatccttctgtcatatagtggtgctaatcgatgagtgacatgccaattgtaggatttgacataggactgtaggtttagatgtgcttgattttcctcattccaaactatgaggtatcttaattatatttattgaatataaatcatgggggcatagattgcatgacatgttaaatacattgtaccgaatctgggggttacctgtttttcatctcaggaattgagataactagttattttgattgagcaaatctatagggaaaccactaattgttgcttgtgatctattctagtaaaacctttggccaaaggtgaatcaccaagtactcaattatacaccttcactgagagcatgagacaactcgcgaatatatcaagactcccaaaattatcatcatagattggctccaaaagcctttgctctgagtacatttgttggtcttatatgtatacagctagaatcatatcaaagacgtataacactgctaaataagctgttctacttggattactggttatgtgaaaagcacctacagtcctaggtgtcatggccatacgacatgcgggctgctagtaggtcctttggcccaatgaaacactggagcagcaaggcgttggattatctgatatcatttgttagtttagttgattattattcctagttagcttttgtatcatatcattactcattagttggttagatcagtagggcattggcatcatcattggggattaagcaaagagttaaaaaattacctctctccttcatgttgtctcctattctccctccaaagccctcttctgtattcttgctgttcacatctaatctactatttcttcaatccctaacccagctacccaaatgggtgatcaaggctactgacaaaaggtacagaggttttctttggaagggtcaggagagggctaatggtgctaatttccttgtttcttgggattgcgtttgctgacctctcccttatggggacttgcattcataatctggaaaagatgggatgggccttactcatgaggtggttgtggcttcaaacacctgactcttctagaccttgggcttgttttggttttcctatacaagtacctcacaatgttcactctttgtttggagtggctgtgaaaactataattggtaaaagggggaacaccatgctctggcatgatagatggctgccaggaagaacaatagctgaactggcccccaatctttttgaattaatcactcaaaggtcaagtaagcagcgcactgtggtgcaggcattggagaacaaaaggtgggtgagaaatataaaaggtggcttcactgttcaagttctctgttgatttgggacttggttgagggggcggtcttgcagcagggggttcaggactaacacatttggaagcttacagggtcctgctcctacactagcaagtcaacctacaatgcttatttcctgggatccatcaagtttgctccatggaagcgaatatggactagttgggttcctttatgctgcaaaattttcatttggttggctattaacagcagatgttggacttcagatcaacttgcttttaatcagggtctaccacatcctgctgcctgccctttatatgatcaaagcggcgaaactgttcaccatatccttgtatctcgtgttttctctggccatgtttggactttactactctctaaagttggggctggctggtcctgcacctgaactgtcggcagcccattttccaggatggtggtggcaaagttatcgggattatcctagcagcttgggtgatttggaagcacggcaacgactgtgttttcagtggtgccacaacaaacgttttggtgcttttaaagacagcggaaaatgatagtagtagcctgtgcctacatgtgtttctttgtaggttgtttaccccggatggctagtccttcctttttcgtttgtggttatgcatcacctttaagtgatgagtatgtgaggtgtgttcttagtggtggatcagttttgatccctccttttgtatttggtttattttcttaatgaaatgaagtacagtcctgcgtttccgaggaaaaactccagctacccttcttaatcctcacatgtgacactggggcttgattttgccctgaccaatctgagttgaactggttaaaatagacaaaattcaatctaggactcaattagttgttagtgtatcacattcaagttgttttatccttgtgcagcacaatttggtagataaaaaatatttaggttcttatttgtagcataatgtctttgttgaaaagtccatttagagagacaataagctgaccatatttttgtattaatcatgcattaatattttatatgagctcagtttctacgaatggaaaaaggatgggccaaagaagatgccgtattacattcatttccaagatcagaggcctcttgtctttgctgccctctttgacacttggacaaactcggaaggttagcatgcacatttgtcaattaactttctagtctttggaagccatgattatggtactaagaatgtgtttcagtgtaatcacattttcttaaagtagtcttgggagttgctgcaaaagatatgttgtcctgttaatgctgcagcttatttattccaacatctgtggttgtaattactaattggtcttatttagcttcctaaaaggttttatctgcatatatgacattgtaaatgaaacaagttgtagtatgatatatttttgtactggtttaacgccatgtttgtaaagatctaacatggttgctcagttttgctttgtgcctgctctgtctgcacatagttgtaaacatattatatccacatcctgctttatatctagatcatgtcttatcataagcggtgcgacaagttcatgttgtcttgtgatcaaaattgcaaatatggatgaactgtgataatgaacatttgcaggcatgtactgaacttgaagtagtgctgtcatcaagtgtttcacattttttaaatctaatttatgccatgcgctgcgctgcgctgcgcattaaatgcctaacattattaattacatagaagaactgcattctgaatagtacaatatgcatatcattatgatagggaaaagctttcagatacgagttccactgtacaatgtcccagaactacatgtttggtgtttggctttttgattgtaaaaataatacgacgttttgctctacaaatattgacagatttagtatataaattgtctagcatgcactcacactaccaactcttatctgctatccttttgtctacattttaaggaaccattttattaatgcattttttattgagctgaattattgatgcatatttcaaaacactttctgctgttcacatacgtcagtttatcacatgttcggattaattgattatgccactttagacttttgttgctccaatcggtaaaatgataatttacttgtttgagtattaatattatctgctatttccccaggagaaaccatccatacttttactattttgactactcgggcctcgatttctctaaaatggcttcatggttagctagatactctctaccccccatgatctcagattattcatatatttactatttcgatacatgtgtgataaggctgcttttgaattggcttcatggttagtagggttaataacaaaaccctgttattttacactatatcaagctgacatttatttgtacacacctactctggtcttcgtagctagtgacattactggaagtttgtaatgtttagcttgttaatgcactgttcctattaattttcactttacaatatcttatttagaggcaggcaaggagaaagccagttgattttcaattaaaagatagtatatatcattgatgatagtacaatattgcctttaacagtactgatgcatctgtattttactttatatgataagttgtccttgtagttcaatttaattgagaaaacagattatacctttttctggtaatggatgtatgaaaaatgtttttgccaagtctatcaggtcttgatatacgagtacttattatactgttgcacacaatgtttttatgacttgctaccttttgatttgatttggcaccttctgagtctgcatgtgacttaacagatagaatgccagtaatcttgggtgacaaagactccattagtacttggttgaacggtgcatctgtgaaactcgaagaaattacagtaccctatgaaggagcagatcttgtaagttcatgctttcatcattttattgggatttccgtgatatggctgatatcctttttggatgttattatttgctaactgaacattgtctttaactttttttaatgactagcaaaaatgcatgtgcgatgcaacatgtgaagacaattttaaaaactataccaatttaacagcaaataaaaaaaaacaaacgtaacaatggcattgaatctggtcgcgctcgcttcatgcatcatcacatgaagaatcctttatatacaccattccatagccttacaaatcgatcgggtggctatgccgtaagttgatgtatgggtattttgctatacctcatcaaccaaagattgaaataggcgtttcagaccagcactattggaagttctcaaagtcaggggtttacacttccaaatccgcacatgggaccttctttatcccagacggtcaggtttgctccttggaaaatgatatggaagaattgggcacctcttaaatgtaggttttttttctgtggctgacggatacacaaccattgttggatgacttattgtcttgccaagcgtgacttgcctcatctagccgcttgccccttttgtgatcaagcggatgagacaatgcaacacactttggtttcttgtgttttcaacagacaagtgtggtcactagttctttgaagtctgggctatttctccactcttccgaaccatgacacgcaagttttcgtgttggttgtcaaaggcagtaaaagggttgcgaatgagcgagaagaaagggcttaactctcttattatcttggtcacgtgggcaatctggaaacacagaaatgcttgtgtttccaatggtgttactcctagcatggcggatgtgattctgtccatcactaatgagggcacactatggtgtatggcgggagcttctaggctccaagagctgttagccaaggcaatagctcttgtgccctaggaggggggcgaatgtgggtgtgtttctttgtgtttttgtttttgtaagtccgaacatttattctttgcttaatgaaatgatatgcacatctcatgcgtgttcgaaaaaaaaagattcaattttgattattcaattagtgaaagtctttttgttttactgtagatgaaaagcatttacaaagtaacaaacttactgtatacataccttaaacaatgataatttcaaaaggaaaaaaatatttatgaggagcgaaatttggaagagg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0470800, RefSeq:Os06g0470800