Os09g0510700

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0510700

Description

Similar to GCN4-complementing protein homolog

Version

NM_001070170.1 GI:115480082 GeneID:4347541

Length

7417 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0510700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:20477558..20484974

Sequence Coding Region

20477792..20477909,20478345..20478844,20479152..20479248,20479341..20479483,20479895..20480236
,20480310..20480396,20480518..20480739,20480851..20480982,20481094..20481309
,20481682..20481723,20481809..20481904,20481989..20482036,20482124..20482189
,20482485..20482529,20482611..20482673,20482982..20483052,20483307..20483407
,20483604..20483680,20484564..20484608

Expression

GEO Profiles:Os09g0510700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:20477558..20484974 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgtttttcaccaggctggatgactcgcccatgttcaggaagcagatacaatcccttgaagaaggttctgaattgctgagagagagatgtttgaggtttcataaaggttgccgcaaatacactgaaggactaggggaagcatatgatggagatattgcatttgcaagttcactggaagcatttggaggggggcataatgatccaatcagtgttgcttttggaggacccgtcatgaccaaatttacaattgccctgagagaaattggaacttacaaggaagtattgcgctcacaggttgagaatatgctaaatgacaagttgctgcaatttgtggacattgatttgcatgatgtgaaggatgccaggaagcgttttgacaaggctagccttctctatgaccaggctcgtgagaggtatttatccttgaagaaaggcacacggacagatgtagcaactgcggtggaggatgagctccatagtgccagatcctcatttgagcaagctcgtttcaacctggtgactgcactttcaaatatcgaggccaagaaaagatttgaatttttagaggctgtcagtgggacaatggatgcacatctgcgctatttcaaacaaggatatgagctactccatcagatggagccatatatcaatcaagttcttgcttatgcacagcaatcaagggaacggtctaactatgagcaagctgctcttgtagagaggatgcaagagtttaaaaggcaaattgatcgggaaagtcgttggtcaccaaatggcataaacgattcccctaatggtgatggaatacaagcaattggtagaagttcacacaaaatgattgaggcggtgatgcaatcagcttcaaagggcaaggtacagaccattcgacaaggctatctctcaaagcgatcttcaaacttgagaggtgactggaaaagaaggttctttgttcttgatagccgaggaatgttatattattatcgcaagcagaatagtagaccatctagtggttatactaaccaaagaagtagcgctccgtcagagcatggttctgggttgcttagcagatggttctcttctcattatcatggtggagtacacgatgagaaatctgtagcaaggcataccgtgaacttgctaacatcaaccattaaagctgatgctgaccaatcggatctgcggttctgcttcagaataatttctcccacaaaaaactacactttgcaggcagagagtgcgatggatcagatggattggattgaaaaaataactggtgtcatcgcttctttgctgagctcccaatcgcccgaacggcgtcttctgtcgagcccaaagggtagcggccataatcgaactgccagcgaaagtagttcctttagtagctcgacagaacttgaccattccattagtgaagactgcatgctggaaaggaactctggaagtgggtattttgaccactctggcagagccatccagcatcaccgaaccagcatgaaacctgacaagccaattgacttgcttaggaaagtggtcggcaataatatttgtgctgattgtggtgcagcagagcctgactgggcatccctaaaccttggaattcttctatgcatcgaatgctctggggtacacagaaatctcggtgtgcatatatctaaggtaagatcactgacacttgatgtcagggtctgggagccatctgtaatcaatctcttccagtcattaggaaacacatttgccaacactatctgggaagatatgttaccttcatcaagcagtgttgatcatggtgataattcaagggctgatggactagaaaacacatcacataacttaattttcagcaagcctaaacactcggatcatattgctgtgaaggagaaatttattcatgcaaagtatgccgagcgagattatgtgcgaaagcttaatatggatgatagcctggtagctcaacagatgtgggaaaatgttagttcaaacaacaagaagggggtttacagtctgattgtggggtcaaatgccgatgtaaatttaacttatgggcagacatcatttaattcggccctaacccttggaaaagctctacttttacaagagcagccaacttcaccatcagatggaagttccagatgttttgatcgtagttcacttgaaaggatttctcccagggactctctttctcttgccagcacaagtgcacgtatagatgaattggatgattgtgtcgagggattgtcattgcttcatctagcatgccgtgttgcagatgtgggtatggtcgaacttctcttgcaatatggtgccaacgtaaattctgcagactctagaggtcgaacgcctcttcatcacagcatcttgaaaggacgacatatgtttgcaaagttgttgctatccaggggcgctgattcacaagccacggaccgagatggtagaacagcattacagtatgctattgacagtggaactattgacgacgaagagattcttgttttgttagaagacccaagtagataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MFFTRLDDSPMFRKQIQSLEEGSELLRERCLRFHKGCRKYTEGL GEAYDGDIAFASSLEAFGGGHNDPISVAFGGPVMTKFTIALREIGTYKEVLRSQVENM LNDKLLQFVDIDLHDVKDARKRFDKASLLYDQARERYLSLKKGTRTDVATAVEDELHS ARSSFEQARFNLVTALSNIEAKKRFEFLEAVSGTMDAHLRYFKQGYELLHQMEPYINQ VLAYAQQSRERSNYEQAALVERMQEFKRQIDRESRWSPNGINDSPNGDGIQAIGRSSH KMIEAVMQSASKGKVQTIRQGYLSKRSSNLRGDWKRRFFVLDSRGMLYYYRKQNSRPS SGYTNQRSSAPSEHGSGLLSRWFSSHYHGGVHDEKSVARHTVNLLTSTIKADADQSDL RFCFRIISPTKNYTLQAESAMDQMDWIEKITGVIASLLSSQSPERRLLSSPKGSGHNR TASESSSFSSSTELDHSISEDCMLERNSGSGYFDHSGRAIQHHRTSMKPDKPIDLLRK VVGNNICADCGAAEPDWASLNLGILLCIECSGVHRNLGVHISKVRSLTLDVRVWEPSV INLFQSLGNTFANTIWEDMLPSSSSVDHGDNSRADGLENTSHNLIFSKPKHSDHIAVK EKFIHAKYAERDYVRKLNMDDSLVAQQMWENVSSNNKKGVYSLIVGSNADVNLTYGQT SFNSALTLGKALLLQEQPTSPSDGSSRCFDRSSLERISPRDSLSLASTSARIDELDDC VEGLSLLHLACRVADVGMVELLLQYGANVNSADSRGRTPLHHSILKGRHMFAKLLLSR GADSQATDRDGRTALQYAIDSGTIDDEEILVLLEDPSR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7066..7183#6131..6630#5727..5823#5492..5634#4739..5080#4579..4665#4236..4457#3993..4124#3666..3881#3252..3293#3071..3166#2939..2986#2786..2851#2446..2490#2302..2364#1923..1993#1568..1668#1295..1371#367..411#gttctcctttccgctttacctctctcctctctcctctcgcctcgccgagccattcgattcctccgccgaatcgccgccattacgcccaattccggccgcctcctagggtttcgcccgcgctccgccaccgtcgccctccccccggcactgcgccgccttccccacgccgccctggaggagctgctctgactgcggggaggtgtaggaggaggagggcggaggaggtggtggtggtggtggtggagagagagaggagtgcgtcgccgacgaggtgggtggtggtggtgcgaggagagggcgttgatgaggttgtggtggtagggaggcaaagcagtgtggtggtcgcggcggcgggcggcggcggagatgtttttcaccaggctggatgactcgcccatgttcaggaagcaggtgagtgagtggagatctcggttcgtggcggtttgggggcgctcgtgcgccgtggttgggaggttggtgtcaggcgagtggaagcgtaggggaagaagaaaaaaagggatgcagcttttggtgtaatgcttgccgctggtggcttctgggttgcgctgagagtggcgggttggatctatcgaatgttttttgggctgtgacgatgggaatggctggagaaagtgtgatctccctctatctcgggggggtctaatttgtggatttgaaattgaaatggagctgctcgtatcgtaggtttcttaaaatttttttgttgctgttctgacggtttcattcctagatggaagaatttagcgtcattagttctgtatttttcgtatgagcgtgtgagtaaagtatctcctgtaagcgttatttttggcttgggttcctcacaactgcagtagattttgcattctgttagaatatcttcttttctcatgtgtgtgttcggcactcgattattatcctgaattcctgatgcaaaggggaccttaggttatttctgtgtgaattttggcgaataatgttatattggtatgggtcctgtttgaaattccagaatgacaggggcattgttcaattccatcaggagataatcctgcaccctaaaactgaatcatacattatttgggttctttgattctttcgctgattgtgaacaagtggtttataattatcgtgattcatagagaaaatggagggactcttttattcaagggttatggggaatatattataaacgtttgcagtttgggcaaatgtggtgtattgatttgaatcatgtcttctaaagtttttggttcatgaacactgtttaaatggttatccttgcaatatgtagatacaatcccttgaagaaggttctgaattgctgagagagagatgtttgaggtttcataaaggttgccgcaaatacacgtaagtggtaacttagtctgcagttttagacttacaaaaaccaaaagtttgtttgctcatttatttgcaaattctgttggaaaatatggtctggactcttaactcaagaaccattgggctctctatattcttctctcctcgttttgcttatgctttgctatctagcattaaaaacatatatgtttgcttattacagtgaaggactaggggaagcatatgatggagatattgcatttgcaagttcactggaagcatttggaggggggcataatgatccaatcagtgttgcttttggaggttagtaatgcagttcttattcagatatatttattcaagtttttataacatgggatcgaggaatccttttgttatttccaaactggacaattggcacgaatcgttgagaactacaaaataggtttcagtagatttcattctccagcttattgccttcaaaatagtgatcctaggattcagtaaatttcattccccagcttgttgccttcaaaattagtgatcctttagtaagtgtggcattcacttttttccaggacccgtcatgaccaaatttacaattgccctgagagaaattggaacttacaaggaagtattgcgctcacaggtaaacattcatatatacattactatacatgcattctctcttctggaaaatctgaaattctgaatgttcttttctaagttgtcactctttcagatattgtcagccagttgtatgacttatctactttaatgtgagattctggatttactagtcatttgggaatagtatggttgaaataattcatgttattgtatcatagttcaagttccaggctttcattaccaagaatggaaacaaccccagttttattagaagctgtaaccatacttccacttagtggtattactaataatatactctttttttaggttgagaatatgctaaatgacaagttgctgcaatttgtggacattgatttgcatgatgtgaaggtactggcataatcttctattaacattggataaatatttggatctgcatacaatgttttaactttgatattgtttgtttaggatgccaggaagcgttttgacaaggctagccttctctatgaccaggtgacataataatgtttctatcatctcgctctccaatatgataatcaacttgtgctggaaccttgaaggttccattagccaattatacgtaggtgtagctaattgataatgaaggaattgcacaaaaatacccaaactattttaggataaggagaatcactgcagttaagcactggtattgccatgttcacttgtacttggtgctgcatgtttaacaaaaagttaaaagttgatggctatcttttaggaagagtttatctatcactgacttctagttgtttgtctactcactcaggctcgtgagaggtatttatccttgaagaaaggcacacggacagatgtagcaactgcggtggaggatgtatgttccttctatcatttgtcttcatatttgtatttagaaagttggatcactgcatccttactaatttatatgtcacacaaccaggagctccatagtgccagatcctcatttgagcaagctcgtttcaacctggtacatgcactgtttccctgtataactgttctgatttctgtagttgtatgtaccgtggctttgtcttatctatttaattttcaggtgactgcactttcaaatatcgaggccaagaaaagatttgaatttttagaggctgtcagtgggacaatggatgcacatctgcgctatttcaaacaagtaatctattgtcataatttgcattttgacatccttagtaatatatgaatgtggttcaaggttccactgttgctgtttctttcagggatatgagctactccatcagatggagccatatatcaatcaagtataagtctttaaccatgaccattcttctcataatgtttcttgtgctgtattcctatacctgaatgtttcatgctagttcttgacttaattgaggccaatgcacatttgcttattattggatacaccaatattttatgtcaccgatgggccattagtcattcttgcactttatataaaacataaatttctgctcatttccttcaaaatgacatgctctgctaaggcctagtaatacctgtaatttaagtgttggatgtgtatgcaacattcacttcatttctaaagaccaattgttttctgtatgtgcatgcatgtttctataccctcatttgcggttttttgtaacacattatggattctcctttttcaggttcttgcttatgcacagcaatcaagggaacggtctaactatgagcaagctgctcttgtagagaggatgcaagagtttaaaaggcaaattgatcgggaaagtcgttggtcaccaaatggcataaacgattcccctaatggtgatggaatacaagcaattggtagaagttcacacaaaatgattgaggcggtgatgcaatcagcttcaaagggcaaggtagcacattctggttgtcctggaagttaatactcttgcttatgtctacgctcaggctcacatttcagcatggaaattcatgtcatattttaaagtgagtacttatttcaggtacagaccattcgacaaggctatctctcaaagcgatcttcaaacttgagaggtgactggaaaagaaggttctttgttcttgatagccgaggaatgttatattattatcgcaagcagaatagtagaccatctgtaggtcctcactcccctgaataaaattattcaaatacttaatttgacttgatattttttacatgcttgtttcatttcagctcataatgttttcgtttttttacttcgtagagtggttatactaaccaaagaagtagcgctccgtcagagcatggttctgggttgcttagcagatggttctcttctcattatcatggtggagtacacgatgagaaatctgtagcaaggcataccgtgaacttgctaacatcaaccattaaagctgatgctgaccaatcggatctgcggttctgcttcagaataatttctcccacaaaaaactacactttgcaggtacaaatatttaccagaaatctgttgcatctattttatttagatagatttatattacaggaatttttgaatagctgccagatttcttccttcctaatgacatgcacctctatttgggcaggcagagagtgcgatggatcagatggattggattgaaaaaataactggtgtcatcgcttctttgctgagctcccaatcgcccgaacgggttagtgagtacttaggtggggttagttacatagccagattttgatttatctgacactaatattttgtttcagcgtcttctgtcgagcccaaagggtagcggccataatcgaac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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0510700, RefSeq:Os09g0510700